EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS193-03095 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
U87 
Coordinate
chr1:218669030-218673450 
SNPs
Number: 4             
IDChromosomePositionGenome Version
rs1015275chr1218670141hg19
rs622912chr1218670357hg19
rs72738842chr1218672807hg19
rs11118112chr1218673257hg19
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXH1MA0479.1chr1:218673425-218673436TGTGGATTGGA-6.62
Foxd3MA0041.1chr1:218670944-218670956AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:218670948-218670960AAACAAACAAAC-6.32
IRF1MA0050.2chr1:218672251-218672272AAGTGCTTTCTCTTTCTTTCT+6.35
NFAT5MA0606.1chr1:218672400-218672410AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr1:218672400-218672410AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr1:218672400-218672410AATGGAAAAT-6.02
NFICMA0161.2chr1:218670753-218670764TGTGCCAAGTA-6.32
STAT1MA0137.3chr1:218671728-218671739TTTCCTAGAAA-6.14
TCF7L2MA0523.1chr1:218672834-218672848TTCCTTTGAAGTTG-6.16
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02323chr1:218668940-218673595Astrocytes
SE_34115chr1:218670708-218673590HCC1954
SE_36549chr1:218669094-218673670HMEC
SE_37059chr1:218667317-218675140HSMMtube
SE_38564chr1:218669211-218673648HUVEC
SE_45788chr1:218669012-218673879Osteoblasts
SE_51738chr1:218669025-218673706Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_56115chr1:218667886-218673684u87
SE_63527chr1:218668917-218674335HSMM
SE_68133chr1:218622758-218673720TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1218671355218673056
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I218493chr1218667158218673741
Enhancer Sequence
TCTGCCTAGA TTCTTCTCGG CCTCTCTGAT CATCCCTTCT TTCCTTTTAA AAAGGTGGGG 60
TGGGGCCCTT TCTGGAATGG GGGTCTTATG ACCTACAGTC AAACAAGGTA GGTCAGATCA 120
TTTCTTTATG GCCAGGTTTT ACACAGAAAG GGAGAGGGAA AATGAGAATA ATATTTTTAG 180
GTCTTATGGC TGGCTTTGGG GCAAAGGGGT TTTGTCCTGG AGACCCGCTA GAAAAGAGGG 240
ATTCCAGTTT CTATGCTAGC CTTAGGAGAG AATAAGAGTG AGACAGGAGG GCAGGAGAAG 300
GTCAGAGAAA AACGTCTGCT TTCTGAGGCT GTTGCTGAGG CTGTCGTTTT GGGGTATTCT 360
TTCTTGAGGC CCAACATCTA TACAGATTTC AGTAGATAAC ATGTGTCAAC TGAAAATGCT 420
TTTCACGTGA AAATTCCAAT GACAGGTCAT TTAAGAATTC TAAAAATACT GTCTATCTTC 480
TCTTATGCAT TCTTTCTTGG GGACACATTT TTGTAAGAAA ATGTGAACTC AATAGGAAAG 540
TTAGACACAA GTAAGTTAGA AGAGTTAGAT ATGTAATGAA GTCAAAGGAG AGGCAAAAAA 600
CTATCTGTAT TTTTTGTTGG TATTCAACCA ACAAAAAAGC TAAAAGTATA ACAAAATAAA 660
AACAAAAATC TTAGAAGATA GTGTCTTTAT CATCCAGAGT GGTCAAGCTG TAATCTTGGC 720
CAAAGAAGTA AAGGTGCATT AGAATGGAAT ATTACCTTGT TCTGTCTATA AATTGTTTTA 780
TTTTTTTTTT CTTTGGATGA GATCAGATAC TTCTTAGAAC ACAACTTGAT GAGGTCTTGT 840
TAGAATAGAG AGGAATGGAG AAGCAGAGGG CATTAGGATA TTGGAAAACA TTGCAAGACC 900
CAGCAGTTTT AAAAGCACTT TTTTCCCCAT CCCTATAAAA AAAAAAAAAA AAAAGAGAGA 960
GAGAGAGAGG GAGCGAGAGG GAGATGATCT CATTCGATCC TGTGAAGGAC TGCTACTCAG 1020
TAAGGAAGAA GTCCTGGGCA GTGTGAATCA GTTCAAGTCA ACATCAGTGA TGACTTATGT 1080
TCTGGGCATT TAGGGGAGGG TGGAATTCCA GACCATCCTG CTGGTAACCT CAGAAGGCTT 1140
GTGCTCACAG TGACTGTATC CCTTAAGGCA GTTAGAGGCT GAGAATGTAG ATGGAGTAAT 1200
GATGATACAA ATGTTACTAA ACTTTGTCCT CTGAGAGGAG CCTGGAGTGT TGCAGTATAG 1260
GAAGCTGTTG ATTATCAAAT GATTTTTCCC TCTTGGAACC TTAAGAAGAA AACACTAGTG 1320
TGTGTCTTCA GTAAGTCCTC TGATTTATAG GGCGCTGATA ATTGATTCAA GAAAAAGAAA 1380
GTATAGATTT ATATATACAC ACACATATAA TACCTATGCA TGTATATCAT ATGTATATGC 1440
ATGTTTATGT ATGCTTTGTG TATGTGTAAA CATCTTTTGG TAAAACTTAT TAATGAAATA 1500
TGAAGTTGAT GTAAATATCT TTGGGCTGAA AACAGTTCAT ATATATATAA CAATTAATAA 1560
GGGCATAATT TTTCACTTTG CAAAACATTT TTTTCCTTCA CAAAATGATT CCTCACAAGA 1620
TTATAAATGA ATGAACTAAT AAACTTCCAC ATGTCTCTTA AAATAGGATT TGCTATATTA 1680
GTATTTATTA TAATAATAAT AAAATTAACA TTTTTAAACC TTTTGTGCCA AGTACTGAGC 1740
TGAGGGCTTT ATGTGAACTA CCTCATTTCT GTCTCCCAGT CACGCTAGGA TGTAAGGTAA 1800
CATCATTATC CTCTGCATTT GAAAACTTGA GGTTTACACC TGTTCCCAAA AATCTATTGA 1860
AATAAAATAA AAATTAAAAA AATTTTAAAA AGATATTCAG CCTAGTTGAA AAGCAAACAA 1920
ACAAACAAAC CCTTGAGGTT TAGAAAATTT CATAACTCTC CCAGAGTCAC ACCTTAATAA 1980
GAGATGTAGC TGGGATTCTG ACCCCATAGC CTGTACCTCC CTCTTCTCAA CAGTATTTCT 2040
ATATTTTGGG ATACCATGAC TCTTATGCAA AGCAACTCAT CTGTACAAAT AGCTTGGGCC 2100
AAAGCAATCA ATCATGTAAC AAAGGTGTAA ATAGAAATAA AAATATTAAC CCTTGGCTTG 2160
GATCCAAATG TCATTCATTT TAGCCAATGT TTTCCTTTCC ATCATTAAGA ATTCTGCTTT 2220
TTTTTTTTTT AAGTTTGGGA AAATCTGATA TCAAATAAAT TCATTGCATT CTTTCTGCAT 2280
AACCATGTGG TAAATGCTAG TCCCGGGCAT GGAAAGACAG GCACAGTAAG CAAAGACAGA 2340
ATGAGGAAAA ACTGTGAATC TAGATTTTTT CCTCTGTGTA AGAAAGTATA GTTCCCTTGG 2400
TAGAGAATGC AGAGACTAAA GCCTTTGACT ATTGGACAAG AAACTGTTGA CATTGCTGTA 2460
GTGAATCATC CGTCATACAC AGCTCTTAAT GGGGATGGGA CAAATTACAG CATTTCATGA 2520
TGCTGCCCAA AGATAATTCA GTCTAGCACC TGGATTGTTT GGAAATCCAC TGGATCCCTC 2580
CTTGACTCTC ACATGCTCAT CCTGCATATA CACTCCTTGT ATAGCAACAA GCATGAGATT 2640
GAGCGATAGA GTTGGACAAA TGACCAATAT TTATTCAGTT AATAAAATAC AGAGTTGTTT 2700
TCCTAGAAAC ACCAGCAAGG CAAAGGGAAA CAGAGAGAGG AATCCTGCTC CTACCAGAGA 2760
GATGAATGGG TGTGAGAAAA TGTGAGGGAG ACTCATTGCA TAAACATAAC TGAGGCTAAA 2820
GATCGCTGCA GCCCCAGCCA GGCTAAAACA TGGAGAAGAT GACCATGCGA GGCTGGGCAA 2880
GTGGGGTGCT ATCTACCGAG GAGTGGGTAG GACAAGGGGT CCAGGCCCCA TGCTTATCTA 2940
TTAGGTGAAG TTTTGATCTC AAGGCTGGGA AAGACATGGC CAGAAATAAA TGTTTAGGAC 3000
ATAACATTCT TTCCATGTTA GGACACCACA TTCTTGCTAT TTGGTGACAA ATGACTGAAC 3060
CGGGAGCTTG GTCCCATTTA TGATCTAATT CTATAAAAAT GAAATCCCGG GCATCTGGTT 3120
CAGAGCATTC CAGGAAAGAG TTAAAGCCCA ATATTGCTGC CTCACTCTGT TCTTCCTTTT 3180
TGGTGAATGA TAGGCTAGGA CGTGAACTTG CTGCCTTCTG GAAGTGCTTT CTCTTTCTTT 3240
CTGTGGATTT TATTTTCTGC CTTCTATGGG AGAGAACAGC TCTCTTGCCT TTCCACTTCC 3300
CCTGGGCTTG AAAACACTCA TAGTAGAACA TATACCTTCT ATCTGAAGAC AACATATAGA 3360
AGGTAAAAGA AATGGAAAAT CATCTGCATA AAGAAGAAAA ACAGAGAGTG AGTGAGCATA 3420
TGGGCGTGTC TGAGTGTGCG TGTTCAGTGT AGGAAGTGTC TGAAGAGAAG TCCAGCTACA 3480
AGAACTTGCT GCAATAATTC TCTAACAGCA TGAACAAAGA CTCCAATAAT AAATGGTGAC 3540
ATTTACACAA ATATTTGTGG TTGTGCTTTC CATTTCTTCT TATAGGAAAC AAGTAAGATT 3600
TTTAAATGCT TTAGTGATGT GATCAGTAGA CAGTAGTGGG AAAGAATTTC CCTGAAACCT 3660
GACTTGCAAT CAAAATAAGG AAGGAAGATC TGAGAGAATT GAGAATATTT CAGCTAATCA 3720
GGATATGGCA CTTTCCGGCA TCTGGGTGTC CAAACAAGTG TTTTGAATTC AATACTGTTA 3780
ACATGTGTCA CTTTAATGAA TATTTTCCTT TGAAGTTGAT TGGATGGTTA CATTTTTGGC 3840
AATAATCTTG TGGTCTGTTG CTTACATTAC CTGACCCACA GTCCATTTTC CTTGTGTTGG 3900
CTGTGGGAAA GAAAAAGAGT GAAAAATATC TCAGAACCTG GGAAACAGCA CTGAGAATGC 3960
GACTCATCTT TTAGTTAAAC CACTTCAGAT AGAAGCTCTC TAAGGATTGC CTCCTCACTG 4020
TCTGTGATAT GTGTAACCAA AAAAAAGAAA TAAGTTCCCC CGGTGTCAAA AAGATAAGGG 4080
GAAAAATCCA CAAAATGAGA TGAGGCTATT TTTCTTTTTT AAGCCTGAAA TAGGAGGTCA 4140
GTCCTTTGCA CTCTTCCTTT TGACTTCTAA CAAAACCAAT CACAGTCAAG CTATTCTCTT 4200
GAGTTAAAAA GTGTTTTCAG GAAGTCCATA ACATGTTCTA ATTGATTATT TAAAAATCCC 4260
CACACAGGAA CATCCCCTCA TGGTCTGAAT GTCTTTTTAG CCCTCTGCTA TTTGCAGAAC 4320
CTTAAACAAA TTGTAAGAGA GAGTCCTTGG CTAACTCCAA GGACCTTTAT GAGGAGTGGG 4380
AGAGAAAGGG GAGGATGTGG ATTGGATGCA GCAAAGTGCT 4420