EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS193-23624 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
U87 
Coordinate
chr3:71544340-71547050 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs11720523chr371545170hg19
rs6798507chr371547039hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr3:71544391-71544406TAGGGACAAAGGCCA+6.03
IRF9MA0653.1chr3:71545613-71545628AGTTTCGTTTTCATT-6.41
JUND(var.2)MA0492.1chr3:71545331-71545346ATGGATGAGGTCATG+6.02
MEF2AMA0052.3chr3:71546072-71546084TCTAAAAATAAA+6.07
ZfxMA0146.2chr3:71545732-71545746GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02329chr3:71544583-71548169Astrocytes
SE_09191chr3:71541698-71547451CD14
SE_10856chr3:71540154-71553996CD20
SE_12176chr3:71540131-71545864CD3
SE_16818chr3:71544701-71546060CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17460chr3:71525976-71548622CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18589chr3:71531889-71546927CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_21547chr3:71535178-71547083CD8_Naive_7pool
SE_21991chr3:71531907-71547304CD8_Naive_8pool
SE_45920chr3:71543874-71548507Osteoblasts
SE_58320chr3:71535686-71635865Ly1
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I071492chr37154163471548550
Enhancer Sequence
ATGCCATGAG CCCATTCTTT ACACAACTGG TCCCTTCTCA GTACTGGGAC TTAGGGACAA 60
AGGCCACTTC AAAAAGCTTG TCCTGCCCAC CTACTTAAGT TAGGTTCCAA GTTAGTCTCA 120
ATTATATCAT CCTATGTGCT TACTTCAGAG CTTTCGCCCT GATCTATTTG CTCATTTGTC 180
TTCCCCACTA GAATATAAGC TCAATTAGAT AAAAGAACTA TTTCTTTTCA TCGCAATGCT 240
CCAAAATTTC AGAAAAATGC CCAGCTCATA GCAAGTACTC AATATGTATC TTTTGAGTGA 300
ATAAATGAAT CAACAACTGA AAGAAGTAAC TTTTCGGTAC TCTCTAAAAA TATAATTGCC 360
ATTTGTTGAA AACTCATTAT GTACTGGGTA TTGTTTTAAG TCTTTTATAA TCATTATTTC 420
ATTCTATTCT TACAACAAAG TTCTTAGCAG ATATTATTAT TTTAAACTCA ATATGTGGAT 480
AAGAAAACTG AGGCACAGGG AGTTTTAGCA GCCTGACTCA ACTCTATAAA GCTTGTGCCC 540
ATGGGAACTC TATATTTTCC AGCCAATACC CTAATATAAA AGTCCTGAGT TTTTGTGATA 600
TACCCTTCTG ACTCAGGCTT GCTCAAGTGA ATTTTGGCAC TACCTGACCA TGCTGGTACT 660
AACAATCATG GGCCACATTT TGTAACAGGC AGGTAATGCA AATGAGCGAG GAAGGCCAGG 720
TGTAAGGTAA CAGGGAGAGG GAAGGAATGT GGCAAGCTGA GAAATCCTCA CTTTATCAGC 780
TTCAAGGGGG AAGCCATTGT ACTTCCCCCT CCAATTACTG CCACATGGGC ACATACCCTC 840
AAGAACCTCA AGAGCTTTCA ATTCTACAAA TAAAGGCAGT AATCTAGATT TCTATTTAGT 900
AAAATTCCAG AATTTTTCAA AGATGGCAGC TAACTTTTTA AATAAGTTAT ATTTAAACAA 960
AACAAACATG TTGCAATCCC TGTAGCAAAG GATGGATGAG GTCATGCACT GTCTCCAGTT 1020
TTATGATTCC AGAGTGATTC AGAAGCACAG AGAAGCAGTA CGGGTGACAC AGAAAAGCAC 1080
AGTAGGTGTC TGGGCAGATA AGAGCTTTCT AGAAGAATTC ATTATCTTGA GGTTTTGGGA 1140
GGAATTGGAA GATTGGGTGG AAAACGCATT TCACAGGTCA GAATATCATA CTCGAAGGCT 1200
TGGGGGTGAG GAGTAGGCAA GTCAACAGCA AAGATCAGCC ATGAGGAGAG GGCTGGTGGA 1260
GGTTTCCTGT GGGAGTTTCG TTTTCATTCG GACTGGAGTG AGTAGCAGCT TTCTAGCTAA 1320
GACATAAATC GGTTAAACAA TACTCTATGT GGCCGGCCAC AGTGGCTCAC GCCTGTAATC 1380
CCAGCACTTT GGGAGGCCGA GGCGGGCGGA TCACGAGGTC AGGAGATCAA GACCACACTG 1440
GCCAACATGG TGAAAATCCC TCTCTACTAA AAATACAAAA ATTAGCTGGG TATGGTGACG 1500
CCAGCTACTA GGGAGGCTGA GGCAGAAGAA TCGCTTGATC CAGGGAGTCG GAAGTTGCAG 1560
TGAGCTGAGA TTGCGCCAAT GCACTCCAGC CTGGCGACAG AGCAAGACTC TGTCTAAAAA 1620
AACAAAAGAA ACAAACAACA ACAACAAAAA GACAAAAAAA AACAATGCTC TATGTGTATG 1680
GTCATTAGTG CTGTCTTATT TGACTTCTAA TATTTTAAAG TAACCAGGCA TATCTAAAAA 1740
TAAAGGGTGA ATCACCACTG TGGTGTGTGG AAGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTGTT 1800
AAGAATTCAA CAGTCACAGG ACTGAATTCC ATCTTCATGG AACCCCATAG CTAACTAAAA 1860
TACTTAACTG TTCTGAACTC TAGACATAAA AAAATACAGC AACTGAAATT TTTAAAAATA 1920
CCAGAAGATA GATACCCAAA TAAATTATCC TTTCCACAGT ACAGAGGCAA AAACAAAAAA 1980
GAAAAGAAAA AAATGACAGA AACCCCCACC CGCCTACGTA GAATTGTATA ACTAGAAAAA 2040
CTATCTCTTA AAGCTGAGGG TGAAATAGAA GCTTTTTCAA ACAAACAGAA GTTTATCACC 2100
TCTCTATAAG GACATTCTAA AAGACTTACT TCAGACCAAA AAGAAACAAT TTCCAGGAGA 2160
AAGTTTTTTG ATTTAAGAAG GTAGGGAACA GCCAACTTGT GAAGTAGAGT AAGTGAAAAG 2220
TAAATGCACT AACAAACAAT GTGCAAGTCT CAAACATTTT TTTAAAATGT AGCAGTACCC 2280
CCACTTGCTT TCTACCCCAG CTCACGGTAT TTACACTGTA GCAATATCAA TCACCAAGGC 2340
CATGGACTGC AAATGTGAGT GTGCAGGGAG GCACCAGCTT GAAGCCCAAG TTCCCACCCT 2400
CCATAGTCCA GAGATTCTTA AACAAGTTCC AGGAATCTGC TGTTCTACCC AACAGATACC 2460
CCAGGTAACT CTGATAAAGA TCTGAAGAAC ACTGCATTGC TCTCTGACTA CTTTAGGGGA 2520
AGGAATTATT CAGTGAACCC CCAGGGGCTC ATCCCTGGGA GGCTCCAGCT GAGAACACTA 2580
TCAAACCTTT GTTCTTTTCC ACTTCACTAC AGCCCCAGAA GTACCTTGGC CCAGGAGGTC 2640
AGCAGTAACC CTGCCTCAAC CCTGCTAATC AAGAGCTGCA ATAAATTAAA AGCCCATTGA 2700
AATATTTTAG 2710