Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS188-06149 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | Th2 |
Coordinate | chr19:3151830-3155010 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
Nr2f6 | MA0677.1 | chr19:3152595-3152609 | AATGTCAAAGGTCA | + | 6.96 | Rxra | MA0512.2 | chr19:3152595-3152609 | AATGTCAAAGGTCA | + | 6.17 |
|
| Number of super-enhancer constituents: 17 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_12975 | chr19:3150181-3152369 | CD34_Primary_RO01480 | SE_12975 | chr19:3154517-3156405 | CD34_Primary_RO01480 | SE_13481 | chr19:3150142-3153236 | CD34_Primary_RO01536 | SE_13481 | chr19:3153358-3156613 | CD34_Primary_RO01536 | SE_14110 | chr19:3150059-3152808 | CD34_Primary_RO01549 | SE_14110 | chr19:3153486-3157108 | CD34_Primary_RO01549 | SE_19358 | chr19:3151638-3152447 | CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17 | SE_19358 | chr19:3153424-3156496 | CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17 | SE_34734 | chr19:3150282-3156645 | HeLa | SE_36531 | chr19:3151424-3153065 | HMEC | SE_36531 | chr19:3154162-3156502 | HMEC | SE_42742 | chr19:3151577-3152926 | Lung | SE_42742 | chr19:3154184-3156647 | Lung | SE_56375 | chr19:3149400-3152974 | u87 | SE_56375 | chr19:3153990-3155289 | u87 | SE_59530 | chr19:3131939-3156094 | Ly3 | SE_65597 | chr19:3154418-3156115 | Pancreatic_islets |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 3 | Chromosome | Start | End |
chr19 | 3153392 | 3153939 | chr19 | 3154006 | 3154458 | chr19 | 3152176 | 3152389 |
|
| Number: 1 | ID | Chromosome | Start | End |
GH19I003150 | chr19 | 3150382 | 3156390 |
|
Enhancer Sequence | GCGGTGAGCG CTCCACCTAG GCCCAGCCTA GGGGGCAGGG AAGGCTTCCT GTAGGAAGGG 60 CAAAGGAGCT GGGGCCCTGA GGGATGAGTA GGAGTTTCTT AGGCCCAGCC TTCAAGGAGC 120 TGCCAAGCTA GGGGAAGCAA AGCTCCATGT AGACACCTCC AGGCCCCCAG GTAGTCAGGA 180 CTGGGACCTG TAGGAGCCCA GGCTGAGGCA TCAGAGATCC AGGAGGGAAT ATCTTCTTGG 240 AGGAGGGAAT ATTAATGGGG TTTTGAAAGA CGAATAGGAG TTCAGTAGTC CTAACCCTGA 300 AGGGGCTGCT GGGGAGGAGG AAATAGAGAC TATACAGTCA GGACCAGGTC TGGGGAGGCC 360 TGGTCTGGGG AGCTCAGAGG TGATCCCTGT AGTCATCAAC ACTGGGGGAT GGACTAGAGT 420 GTGAGGCTGG AAGTCAGGAA ACTCAGAAAA AGGAGGAGCC AGGACAGCGG GCGTGGGGAT 480 GGAAAGGAAG GGATGGGCAA GAGTTGTTTC TGATGTGGAA TGGGCAGGAC TGGATGAGTG 540 TGGGAATTAG AACAGGAAGT CAAAAATGAC ACCTGAGTTT TTTGTCAAGG TGATGGGGGT 600 AGACAGTGGA GCCGGTGGGC TAGAGGATGA AAAGGTGGTG ATGGAGTCCT TTGGGACAGG 660 TTGAGTCTGA GGGGCCTAGG GGGACTCCAC CTTAGCTGGC AGACAGAGGT GGGAATGGCC 720 AGTGCAGCAC CCTAACCCTA ACCCTAACCC AGCAGAGCAA TGGCCAATGT CAAAGGTCAG 780 GAAAGGAAAG GTCAAGAATA CAGTGAGAAG AATGACTCTG GGATTGGCAG TTAGAGGGTC 840 ACTGGTGACC TTAGCAAGAT CTGTTTCCAT GGGCTGATGG CGGGGAGCTG AGCAGGGGTG 900 CAAAGTCATG CCCAGAGACA GCGATTGTGT TTGACCTACC CCTATTTGGC CTTCCTTTCC 960 CTAAATCCCC CAAACCTATT GTTTTGGCCT CTTCAATAGT CCTTACTAGG AAGGTTCATA 1020 ATTTATCTGT TTTCTGTGGG TCTCCTCTAC AAGATGGAGA GCCTCACAAG GTTAGGGGCT 1080 GAGTTTGATT CTTCTGCTTC TTTAGTGAAT AGCTAAAGGT CAGAGTAGAA GTTGGTAAAT 1140 GTGGGTGGAT GGTTGGAAAG ATGGAATGGG GGCAACCCGC TCGGGTCCCC TTCCACGCTG 1200 TGGAAGCTTT GTTCTTTCGC TCTTCACAAT AAATCTTGCT GCTGCTCACT CTTTGGGTCC 1260 ACACCACCTT TAAGAGCTGT AACACTTACT GCGAAGGTCT GCGGCTTCAT TCTTGAAGTC 1320 AGCGAGACCG AGAACCCACG AGAAGGAACC AGCTCTGGGA CACAATAGTA GTGTTAGTAC 1380 CCAAGGATGA CTTCTATGGG AGAGATACTT GGTCTGGGAA TCTTTAAAAA AAAAAAAAAA 1440 GGAAAGATGG AAGGGAATGG ATGGGTGGAT GAATGGGTGG ATGGATAGAT GAATAGATGG 1500 ATGGATAAGT TGAGGGATAG ATGAGTGGAT GGATGGAGTG GCAGGATGGA TGAGTGGATG 1560 AATCAATGGA TAGATGGATG AGTGGGTGGA TGGATGAATG GATGGATAGA TGGATGGATT 1620 GAAAGAGGGA TGAGTGGATG GATGGATGGA TGGATGGTTA GATGGGTGGA TGGGTGATAC 1680 ATGAATGGAT GAGTGGGTGG ATGAGTGGAT AGATGGATAG ATGGGTGGAT GAATGGGTGG 1740 ATGGATGGGT GAATGAGTGG ATGGATGAAT TAATGGGTAG ATGGGTGGAA GGGTGATGGG 1800 TGAATGGATG GGTGGGTGGA TTGGTGAGTG AAGGATGGAT GGATGAGTGG ATAGATGGAT 1860 GGGTGGGTGG GATGGATGAA TGGATGGATG AATGGGTGGG TGAATGCATG GATGGATGGG 1920 TGGATGAGTG GATGGATGGA TGAATGAATG GGTAGATGGG TGGCAGGTGA TGGATGAATG 1980 AATGAATAAA TGGGTGAATG GGTGAGTGAA GGATGGATGG ATGAGTGGGT GAATGGATGG 2040 ATGAATGGAT GAGTGGATGG GGGTGTGGGT GGGTGGATGG GTAGATGGGT GGACGAGTGA 2100 GTGGATAGAT GGGTAGATGG ATGTATGAGT AGATGGATAA TGGGTGAACA GATGGGTGGA 2160 TGGATAGATG AGTAGATGAA GCGATGGATG GATGGGTGGA TTGAGTAAAT GGGTGGACAG 2220 GCAGGTGGAT GATGGATGGA TGAATAGATG GGTAGATGGA TAGACGGATA GATGGATGGA 2280 TGAGTGAATG AATAGATGGA TGGGTGGATG GATAGATGGA TGGATGGGTG GGATGGATGG 2340 ATGGATGGAT GGATGAATGG GTGGATGGAT GGGTGGATGA GTGGATGGAT GGATGAATGA 2400 ATGGGTAGAT GGGTGGTGGG TGATGGATGG ATGGATGAAT GGGTGGATGG ATGGGTGGAT 2460 GAGTGGATGG ATGGATGAAT GAATGGGTAG ATGGGTGGTG GGTGACGGAT GAATGGATGA 2520 ATGGGTGGAT GGGTGAGTGG ATGAATGGAT GAGTGGATGG GTGGGAGGGT GGGTGGATGG 2580 GTACATGGGT GGATGAGTGA GTGGATAGAT GGGTAGATGG ATGGATGGGT AGCTGGGTAA 2640 TGGGTGGACA GATGGGTGGA TGGATGGATG GATGAGTAAA TGGAGAGATG GATGGGTGGG 2700 TCGGTGGGTG GATTTCGTAA ATGGGTGGAC AGGTGGATGG ATGATGGATG GATGGATAGA 2760 TGGGTAGATG GATAGATGGA TGGATGAGTG AATGGCTGGA TGGGTGGATG GATGGGTGGG 2820 TGGATGGATG ATGGATGGAT GGATAGATGG GTAGATGGAT AGATGGATGG ATGAGTGAAT 2880 GGCTGGATGG GTGGATGGAT GAGTGGGTGG GTGGATGGGT GGATGGATGA GTGAATAAAT 2940 CGATGAATGG GGTGGGTGGG TGGATAAAAG TTTAGGAGTG AAGGTAGAGG CTGGGAAATC 3000 ATGGGGAAGT CTGGGCCAAG GAAGTGATTT TTAGGTGTGG CCCAGGAGTG AGACGAATGA 3060 ATGGAGTGAG GGCTCAGAGG ACACTGAGAC CCGAGATGAG AGGTGATGCC CACAGTTCCC 3120 AACTGGTCAG TTGCTGATCC CACTCCCGTC TCAGTCTCCA GAGCCCCCTC TCGACGGCTG 3180
|