EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM002-19652 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
3T3-L1 
Coordinate
chr19:8788380-8791700 
Target genes
Number: 39             
NameEnsembl ID
Chrm1ENSMUSG00000032773
Slc3a2ENSMUSG00000010095
Snhg1ENSMUSG00000090867
SNORD25ENSMUSG00000064721
SNORD26ENSMUSG00000065392
SNORD27ENSMUSG00000065281
SNORD28ENSMUSG00000065280
SNORD29ENSMUSG00000065378
SNORD30ENSMUSG00000065782
SNORD31ENSMUSG00000065305
Snord22ENSMUSG00000065087
Wdr74ENSMUSG00000042729
1700092M07RikENSMUSG00000090840
Stx5aENSMUSG00000010110
Nxf1ENSMUSG00000010097
Tmem223ENSMUSG00000075043
Tmem179bENSMUSG00000079437
Taf6lENSMUSG00000003680
Polr2gENSMUSG00000071662
Zbtb3ENSMUSG00000071661
Ttc9cENSMUSG00000071660
Hnrnpul2ENSMUSG00000071659
Bscl2ENSMUSG00000071657
Gng3ENSMUSG00000071658
Lrrn4clENSMUSG00000071656
Ubxn1ENSMUSG00000071655
AI462493ENSMUSG00000071654
SNORA57ENSMUSG00000070167
Mir5136ENSMUSG00000093314
1810009A15RikENSMUSG00000071653
Ints5ENSMUSG00000071652
GanabENSMUSG00000071650
B3gat3ENSMUSG00000071649
Rom1ENSMUSG00000071648
Eml3ENSMUSG00000071647
Mta2ENSMUSG00000071646
Tut1ENSMUSG00000071645
Eef1gENSMUSG00000071644
AhnakENSMUSG00000069833
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA2MA0036.3chr19:8789914-8789925ACAGATAAGAA-6.14
Gata1MA0035.3chr19:8789914-8789925ACAGATAAGAA-6.62
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:8791227-8791242AAGGTCAGGAGTTCA+6.04
RarbMA0857.1chr19:8791226-8791242GAAGGTCAGGAGTTCA+6
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01390chr19:8757458-8816492Th_Cells
mSE_06172chr19:8785881-8792130E14.5_Liver
mSE_07808chr19:8785863-8789080Intestine
mSE_07808chr19:8789178-8791286Intestine
mSE_10189chr19:8785945-8789091Embryonic_stem_cells
mSE_10189chr19:8789285-8790204Embryonic_stem_cells
mSE_10189chr19:8790396-8791292Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
CGGCGGGGAA GTGACCCAGG ACTCCGCCCC GGTCCGCCTC TTAAAGAGAT GCAGAGAAGT 60
CTTTTCGCAC CTCCAGCCTC GCTGAATACT CCCGTCTATC CCTAACGCTT ATTCCTGCAA 120
GAGTCTGGGA AGGGGAGCTT GTGGTCAGAA ACCCTTAGAA TAACAAACGT GAATTTGTCT 180
TGACCAGGTT TCAAAGCCCC TCCTCCGACC TTCCGGCCCC TTACCCTGCG AGGCCTCTTT 240
TCTCTCCACA AGATGACACC AGTCTCCATC CACATCGTGA TCCCTTCGCC CCAAGCACGG 300
CTCAGGCTGA TCTCCCCAAC TTCACACAGA CCTTGGCACT ACATCTCACT TCTGCTTTAC 360
GTACATCTTC TCATACTCCG GACTTAGCTG AGTTCCTGGA TTCTCCTCGG GGCTTACACG 420
TACTCACCTT TCAAGACTCC TTGAATTTAA TTCCTCAGGC AGCAACTATT TACTGGGCAC 480
CCACTCCAAT CCTTTGCTTC ATCAACTGCA TAGGATCAAC TCTAATCCGT TCTTCTTGAT 540
TTTAAAATTC AACTGCAGAA TTGAAGTGGT CACTACCCTT ATTATCTTAC CCTAGTTACT 600
AGCAAGAATG TTGGATTACT GGGAATCAGG CATCCAGAAG AGATTAATGG GGCTGTAATA 660
AACATTCCGA AGGTATTGAG GCACCTACCC TTTTAATATA CAAGCTGTTC TAACTCTTTT 720
TTTCTTTTTT TTTTAACTAT TTACTATTTT TTAACTATTT ACTCACTTAT TATATGTGAC 780
TACACTGTAG CTGTCTTCAG ATGCACCAGA AGAACTATTT ACTCACTTAT TATATGTGAC 840
TACACTGTAG CTGTCTTCAG ATGTACCAGA AGAGGGCGTC AGAACTCGTT ACAGATGGTT 900
GTGAGCCACC ATGTGGTTCC TGGGAATTGA ACTCGGGACC TTTGAAAGAG CAGTGAGTGC 960
TCTTAACTGC TGAGCCATCT CTCCAGCCCC TGTTCTAACT CTTAACCACC TTGCAATAAC 1020
TCTCAAACCC TCTAGTGTGC CGGGCTACAT CAGTTGACTA TGCTAGGCCC TGGAACCAGC 1080
TTAGTTCCCT CACACTTTGA AAGTTTCTCA AATTCCCCCG GCAGAGGTCC TTGGCAAGAG 1140
GAAGGGTAAA TGGGGCAGAC TGGGTTAGCA GCAGGGACAA GTGAAAAGTG AACATCAACT 1200
CTAGGAGGTG CCAACAATTT CAGGAACTTT GTGTTCCAAT TAGGTTATTT TCAGAGAGAA 1260
TCGGAAGGAA ACAACAGGTC CTTTCTCCCT CTCCCCACGT AGGCCGGCAG CCAAGATTGC 1320
TATGTATTTG GAAGAAAGCA GAAGCCAAGG CCAGAACAGT AGAGAGGAAG GGATATGAAA 1380
AGTCTCATCA CCTGCCACTG TCCTTTTGAA TTCCCAAAGT CCTCCCCGGC CTCACTAGAG 1440
AAAAGTCTAT ACACCAGCTC CTAGGAAGAG GGAAGAGGCT AAGGGTCATG CTAGTGTTCA 1500
TAGTTGATAA GAGTCCTACC TTGCCCTGGG CATGACAGAT AAGAAAAGTC CAATGCAGAG 1560
TTTATACACA GCGTGAAAGC TCAAGGTTTG TGGACTGTGA AGCAGAAGCA CTCCTTGAAA 1620
GGGTTTGATG AAATGCTCAT TAGAAACATG GTGTTTCAAT CAACCAAACT GAAAACAAGA 1680
TGGATCAAAC CAACCAGATG TTCATCTGGA GCCGGGCGTG GTGGCGCACA CCTTTGATCC 1740
CAGCACTCGG GAGGCAGAGG CAGGTGGATC TCTGAGTTCG AGGCCAGCCT GGTCTACAGA 1800
GTGAGTTCCA GGACAGCCAT GGCTACACAG AGAAACCCTG TCTCAAAAAA CCAAACCAAA 1860
GGGCTGGTGA GATGGCTCAG TGGGTAAGAG CACCCTACTG CTCTTCTGAA GGTCCGGAGT 1920
TCAAATCCCA GCAACCACAT GGTGGCTCAC AACCATCCAT TAACGAGAGC GTCTGAAGAC 1980
AGCTACAGTG TACTTACATA TAATGAATAA ATAAATCTTT AAAAAAAAAA AGACCAAAAA 2040
GAGAAAAAAG ATGTTCCTCT GGTGAAGGTG CCTAGCCAGC AAACCTGAGC TCACTCCTCA 2100
GTGATCAGTG AAGATCAGTG AAAGGAGAAC TGATTCCCAG GAGCTGTCTT CTGCCCTCCA 2160
CACATGCGCA CTGCCCTCCA CACATGCGCA CTGCCCTCCA CAAAGTAAGT AAAATTTAAG 2220
GTAACACAGT ATCTCCCCGC CCCCACCTCC AAGTGGCAGA AATCTATTCC TAAGCATCTT 2280
AGAGAGGAGA CGTGAGCTCC CATCAGTCTT TTCAGCAGCA CCCTTCCTAA TCACTACTGT 2340
TCAGCCACAG CAGCTTTCTA GCACCTGCCA GAGTCACGAC ACACAGGGTG TTTCCATTCT 2400
TAATGCCTCC TGTGCATGCT GTCCTGCTGT TTGGATCTTC CTGCTAAGTT ACTCTTCCTC 2460
CTTCAAGCTC TGACTCAAGT GACAGCATCT CTCAATGCTC TACGTAGATT GCTTTCCCTT 2520
ACCAGGGATA GAACACAATA ACTAACACAG TTGACTATAT AAACTTAAAG GACTGACGAT 2580
GCAGTTCAGA AGACCGGTGC TTTCCTACCA TGTGCAAGGC CCAGGGTTCA ATCTGCAACA 2640
CCAAAGCAGT GAAGGATGAA GGACTGGGGG TGGAGCTCAG CCAGTGCTTG CTTAGCATTT 2700
GAAAGCCCTG AGTTCTATCC TTAGCACCAC ATAAACCAGG CACAGAGGAG GCACAGGCCT 2760
AAAACCCCAG GAAGTGGAGG CATGAAAAGT TCAAAGTAGG GGCTGGTGAG ATGGCTCAGT 2820
GGGTAAGAGC ACCCGACTGC TCTTCCGAAG GTCAGGAGTT CAAATCCCAG CAACCACATG 2880
GTGGCTCACA ACCATCTGTA ACGAGATCTG ACGCCCTCTT CTGGAGTGTC TGAGGACAGC 2940
TACAGTGTAC TTACATATAA CAAATAAATA AATAAATAAA TCTTAAAAAA AAAAAAAAAG 3000
AAAAAAAAAA GAAAAGTTCA AAGTAACCCT CAACCACGCG ACAAGTTTGA GGCCAGCCTG 3060
GGCGACATAA GACCCTGACT CAAAAACAAA CAGCAAAGAC AAAACTGGGG TAAATACAAT 3120
AGATATGCTG GGATGGGTTG ATTGTGTGAA GCCATAATGA GAACTGAAGC CCAACGGTGC 3180
AGGAATACCC AAGTCAGCAG GAATACACTG GTGAGAGGAG CACCTGAATC TTTTAGAAGT 3240
GAGAAAGGGA GGGGCACAGC TGAGCCACTG AGAATGCAAA GACCATAGGA CTGAACCACA 3300
GGACATTTAT CACTTGTAAC 3320