EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS188-06423 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Th2 
Coordinate
chr19:19482890-19485070 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs2905432chr1919484295hg19
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr19:19483171-19483184TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:19483175-19483188TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:19483179-19483192TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:19483172-19483185AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:19483176-19483189AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:19483180-19483193AATTAATTAATTT-6.92
Nkx3-2MA0122.3chr19:19483728-19483741ATTAAGTGGATTA-6
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:19484855-19484870TGAACTCCTGACCTC-6.22
POU6F1MA0628.1chr19:19483173-19483183ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:19483177-19483187ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:19483181-19483191ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:19483173-19483183ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:19483177-19483187ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:19483181-19483191ATTAATTAAT-6.02
SREBF1MA0595.1chr19:19484692-19484702GTGGGGTGAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09215chr19:19483114-19484967CD14
SE_14988chr19:19483154-19484492CD4_Memory_Primary_7pool
SE_21339chr19:19483111-19484446CD8_Memory_7pool
SE_23432chr19:19483389-19484372Colon_Crypt_1
SE_23432chr19:19484383-19484690Colon_Crypt_1
SE_32412chr19:19483362-19484659Gastric
SE_40222chr19:19483245-19484320K562
SE_43282chr19:19483235-19484514Lung
SE_50929chr19:19483247-19484750Sigmoid_Colon
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr191948362919484204
chr191948334719484384
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I019370chr191948137819484648
Enhancer Sequence
TCACTATGTT GCCCAGGCAG TTCTCAAACT CCTGGGCTCA AGCGATCCTC CCACCTCAGC 60
CTCTCAAAAG GCTGGGATTA CAGGCATAAG CCACCGTGCC CAGCAACATT TTTAACTCTT 120
TTTTTTTAGA GAAAGGGTTT TGCTCTGTCA CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG CACAATTGTA 180
GCCTACTGCA GCCTCGGCTT CCTGGGCTCA AGGGATCCTC CAGTCTCAGC CTCCAGAGTA 240
GTTAGGACTG CAAATGCACA CCACCACACT TAGACAGTTT TTAATTAATT AATTAATTAA 300
TTTTGAGACA GAGTCTCACT CTGTCACCCA GGCTGGAGTG TAGTGGTGTG ATCTCTGCTC 360
ATTGCAACTC CCCATCCCAG ATTCAAGTGA TTCTCCTGCC TCAGCCTCCA GAGTATCTGG 420
GATTGCAGAC ACATGCCACC ACGCCTGGCT AATTTTTGTA TTAATATTTT TAGTAGAAAT 480
GGAGTTTTGC CATGTTGGTC AGGTTGGTCT TAAACTCCTG TCCTCAAATG ATCCATCTAC 540
CTTAGCCTCC CAAAGTGCTG GGATTACAGG GGTAAGCCAC CATGTCCAGC CAATTTTTAA 600
ATTATTTTTT GTACAGATGG AGTCTTGCTT TGTTGCCCAG GCTGGTCTCA AACTCCTGGC 660
CTCAAGCGAT CCTCCTGCCT CAGCCTCCCA AATTGTTGGG GGGTTACAGG CATGAGCTAC 720
TGTGCCTGAC CTGGAAGTGG ATTTTGAAGT GGATTTTGCA GCCTGTTTGT GTCTCCCAAG 780
CCACAAAAGA CTCTGACCTT CGTGTTTGAC CAGTTCCTTG GAAGGCACCA GTCTGTGTAT 840
TAAGTGGATT ATCCAAACCC AGACTGACTC CTGGCACATG GAAGATGCTT TGGGATACAC 900
TTATACTAAA AGGGTATTCA TTCGTGACTG ATCTGAAATC CAAATCTAAT GGGGCATCCT 960
ATATTTTCAC TTGCTAAATG TGGCCACCCT AGATGCTCAA TGACATCCTT GAATAAAGGA 1020
AGCTGATGAA GTTCAAACAA ATAATTTTAC CAGCGGGGTA AAAAAAGCTC AAAGCTCAGT 1080
GCACTTTGCG AAACAGTCAT TTCCTCTTCC GGTCAGAATA AACTCCTGAC TCCTCCCAGG 1140
CCCAAGTGAT CAGCCACTCC CTCCTACCAG CTGGCTGGGC TGCTGTGCTC AGTCCCAACT 1200
CAGGAAGGAC AAGAGTAGCT CCTGTGACCA TAATGCCTGT CCACAAGCTG AGGCCCCACC 1260
CCACTCCGCC TCCTTTTCTT TTTCTTTGAA ATGGAGTCTT GGTCTTTTTG CCCAGGCTAG 1320
AGTGCAGTGG CGTGATCTCG GCTCACTGCA ACCTCCACCT CCCAGGCTCA AGCGATTCTC 1380
CTGCCTCAGC CTCCCAAACA GCTGGGATTA CAGGCATGCA CCACCACCCC CAGCTAATTT 1440
TTGTATTTTT AGTAGAGACA GGGTTTTCAC CATGTTGGTG AGGCTGGTCT CAAACTCCTG 1500
ACCTCATGAT CCACCTGCCT CGGCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGCG TGAGCCACCG 1560
TGCCTGGCCA CCCCCTTGCT TTTTAGACAC AAGGTCTTGC TCTGTCACCC AGGCTGGAGT 1620
GCAGTGGCAT AATCTTGGCT CACTGCAGCC TTAAAACTCC TCAAGTGATC TTCTGTCTCA 1680
GCCTCCCAAG TAGTTAGGAC TATGGGTGCG TGCCACCAAC GCGCCTGGCA CTGAGACCTG 1740
GATTTTTTTT TTTTTTTTTT TGGTGAGATA GAGTCTTGCT CCGTCGCCCA GGCTGGAGTG 1800
CAGTGGGGTG ATCTTGGCTC ACTGCAACCT CCGCCTTCCA GGTTCAAGCG ATTCTCCTGC 1860
TTCAGCCTCC CAAGTAGCTG GGACTACAGG CGCCCGCCAC CATGCCCAGC TAATTTGTGT 1920
ATTTTTAGTA GAGACAGGGT TTCGCTATGT TGGCCAGGCC GGTCTTGAAC TCCTGACCTC 1980
GTAATCTGCC TGCCTCGGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AGGCGTGAGC CACCACTCCC 2040
GGCCTGAGAC CTGGATCTTA AAAAGGGCTC AGCTGGGTGT AGTCACACAC CTGTAGTTCC 2100
AGTGACTTGG GAGGCTGATA TAGGAGGCTA GCTTGAAGCC CAGGAGTTCA AAGTGAGACT 2160
AGCAACATAA TGAGACCTCA 2180