EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS193-29232 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
U87 
Coordinate
chr5:172216040-172217480 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr5:172216841-172216851GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr5:172216841-172216851GTCACGTGAC-6.02
Foxo1MA0480.1chr5:172216800-172216811TCCTGTTTACA+6.62
MITFMA0620.2chr5:172216837-172216855TTTGGTCACGTGACCAGG+7.51
MITFMA0620.2chr5:172216837-172216855TTTGGTCACGTGACCAGG-7.51
USF1MA0093.2chr5:172216841-172216852GTCACGTGACC+6.14
USF1MA0093.2chr5:172216840-172216851GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr5:172216837-172216853TTTGGTCACGTGACCA+6.92
USF2MA0526.2chr5:172216839-172216855TGGTCACGTGACCAGG-7.86
ZNF263MA0528.1chr5:172217273-172217294CCCCTCACCTCCCACTCCTTC-6.34
Number of super-enhancer constituents: 41             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00085chr5:172214644-172229976Adipose_Nuclei
SE_00782chr5:172216455-172216630Adipose_Tissue
SE_00944chr5:172215631-172217600Adrenal_Gland
SE_01555chr5:172215762-172224185Aorta
SE_02948chr5:172215846-172216870Bladder
SE_06342chr5:172215482-172218030Brain_Hippocampus_Middle
SE_09165chr5:172215673-172217461CD14
SE_12666chr5:172216483-172216881CD34_adult
SE_13477chr5:172215269-172217489CD34_Primary_RO01536
SE_14398chr5:172215046-172217632CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20749chr5:172215061-172217545CD8_Memory_7pool
SE_23118chr5:172215755-172217592Colon_Crypt_1
SE_23781chr5:172215830-172217492Colon_Crypt_2
SE_24715chr5:172215796-172217459Colon_Crypt_3
SE_25789chr5:172214987-172217393Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26519chr5:172215740-172217497Esophagus
SE_27813chr5:172215018-172217790Fetal_Intestine
SE_28860chr5:172215565-172217673Fetal_Intestine_Large
SE_29599chr5:172215741-172217481Fetal_Muscle
SE_31376chr5:172215042-172217563Gastric
SE_34653chr5:172215548-172218880HeLa
SE_36923chr5:172215717-172217597HSMMtube
SE_39983chr5:172215099-172217642K562
SE_40610chr5:172215615-172217603Left_Ventricle
SE_44768chr5:172215933-172216771NHLF
SE_47360chr5:172214984-172218047Panc1
SE_47554chr5:172215467-172217196Pancreas
SE_48206chr5:172215171-172217650Psoas_Muscle
SE_48563chr5:172215545-172217647Right_Atrium
SE_50124chr5:172215033-172218035Sigmoid_Colon
SE_51114chr5:172215289-172217459Skeletal_Muscle
SE_52338chr5:172215039-172217580Small_Intestine
SE_53284chr5:172215022-172219655Spleen
SE_54705chr5:172215772-172217309Stomach_Smooth_Muscle
SE_55249chr5:172215856-172216271Thymus
SE_55249chr5:172216272-172216947Thymus
SE_55716chr5:172215847-172217417u87
SE_61533chr5:172191523-172278016Toledo
SE_62363chr5:172184582-172235488Tonsil
SE_65260chr5:172214988-172217577Pancreatic_islets
SE_67508chr5:172215847-172217417u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr5172216221172216413
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH05I172787chr5172214436172231054
Enhancer Sequence
CTGAATCTGT GAGCTGAAGC CCACAGGGCT GAGCTGCTGA GCCCTCCAAA ACCCCTTCAA 60
AAGTCCCTAA GCTCGGCAGC CTGGATCCCG CCGTGGGTTG TGGTAACAGA AAAGCTGGGG 120
AGGCCCTGTG GGATGGTGGC ACTGGTGGGG GTTGGGGGTG GTCCTGGGTT CCCGAGTCAG 180
CTAGCCTTGG AGCTCCACTA GATCACTAGA TCAAGGTCGT GGAGACAAGT CATTCTAGTG 240
ACCTCACACT GACATAGCCA CCAGGCCCCG CCTCTGGGTG TTTCAGAGAA AACTCCAGGC 300
AGCGGTAGGA GAACGCTCCA AGGGCTGTGT TATCTAGGGT AAAAGCCACA TGACACTCTG 360
TGAGGGCCAG CTCAGGGTCC TTGGGCTGCT GATAGGGACA CCAAGGCTAG GCTCAGGGTC 420
CCTTGGTGCT GGTCCTAAGC CACACAAGCT CCTGAATTTT AGGACCCTGA AATTCATGGC 480
ATCCTGAGGC CCGGCTCCAC TCTGGCACCG TCCTGGGACT CTGCCTCAGG CTCTCCTGGC 540
TAGACACAGA GCAGAAGCCA GGTAACTCTA CAGCCTAAGG AAGACCCCCA GGAAACCTGA 600
AGCATGGGGA AGCGCTAGGA AATCCCTGCT CCAGCCCTAA GCCTGTTGGA GCAGGGTCCT 660
AGCAACTGCT TCCCCAACCA GAAGCATAGC ACCTGCCAGG CCAGGAACTT AAGAGAAATG 720
AAGGCCTCCC CTAATCCCAG GGAGGCAATA CTATTATTTC TCCTGTTTAC AGACAAGAAC 780
CCTGGGGCTG AGAGCCATTT GGTCACGTGA CCAGGGCCTT CCCTGCAGAA TGGGCAGAGC 840
CAAGTCCCCT GACCCCAAAG TGCAGGCCTC ACAGTGCTTT CAGAGTGCCT GAATGGTGGA 900
GGGGGCTGAG GGCTTTCTTC CCAGCCCTGG TCATCTCGCC CCAGGCCTCA GCTGTGGGCA 960
TCTACCCAGG AAGGCCAGGA GAGGCAGGCC TGAAGAAGAA TCTGGAAGGA GGAGGTCCAC 1020
CATGGGGCAT CAAATACTTC ATTTGTATGC TGAGCCAAGC TGGGCTGGAG GCCGGGGGCC 1080
CCTCGAGGGC AAGCCTCTGG GCCGGGAGCC AGGCTGACCT CTGCCCACTG AGGCCAGGAT 1140
GAGTATGTCC TTTTCTGCCT CCCTCTTTCT TAGAAGTACT CTCAGCCCAG TACTTCCTGA 1200
GATTTCTGCT GCAGTGCCAA GCAGCCTGCT TAACCCCTCA CCTCCCACTC CTTCCGAGGC 1260
GACTCAGAAC CCAGAGGGGA AGGGTCAGAG GTGTACAGGT GCCCAGGGGT TCCAGGGAAA 1320
GAGAGCATGC ATCCGGGACC CTGGAGGGCT CTGTTTCAGC TTCACCTCTT AGCCTATGCC 1380
TTAAATGGAC CACTTCACCC CTCAGAGCCT CTTCAGCTTC AAATGGAGTT TGGCGATGAC 1440