EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS195-02427 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
VCaP 
Coordinate
chr15:93351440-93355850 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr15:93352488-93352507CAGCCGCCAGGGGGCAGCC+6.31
FOXA1MA0148.4chr15:93354564-93354580TCTTGTTTACTTAACG-6.84
HNF1AMA0046.2chr15:93352268-93352283AATTAATAATTAAAT+6.58
Klf12MA0742.1chr15:93353942-93353957GCGGAGGGCGTGGTC-6.05
PHOX2AMA0713.1chr15:93352274-93352285TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr15:93352274-93352285TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr15:93352274-93352285TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr15:93352274-93352285TAATTAAATTA-6.62
YY1MA0095.2chr15:93352620-93352632CAAGATGGCGGC+7.22
Number of super-enhancer constituents: 98             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00699chr15:93350382-93355263Adipose_Nuclei
SE_02552chr15:93351321-93354597Astrocytes
SE_03406chr15:93350992-93351943Brain_Angular_Gyrus
SE_03406chr15:93352538-93354537Brain_Angular_Gyrus
SE_03406chr15:93354610-93355246Brain_Angular_Gyrus
SE_04213chr15:93350937-93355562Brain_Anterior_Caudate
SE_05294chr15:93350768-93355754Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06531chr15:93350669-93355592Brain_Hippocampus_Middle
SE_06939chr15:93350714-93355992Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08169chr15:93350930-93352317Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08169chr15:93352502-93355632Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08934chr15:93352512-93354443Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09652chr15:93349955-93354866CD14
SE_10533chr15:93351009-93354773CD19_Primary
SE_11607chr15:93350814-93355778CD20
SE_12070chr15:93350988-93355082CD3
SE_13564chr15:93350781-93355924CD34_Primary_RO01536
SE_14477chr15:93350583-93355909CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15588chr15:93350907-93354429CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16031chr15:93351298-93355362CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16747chr15:93351476-93354037CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17069chr15:93350870-93355124CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17547chr15:93350914-93358846CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18103chr15:93350647-93355857CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18547chr15:93350654-93355466CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19553chr15:93350633-93355417CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20693chr15:93350970-93354657CD56
SE_20859chr15:93350648-93355761CD8_Memory_7pool
SE_21781chr15:93351598-93354459CD8_Naive_7pool
SE_22279chr15:93351135-93354892CD8_Naive_8pool
SE_22966chr15:93351217-93355222CD8_primiary
SE_23716chr15:93351127-93354525Colon_Crypt_1
SE_23716chr15:93354773-93355281Colon_Crypt_1
SE_24264chr15:93351235-93353574Colon_Crypt_2
SE_26010chr15:93350804-93355497Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26840chr15:93350743-93354513Esophagus
SE_26840chr15:93354714-93355296Esophagus
SE_26840chr15:93355388-93355992Esophagus
SE_27996chr15:93350943-93355551Fetal_Intestine
SE_28970chr15:93350776-93355741Fetal_Intestine_Large
SE_29703chr15:93351018-93355815Fetal_Muscle
SE_30995chr15:93350936-93355586Fetal_Thymus
SE_31921chr15:93351112-93354423Gastric
SE_32877chr15:93352538-93354900H1
SE_33509chr15:93350953-93356085H2171
SE_33848chr15:93350818-93352457HCC1954
SE_33848chr15:93352527-93355881HCC1954
SE_34564chr15:93350755-93353970HCT-116
SE_34679chr15:93343662-93356193HeLa
SE_35377chr15:93350917-93355359HepG2
SE_36003chr15:93351053-93356046HMEC
SE_37354chr15:93351059-93355124HSMMtube
SE_39112chr15:93351110-93355282IMR90
SE_39970chr15:93350921-93354700K562
SE_39970chr15:93354710-93355903K562
SE_41310chr15:93350936-93354495Left_Ventricle
SE_41310chr15:93354780-93355979Left_Ventricle
SE_42600chr15:93350773-93354539Lung
SE_42600chr15:93354778-93355290Lung
SE_42600chr15:93355305-93355924Lung
SE_43471chr15:93350846-93352419MCF-7
SE_43471chr15:93352547-93355811MCF-7
SE_43659chr15:93351234-93355573MM1S
SE_44673chr15:93350972-93354914NHDF-Ad
SE_45291chr15:93351064-93353833NHLF
SE_47211chr15:93346289-93355941Panc1
SE_47960chr15:93351302-93353578Pancreas
SE_47960chr15:93353817-93354264Pancreas
SE_48549chr15:93350767-93354450Psoas_Muscle
SE_48549chr15:93355302-93356055Psoas_Muscle
SE_49286chr15:93351031-93354449Right_Atrium
SE_50492chr15:93350994-93354648Sigmoid_Colon
SE_50492chr15:93354694-93355208Sigmoid_Colon
SE_51268chr15:93350138-93355727Skeletal_Muscle
SE_52184chr15:93351272-93351908Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52184chr15:93352090-93353925Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52822chr15:93351139-93354533Small_Intestine
SE_53626chr15:93350055-93354623Spleen
SE_55179chr15:93351149-93354451Thymus
SE_56153chr15:93350977-93355800u87
SE_57089chr15:93351141-93352494VACO_400
SE_57089chr15:93352542-93354015VACO_400
SE_58215chr15:93351274-93352463VACO_9m
SE_58215chr15:93352576-93353598VACO_9m
SE_58215chr15:93353610-93354109VACO_9m
SE_58414chr15:93350819-93397613Ly1
SE_59292chr15:93350909-93397284Ly3
SE_59816chr15:93351073-93397403Ly4
SE_60705chr15:93340495-93393151DHL6
SE_61142chr15:93340330-93400291HBL1
SE_61602chr15:93347024-93408751Toledo
SE_62387chr15:93344538-93393491Tonsil
SE_63974chr15:93351225-93353925HSMM
SE_64371chr15:93350953-93355902NHEK
SE_65898chr15:93350806-93353833Pancreatic_islets
SE_65898chr15:93353894-93356264Pancreatic_islets
SE_67338chr15:93351234-93355573MM1S
SE_68639chr15:93350938-93376211TC71
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr159335482493354998
Enhancer Sequence
GTCCTCAGAA TTTCCCATTT AGAAGGTCCG GGATAGACTC CTAACACTGG CATTTCCAAC 60
GAGCTCCCCG ACATTGGAGA TGCTGCCTGG CTGGAGGACT ATCTGAGAAC CTCAATGTCT 120
AGTGGAAACT TACGTGCCCT CGATTCCAAC CAGGCTCTAC CCCATGAACA AATTACTCTT 180
GCTGAGCGCC AGTGTGAGTA GAAAGAGCTT CCATATCAAA GGCTGCTAGG AGGATTACCT 240
AAGATAACGC AGGCCTTGCT CAAGACAAAC GTTCAGGAAA TCAAAATCGG TTTGGAGATG 300
AAATGGGAAA GACAAGAGCA GCTCCAAGGA GAGAAGAACG TCCAGAAAAC CAAGAAATAG 360
GACTGGTAAA GGGTGCTGAC CAGGTCCCTG GAGCTGCACC CCGCCCCGTG CGCCTCCCCA 420
GCCCCCCGGC CGCACCGTGC CCACCCCGCG CTCGTCGTCC CCCTCGCCCC CAGCGCCACC 480
CTGCACTGCG GACCCGGGAC CGCCTGGGAA ACGCCCTGGT CTGACATGGC TTGGGGCTCT 540
GGGCAGAAGC CAGGTCTGAA AACCAAGGTT GGGGCCTCAT GTGTTAGTCT GGAAGCACCA 600
AGCACCGCAT ACCAAAATAC CTCGAGGCAA CCGTATGGCT TTTTTTTTTT TAATTAAGTT 660
GTTCCCGGGC GGTGGCTCAC GCCCGTAATC CCAGCATGTT GGGAGGCTGA GGCGGGCGCG 720
TCCCTTGAGC ACGGAAGCTG AGGCTGCAGA AGGCTGTGGT CGCGCCACTG CACTCCGGCC 780
TGGGGGACAG AGTGAGCCCC TGTCTCAAAA ATATAAAACA AAATAAAAAA TTAATAATTA 840
AATTAAATGT GTGTAAACAT GTAGGTGACC TTCTAGCCCT CGGTGAACCA GACTAAAAAA 900
CGCTCCCGCA CTAGGCGTGG TGCCCGGAGC GGCCCCGCCC TCGGAGCACG CTTGTGCGCC 960
AAGGCTGGTG GCGGAACGCG GACGTGCTGC AGGCAGGGAA TGAAATGGCG GAGGAAGGCG 1020
GGGCAGGGCG CGGCCGGAGC TCCGCGGCCA GCCGCCAGGG GGCAGCCGCG CGTCTGCGTC 1080
CCGCGGGCGG CTAGAACCAG TCCTGCCGGA AGTTGGGGCG GTGCCTTCGC TTCCGCGGAG 1140
CCGTGCCACG TGGCCGGCCC GGAGGGACAG GGGAAAACAA CAAGATGGCG GCAGCCGGGG 1200
GCGGGGTCAG CCCGGCGTCC CTGAGGCTGC GAGCCCCTTA AAGGGCCGCG TTCGAGGAGC 1260
CGGGCGAGAT GAACTGAGTG GTTTTACCCA GCCGTGGGGG CTGTTCGACT GAACATGGGC 1320
CTGGGCGGGG ACAACCGCGC CAAGCGGACG CGCCCTCCGC CTGGTCGGAG TTCATCGACC 1380
CAGGCCCTGC GGGGAATCCC GCGGCGCAGT TCCGCAAAGC TGCCAGCGTG CTTACCAGTC 1440
GGGGCCCGTT TCTTTTGTCT CTGCGTTTGC TGCTCCGTGC AAACAAGGAG GACAGAAAAC 1500
TCTTTATCGT GGCGTTTTCT TCCTGAGCGA GAGATTAGGT TGCTGCAAAT CCAACGAGGC 1560
GAGTCCTCTT GGATCGAATT AATGCATTGG CTCTTCCCTT CGCAACAGCT TTGATGACCG 1620
TTTCCCGCCT TTGTGCAAAG CGTTAGAACA AACCCTACCT TCCTCCAAAC GAAGGAGAAA 1680
AATCTCAATG ATCTGGGTTT TAAAGTACCT TCCCCGCCCT GTCCAAATGC TGGAATTTTT 1740
TTTTTTTTTT TTTTTGACGG TAGATGGGAG CTGCCCTAGG ACCTTGAATG TGTGCTAAAA 1800
TCTGAAATTC TGTTAATTTA TATCAGCCAC CTTGGACACC TTTTCAGGAA ATAAACATTT 1860
AGACATCGGT CGCTGTGTAT TACAAAATGC AAGAAATAAA GCACAATCGT CAAGTGCTGA 1920
AGGCCCACAG CTTCCCCTTC GTGTCCACGG ATCTAGTGCT GAAAGACAAA CCCTTTGACT 1980
CCGCCGGGGC AGTTGGTCCA GGGTCCATTT TCATTTCTCA CCGTTTTTGT TTTACATGAG 2040
TTTGAGATGC AAAAGAGCCG GTGTGGGTAA AAATAGTTAA CCCCAGCTAC TCAGAGTGTG 2100
ATGGTATATT TAGAATAAAG GAGACATTTG TCCTTGGTTT TATTTATAAA TGTGTCATCT 2160
TACATTTGGG ATTCGGATTC TCTCATGCTT GCTAAGAAAT TTGTGAGGCC ACTGGCATGT 2220
TTCTGAAATG TGACCTTTTT CTTGCTTATT TAAAACAAAA TAGTAATACT TGCCTCCCAA 2280
AGGTTTGGGA GGTTAATGTA ATCAAAAAAA AAAAAAAAAG CCTGAATGTA ATAAGGCTTC 2340
CAATGGAGGG CACACGACAG TGACAGCTGG GGAAAAGACA TTATTTTCTT CATGAAGAGA 2400
TCCCTTATGG TTTCTTCGGG CTGGTAGGGA TTTTTAACAC CTGTGCTGTG ATCAAAATTG 2460
TATTACTATT AATGGTATAA TGGTGTAATG TGAAGGGGGG CGGCGGAGGG CGTGGTCAAG 2520
CCTTCTATTA TAAGGCTTAA GGGTGGATTT TTGACCCAAT CAGAGGTTTA AGAGAATTTT 2580
CCTTTAGCCA CTCCTTTGTG TATCCATGCC CTCTGAGGCT TCACTTCAGA CTCGTCCATC 2640
GTTTGGCAAA GAAGCGGTGG AAAGAGTTTC TAAAGAATCC TTTAATCTAG AAAGGTCAGG 2700
AACCCTCCCT CCCCTCAGTC TGAGAAAAGA ATGCAACTTT CCTTCATAGC ATTTCCTCCA 2760
AAGGACCCTG CCCCATTTGT GTCCTTATAG TTTGCAGTGA CTACCTCCTT TTTTGTCTCA 2820
TTTTGTATAT ATGGTTCAGA TAAAATATCG GACAACTTTT TCTGCAAATG CCATTGGCAT 2880
ACCGGAGCAC AAGCTTCAGA GTACAGCCTC AGGTCTTAAG TTGTCTCCAG ACTTTCATTA 2940
ACATAGGCTT CCTGTTACAA AAGAGAAAAT GTATTTTAAA TTTTAAAATA CCTTATTCTA 3000
AGAACTTCAG TTAAAAAAAA AAGAAAAAAT TTAAAAGAAC CCATACTCTA ATAATGCAGT 3060
CACTCGTTCT TAGACTAGAC TTAAGTTTGT TTTGGGGGGA TTATACTGTG TGTACAATTT 3120
GTTATCTTGT TTACTTAACG TTTGGAAATT ACTGTTATAT TTCATATTAC TGAAGCAAAT 3180
TGTGCTCAAC AGAAAACATG AAAAATACAA AGAAAATCAC CCAAAATGTG ACTACCAAGA 3240
AATAACCACT ATTAAGCTAA TCATCTGTAC AACTGTATTT GTCTTAAAAT AATACTAGAC 3300
ATAGTTTTAT AACCTACATT TTGTATTTAC GTATAATGTA CTTTTTTATA TCAGTAAGAA 3360
TTTTCATGAG TTTTACAGTC TGCACAGTAT TCCAGCAGAT GAGTATGCCG TAGTTAACCA 3420
TTAACAGTTC TCTTATTGGA CACCAGATTT GTTAAATAGG TTTTGGGTTT TGTTTTGTTT 3480
TGTTTGAGAC AAGGTGTTGC CCAGGTGAGA TCATAGTGCG CTACAGCCTA AAACCCCTGG 3540
GCTGAAGCAA TCCTCCAGCC TGAGCTTCCC AAGTAGCTGG GACTACAGGC ACAATATGCT 3600
GTATGCAGCT CGTTTTTTGC TTCTGTAAAT AATGCTGGCA TGAACATTTT AATAGAAAAA 3660
GTTTTGTACA GATTTCTGTA AAATAAGATT TACAATGAAT CTTTTAAGGT TTTTTGATAC 3720
ATATTTTAAC TCTCCAAACC GAATTGTTAA TTGTATTGCC TCCCCAACCT AGCTCATGTC 3780
CTAGCTCAAC TTTAATTGCC CTCACTCTTC TAAATTGATA TTGGTTTTTT AATGAAAATT 3840
GTAAATTGTA TATTCTCTAT GTATTTTTTT ATATGCATGT GTGTCCAATA AATACCGGAC 3900
ATGGACATTA ACTTCAAGTT AAATATTTAA AAGGACTCCT TCACCGTCAA CCTGCTTAAT 3960
ACACGGAAAC CTGTTTTTCT TTTTAACTAG TTCATTTCTA TGTGGAGATG TGAGGCAAAG 4020
GAAACTAATT GCTAAAATTT TCTTTCTGAT GTGCAGCAAG GATATAAACT TTGCCCTAAA 4080
ATTATTTAAG TGTAAATGAA CGTTTGGTTT TGTTGTTTGT TTGGTTGTTT GTTTTTGAGA 4140
TGGAGTTTCA CTCTTGTTGC CCAGGCTGGA GTACAATGGC GCTGTCTCGG CTTATTGCCA 4200
CCTCCACCCC TCTGGGTTCA AGCGATTCTC CTGCCTCGGC ACCCGGAGTA CCTGGATTAC 4260
AGGCGCGTGC CAACATGTCT GGCTTGTATT TTTAGTAGAG ACATGGTTTT TCCACGTTGG 4320
CCAGGCTGCT CCCGAACTCC TGACCTCAGG TGATCCACCT GCCTCAGCTT GCCAAAGTGC 4380
TATGATTACA GGTTTGAGCC ACAGTGCCCG 4410