EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM002-25223 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
3T3-L1 
Coordinate
chr3:88317270-88321370 
Target genes
Number: 39             
NameEnsembl ID
PrccENSMUSG00000004895
HdgfENSMUSG00000004897
Gpatch4ENSMUSG00000028069
Apoa1bpENSMUSG00000028070
Mef2dENSMUSG00000001419
1700021C14RikENSMUSG00000010538
Cct3ENSMUSG00000001416
0610031J06RikENSMUSG00000001418
Tmem79ENSMUSG00000001420
Smg5ENSMUSG00000001415
Paqr6ENSMUSG00000041423
BglapENSMUSG00000074489
Bglap2ENSMUSG00000074486
Pmf1ENSMUSG00000028066
Slc25a44ENSMUSG00000050144
Sema4aENSMUSG00000028064
LmnaENSMUSG00000028063
Mex3aENSMUSG00000074480
Mir1905ENSMUSG00000084728
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Gm10704ENSMUSG00000074479
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
2810403A07RikENSMUSG00000028060
SNORA42ENSMUSG00000084433
Rit1ENSMUSG00000028057
Gm17146ENSMUSG00000091881
5830417I10RikENSMUSG00000078684
Syt11ENSMUSG00000068923
U1ENSMUSG00000064738
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Scamp3ENSMUSG00000028049
GbaENSMUSG00000028048
Thbs3ENSMUSG00000028047
Mtx1ENSMUSG00000064068
Krtcap2ENSMUSG00000042747
Dpm3ENSMUSG00000042737
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:88321329-88321341GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:88321333-88321345GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:88321337-88321349GTTTGTTTGTTT+6.32
IRF1MA0050.2chr3:88318055-88318076AGAGAGAAAGAGAAAGGGATG-6.2
Nr5a2MA0505.1chr3:88319095-88319110GATGGCCTTGAGCTT-6.83
ZNF263MA0528.1chr3:88318078-88318099GAGAGAAGAGGAGGAGGAGGA+6.2
ZNF263MA0528.1chr3:88319139-88319160TGCCCTTCCTGCCCCTCCTCC-6.73
ZNF263MA0528.1chr3:88318081-88318102AGAAGAGGAGGAGGAGGAGGA+7.64
ZNF263MA0528.1chr3:88319142-88319163CCTTCCTGCCCCTCCTCCCTC-7.82
ZNF263MA0528.1chr3:88318087-88318108GGAGGAGGAGGAGGAAGAGGC+8.95
ZNF263MA0528.1chr3:88318084-88318105AGAGGAGGAGGAGGAGGAAGA+9.73
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01438chr3:88250596-88336770Th_Cells
mSE_02604chr3:88311981-88327111HFSCs
mSE_05600chr3:88315789-88318833E14.5_Limb
mSE_07384chr3:88315551-88319722Intestine
mSE_09381chr3:88315249-88318932MEF
Enhancer Sequence
CGGCTCAGGG TCTGCAGACC AGGCTGGACT AGGGGCAGGA GCCACCTTCC CGAACCTTCT 60
TGAGAAAAGC ACCATCTTCT CGCTCTCCTC AGGTGCCCCT CCCCATTTCC CCAGTTGAAC 120
TGGATGCTGA ATAAATCCTC TTCCAGAGGC TGTGACACTA GGCTAGGCGC TAGCACGGGG 180
TATGTTGAGA GCTATGGGGC CCAGGACCCA AAGGATCTGC TGCAGACTCT CTTCTCTGCA 240
TACTTCCTCA ATGTGAGGCC CCTGTTCTGC AAAGCTTCTT GAAGCCACAG CCTGATCTCA 300
CCCTCCTCCG TACCTGGCCC TCTGCAGACA GGGCAGGAAG GGTTGGCAAG AAGATCTCGG 360
GGGAAGGAAA CTCCTGAGGC TAAGACATGG TTGTCTTTAA GGTTTGGAGA TTTGGACAGA 420
GTAACCCCAG GGGCAAAGTC CCCAACTCTA CTTTCGATCC CCATGTGTCT ACCCAGAAGC 480
AGAGACAATA TGGGTAATCT GCTGAGGAGA GACAAAAACT AGACCACAGG AGGGACTTTC 540
CAGAAGTCCC TTTGCACAAG TCTACAAAGG GAGGGAAAAG AGAGGATCCC AGACACCAAA 600
GCAGAACTTA GAAGTAGGTA CAGACGAGTA GTTAGAATTA AGCCTGTGGA AATCCAGCAT 660
GGGTGGGGCT TGGTGGAGCG CTATGCTAAA CCCAGCACCC AGAGACCGGC AGATCGCTGT 720
AGCTCAGGGT CATGCAGCTT CAGGCCTTAA GCTCTGAGCC AGCTAAAGCT AGAGTCAGAT 780
CCTGGAGAGA GAAAGAGAAA GGGATGTGGA GAGAAGAGGA GGAGGAGGAG GAAGAGGCCG 840
CTGAGGCAGC AACATGGCTG AAAGGCAAAT CCAAGTTGGC AACCAAAAGG CCGTTGTTCT 900
CCAAACTCCC ATTGGAAAAT TTGAAAAATA CCCATAAAGA TGTGACTCAC TAACCCCTCC 960
CCAGGGGTCC CCTTTCCTGG TTTCTATGAT TTCTCTCCCA AGAGTTAAAT TCACGGTTCA 1020
TTTTCACAGG AACCAAAGTC TGAAGAGGGA GGGCACAGGG TTGCCTGTAG GCGTCTGAGA 1080
GGCGCCTGAA GAGGGGCTGA AGTGGAGGTG TGTCCTAGGC TGGCAGGCCA GGGTGTGGCA 1140
ACGGGCCACC ATGGGAGGCC TTGGGATTGC CAGGGAGTGA GTGGAACTAT GGACTGGAGG 1200
GTGGACAGAG TTGAATGCCT CAGCCATACA TAAGACAACT GGCTAAGCAA GCGGCCAACA 1260
TGGCAAGCCC AGCACAGGAC AAGCAGGAAG TCTGCACTCT TCAGTCTCCA GATAGGGTAG 1320
GGCTGGGCTG AAGCTTGGTG TCCTAATAGG TCAACAGTAT ATCCACAGCA CCCTGCTGCC 1380
CTGTGTCTCC AGCCCAGGAG GGTCTCTCTT GCTCCTCAGA ACCCACTCCC AACAGGTTGG 1440
GAGCAGAGAG TATCCCCAGA CTTGCTCACC CCCAGAGAGG CTAAGGAAAC GGGAGGCTTG 1500
GCCACTGCCC AGAACCCAGT GCCCTTCCCC TCTTTGAAAT GCTCAGAGAT CGACCCCATG 1560
GATTCTCAGG CCTCGGACTT TCCCCACCTC AGCGTCCTAC ATAAATTCAT ATTGTATTTG 1620
TGCTAGAGAT GGCACTCAGG GCCTCAGGTG TGGCTTTTGT TTGGTTGCCC TGACTACCCA 1680
AGAGCTCACT ATTCAGACCA GACTAGCTTT GAACTCACAG AGCTCTAGCT GACTCCACCT 1740
GCAGAATCCA GGTATCTGGG AGGTACGCGC CACCCTCCAC ACCTCATTTT TTTTTTTTTT 1800
TTGAGACTTA GACTCTGTTC CTCAAGATGG CCTTGAGCTT GCTCTGTAGT TAAAGACAAT 1860
AGTGAACCCT GCCCTTCCTG CCCCTCCTCC CTCCTGCCTC TCCCTTTCAA GTGCTATGAT 1920
CACAGTCACC ATTCCTGACT TCAGATGGAG TGTATAGCCC AGGCTATTCC CAGACTTGTG 1980
GCAGTTCTTA CTTCATCCTC CTAGAAGCTG GCATTACAGG CATGTGCTAC TCCTCCTCCT 2040
GATCCAGCTG TCATCCTTTA TGTGTCCCCA TGACACCCTG ACCCCACTCA CTCAGCTCTC 2100
AGCCTCATCC TCACCATCTC TCTGGACCAA GGAGCCCCAA GCCATAGGTT CTTCCTCTAA 2160
CCTTTTTCTC CACCTGAGTA CCCCCTTTAG CTCCTTGATG CCTTTGGCCG TCCCTAGAAG 2220
ATGTACCCTC CCTGCCGCGC AACCCTCGCT TCTGCCCTAT TTCTTTTCCC TTGAGCGTCT 2280
GCTAAAGAAA AACTCATTCA TGCTTCTACA AGACTTCAAA CCAACAGTAG AGTCTCCCTG 2340
TATTTGGGAT GAAGTCCAAA TTCCTCGACC TGGCTTGCAA AGCCCTCTGT GATCCAAGCT 2400
CTGCCTGCAC GACTAGACTC AACACTTGTG CTGTCAATGC CAACAATCCC AGCCTCTTCT 2460
GTTTTGATCT AAGCCGACAT TCAGGACTGA GCACATGCTT TCCCGTAGAC CGGTGGTTCT 2520
CGCCCTGTGT GTCTTGACCT CTTTGGGGGG GGGGGGTGTC AAGCAACCTT TTTACAGGGG 2580
TCAAATATCA GATATCCTGC ATATCAGATA TTTATATTAC GATTCATAAC AGCAGCAAAA 2640
TTACAGGTAT GGAGTAGCAA TGAAAATAAT TTTAAGGTTG GGGATCACCA CAGCACAAGG 2700
AATGTTGAGA ACTGCTGTAG CCCAACTCTT ACCCATCATC CAGGTTCAGC TAAAAGTATC 2760
AGGAAGTCTA GGCTCAGAGT TTCCATTAAG CTTTGAGCAC TTCTCGTCAC AGGGCGGTAA 2820
GGCTACCTGT TGATGCCCCT TCCCCTATTA GGGTGCCTCC TTGAGGACTG GGGCTGGAAA 2880
GACCTGAGCC TCACTCCTGT CCCCAGAATC TGGCCTACTG TGTGTTGCAT GGAAAGACCC 2940
CAACATATCT GAACTCAGCA TCTTCAGGAA GCGGTCCCCT TGATGTGTCC TTTCAATGTG 3000
TCAGCATGTC CCCTTCCTTC TGCCACACAC CCTGCTCTTC ATCTTTTAGC TTCACCCCCA 3060
TTTTGTCTGC CTTCACTGCT GCTCCCCTCC AGAGCTTTGT CTGTACACCC CACCTGGGTT 3120
TCCCTCCACA CCCAATGCAG GTGTGCTCAC AATAGCAGCA GTTACAAGAG CCGCTTCTGT 3180
GTCAGGGCTT GTTCTAGCTG CTTCCAATCC CCAGGAGGAG CCAAAATCCA AATCAAGCAA 3240
GAGGTTGGCC CAAGAATCTG GCTTATCTGA TGACTCAGGA CTGTGTTCTG TAGGCATACA 3300
CCACCATTAC AGCTCCATAG TCACGGTGGG TAAGGGAGAT GGGATGTAAT GCTAGGCCCT 3360
TAGCAAATGT TTATCCAGGG AATGAGCAAT ATAATTGCCT ACTTTTATAG CAAGTCTTAT 3420
TGCTGGCAAA ACATCATCTC AGGGCAGCCT TGAGAAGTGA GCATAACACA GGGAGTATTC 3480
TCATTTTATA GAGGACTCTG AGTGAGTAGA GAGGGACCTG CTTGTGGCCA GGCAAGTAGT 3540
GATGAGCACT TGTCCCAACT GTAGGCAGGG GAGCTATGCC AGGCTTGGGG ATCCTTCTAG 3600
ACCATCCCAT GTTTTCAACC TTCACTGATC GTCACAATTG CTTGAAGAGT GTTGGGGTGT 3660
GGGGATGAAA TTCAGCTGAT AGAGTAATGA AGCCCTGGCT TCAACTTCTG GCACCAAGTA 3720
AACTTTTTGT GGTGGTATAT GTCTGTAACC CCAGCACTCA CGAGGTGTGG GAAGATTAGG 3780
AGTTCAAAGT CATCTTCAGC TCCATAGAGG CCAACGTGGT GAGATCCTGT CTTTGGGAGG 3840
AAGAGGCTTT GAAGCGACCA AAGCAATGCT CAATGTAAAG TTCATGCTTA CATGCTGGAG 3900
GCTCCATCCC TCACTGCACA TGCATGCATG CATGCATGCA CACACACATG CATGCACACA 3960
CATACACACA TACAAGCCCT CCAATGGTCA AGGGCTTGTA TATTTTGGTT CAGTAATTAA 4020
GGTGAGGCTG GAGGACTTTA CACAACATTC CTGTTTTTTG TTTGTTTGTT TGTTTGTTTT 4080
TAAAAAAGAT TTATGCCGGA 4100