EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS191-02450 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Trophoblast 
Coordinate
chr1:159885130-159886940 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs12122337chr1159886422hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EBF1MA0154.3chr1:159886224-159886238AATCCCCTGGGAAT-6.12
EBF1MA0154.3chr1:159886224-159886238AATCCCCTGGGAAT+6.46
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:159886551-159886569GGAAAGGGGCAAGGAAGG+6.32
MEF2BMA0660.1chr1:159886082-159886094GCTATAAATAGT+6.18
Number of super-enhancer constituents: 22             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02009chr1:159885104-159886879Aorta
SE_02391chr1:159885366-159886916Astrocytes
SE_10984chr1:159884833-159896640CD20
SE_13325chr1:159885066-159886957CD34_Primary_RO01536
SE_14052chr1:159885331-159886978CD34_Primary_RO01549
SE_17500chr1:159885071-159886264CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_30108chr1:159886059-159886832Fetal_Muscle
SE_34858chr1:159885031-159888333HeLa
SE_36438chr1:159885508-159886945HMEC
SE_38165chr1:159885029-159888329HUVEC
SE_41182chr1:159885360-159886918Left_Ventricle
SE_42315chr1:159885077-159886984Lung
SE_44957chr1:159885611-159886831NHLF
SE_47692chr1:159885387-159886849Pancreas
SE_48986chr1:159885191-159886903Right_Atrium
SE_52604chr1:159885209-159886864Small_Intestine
SE_53483chr1:159885044-159886920Spleen
SE_59359chr1:159879583-159907614Ly3
SE_63031chr1:159879414-159896447Tonsil
SE_63399chr1:159883649-159916570NCI-H69
SE_64771chr1:159885478-159886944NHEK
SE_65431chr1:159886137-159888901Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1159885499159885591
Enhancer Sequence
TAAGGTGTTG GGAGATGGCA AGAAAAGGCA GAACCATACA CAGGCTGGTG CCTAGTCTGG 60
GCCCCAGGGC CTGAAGTGGG GTCAGAGATG AGAGAAGCCA AGTTAAGGAT GAAATTGTAA 120
CCTCAGGTGA GACAAAATGC TAGAAAGCAG ACAAACAGAA AGCTGGAAAA TGTTGAGATG 180
CCACTGGAGG CCGGCTCCAG AAGGAAGCAG CTGAGTCTGC AGTTAGATGA ATTAAGGGAA 240
CATTGAGATT CCTCACAAGG CTTGGGTGGT GGTGGGTGCA GCCAGAAGAA GGTGAGCCCA 300
ATGGCTGAGC CCCTCTCAAA TACAGCTGGT GTCTCCCTTG AAAATAAGCT GTTCCAGGTA 360
AAGGGGATAG GGCCACTGAA AGCATCTTGG CCCGTGTTCA ACAGGACAGT GGTGAAGGGC 420
ATGAAACTGC TGGGCATCAG CTCCCTCTCA GCCCAGGGTC CATACACAAA TGTTCCACCT 480
TTTATTCCCC ACACTTCCAT TTCCTGAGCA CTATGTGCTA GCATTCCCCA TGCAAAGTGC 540
TTTCCAGGGT TCATCTAATC CTCACGGCAA CTTCACGAGG AAGGAATTAT CATCTTCAGC 600
TTACAGATGA GGAGCATTGC CCTGCCACCC ACCACCACCT CTGTCCCCTA GTCCCTTGAC 660
AGCTTCACTT CTTGCTGAGC CTAGAGCTGC ACAGGCTCAG CCAGGTTCAG AGCCAGCTTG 720
ATTGGATGCA AATCCCTGCT TCTCCCTTAA TTGCTTTGTG GCCCTGGGCA CATTCCTTGG 780
CCCTTCTGAG ACCAGTATCC TCATCTAAAG ACAAAATGGG GAACACATTA CAGTAATATC 840
CACCTCCTGG GCGTTTGTGA GAATCTTCTG GGAGAAGGCA GTGGTTCTCA GCGCTGGCAC 900
TGTAACAAAT GGCATTTCTC AGAGTTGTGA GGCGTGTGGC CAATAATTTA TAGCTATAAA 960
TAGTTAAACC AGGGAAGGTG GCAAACGGCT TGTTGTTTTA GTATACATAG CGAATTCAAT 1020
GTTTTCTCTG CAATGACATC ACTCTCCCTG ACTAGCATTC CACAAAGCCT TCCTGAATGA 1080
GAGATAAAGG ATCTAATCCC CTGGGAATTT GCCCATAGGC TGCAGCCTAT CTTATCTGTG 1140
CCACAGCCTG TGGGAGTGCA GCAAGCAAGC AAATACAGTC TCTCCCGAGG TGTGGTGTGG 1200
CAAGGCTAAG CGTGGTGTGG GGATGAGGCT GACAGCCATG GCTATGAAGA ATTGGCATTG 1260
GGCCTCGCCC CTAGTGGGTG CTTTTTGGAA GAGGGAGCCT CAGAGAAGCA GGGGAACAAA 1320
AGGGGAGAGA ACAAAAGCTC TGGATACAAA CCTGTTTCCC TCAGGCACAG TGTTGTGGCT 1380
TTCTCCTCCT AGGAGACAGA GATACCCTCA GGTAGAAAAG GGGAAAGGGG CAAGGAAGGC 1440
CAGGCCTCTG GGTGAGGCTG ATGGGGCTGG AACTTAATGT CAGACTGGCC CAGCGTCCCT 1500
CAAATTCCCC CTGGGGAGAC ACAGAGTCTG ACTGGGAAGC CTTGGGGTAA AGGTAACACC 1560
TAGTGGTTAG AAACTATGGG TGGGGCTCCC AGCACTTTGG GAGGCTGAGG CTGGGGAGTT 1620
GGGAGATGGC AAGAAAAGGC AGAGCCATGA GGTCAGGCAG ATCGCTTGAG CTCAGGGGTT 1680
CGAGACCAGG CTGGCCAACA TGGTGAAACC CCATCTCTAT AAAAAATACA AAAAATAGCC 1740
AGGCACGGTG GCTCACATCT GTAATCCCAG CACTTTGGGA GGCCGAGGCT GGCAGATCAC 1800
CTGAGGTCGG 1810