EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS197-05302 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
ZR75-30 
Coordinate
chr12:89738290-89741600 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr12:89740527-89740548AAAAAGAAAGAGAAAAGAAAT-6.07
IRF1MA0050.2chr12:89740521-89740542AGAAAGAAAAAGAAAGAGAAA-6.27
RFX5MA0510.2chr12:89739671-89739687GGTTGCCCTAGTAACC+6.25
SPICMA0687.1chr12:89740280-89740294TACTTCCCCTTTGT-6.47
SPICMA0687.1chr12:89741405-89741419TACTTCCTCTTTGG-6.51
Number of super-enhancer constituents: 23             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00690chr12:89736686-89749897Adipose_Nuclei
SE_25495chr12:89737202-89749426DND41
SE_26301chr12:89738766-89749678Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27644chr12:89739368-89741580Fetal_Intestine
SE_28566chr12:89739453-89741345Fetal_Intestine_Large
SE_30143chr12:89738982-89742175Fetal_Muscle
SE_31980chr12:89739391-89740790Gastric
SE_34489chr12:89739228-89741819HCT-116
SE_35929chr12:89740392-89750597HMEC
SE_38477chr12:89738992-89749161HUVEC
SE_41177chr12:89739166-89741735Left_Ventricle
SE_42423chr12:89739274-89741688Lung
SE_43823chr12:89737701-89749582MM1S
SE_45220chr12:89740269-89741084NHLF
SE_48925chr12:89739317-89741128Right_Atrium
SE_50215chr12:89739271-89741701Sigmoid_Colon
SE_52692chr12:89739104-89741673Small_Intestine
SE_53425chr12:89738103-89741838Spleen
SE_57109chr12:89739987-89741122VACO_400
SE_57109chr12:89741142-89741558VACO_400
SE_67349chr12:89737701-89749582MM1S
SE_67873chr12:89740020-89749518u87
SE_68915chr12:89739205-89740987H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr128973919489741546
chr128974008489740418
chr128974042789740813
Enhancer Sequence
ACATTTCAAG GATATTTTCT TACAGCCAGC TACCACATGA TCTGCCCTGG CTGTATCCTA 60
AAAACCCCCA TCTCCATTAT TTGCTAATTT GCTGGTCAGT TTACCTCTCT TCTTCTGTAG 120
ACCTGCACCA TATATATGTC TTCTGCCTCT CCTCCTTGCT TCTTCACACC CTTCCCCTTT 180
CCCCTGACCC ACCTCCCTCT CCCAGTTTGC CTCTAGGAGG GATAAGAGTG AGGAAGTGAA 240
CTTCTTTGGG GCCAGTTTAG TTGTGTCATC CTGAAAGGGG AGTATGGGCA AGGGTCAGGG 300
TCAGGCCCTA TGCTAGCTGG TAGCCATTTT AGAGATACTT AGGAAAAGTA GTTTTATAAT 360
TTAAGTGCCA ATGGGACCAA GGAAGAGCAA CTTCTCTGCG GAGAAGGAGG ATGGAAGTTT 420
ACCCCCGGTG GACACCTCTC TGACAGCACA CCAGCTGGGG CCTCCCATGT GGCTGTGGAA 480
TTCACATGGA ATTTGGCTAG TCATTTAACC TCTGCTTCCT CCACTTCCTC AGCTGTATAA 540
TGGGGACAGC ATTTCCTAGC CGACATCATG AGACTTTATA AAGGGGAGCA AATACTGATG 600
ACAAGCAGTT TCCAACAGGA AGAGCCAAAG GCTCAAGGTT CAGTTCTGCA GTAACAAGCA 660
CTGGATATGC AAACCTTCTC TAACATTATG TGTCAGGTGT CCCATAAAGG TGGCTTTAGG 720
CTTTATTGGC CTTTCTCTGC CTCAGTTTCC TCTTTGCAAA ATAAAGATAA TAATAGGACC 780
TATCTCACAG AGCTGTTTTG AAGATTAAAT GAGATACAAA GTATAGTATC TGGTACTCAT 840
GATAAATGTT AGTTATTTGT TTCACCTGCT CCGCACCTCA TTTTATCATG TAATAAGTGT 900
CACCAATCCA TGAACAGAAG CTGGAATTAT GAGAGAATCC TAGAATGGGA GGTAAAAACT 960
CCCTCATTTT TACAGACAAG AAAAAAGAAA TGCGGTAAGA TTGGGTGCCC TGCCCAGGGC 1020
TACCTGATTC ATTAGCAAGA AAGCAGCAGC TACAGTTCAG GTCTCCTAAT TGTCAAGGTT 1080
GGTGCAAGTC TCAGTTTTCA TTCCTTTGAA GACTGTGTTG GTATTTTTAT CCCCAGATAA 1140
CCCTTTTTCA TTCCTATTTT AACGCTAAGA CCAGTTCATA CTATTAACCA CTGCAATCTC 1200
TGTCTCCTGC AGCTCCCAGG AAACCTGCTG ATAACCTCCC CTTCCCAAAA GCCATACCCC 1260
ACCCTACCCC CCTGCCCCTG CAAAAGGCCA GGAAAGGTAG CGCTTTCTCA GAGACCTGAG 1320
GAAGCTACTA ATGGGGACAG CAGGTGAGGA AGGAGGCGGT GGAACTGCAG CTGCTGGCAA 1380
AGGTTGCCCT AGTAACCGTG CGGGCTCCAT TCAGGAAGCC AGCCCAACTC CAAGATGCAA 1440
AATGATCGCC TTCACGCGGC TACTGCAAGC ACAAAGGAAC CAGAGGAGCC CTGATATAGC 1500
TGGAAGAAAG GGAGGCACAG AGAGAGGTGG GGGCCCATGC TGTCAGTTAC AACCTTCCAC 1560
CTTCCACAGA AGAAAAAGAA GGAAAGAGAA TAGCTCTTTG AATCTTCTGG CCTATGTGAA 1620
CCGTAAAAAC CACCCATTTA ACATGAGTCC TTTGGTGAGA ATAGAGGGAA ACAGGCACCC 1680
CTCTGTTCAC CAGCCTTCTG AAACAATATG TCAGGAGAAG GGGGAGAAAC CTCAAACATT 1740
GCAACTTTAT GGAGGCTCTA AGCTCTTCAT ACTCTCTCTC TCCTTTATTC AGACTGGTGA 1800
CAAAGACCAT TTGCTCCCAA TTTATTGGAA ACTTTTTTTT TTTTCACAGC TTGAGCTGCT 1860
TAGATGCAGC GAGCTCCCTC TCCCCAAATT GCAGTCAGAC ACTTGCTGAA TGGGCCAGGC 1920
TCAATTATGC TCCCTCCACA GGTTCAGCTC ACACTGTGAC CCTGCATGGC TTCCTGCTAT 1980
TCATATGTGT TACTTCCCCT TTGTGGTAAT GGCTTGTGGC ACTTAGCCAG AAAACATTAT 2040
TAATTTCAGA AGTGGACTGA CAAACAACAA ACCCACAGTA AAACGAGAGG AAGTGCTGGG 2100
GAGGCCAGCT GTCGGCTTGA GCCAAGCAGT AGGAACTCAA TGTATGCAGG TTCTAGGAGG 2160
AAAGAGATAA TAATCCACAA AGAGGAAATG CACTAAAATT ATCCACAGCC CATATTTTTT 2220
TAAAAAACGA AAGAAAGAAA AAGAAAGAGA AAAGAAATCA GAGAAAAGAA AGGGGGGAAA 2280
AGCACCCAGC TACTTGAGCT GCAGCTGGAC AGGAAATTGC TAACGCTGCT TGCAAATCCT 2340
TACTTTGAAC AGGCAGTTTA GGGAATGCCA GGAGCGGAAA CCGTTCAGAA CTGGATTAAC 2400
ACGAGCCAAG TTGAACTGCA ATCCACTTCT CCTTTCTGTG CTCTTGCTGA CTTGGGACAC 2460
CCAAATAGGA CAGACTGACT TGGTATATAT ATATATTTGC ACTATTTCTG TTTGCTTTTT 2520
ATACTTAGTT GCTTAAAAAT CACCATGGAC AGTTTTATAT GATTGCCATC GAATGAAGGC 2580
CACTTGCCTC CTAAGTTAGT GTAGACGACC AAGCAGTCAA CTCATGTGCC ATGTAGGTGA 2640
AAAGCTCATT CTTCTCCCCA CTTCACATGA AGGGACTGAG CTCATGCAAA AAGAGCCCCA 2700
AATATAAGTA CGTTCTAGTT CTTTTGATTC CATACACCTG CCTTTTATTT TGGTTTGTGT 2760
ATTTTTACAT TTGAGGTAAG GAGAGGGTAG GTCCCAAGAA AAATGGCAAG ATATAAAGTC 2820
TTTAGCTTGA AAAGAAACTA AAATAATCCC CACAAGTTTC AATAAGGGTT TCTGACCCAC 2880
ATCCCAAGCC AGTTAAACAA AAAAGCACAT TACAACAGGG ATGACAAAGT TGCCTCCTAA 2940
GTGCCAATGT AAAATTCTAA AGCCATATCC TGACACGGTG AGGAAGCTTA GATATGCCTT 3000
GCCATGCGCA TGCTAGGGGA AAAAGTGGAG ACATCATTCT GGATTCAGCA TTCTCACACT 3060
AGGATATCTG CAGGTAGAAT TGCCCATGAC AACAGACTGG AAAAAGAATT ATCCCTACTT 3120
CCTCTTTGGC ATTATCTCAG CATTATAAAG CAGAAGATCC TGACAGTGAA GGATAGGGAG 3180
GAGGTTAACA TGTGGCTGTC ATCTTGGTAT TCTGCTACAC CTCTCTGTGG TTAATATCCA 3240
AATTGTATTC CTCAGCAAGC TATGCTCTAT AGGTTCATTT TTCTTCAGGG GCTTTAAAAT 3300
CTTAAGCCGG 3310