EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS191-25690 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Trophoblast 
Coordinate
chr3:42076000-42079980 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MEF2CMA0497.1chr3:42078426-42078441TTCTATTTTTGTAAA-6.23
NKX2-5MA0063.2chr3:42076013-42076023CTCAAGTGGT-6.02
Nr2f6MA0677.1chr3:42076645-42076659TGACCTTTGACATC-7.06
RxraMA0512.2chr3:42076645-42076659TGACCTTTGACATC-6.49
STAT3MA0144.2chr3:42076710-42076721CTTCTGGGAAG+6.14
Number of super-enhancer constituents: 30             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00063chr3:42073059-42080252Adipose_Nuclei
SE_01171chr3:42076723-42078482Adrenal_Gland
SE_01796chr3:42074160-42079952Aorta
SE_02512chr3:42077142-42078750Astrocytes
SE_10226chr3:42077557-42078365CD19_Primary
SE_10922chr3:42075821-42080123CD20
SE_23272chr3:42076052-42077174Colon_Crypt_1
SE_25861chr3:42075932-42080024Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26989chr3:42077067-42078528Esophagus
SE_29565chr3:42076643-42080017Fetal_Muscle
SE_36966chr3:42072330-42080080HSMMtube
SE_38230chr3:42076638-42079654HUVEC
SE_40683chr3:42072910-42080148Left_Ventricle
SE_42248chr3:42073149-42080124Lung
SE_44658chr3:42072804-42079954NHDF-Ad
SE_44918chr3:42076813-42078722NHLF
SE_45733chr3:42072762-42079851Osteoblasts
SE_48185chr3:42073228-42080873Psoas_Muscle
SE_48670chr3:42075960-42080115Right_Atrium
SE_49555chr3:42076679-42078071Right_Ventricle
SE_50309chr3:42075955-42078455Sigmoid_Colon
SE_51166chr3:42072944-42080431Skeletal_Muscle
SE_51885chr3:42076843-42078622Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52625chr3:42076752-42078272Small_Intestine
SE_52625chr3:42078429-42079773Small_Intestine
SE_53513chr3:42076720-42078314Spleen
SE_54717chr3:42072918-42079574Stomach_Smooth_Muscle
SE_62800chr3:42053253-42125059Tonsil
SE_63663chr3:42076843-42078849HSMM
SE_65769chr3:42075175-42078776Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr34207909442079276
chr34207718442078330
chr34207804042078206
chr34207701742078470
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I042031chr34207282142079914
Enhancer Sequence
TCTAACTCCT GGGCTCAAGT GGTCTGCCCG CCTCAGTCTC CTGAAGGGCT GGGATTACAG 60
ACATGAGCCA CTGCATCTGG CTCCTGTTGT ATTTCGTTAG TCTTCTCTCT GCCTTTTGCC 120
ATGATTACTG TTCTAGACTT TCCGTGTCTT TCTCAAACGC TGTACCTCAT GCTTGCCCTT 180
GGCCTTTAGA AGCTGCCTTA ACAGCGTGAG CAGGAGCCAC CAGGTGTGGT GCCTCCAGCC 240
CTCTTTCCCA GCCATGTAAG GGCTGTTCTT CTGGTCTGCC TCCTGTTAGG TGAAGGAGGG 300
GCCCTCTTCC TACCTGAGCT AGTTTGTGCC ACCGAGACAG ATCCTATCCC ACCTCCTTAG 360
GAGCAGCACT TAGTCCATTA GCCCCTCTCT GTCTCTTCAG CCTCATCTTG CCTGTGGCCT 420
CCATCTCACC ATCCTGTTAC ATGCTCAGTT CTCTACCAGT TTTCTAGGCC ACATCCCCTG 480
CAGCCATTGC TCTTCTCCTA CTTCATTGCC GGTCTCACCA AAGTGCCTTC TTTCTCCTTT 540
CCCTGACCTT CTTGCCATCA GACATCTGAG CCTGTTATTC GAGCACCCAT AACCCAGTGA 600
ATATGGTGCT AAGTCCATAA ACCACCTTCT AGTCCTGGCA TTCTTTGACC TTTGACATCA 660
TGGTCTATAA TACCCTCATT CTTTCCTTCT GGAAATGCTG TTTCCCTTGG CTTCTGGGAA 720
GCTACACCCT CTTGGTTTTC CTCCTACTTC TCCAACCACA CCACCTTAAT TGCCTTGTAG 780
ATGGCAATTA AGACTGGCAA GGCTCCTGGT GATCTCGCCA GGCCAGTGCC TTGGTTGCCA 840
TCACTACCCA AATCTTGGTT CAGACCTGTC TCCTGAGCTC TGGACCTGTT CACCCACCTG 900
TCTGCTCATT CCGCACCTCC ATCGTAGCCT GTACAAACGC TTCCCGGCTG ACCACCACTG 960
CCATTACCCG TTCCCTGCCA CCCCCAAAGA AAAGGATCTG CCTGTGAGCA GTGACATGGA 1020
GGGCACCGCT GTCCTCAGCT GCTCAGGCAG GAACCAGTAC GTTTTCCTGA CACTTCTTTT 1080
TGCTCTAGCC CCTTCTGGTC AGTCACCTCC CAGATCTCCC TAATTGTCCT GTTGGACTTG 1140
GCTGCTCTAA TGTTTTCTCT ACTCTGGTGT TAAGTGACCT TCCTAAAGTG CAGATCGAAT 1200
CCCATCACTC CCCTGCTTAA AATCAGTTCG GGAGCTCCCC ATGGGGCAAA AGAGGCTGCT 1260
GCCTCTCCTC CCCTTGCTAA AGCCATTCAG AGCGTTTTCA GTTTTCTAAT GGGCCGTGCT 1320
TCTCCCTTCT CCAGGACTTT TGCTTCTGCA GTTACCTCTG CCTATATAGA GAACTCTGCC 1380
CACCCCCAAA CCCTACTTGC TTCTCTGCAC AGCCTGTTCT GGCAGCTCCA GCTTGTGCTG 1440
GCAGTCTAGG TATTTCCTGC TCAACTTTTA AGTCAGACCT ACGGTTGGCC TGGGAAGCCT 1500
TCCCTGACCC CAAGTGACCC ATCTGTGTCA GCAGTTTTGA CAGTGGCCTG GCACTGCTGA 1560
TATTTTGGTC TGCGGCCCCT TGAAAGTAAA GGGCATCTGT GAGAGGCTTT ATTTGGACAG 1620
TGGGGGACAC AGAGATGGCT GACCTGGCAT CTGGCACTTG ACCCAAAGGG CAGTTCTTGT 1680
CTGTGTGTTA CAGGGGCCTG AGCTTGTTGA GATCATTACT CCCAAAAGAT TGTAGGTTCC 1740
ATGAGGGCAG AGATTTTTGT TGGATTCATT TTCTGCTATA TTCTCAGCAC TAGCAGTGCC 1800
TCACAGTAGT GCCTGGTACA TAGTAGGTAC TCAGTAAATA TTTACTGAAT GACTAAAATG 1860
TGAACTTTTC AATCTTCACT TAGTGGGTTT TCATGATACC CGGTGTGTGT TCCTCTTACA 1920
GCTCTTAGAA GTTGCTCTGT CTCTCTGCCA GGGTAGATAG ATGGGCATGG ATTTGGAAGT 1980
GGGTACTGGC TCATTGGAGC AGGCTTTCTC TGCAGCCTCT CTGCTCTTTC CCCACACATT 2040
TGTGAACCTC TTGAAATCAC AAGCTGTAAT CACCAGAGCA GTGTAACAGA ATTCCTGGGT 2100
CATGAGATAG CCGTGACTGT TCTGACTCAT GTCACACAAG GGGAAAATTA GCGTGTTTCT 2160
AGTCCTAAGA GTTACAGACT TCCTAGGCTT GACTCTGTAA CAGCCAAATG CCTTTTAACC 2220
TTCTAGGGAG TTTATTGTAC TTTTTATTTT CTATCTTTTT GAGACAGGGT CTCGCTCTGT 2280
CACCCAGCTG GAGTGCAGTG GTGCAATCAT AGCTCACTGT AGCCTCGAAC TTTGGGGCTC 2340
AAGCAGTCCT CCTACCTCAG CTTCCTGAGT AGCTAGGATT ACAGGTGCAT GCCACCACAC 2400
CTGGCTAATT TTTATTTATT CATTTATTCT ATTTTTGTAA ATTTTATTAT TTTTCTTTTT 2460
TTCTCTGCTG CTTGAATCAT CATAATTTCT TATTATTTTT TGTAGAGACA AATCTTGTTA 2520
TGTTGCCCAT GCTGATCTCA TACTCTTAGG CTCCAGCTAT CTTCCCACCT TGGCCTCCCA 2580
AAGCATCGGG ATTACAGGTG TGAGCCATCA TGCTTTGAAT TTAACCTGGC CAAGTGCAGT 2640
AGATAATGCT GTGGTACCAC AGAGCAGAAA TGTGCTATTG TTGTAGTGTG ATACCATAGA 2700
AGCTGCTTTT AGAGTTTTAG GATTCAAGTA ACTGATTAGA TAAGGTTCAT CATCATTCTT 2760
TTATTGGACA AATATACACG GTGTGTCCAT TTTAGACCCA TTTTCCTTAA TTATCTTATT 2820
CACTGGCTTA TGGATTTTGT TTTCGGCCTT CCCTCTAAGT AGACCAGAAG CTTCCAGAGG 2880
TCAGGGGCTT CATCTGATGT TTCCTGCAGA TGTTCAGGAC CTAGAGAGGT GCCTGGCAAG 2940
TGTTGAGTCA ATGGCAGGCA GGGTACTGGG GATGGTGAGC AGGCATGCAG ATGCATAAAC 3000
TGTCATGGTG TTTACAGTCT GGTACTATAG ACAGACATTA ATGCAATTTC ACAAACAAAT 3060
GTCAAATTGT AACTCTGACA GTTTCTGTGG CAGAGACCAC TGTTCTCAGA TGACTAACAT 3120
AAGAGCTTTG GCTTAGCCAG GAGTTTGGGA GAACTTGCCA AGGGCTAAAG AAAAGGTACC 3180
CAGGTGGAGG AAGTCTCGTG ACCTGTGTCT GGAGAGTGTG TGCTAGAGGA AACAACTGGA 3240
GCAAAATTGG AATCATGTCT TTCTGTCTCT AAGAGCAGGT TTAGTCATAT GCCTCTCCTT 3300
TCTTAATGAT GACAACAAAT AACATTTAGT GAGTGTTTGT GTGGATGATA GCAGTATAGT 3360
GTTCCATCCT TCCAGTGACC CCGGAGTGGA GCCTGGGAAA TCCATTAGAG GTCAGGTGGC 3420
TGGGTGAGGG GTTCGAGTCC AGATAGCCTC TCCTTTTTCC TGATATGAGT TGTGTGTGGT 3480
GTGATGTTTA AAAGATACCA TCAGTCCTAG ATTCTTGAGA GGTCATTCAA AGGGATGCTA 3540
CCCTGAAGCT GCTGGACCAT GTTTAAGTGA AAGACAGGAT TATAACATTG TCAGCCACTT 3600
GCCTGATAGA GATTTGGCTC AGAGAGGTCA GTTGCCTTCT CTAATGCAGG ACCTCAAATG 3660
GAAAGGGAGG CAGTGGGTCA GAGACGTCCC AGAAGTTTAC AGCATGGTGG TGGCTTTAAA 3720
ATCTTTTAAA TTCATCTCTT TTCTAGGTGC AAGGGTGTTG GGATAGGGTC AGGAATACTG 3780
AATTGAATTG AATTTCTCTA GCCCAAAATA GCAAGGAGAT ATTGGTGTTT TTTTGAGGCA 3840
GGTTCTCACT CCGTTGTCCA GGTTGGAGTG CAGTGGTGTG ATCACAGCTT ACTGTAACCT 3900
CAACCTCTCT GGCTCAAGTG ATCCTCCCAC CTCAGCTGGG ACCACAGGTG TGTGCCACAA 3960
CACCTGGCCG GTTATTTTTA 3980