EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS187-17297 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Th1 
Coordinate
chr3:66539560-66541660 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr3:66541611-66541627TACAAAGTAAACAATA+6
Foxa2MA0047.2chr3:66541612-66541624ACAAAGTAAACA-6.18
LMX1BMA0703.2chr3:66541153-66541164AATTTAATTAA+6.32
RUNX1MA0002.2chr3:66540880-66540891AAACCACAGAC-6.62
Stat4MA0518.1chr3:66540780-66540794TCACTTCCTGGAAG-6.37
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00059chr3:66530196-66552544Adipose_Nuclei
SE_01889chr3:66540527-66541068Aorta
SE_04477chr3:66539880-66541883Brain_Anterior_Caudate
SE_07402chr3:66540177-66544311Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_18933chr3:66537513-66543483CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19806chr3:66539075-66541612CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_25818chr3:66529498-66551465Duodenum_Smooth_Muscle
SE_30213chr3:66540130-66541533Fetal_Muscle
SE_42410chr3:66540491-66541134Lung
SE_54531chr3:66538686-66541014Stomach_Smooth_Muscle
SE_62110chr3:66522634-66552298Toledo
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I066488chr36653882666541642
Enhancer Sequence
GCTCACAAAA GGGTCCCTCA TTGAGACTCT GCATGCACAT ACCCTTTTTT CTCTTTGCTG 60
CTTATGGTAT CCATCTGAGA ATTTCACTCA GAAGTAGCAA ACATTGGCCT AGCATGGTAG 120
CTCACATCTG TAACCCCAGC ACTTTGGGAG GCCAAGGCAG GAGGATCACT TGAGCCCAGG 180
AGATCAAGAC CAGTCTGGGC AACACAGCAA GATCCCATCT TCACAAAAAA TAAAAACTAG 240
CCAGGTGTGG TGGCACATGC CTGTAGTCCT AGCTACTCAG TAGACTGAGG TAGGAGGATC 300
ACTTGAGCCT GGGAGGTCAC GGCTATAGTG AGCCATGATT GCGCCACTGC ACTCCAACCT 360
GGGTGACAGA GTGGGACCCT TTGTGTGTAT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTCTAA 420
CACACACACA GAGAGAGAGA GAATGTTTAA GTATCCTAGA TACAGATCAA TTTAATTCTT 480
ACCATCCAAT GAAATATAAG TTTACTCCCT TTTTGCTTCA ATTAGAATAG AATCATGAAC 540
CTAAAAATGA GGGGTCTTAG AAATTATACA TCCCTTTACA GACAGGAAAT GAAGTGACTA 600
GCCCAAGGTT ATGCTGCCAA TCAGTGGCAG AGCTGGGACG AAACCCCAAC GTCTCCTGAG 660
GCCCAGCCAT GAGCTAGTTT CCCATTCTAC CACATCCTCA CTTTCATGAC TTTAAGAAAA 720
TTAATTTTTT CCTCTCAGGT GAATCATTTT TATGCCTCTT TGGGCAAGCA CCCCTTTAAG 780
AAACTCCATG AAAACGTGGT CTCCTTTCTG TCCAGAAAGA CATTCTGAGC ACCACGACTT 840
CACATAAAGT TTCTCCCAAG TAAATAATAA GGTCAGCCAA TCTTTATTTT AGGATAGTAA 900
TGAAATGAAT ATAATTTACT CATTTCTAAG TATTGTTTCA AATGACCTTG TGAAAGAACC 960
CAAAAATCTC CATAGAAGAG TCTCTGATTT TTCCATTGGG TAAAGCATAG CCCTGGATAA 1020
GGCCAAACCA CCCAAAGCAA AGAGTCCTAC ACAGACTCCA AATCTGAGAA AACAATCAGA 1080
GGAATTTGGG ATGAGGCAGA TCTTAATAAC TACAGGGCAT GTCAGCTTGT TTTCTGGATC 1140
TCCCCTCCTC CAAGATGGAA GGAAACCCTG CTCCCTTCGA GCTGCAGCCT CTGCATCCAT 1200
CACTTCATTG CATCAACAAT TCACTTCCTG GAAGCAACGA GCTCTTCTGA CTGTTTATAA 1260
GTTTTGCAAG CACTGGGAGC TTGTGTGCCA GAAACTCACA CCAGCCCAGG TGGAGGGAGG 1320
AAACCACAGA CACAGAGAAA AATTCTTCTT AATTAAAAAT AAAACGAAAA CTAAGACGGA 1380
GGCATGATGC TGGGTCAAGG TACCACCACA CTGCTAAAAC CAGATGAAAG AATGGTGTTC 1440
TCCTAATTTG CAGAACAGCA CTTAATTTCA TAGAATCTCT CAATACTAAG CTTTTCTGCC 1500
CCATAATTTA AAAAAAAAAA ATGCATTGGA GCGTGCTTCC ACTTTTCTAA ACAGAGAACC 1560
CACTGTAAAT GGTGTATAAT CGGTTATCAT ATAAATTTAA TTAAGCTTCA CAGATCCACC 1620
AGTTTAACCT GACCATGTTG GACAGCTTTT AAGGCCACCG AACACTCCAT AATCTACCTG 1680
GAATTTGATT TTCACAGATA GAAGATGGAA GTCATTCCAA AAACTAGGAT AAAGTGAATG 1740
GAATTTGGAG GACTAGTAAT TCCCACTCAG ATTCCTAAAT GAAGCTGCAG CTAGCAAAAA 1800
ATCCATTCTA AAGAAGCCCC CTCACCAACA AAGTACCGGA CTGAGGAGAA ATTAAACTAT 1860
GGACTTTTAT AAAATAAAAC AAACCATGCA GCAGCTACTT GGAGAACACA TTTTCAAATC 1920
TGTGTGAAGT TTAAATCAAG CACAGAGGGT TCCAGGAACC TAGTTCTTTG CTTTTTGAAG 1980
ATTTTTCTTA CAGGCTGCCT CTAACTCTAT TTAAAGCAGC CTCAAGTAGC CACAGCTGGA 2040
GGGTCAGGCC TTACAAAGTA AACAATAGTT AACTCAATTC AGACTCATGA CTTAACTACA 2100