EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS189-00577 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Thymus 
Coordinate
chr11:128341720-128347740 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs11221322chr11128346793hg19
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr11:128347222-128347233AAGCAATAAAA+6.32
Foxo1MA0480.1chr11:128344099-128344110TGTAAACAGCA-6.14
GATA2MA0036.3chr11:128346871-128346882TTCTTATCTTT+6.62
Gata1MA0035.3chr11:128346082-128346093TCCTTATCTGT+6.14
JUN(var.2)MA0489.1chr11:128342255-128342269GAGAGGTGAGTCAT+6
MyogMA0500.1chr11:128346059-128346070AACAGCTGCAG+6.02
MyogMA0500.1chr11:128342427-128342438CTGCAGCTGTC-6.62
Tcf12MA0521.1chr11:128342427-128342438CTGCAGCTGTC-6.14
Tcf12MA0521.1chr11:128346059-128346070AACAGCTGCAG+6.62
ZNF263MA0528.1chr11:128346512-128346533GGAGAAGCAAGAGGAAGAAGA+6.81
Number of super-enhancer constituents: 66             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00192chr11:128343065-128345670Adipose_Nuclei
SE_10455chr11:128336385-128345560CD19_Primary
SE_10455chr11:128345595-128346520CD19_Primary
SE_10455chr11:128346664-128354801CD19_Primary
SE_10902chr11:128321727-128394358CD20
SE_11817chr11:128332177-128365777CD3
SE_14378chr11:128332215-128357048CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15393chr11:128334329-128354653CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15802chr11:128333937-128343680CD4_Naive_Primary_7pool
SE_15802chr11:128343841-128353543CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16285chr11:128336891-128349260CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16849chr11:128332262-128356520CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17294chr11:128324512-128398551CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17759chr11:128329148-128357623CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18249chr11:128321852-128398718CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19114chr11:128331753-128357509CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20009chr11:128331567-128356080CD56
SE_20752chr11:128333828-128354747CD8_Memory_7pool
SE_21448chr11:128332404-128348475CD8_Naive_7pool
SE_21913chr11:128331599-128357479CD8_Naive_8pool
SE_22308chr11:128328960-128398600CD8_primiary
SE_25501chr11:128334490-128349805DND41
SE_25865chr11:128340548-128342812Duodenum_Smooth_Muscle
SE_25865chr11:128342976-128346880Duodenum_Smooth_Muscle
SE_30919chr11:128331670-128357481Fetal_Thymus
SE_32337chr11:128342251-128342859Gastric
SE_32337chr11:128344310-128345120Gastric
SE_37100chr11:128343098-128345460HSMMtube
SE_39385chr11:128337567-128345541Jurkat
SE_39385chr11:128345646-128354812Jurkat
SE_40667chr11:128341705-128343082Left_Ventricle
SE_40667chr11:128343225-128345642Left_Ventricle
SE_42190chr11:128341942-128343034Lung
SE_42190chr11:128343150-128345313Lung
SE_42190chr11:128346631-128347664Lung
SE_44140chr11:128340654-128343087NHDF-Ad
SE_44140chr11:128343125-128345583NHDF-Ad
SE_45563chr11:128331262-128345581Osteoblasts
SE_45563chr11:128345636-128357484Osteoblasts
SE_48975chr11:128343306-128344131Right_Atrium
SE_48975chr11:128344373-128345161Right_Atrium
SE_49876chr11:128332214-128345505RPMI-8402
SE_49876chr11:128345674-128354726RPMI-8402
SE_50081chr11:128340674-128345619Sigmoid_Colon
SE_50081chr11:128345626-128346525Sigmoid_Colon
SE_50081chr11:128346625-128347749Sigmoid_Colon
SE_51541chr11:128342935-128345450Skeletal_Muscle
SE_52408chr11:128341713-128343047Small_Intestine
SE_52408chr11:128343166-128345590Small_Intestine
SE_52408chr11:128345659-128346650Small_Intestine
SE_52408chr11:128346714-128347763Small_Intestine
SE_53438chr11:128341663-128343050Spleen
SE_53438chr11:128343105-128345612Spleen
SE_53438chr11:128345621-128346463Spleen
SE_53438chr11:128346682-128347736Spleen
SE_55100chr11:128341650-128345463Thymus
SE_55100chr11:128345565-128347779Thymus
SE_58620chr11:128337654-128393684Ly1
SE_58996chr11:128336836-128368437Ly3
SE_59884chr11:128331300-128367984Ly4
SE_60892chr11:128338047-128393180DHL6
SE_61158chr11:128336682-128372908HBL1
SE_62208chr11:128321103-128398910Tonsil
SE_63501chr11:128343200-128345106HSMM
SE_66273chr11:128337567-128345541Jurkat
SE_66273chr11:128345646-128354812Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr11128341794128342415
chr11128343668128343835
chr11128346619128346923
chr11128344516128345492
Enhancer Sequence
GAAGATTATA GTCTTTTCTC AGTAGGATTC TCAACTTGCT CTCTGGAATT TATTTTATCC 60
TAGGGGTTAA GTTTTCCCTG CATGTCAACA ATGAGAGAAA TCACTAGTTA GGTATAATAG 120
AATCCTTGGA AGGTAGTTGA ACTAGATCCT AAGTGATCAT TTGCACACCG AATTTTGTAA 180
GCATTTATCC AGCATATAAT CTCTGAACAC TCCTCAAACG TAGCCAGAGT GTGTTGAATA 240
GCAAAACACA ATATTAACAA CTGCATGGAG GTAGCGGAAC AAGTACTTTT TGTTTCACCA 300
TAACGTGATA AGCTGAAAGT GTCCTACCTA CGCCTTTAAA GAAAAAAAGA ACAGAGAACC 360
TAGCCTTGAG AGGCCTCCAT AAGAAACTCC ACCGCCTCAG CTCTGAATGT CAAACACCTC 420
CACAGACCTG TGCCCTGTGA GCATCTCCAA CAAAGCAAGT CCCATCCTTG TTTCAGAGTT 480
TAAACTTTCA CATTCAATCA CTCTAGGAGA ACTTTCACTC TCATTATCTC TCAGGGAGAG 540
GTGAGTCATA CAAAAGACAA TAAAGTTTGG GGAGTTACAG TCAACAACAT GCATTGAACT 600
CAGAAGCCCA TCACGGACTA CTGAGAGTGT CGGGACACAT GGTCTTGAGT CCTGCCACAT 660
GGAAAAGCTG TGCTGGTCTC AACAAGCCAT GTTTACAGCT CAGGTCCCTG CAGCTGTCAC 720
ACTACCTGTT CTACTCAGTT CTCCTGCTTC AGGGAACATA ATTGACTGGC TCTACCATGT 780
CCACACCAGC ACCCCTCATC CTGGGGACTG CTCCAGCCAG GGACTGAGCA CAGTGAGGGC 840
ATGCAGGTCC ACCCCTGTGA GACACAGAGC TCCTCCAGCA GACGACCTTG ACCCAAAGAT 900
CCCCTGGGCC CAGCCAAAGT TTTCTTAGAA TGGAGCTGCA GTTGAGGGCT CTTTCTACCC 960
AAATCTCCTC CTTCCAGACC TGCAGCATGG TCTGAAGGTT CCGCTGCCTT CTCTTCGCTG 1020
CCTTTTTTTC CTTCATAGAT GCTCCTTCCG TAAACATCTT GCACATCTAA TCATGTCTTG 1080
GCACCTGCTT TCCGGCACAC TCAAACTAAC ACAGTATTTT GAATATTTTC TGACATGTGA 1140
AAACCCTGAA AGTCATCTTA TTTGTTGTTT GCTGTGTAAC ATTGGGCTAG ACCTCCTCCT 1200
CTAAAAAGAA AAAAAAAAGT CTCGATTCCC TCATTTATAC AATGGGCATA ACAGAAACTT 1260
CCTCATGTGA TATTTGGTGA AGGATTTAAA AAGTCAGTGT ATATGAAGGA GTCTAAGCAC 1320
ACAGTAGGAA CTTAATACAT CTGGGATTGA GCTAAATAAT TGAAAAGACC TAATTATTAT 1380
TAAATGCCTG CTACGCCCCA TGACACTGCC AGCAATTACT GCAATTCTAT AAGTAAAATG 1440
CGTTGTTCCC TGGCCTCAAG GAACTTAGAA TTATACTGGA AAAATAAAAG GTTTGGAGAA 1500
TACTATGGAA TGTAGGTGAC AGCTAGCACT TAGAGCCTAG CTTCCTGTAT ACCCAGCACT 1560
GCTCCAAGTG CTCTCCATAA ACTAATTCAT TAGTTCTCAC AACAAGCCTA TGGTATAGAA 1620
ACTATTATTA CTGCCATTTG CAGATGAGAA AACAGATACA GAGATGTTAG CTTGCCAAAG 1680
GTTACACAGC TGCTCACTGG CAGGGCCTGA CTCCATGCTC TCAATTCTAC AGGGATGGCC 1740
CCTGAATGTT GCCCTTGGTA AAACTGCATG GGATGACCAC TCTTTCTTGT GTTTAACTTG 1800
GACTTCTCTA CCTGCAGGCA TCCCCAAGTG ACTGATGGGG TGCTGATGAG TGCTCCAACC 1860
TGCAGGCATC ACATGCAAGT CACCTTAGGG AGACAGGAAG GGCAGCGCTT CTCTTGAATG 1920
AGCCTCTACA AAGAGCAGCA GCTGCTCACT CTCTGCAGCA GGGGAGGCCG TCCAGAGAAA 1980
AGAAAGAAGT GCCAAGGGGG CAAAGGCAGG GTCATCTGGG ACACCTGGCA GGGCCTTTCC 2040
CAACAGAGGT GATGGGGAGT TTCCGAGGCC TGTTGTTTAA AGGCAATAAA GACTGGTGTG 2100
GATGTCTCAG CAGCACGCTG GCTGCATTCT GCTCAGTGGA AACATTTTGC TTCCTCCAAA 2160
GGTGGAGCTT CAAACTGGAG ACAGAGTGGA ATTCCAGAAC AGTCACCACC CAATTCCATT 2220
ATTTGTAGTG AGACTTTATT AAAGAAACAG TGACCCCAAA AATCTAAGAC TCAGAGACTC 2280
TTCCTCTAAA ACAGGCAGTG GGCTATACCC AGAATAGAGG GGTCAACCCG TGAGTCTCCT 2340
GGTATCCAAA ATCCAGGCAC CCTCAAGACC TCAGAGAGTT GTAAACAGCA CCAGGGTGCA 2400
GGATGTATTG TACAGTATGA ATAGATCCCT TCTGTCCAAA GACTGCTTGC AAGGTATTAC 2460
CGCAGCTGAA TCAAGACACT AAGATGCTTC AGCCAGTTGT GGTCTTTGAA AGCCATGACA 2520
GAAATAGGCA ATCACCACTT TCCACGTTTT TTAAAAGACA TTTAGAAAAA AAAAAGTTCA 2580
TAGTGAGGAC GAATCTTTTT ACCATGTGAT CTTTTTCTAC TGGTAGCAGA TGATTAAGAA 2640
AAATTCATAC AAAACTAATT AGATAGGAGG CAGAAACAGT GGAATTACTC ACAGGCAATA 2700
GAAAAGAGCT TTGCCTCCCA ACCAGTTCAA ATCTTCCCGG GAATTTTCCT CCTCAGTGCT 2760
CCAAAGTATT TTCCCGTCAA TCACATAACT GAGCAGCATG TGAGTCTATT ACTCCACTGA 2820
GATCCCCAGG TCCACGCCAG GCACCCCTTT AGGATCCACT GCTAAACCCA GCACCGTGAA 2880
TGGAATCCCT GCCAGCATCT CAGCTGCTGG CTGACAGGAA GGCTCTATTT AAGCTGAGGG 2940
GGCTGCCAGC TTCCTGCAAC TAGTTAATCA CAACAGCCTC TGAGCAAGAA AGGGAAGACA 3000
CTCTGTTTCT GCCCTTCTCA TTCCCAAGCT CTTTTCCTCT TATCCAATCA GGTACTGCCC 3060
AAGGATGGTC TACATTGAGA CTGTGATGGC TTCAGCAAGC CTGGAAGCCA GCCCCAGCTT 3120
TGCCTGGCCT GCAGACCTCA GTGAAATGCC CTAACTTCTC TGGGCCTGAC TTTAGCCAAT 3180
TCACACTGTC TTACACAACA GCATTTACAT GGAGAGACTT TAGATTCCAG AGCTTCGCTC 3240
CTGTTATCTC CCCAAATTAA AAGGCTCTAC GCTGTTCCTA ATCACATGCC CACAGCACAA 3300
ATTCACACTG CACTAGTAAC CTGCTTTTAC TCTTTCCTTA TCACTAACTT AGGCTCATAC 3360
CAAAAGTTTC CTCAGTTGTT GTTTGTACCT GAATACATTG AGATTATTTT GCAATCGAGC 3420
CTTCCTTCAG AAAACTGTGA TTTCAGCTAA TGCTGCCAAA TCTCAGGTTT CATTCTGAAC 3480
TGAAGGGCTT TGAAGCACTT CCTTTTGCAG TAAAGTTGTT TATTTTCAAA AACATGTTTT 3540
AGCAGTAGTT TTGGGTTACT GATCCCTAAA ACTCAACTAC GAGCCAGAAC TCTAAGGTTC 3600
TGGACTTGGC CCTGGGACTT TCTTATTGTG TGACTTTAGA CTGGCTCTAG AGTCATCTAT 3660
GAAATGACAA GAAGAGGATT TATTTCAGGG CAGAATCAAC TTGAGAGGAC CTAGAGGAGA 3720
ATGCACAGGG CTTTTTTTTT TTTTTTTTTT GAGACGGAGT CTCGCTCTGT CACCCAGGCT 3780
GGAGTGTGCG ATCTCGGCTC ACTGCAAGCT CCGCCTCCTG GGTTCACAGC ATTCTCCTGC 3840
CTCAGCCTAC CAAGTGGCTG GGACTACAGG CGCCCACCAC CACGCCCAGC TAGTTTTTTG 3900
TATTTTTAGT AGAGACGGGG TTTCACTGTG TTAGCCAGGA TGGTCTCGAT CTCCTGACCT 3960
CATGATCTGC CTGCCTCTGC CTCCCAAAGT GCTGGGATTA CAGGCGTGAG CCACCGCACC 4020
CGGCCCGGGG CTTCTTTTCC TGCAAGACTA GTACCTTTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGA 4080
TGTCTCACAC ACACAAAAAA ATTTGGAAGT TGAATTCCAG ATAGTCCCAA ATTTAGCCTT 4140
AAGGAAACTG AAGGACTGCC TACTTATAAA TCTGCATAAC ACCATAAAAC ATAATTTCAT 4200
TACAGTTAGT GAATGGCTTT GGGTTTAGCC TTTTTCAGGC TCCTAGAAAA CAAGAAAATC 4260
ACTTCATTCA TAAATGCAAA TCAAAGAGTG AGAACACACC TAGACATTGA TAAGGGCATT 4320
ACCACCAGAC CTGCTCAACA ACAGCTGCAG AAGTGATAGG ACTCCTTATC TGTGGCTATG 4380
TCTGACAATC TGGAATGAAG TTCAATAAAG GTGATTTATA GGTCAATAAT TCTGGACGGA 4440
AGCCAAGGCC AGCTCTCTTC CCTCCCACAT ACCCCTAACC CACATGCATA TAGTGTTCAT 4500
TAGTGACAAG AGGGAGATAA GGTCCTAATC AGTCTAGGCA GGCAACTGCA ATAACCAAGG 4560
AGTACTCTCA TTATCTAATA TGAAGAAAAG ATTTTCTATT CAGGTGAGAC ATTTGGTGCT 4620
TAAGATTCAA TTCAGAAGCT ACCTCTGTGC AGAATGCAAT TACATACATG GCCTTGAATA 4680
AGTCATTTTT TTGTGCCTCA GTTTCATCAT CTATGAAATG GGACTAGAGG GGTTGAGAGG 4740
AAGAGAGACT ACTATGTGAC AACCCATTAT ATTATTCTAT ACCTACTGAA ATGGAGAAGC 4800
AAGAGGAAGA AGAGATGCCT ATGTTTTTCA AGGACTTGGA AAGCGTTTTG CTTAGGTCTA 4860
TAAAATGTAT ATAGAAAGCA TTGGGCTACT TCTCTAGGAC TGTGTTGTAA TTAGAAGGGG 4920
TTCATAATGT ATCTTCGAAC AAAAGAAAAT GGAGCTTTCT GATGGTATCA GTTTGATAAC 4980
CGTAAACAGT TCACAGTAAG GTAAGAAGGT ACATTTTGGC GGAAGCCAAC ATTGCATTTG 5040
ATGTATTCTT AACTCAGCTA ACAGGCAGGC TTTCAAGCCA CGTTATCTGC CCCCGCATCT 5100
TGACCTCATT TAACAAGTTG CTATGGGAGC CCAGTGAAGG TTGATGCAAT TTTCTTATCT 5160
TTGGAGGAAG AATGTAACTG TGCAGGAGAA TGTGAAAATT CAGTTTCTAA CTGGCTTCCG 5220
CACTTACAGT GCAGTAAGAA AGACATCCTA TCAAGAAGTA AAATGTATTC CTTTGGACGT 5280
GATAGGGACA AAGACCCAGA CTCCTGGTGA AATGGCAGGG AGATGGATTC TCTTCCCAGC 5340
TTGGAGAATC TAAGCATGCA CCCTTTAGTT CAGGCCAAGT AATAGTGACA TAGAGCTATG 5400
TGTACCCCTA CTGTGTGGCC AAACATACTC TGGAGCAATC AAATTTTAAG GGAACAGACA 5460
GAAAAGTTGA GCAGAACCTG AGAAGGTGAG TGTGACTTTT ACAAGCAATA AAATGTATTG 5520
CCAACAAGTC TATACAATGA TTTCTGCTTT CCAAAGTACT TTTGCAAATT TCAGCTCATC 5580
TTAACATGTC TGCATAAAGC TAGACAGCCA TTTATAGGCA CTCTAGTGAC TGCCTCAGGT 5640
GGTGGGTGAG GCTGTATGGG CACATTTCAT CCGCTTCCCT ATTCCCTAGG ACGCATCTTA 5700
AATGAGGTTG GCGGGGGCAC CATGAGGGTG TGAGATCACC CTCAGAGGGT GAGTCTGCAG 5760
TACAGGCAGG AGGTGTTCAC CAGGTATCAA TTACAGGGAA AAAATAAATA CTAAAATGTG 5820
GGCTGCTCCT CACATACCTA ACAAATCCCA ACTTTCATTC AGACCACAAC AATAGGAGAA 5880
TCCAGTTCAA GTCTAAGGAT ATTTAAAATA TCTTGAATCC AAGGAGACAG TGAGCCCACA 5940
TACTCGCTTT TCTGCACTCA ATATGCGCTC AAACATTTGC TGAAATAATT GAATTGTTAT 6000
AATTGAGGGT TTTTTTCTCT 6020