EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS191-00929 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Trophoblast 
Coordinate
chr1:39677740-39681800 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:39679758-39679776CCCTCCTCCCTCCCTGCC-6.11
ZNF263MA0528.1chr1:39679758-39679779CCCTCCTCCCTCCCTGCCTTC-6.15
ZNF263MA0528.1chr1:39681475-39681496GGAGGATGGGGGGTGGGAGGG+7.04
Number of super-enhancer constituents: 38             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02052chr1:39678941-39681816Aorta
SE_02469chr1:39679051-39680375Astrocytes
SE_03650chr1:39679236-39681297Brain_Angular_Gyrus
SE_04714chr1:39677545-39678456Brain_Anterior_Caudate
SE_04714chr1:39679013-39682594Brain_Anterior_Caudate
SE_06399chr1:39678642-39682444Brain_Hippocampus_Middle
SE_08441chr1:39678782-39682966Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_11519chr1:39678917-39683544CD20
SE_12403chr1:39680528-39683031CD3
SE_12935chr1:39678588-39679219CD34_Primary_RO01480
SE_12935chr1:39679730-39680392CD34_Primary_RO01480
SE_12935chr1:39680589-39682820CD34_Primary_RO01480
SE_13363chr1:39677560-39683021CD34_Primary_RO01536
SE_14150chr1:39678472-39682940CD34_Primary_RO01549
SE_14598chr1:39679029-39683036CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18276chr1:39679312-39683290CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19457chr1:39680332-39682971CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20719chr1:39679521-39683668CD56
SE_21332chr1:39679738-39683052CD8_Memory_7pool
SE_22852chr1:39679249-39683067CD8_primiary
SE_25675chr1:39679317-39682591DND41
SE_25799chr1:39679178-39682849Duodenum_Smooth_Muscle
SE_35822chr1:39678839-39682898HMEC
SE_36947chr1:39677583-39681522HSMMtube
SE_39750chr1:39679972-39682489Jurkat
SE_42256chr1:39677699-39678303Lung
SE_42256chr1:39678967-39681869Lung
SE_45768chr1:39679068-39681244Osteoblasts
SE_47164chr1:39678945-39681200Panc1
SE_51765chr1:39679161-39680329Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53123chr1:39679298-39681931Small_Intestine
SE_54583chr1:39679240-39681665Stomach_Smooth_Muscle
SE_55533chr1:39679583-39680061Thymus
SE_55533chr1:39680137-39681910Thymus
SE_63091chr1:39648877-39697679Tonsil
SE_63563chr1:39679150-39680383HSMM
SE_64597chr1:39679175-39681103NHEK
SE_66592chr1:39679972-39682489Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr13967919939681727
chr13968020039681200
Enhancer Sequence
GTAGCTGTCA ATTCTCAGAT AACTTCTGAC CACATGTGGA AATACTGGCC TGAACCTCTT 60
CCCTCCACTC ACCCTTTTCA AGATCTGCAG GTAGCAGCCA GACTTAAACT TTTTCCTACC 120
TTTAACAGGA AATGACAAAA GTTGGGAAAA AAAGAAGGGG AATGGCTCGG ATGACTCTAC 180
TGGCCCATCT CCTCTGGATA GTTAAGAGCT GACTGTCCTA ATCAAAGTCC TCTCCTCCAT 240
TGCAGCAGAA CTTGCCTCTT TTTGAGGCTC AGGACCTCTT GGGAACTTGA AGGGAAGGCC 300
TGTCTCCTGT AGGTAGACTG ACCTTGTCCC CAAGACTCTA CCCTACTTTT CTCAGTCTGC 360
AGTGCCGTTA GGAGAAATAG GTTCTGCTTG AGTGCCAGGG AATTTAGGAG ATGGCAGATT 420
TTGGTTCACT TTCCTCCAAC TTCACCCAGT AATTATTATT TTGATTTTTA GAGACTGTGA 480
ATTCAGTATT TCTAGAAGTT GCCACATGTG TTCATTTTGG ATGTGTCCTA AATCTCTGGT 540
CAACCAGTTA AGTATTTTTT ATTTTTTATT TTGAGACATA GTCTCATTCT GTCGCCCCGG 600
CTGGAGTGCA GTGGCGCAAT CTCGGCTCAC AGCAACCTCT GCCTCTGGAG TTCAAGTGAT 660
TCTCGTGCCT CAGCCTCCCA GGTATCTGGA ATTACAGGCA TGTGCCGCCA TGCCCGGCTA 720
ATTTTTGTAT TTTTTTAGTA GAGGTGGGGT TTCGCCATGT TGGCCAGGGT GGTCTCTAAC 780
TCCTTACCTC AAGTGATCTG CCCACCTTGG CCTCCCAAAA GTGCTGGCAT TATAGGCGTA 840
AGCCACTGTG CCTGGCCGAG TTAAATGTTT TTATTTGTTA CCCTTCCCAA GAATATTTCA 900
CCTTCTTACA TATACAACTC CTATGCCTTT GTTTGTTTAT TCTGGTTTAG GTCCTTCTCA 960
GAGACAGCAG GGTATAACAG GGAGCACAGC TTTGGAGCTG GACAAATGGA CATGTAATCT 1020
TGGTCAAGTT ATTTAACCTT TTAAAGTCCT AGAATTTTTA TCTCTAAAAT GGAAATGATA 1080
ATATCTTTCT TGGAGAATTG TTGGGATTAA ATGAAATGAT ATTTAAAGTT TTTAGCACAT 1140
TAACTGTGAA CTAACAGTTA TAGTAAATGT TCAGTTAATT TTAGCTTAGG TTATTGAGTA 1200
CCTTCTAAAT GTGATAGAGA TGGGGTTATG GAGACAAAAG AGTCCCTACA CTCAGATAAT 1260
TTATTTTTTT ATTTTTTATT TTTGAGAGAG TCTCGCTCTG TGGCCCAGGC TGGAGTGCAG 1320
TGGCACAATC TCGGCTCACT GCAACTTCTA CCTCCCGGGT TCAAGCAGTT CTCCTGCCTC 1380
AGCCTCTCAA GTAGCTGGGA TTACAGGCAT GTGCCACCAC GCCCAGCTAA TTTTTTTTGT 1440
ATTTTAGTTA GAGTCGGGGT TTTACCGTGT TGGCCCCAGG GTGGTCTCGA ACTCCTGAGC 1500
TCAGGCAGTT TACCCGCCTT GGCCTCCTAA AGTGCTAGGA TTACAGGCGT GAGCCACTGC 1560
ACTCAGTCTC ACTCAGGGAA TTTAAATCTG ATAAAGGAAG AGGTTACTAG ATATGAGTCA 1620
GGAAATGTTC ATTCCTTTTT TTCTCTCTTC CCTATTTCTT ATGCATTCCT TTTCCCAGTA 1680
CGAGGCAAAT TCTAGGAGGA CCCTTCATCT CCAAGGCTAA AAAGAGTCTT ATAAGAGGGA 1740
CAAACTGAGT ACAGTTGTCA CAGGTTATCA GGGTGACTGA GAGCTTAGTC TAGGCGGGAT 1800
AAAGTCAGCT GTGAGAACCT TTATTAGTAA GCAGTAACAG GATTATTAGC AGTTTGTAGG 1860
TGGGAGGGAT ACCCACTTGG GAGTGAAGTT GTCAAGCAAC TGAGGCAGGT CATAGGGCTT 1920
GTTTAAACTG AATGGTCTGC TAGGAAAGCT TGCATTTACT TTTTTTCATT TGTAGTCGTT 1980
TGGGCTAATC TCTGGAAACT TGCTTTCCTA GGTGCTGCCC CTCCTCCCTC CCTGCCTTCA 2040
GGAACAGGAT TGAAAGCAGC ATTAGCCTGA AGAAGTCGTT CTATTTAGGG AGCTAGAGCA 2100
GAGGGCCAGT GATTAGGCCC TTATCTGCAG CGGGGCCTTT TTGAGTGGTG TGGGGCAGGG 2160
CTGCAGTGTC TGTCCTGACA CCCACAGAGG CTGGACTTTT CTGTCCCCTG GTTGGGTTAG 2220
AACTGTGAAG AACCAATAGA AGGGCTGGGC CAGCTGAATG AAAAAGCCCT TCATTGTGTT 2280
TCTTCAACAT TCCAGTGTCT GGTACAATTA GCCAAGACTC GGAAAACAAG TTGGACAAAC 2340
AAGCAGGCAG CCTTCTACTG ATGGATGAAA GGATTTCTGG CACAGCTGAG TTAAGTGCAC 2400
TGACTGTAAA GACAGAGTAG GAGGATCTGG GAAGAAGAAG GGGACTTTGG AATGCCATTC 2460
CTGGCTGTGA GGGGAAAGAA TGGAGCAACA AGCAAACGGT ATTTTTGAAG CTGATAAAAT 2520
TTGCTGTGAT AATCTACCTG GGAGGCTGGC TGAGGCGAGG CTGGCTGAGG TGGGGCTACT 2580
CTGTAAAGTA GGTGGAATCA CTGGGGAGTT ACTGACTCTT CCCTTTTGGC AGCTGTAAGT 2640
GCGGGGAAGG GAAACTTTCT TTGGAATCTA GGGATCTGTT CACAGTGGAC GGTGAGTGTA 2700
TGAGCTTGCT CCATTATAGT CTCTCCCATC ATGAGACCTT CTCATTTGGT TAACACTATA 2760
TGTACTTCTG CCTGAGAAGA GGCACACCTG AGGAGCAAGT TGTTGGGCAA TGGATGCACT 2820
GTTCCTGACT TGGCAGTAAA CCACTTAGCT CACCAGCTCT CCTGCAACTA AGATTCACCA 2880
CATTACAAGC TTCTGCTCTG CAAATGGAGG GTAACTCAAA GACCAGTTTC TTCCTACTCA 2940
GGTTTACTCA CTTCATACCT TGACTGGACT TTTGCATATG GAGCTCTCCC CTCTGTACGC 3000
TCTATTGGTC TGGAAACACA GAGTTGGTGC TACTTTTGAA CAGCATGCAG CATGCTATAT 3060
GCCTGAGACA TGGACCCAGT TTTTGGAAGT GCCCTAGGGA GGAGCTTCCT CTCTGACCTC 3120
AAGGGAAGAA GGAGGTCAGT AGGAAGTGGT GGGTGGAGCC ACTTCTCTGT TCTGCTGTCT 3180
CCTCTCTACA CCTCACAGCC CTTTTTGAGG AGCTGCGAAG GGTGCACAGG CCAGTAGCTG 3240
GAGGTTCTTT GGTACCCCCT CCTTTTAGGT GGGGTCAGCA GACACAGGGG CGCCATGTGG 3300
CCGAGTTACC AAGATGAACA CGAGTTCAAC GCCCACCTGG TTTGTCGCAT GTGCTGTATG 3360
GGTTAGTATG TGAAGTTTTT TTTTTTTTTG CTTGTCCGGG CCTGAGGATC CCAAATAGCC 3420
CTTGCTCTCA TTGACTCATA GGAATGCATG GACTTCGAAG CCTTGTGGTG TTACAACCTT 3480
TAGGCTTGTT AAAATGTGCA GTGGAATAGA TTGGGGTGCC CTACTTCCTG GGGAACTTCT 3540
TAAGCTTGCA GTAACTGGCA GTTAAGAGCC CAAGCTTTGG GTGTAGAACT TTTTTTATAG 3600
AGACTGAATT CATGCTCATG CTTCTGCCTG TATCAGGAAA CCACTTTTAA GGTATGTTGC 3660
ATAGTGCTGA AAGTCCAGAG TGTATTTTTA GCAGAAGTTG GTTGGTTACG GAGTCCACCT 3720
CTGAGCAGAC TGGCGGGAGG ATGGGGGGTG GGAGGGAGGA GTCATGGCCT ATGTTTCCTC 3780
TTTGGGGCTT ATTGCTAGTT CTTTTACACT TTACTCTGCC AGCTGTGACA GAGAGAGAAA 3840
AAGACTCAAA GATGATCTGG GGTCAGGGAC CTAAATAAGA GAGGCTAGGG GAAGAGTCAT 3900
GTTAGCTGTG ACTTAGATCT CTCTTGATAA GGCATCATTA AATAATGATT ATTTAAGTAA 3960
TGTCCTGTGG CCTTGAACAA GTGACTTAAC CTTTTTGGCC GTAGGTTTCC TTGGTTTCAA 4020
AATTGTAGGG TATACAGACT GGTGCTAGAC TGAGAGACAT 4060