EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS191-03597 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Trophoblast 
Coordinate
chr1:228271640-228274050 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr1:228273792-228273803TAATTTAATCA+6.62
GFI1MA0038.2chr1:228272104-228272116CAAATCACTGCA+7.22
NR2C2MA0504.1chr1:228272722-228272737TGACCTTTCACCTCC-6.86
NR2F1MA0017.2chr1:228272718-228272731CCCTTGACCTTTC-6.04
Nr2f6MA0677.1chr1:228272722-228272736TGACCTTTCACCTC-6.6
RxraMA0512.2chr1:228272722-228272736TGACCTTTCACCTC-6.8
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
SE_32319chr1:228269632-228273992Gastric
SE_42925chr1:228269664-228279319Lung
SE_54084chr1:228269522-228279024Spleen
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1228273480228273740
Enhancer Sequence
GAGAGCTGTA GAGTTGGTGC CACTGCCCCT GTTGGAGTGG GCAGTTGTAG TTCTTGTTTC 60
AGAACTAGTG GTCAGCAGTT TTCTTTGCCG GCTGTTGCAA GGCTGGTGGT TCTGGCGTTT 120
TCCGCAGTGT GTTGGGAGGA GTGTGAGATG CCGCGGTGCA GTTGTGTGCG GCCCCTGTGG 180
CCCTCTGCTG TTGCGTTAGC CATTGTCTAA CACGTGTGAC CGCATGGATG GTGTCCTCAT 240
TTAATTTGAA TTTTCACCAG CACTGCCTAG GTAGCCAGAA CCATAAGGTC CTGAAATGCC 300
GTACTATTAG CTGGGTCCAA AATTGAGAAG AATTGAGTAG TGTAAATGTT AGTCACACAT 360
CTCATTGGAC ACATTGTTAG AGTGTGTTGT CCATGTTTTC ACATGTTGGT AGACTGGAGA 420
ATAGCTGTCA CTTGTCTTCA GGCGTATCTT GTTGAAAATA AATCCAAATC ACTGCAGCAG 480
TAGGAATATG CTGTTGCCTG TGAGGCAGAT TTTCGGATTT GCTAGTTGAA AAAGATTTGA 540
AACAGTTGGT TTGGACAACA GCTGAGTCAC ACAATGACTG TGAGTGAAAA GCAAAAACTG 600
GTTCTGTGCC CCTCACAGTT CTGGTTTTGT ACATCATGTG GTCTAGCTAT GGGCTGTACC 660
TCTTGCACAA TATGGAGAGG ACATTCAGAC ATCTTCAACT GCTCATCTGC CCCTACGGAC 720
CAGACAGGCT TGAAACTATA GGAAGATGCA TTTGACCTTT CATTTTTCAG TTCAGTAGAA 780
TTTAATATGG ACTGTCAGCC GCTGCGGTGA TCATGGAAGT AGACCTAAGA GAAAAAAACT 840
TGTGCAAGTT CACACGTGGA GTAGTATATG ACCATGGTTT CAGAGAACTG AAGCAGTTCT 900
TTTTAGATTC TTCAAATTAA ATGTCTCCTT GGTGTATTTA AACCTGCTGT TACTCACAGG 960
CCAGGCTCCA CCAAGCTTTC CTACACACTT CTTCCTGAGC TGTGACCATT CTCCTGAGCA 1020
AGAGGCTGCA GCCAGCCTGG GCTGGCGGGC CCATACTGTC TCTCATAGGC ATTCTCTCCC 1080
CTTGACCTTT CACCTCCGTA AATTCAAGAG GGTGAAAGGA AATAGAGTGC ACTGTCAAAG 1140
ATAATTGGGA GAGAAACACG AAAAGGCCTC GCAGTGGGGA TCTTAAATTA TGAGAACTTG 1200
TGTTTTCTGT GTTGTGCCTG CTCCTCATTG GCGTGGATGG TTGGTAGGGG CATTCTGCCC 1260
GTAGCGTCTG AAGTGGTCTT TTGGAAAAGA TTTGGCCCCT TCATGTTGGG ATTCCAGGAC 1320
TTGCCTTCAT CCTCAGGTTA ATATTCTCCT GTGATTGTTA CAAGCTCTCT AAGGCATAGT 1380
TGCATTTATT GCCTTACAGC TGCGCAGCTG CCGCACCGTC CAGATAGGTA GTTTCACATT 1440
CTCAGGTGGG TCAGATGACC TTGTTAGCGA CTTGACAGAC ATGTCCTGGA TGCTCTTTGT 1500
TCCCAGGAGG CTCTCAGGTC CTCCCCCAGG GTCCTGTCAC TCAGCCACCT ACAGGGATGG 1560
GGAGACAGTG AGGCTGGCTG ATAAGCCATA AAGTCCTTGA CTAATCCTGG TTTCCTGGTT 1620
CTCACACAGT GGTAACAAGG GCTTGCAGCC GGTTGTCAGC CAACAGACTG GGAAGGGTGG 1680
TGCTTCTTAC AGGCCCTGAT AACAGGAGAA GCCTAAATGA CAAGAGAAGA GACAGGGAAA 1740
GCATAAAAGG CAGGCAGATT TTCACAGGCA CAGCAATTGA AAATGATTCT GTTTAGAAGG 1800
CAGACATTCT CCCACACCCT TGAGGCCCAG GGCTCACTGC TGGTGTACAG CATGAAGTGG 1860
ACAGGAGAGT TGATTCAGTC CATGAACATT TCAGGAAGTT AGAAGTCTAT AGTTGTGGAT 1920
TGCAAAATAC ATATCTGGCC TGCCTCCCAT TTCCTGGCTA AAATACTTGG AATCTCCGAA 1980
GTGATGATGT CTTTTTGTAC CCTAATGAGT TGACCAGTGA TGGGCAGCCC CTACGAAACT 2040
TCAGGGTAGG GCTAGTCACA GGGCCAAGGC AGGATTAGAG GGTTTCAGCC CCACCCTCCA 2100
ATTTTCCCAG AGTGGAGAGG GACTGAAGAT TGAGCTGGTC ACCAATAGCC AATAATTTAA 2160
TCAATCACAC CTATACCATG AAGTCACACT TTTGCCTTCA GTAGTTAACA GCATCTACAG 2220
CCCCGTGTTT CCACATTTGT ACAAAGGAAT GTTCAGACTG AACCACACTT AAGTACAATT 2280
TTGAAACAGC ATGAGGCTGG GCGTAGTGCC TCACGCCTGT AATCCCAGCA CTTTGGGAGG 2340
CTGAGGCGGG TGGATCATGA GGTCAGGAGA TTGAGACCAT CCTGGCGAAC ATGGTGATAC 2400
CCCGACTCTA 2410