EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS197-14635 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
ZR75-30 
Coordinate
chr3:58359060-58362400 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs57700771chr358360327hg19
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr3:58361517-58361532CATAAATAATTAACT+6.54
HNF1BMA0153.2chr3:58361518-58361531ATAAATAATTAAC-6
IRF1MA0050.2chr3:58359888-58359909ATTTTCTTTCTTTTTTTTTTT+6.41
IRF1MA0050.2chr3:58360512-58360533AAGCTGAAAGAGAAAGTAAGT-7.41
IRF2MA0051.1chr3:58359118-58359136TCTTGGGTTTCACTTTCG-6.97
IRF8MA0652.1chr3:58359123-58359137GGTTTCACTTTCGC-6
Lhx3MA0135.1chr3:58362164-58362177TAATTAATTAGCC+6.32
Lhx3MA0135.1chr3:58362161-58362174AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr3:58362160-58362173AAATTAATTAATT+6.92
MEF2AMA0052.3chr3:58362138-58362150TCTAAAAATAAA+6.07
NFAT5MA0606.1chr3:58361583-58361593ATTTTCCATT+6.02
NFATC1MA0624.1chr3:58361583-58361593ATTTTCCATT+6.02
NFATC3MA0625.1chr3:58361583-58361593ATTTTCCATT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:58362162-58362172ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:58362162-58362172ATTAATTAAT-6.02
PRDM1MA0508.2chr3:58360330-58360340GTGAAAGTGA-6.02
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03296chr3:58361219-58361614Brain_Angular_Gyrus
SE_04968chr3:58359830-58361360Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07003chr3:58360350-58361651Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07965chr3:58360017-58361582Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_11104chr3:58359662-58361638CD20
SE_46458chr3:58358332-58359669Osteoblasts
SE_46458chr3:58360015-58361794Osteoblasts
SE_58408chr3:58306834-58396868Ly1
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr35836026458360426
chr35836058958360974
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH03I058376chr35836230658364449
GH03I058372chr35835833358361794
Enhancer Sequence
CAAAGTGCTG GGATTACAGG CGTGAGCCAC AGCGCCTGGC CGAGTCCATC ATTTCTTCTC 60
TTGGGTTTCA CTTTCGCCGC TGAAATAAAG GGGTTGAACT AGATGACTTC TGAGGTCTCT 120
TATAGCACAA ATGTTTTGTA ATTAGAATTT TACTGCCCAT TGTTGACCTT GGAGAGACTT 180
ACTGTACTCC AGGGGACAGC AGGGGGTTGA GACAAATTGA GGGTCTGTTG AAAGCTTAGA 240
ACTCCCTAGG ATACTGACTG GAATATGGTT GAAGGCAATT TACAGATCAT GAAGATCTGA 300
TGTTGGAAGT AAAGAGCAAT GAACAGATTG AGGTTGAAAG TTTTTCATTC CTGTCTTAGC 360
CCAGGGCCTT TGTATGTTCT GTTTCCTCTG CCTGGAAGTT GCTGTAAGCT TGTGGCCAGT 420
GCCATCTCAT CCCCTGACGT GGTGGCTCAC GCCTGTAATC CCAGCACTTT GGGAGGCCGA 480
GGTGGGTGGA TCACGAGGTC AGGAGATCGA GACCATCCTG GCTAACATGG TGAAACCCCG 540
TCTCTACTAA AAATACAAAA AATTAGCAGG GCGTGGTGGC CGGCGCCTGT AGTCCCAGCT 600
ACTCGGGAGG CTGAGGCAGG AGAATGGCGT GAACCCAGGA GGTGGAGCTT GCAGTGAGCC 660
GAGATCGCAC ACTGCACTCC AGCCATGGCG ACAGAGCGAG ACTCCGTCTC AAAAAAAAAA 720
AAAAAAAGTT TTCCCTCCAG ATAAAAGCTA GTTTTCTGAA ACTGTAATAT AGTTTGTCAT 780
ATAATTTTGG GCTCTAAATC CCAATTTGGG AATCATTCCC TGCTTTCCAT TTTCTTTCTT 840
TTTTTTTTTT TGTTTTGAGA CAGTCTCACT CTGTTGCCCA GGCTGGAGTG CAGTGAGCCG 900
AGATCGTGCT CACTGCAACC TCCACCTCCC GGGTTCAAGC GATTATCCTG CCTCAGCCTC 960
CCAAGTTGCT GGAATTACAT GCCCCCACCA TCATGCCTGG CTAATTTTTT TGTATCTTCA 1020
GTAGAGATGG GGGTTTCATC ATGTTGGCCA GGTTGGTCTC GAACTCCTGA CCTCAGGTGA 1080
TCCACCCACC TCAGCCTCCC AAAATGCTGG GACTACAGGT GTGAGCCACG GCGCCTGGCC 1140
TCCCCTTTCC ATTTTCACTC TGCAGTTGTG CATAGAACTC CGGGGACTCC TCTGCTGGCT 1200
GTCTTGTTCT CTTTTCCTTC TATAAGGAAC TCAAGAAGGG AATCCATAGG GCATGTTAAA 1260
GAGGAAGGTA GTGAAAGTGA GATGATGAGG CATCCTGGCT TGAAGTCATC AGTGTGGAGG 1320
TGTCTAGGAA ATCAGTGGCT TAGAGACTTT ATTATTCCAT GTGTAGTATT TTTTTCCCTC 1380
CCTTCTAATT AGCCATTGGA ATTCTAAATT TTCTATTCTG TAATTGGTAA GCAGTTTAGA 1440
AATTCTAGGA GAAAGCTGAA AGAGAAAGTA AGTGTCTCTT GAATAATCTT TTTTAAGAGA 1500
TGGGATTTTA AAATAACACA TATGTTGCAT AGTCTGAGTA CCTTTAGGAA TTTTTTTTGT 1560
GAGATCTTAA ACTTAGGGCA GGAAAACCAC CTCCGGTCTG TCTGACATAG CAGGGACATT 1620
ATAATTGCAG CTGTTGGCAA AAGAGCTCTT TGTTTCACCT GACGGTTTGA AAGAACTGAT 1680
GGGATGTCTG GGCAGAGCAA TACATTTAAA AAAGTGAAAT GAAGCTTGAC AAACTGGGTA 1740
TGTTGAAGCT TGGAAGCCAC AAAGTTCAAA ACAGATACTT TATGAAATTC ACTCTCACAT 1800
CCCCACAATG AAAGAAAAGG AGCCAGAATA TTGGGATTTG AATCCAATGA TGTCAGATGT 1860
GACTCCTTTC TGAGTGATGT GGACTCAGCT GGGGATGCTG CTATGCGGTA GTGCAGGCAA 1920
ATCTGTCGAT ACTGGGTAAT GGTATTTTAA AAATCCTTGC TCCATATACA ATCAGTTTGA 1980
TAAACAAAAG CACTTTTCTT TCTTTAATTG AAAAAAAAGT AGTAAATGAG CACTGTAAAC 2040
ATTTCACAGT AGAGAAATAA AAATTAATGA ACCAACCCAC TCCTAGAAAT GGTTATTGTT 2100
AAGCAGTTGG TGTGAGTCCT CCCAGACATT TTTTCTGTGC CTGTGTAACC ATATCCCGGG 2160
CTAAGACAGC AGGCTCTCAG ATAACACCGT TTTGTTCAAC ATTGTTTGGT TGTAATGTTG 2220
ATGAGAAAAA AATAAATCTA TCCACGACCA AGGCCACTGT GTGAATGGAG TTTGCACTTT 2280
CTCTCCATGT CTACGTGGAT TTTCTCTGGG TACTCCAGTT TCTTCCCACA TCCCAAAGAT 2340
GTACAGGTTA GGTGAACCAG CATGTCTGCA TAGTCCCCAT GTGAGTGTGG GTGTGTGTGA 2400
GCGCACCCTG ACATGGGATG GGTTCCGGCC ACCTGAGACC CTAAACTGGA AACATGGCAT 2460
AAATAATTAA CTTGTTAAGT TGGCAAAATC TCACCAATGC TAAGCATTAT AATTGCTTAA 2520
GTAATTTTCC ATTTCTTCTG GATTCTTTAA TTACATTTTA ATATCTATAT AATTGCTTTA 2580
AGTAATGAAT GTTAAGTGCA AAAATACACC AAGTTAACAA CAGCTACCCT CCAAAATAAT 2640
AATTATCTTG TTTTTATTAA TCTTTCTTAA ATTATATATA GGTAATATTT ATTTCAATGT 2700
TTATTATTAG ACATGTTTTA GGTCTTTAGA AGTTTGCTGA TGTTTTTGTG ACCAGAAATA 2760
TGCTGGAGGA AGTTAATTCT TGTTTATATA AATTAGCCTG GCCGGGCGTG GTGGCTCACG 2820
CCTGTAATTC CAGCACTTTG GGAGGCTGAG GTGGGTGAAT CACTTGAGAT CAAGAGTTTG 2880
AGACCAGCCT GGCCAACATG GTGAAACCCC ATCTCTACTA AAAATACAAA AATTAGCCAG 2940
GCGTGGTGGC AGGCACCTGT AATCCCACTT ACTCGGGAGG CTGAGGCAGG AGAATTACTT 3000
GAACCCAGGA GGCGGAGGTT GCAGTGAGCC AAGATTGTGT CATTGCACTC CAGCCTGGGT 3060
GACAAGAGCG AAACTCTGTC TAAAAATAAA TAAATAAATA AAATTAATTA ATTAGCCTAT 3120
GGTAAAATTA GTCTTGTTAT TCATTTTGCT TAAAGTCCCA GTTTGTAAGA ACCTATAGAC 3180
AACATTAAGT GATAACTTAG CATACACACA CGTAAATGAG ATGATATTCT GCAACTTCAT 3240
AAAATAGTTT CAGGGAAGAT ACATCAGTTG TGTTTTAGGT AATATATTAC CCTTTATTAT 3300
TTATTTATTT ATTTATTTAT TTTTGAGACA GAGTCTCACT 3340