EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM002-01539 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
3T3-L1 
Coordinate
chr1:135014480-135017740 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:135014527-135014538TTTTATTGCTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:135014575-135014587GTTTGTTTGTTT+6.32
Gata4MA0482.1chr1:135015658-135015669GAGAGATAAGA-6.32
JUN(var.2)MA0489.1chr1:135015601-135015615CTGAGTCATCTCTC-6.02
MEF2CMA0497.1chr1:135016310-135016325GATCCAAAAATAGAT+6.99
Nr5a2MA0505.1chr1:135015468-135015483GTGTTCAAGGCCAGC+6.83
PKNOX2MA0783.1chr1:135016401-135016413TGACAGCTGCCA+6.02
TGIF1MA0796.1chr1:135016401-135016413TGACAGCTGCCA+6.04
TGIF1MA0796.1chr1:135016401-135016413TGACAGCTGCCA-6.18
TGIF2MA0797.1chr1:135016401-135016413TGACAGCTGCCA-6.07
TGIF2MA0797.1chr1:135016401-135016413TGACAGCTGCCA+6.44
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01631chr1:135016352-135030682Macrophage
mSE_03469chr1:135016818-135017245Bone_Marrow
mSE_07341chr1:135014898-135016230Intestine
mSE_08766chr1:135015890-135018602Liver
Enhancer Sequence
CAGACTATTA TACCCAAGAA AACTATCAGT CACAGGTTGC TTTAGGGTTT TATTGCTTCA 60
AAGAGACACC ATGACCATGG CAACTCTTAT TTTTTGTTTG TTTGTTTGGT TTTTTTTTTG 120
TTTTTCCAGA CAGGGTTTCT CTGTATAGCC CTGTCTGTCC TGGAACTCAC TCTGTAGACC 180
AGGCTGGCCT CAAACTCAGA AATCCGCCTG CCTCTGCCTC CCGAGTGCTG GGATTAAAGG 240
CGTGCGACAC CAGGCCCGGC GCAAAAAAAA TTTTTTTTAA TTGGAGTGGG TTTACAGTTT 300
TAGATCTTTA GTCCATTATT GTTATGGCAG GAAGCATGGC AGCACACAGG CAGACATGGT 360
GCTGGAGAAG TTGCTGAGAG CTCTAGATTC CAGATCAGCA GGCAACAGGA AGTGAGTATT 420
ACACTAGACC GGAGTTTGAG CATTTGAGAT CTCAAAGCCC ACCCCCTAGT GACTCACTTC 480
CTCCAACAAA GTTCCACCCA CTACAGCAAG GCCACACCTC CTAATAGTGC CACTCCCTAT 540
GGCCAAGCAT TCAAACACTT GAGTCTCTGA GAGCCAATCC TATTCAAACC ACCACCAGAG 600
TGAAGAGAAA AAACAGCTTC TCATGAGAAA AGCCGGCTAG AAGAATTCAT GGCCATTGAT 660
CAAGTCTCAC AGCAGATACA GAAAGAAATA CTACAGACTA AAAATAAGAA TAAACACATT 720
CCAAAAGCTA CTGGGAACTG AATAAGCAGC ATGAAGAGAG TCGTTAAGAG AACTAAGAAA 780
ACCCTTGACC CGGCAAATAT CTGTGTGCAG ATATGTGCAT GAATCCGTGG ACGATGTCAG 840
TGCCTCTGGA GCTGGAGTTG CAGAATATGT GCCACGCATT GAGGGTGATG GGAATATATC 900
CAGTTCTCTG CAAGAGCAGA ACAGTTAGAT ATAGTGACAC ACATCTGTAA TCCCAGCATT 960
AGGAAGGAAG AGGCAGGTGG ATCTCTGTGT GTTCAAGGCC AGCCTGGTCT ACATAGACAG 1020
CTCCAGGCTA TCCAGAGCCA CCCAATAACA ACCTGTCTCA CACACCCATG CACACATGCA 1080
CACGTCACCA TGCAAGCACT TGCAGTGCAT GCTCTTATTT ACTGAGTCAT CTCTCCAGTC 1140
CTATTCTTGC CTTCTCTTTA AGCCACACTT TGTGGCTGGA GAGATAAGAC AGAGATTATG 1200
AGCACTTGCT GCTCTTCCAA AGGACTCGGG TTTAATTATT ATCTGTAACT CCAGTTTCAG 1260
AGGCCCGGAC TGTCTCTCCT GGCTTCTGTG GGCAGCAGGA CACCTGTGGT GCACAGACAT 1320
ACAGGCAGGC AAAATACCCA TACACATTAA AAAGAAATCT AAATTTCATG TCAAGACATC 1380
AAAGATGGGG GTCACTGGAC CTCTTTGCCT CCCTTCCTGA TGTATGTTAT ATTCCTAATG 1440
TGGTTAAACT GAATAATTGC CTGCTTTTTC TTATTGCTTT TTTTTTTTCA ATTGGCCTAC 1500
TGAGGCTAGG TGGTCAAATC TGGTTTGTTA GGGCTTCCAG GGTCCAGGCT CTGACCACAA 1560
GAACTACAGT AGGTTTGTGT ATCCCTTGAT CTTGTGCTAG ATCTCCTAAG CAACGTGCAA 1620
CAGTCTCTTA GCATGATGGT TGATAGTTTT AGGGTGTCTT AATGGAGTTG TTGTCAACCT 1680
TGGAAAGTAG ATACGTCTCA TTGATCCTGC CAGCAATCAC ACACTGAATA CATTGGTGCT 1740
CCCTAGTGAC TTGCCATCAT TTGCAGAGAA TACAGCCTGA AAGATGTTTC TGGAAATGCA 1800
CACTGGTTCC TGTATCAGGT ACCTGACTGG GATCCAAAAA TAGATCAAGA CAATTCTTTG 1860
CATTTGAAAA GCTTGCTCTG TCCCAATTTA TAATCCCAAA GATGGAACCT CTCGAGGCAC 1920
GTGACAGCTG CCAACTCTTA AGAGCAGAAT TGTGGCCCAG AAGTCTTAAA ATCACGCCGG 1980
TGGAGAGTCG GGTTTCAGAC AAGGGGATTT TGTGGGGCTT CCAAGGGAAT TGTCCTCAGT 2040
AAATGGTAAA AAGTGTTACG TGTTATGTTT CTAAGTGGTT TTATAGCACT GTATCCCCTA 2100
TGGGGCTTTT AAAAGTTTGA ACTTGAGTCT GGCAAGGCTC ATCTAAGGAT TTTTCTAAGC 2160
CAAGTGGGGT AGAAATCTGA CCCCCCTGAG GGAGTGAGAA CTAGGATTGG GAAAGAGAGG 2220
TCACTAGAGA GGAGAGAAAC AGAAGAAGCC CTCGGGGGCT GGGCTACACA AGTGTAGTTA 2280
CCCAACACTG AGGTTTGGGG GTGCAATGAC TAGTGTGGAT TTCAAAAGTG AGAATTCTGG 2340
GTAGTCTAAA TTGTGAGGAA ATCCTGCTGG CTGGGACGCC TCTGGGCTGG TTGATCTCTT 2400
CCACAAACAA CACAGACAAC CTTCTCAGTG TCAGGTGAGG TGTCAGGCAC TGTGGCTACT 2460
CAAGGGATAA ATAGGTGGAT GGCTTCAAGG AGTTCACATG CAAGTGAGGC AGCCACGGGG 2520
ACAAACACGA CAGTCCCTGC ATTTCTCAGA CAACTCTGTC TTCTGGACTT CAGCCAAGCA 2580
GATGGAAAAT ATCTGTACAA ATATCTATGT ATTTGTACTG AACATATACA AACTCCTCCT 2640
TGTGGTCATT CATTTCCTAA ACTCTACCCC AGGACAGCTG TTTACAAAGA CTCACGTTGT 2700
ATCAGTCGTG GGATATCATC CAGAAGTGTT TTAAATGTGT AGGAGAGACA GGTACAATGA 2760
TCCCAACTTG TAGTCCTAGC ATTCAGGAGG AGCAGGCAGA ATTGATCATT TGTAGGCTCC 2820
ATGACAAAAG CCAGTCTCAA AATGTAGAAA ACAAACCACG GTGGAGGTTG TGTATACATA 2880
TATGCATATA CTGTGCCTTT CATTTTATTT TTTGAGACGG GCTCTCTAGG TGCCCTGGCT 2940
GGCCTCAGAA CTTCCTAGAA AGGAGAGAAA GACACTGAAC TTCTGATCTT CCTGCTTCAC 3000
CTCCCTGATC ATGTATATGA AGCTCAAAGT GTGGGCTTTG TCCAGTATGG GATATATCTA 3060
CATAAGGGCT CTAAAAACCA TTTTAAAATT GTGTTATTAA AAAGATTTAG AAAGGCGGTG 3120
CACACCTTTA ACCCCAGCAC TCCAGAGTCA AAGGCAGATA GATCTCTGTG AGTTCCAGGC 3180
CTGGTTGACA GAGTGAGTTC CAGGGTTCCT TATTTTGATG TTATTTACAT GAGTGCTTTA 3240
CCTGCATGCA CATAAGTACT 3260