EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS187-15147 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Th1 
Coordinate
chr20:30305320-30309450 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6087771chr2030306724hg19
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RUNX1MA0002.2chr20:30305443-30305454AAACCACAGAA-6.32
Number of super-enhancer constituents: 99             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30297989-30306428Adipose_Nuclei
SE_00546chr20:30306461-30312254Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30304224-30306272Aorta
SE_01656chr20:30306371-30311908Aorta
SE_02627chr20:30307051-30311961Astrocytes
SE_03109chr20:30308258-30309433Bladder
SE_03156chr20:30304345-30306204Brain_Angular_Gyrus
SE_03156chr20:30306497-30311444Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30297618-30312523Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30291888-30312530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30291812-30312465Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30297611-30312332Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30292115-30312408Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08789chr20:30306561-30307047Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08789chr20:30307109-30310334Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_13448chr20:30303541-30306370CD34_Primary_RO01536
SE_13448chr20:30306439-30312272CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30302978-30312324CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30302871-30312578CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30302979-30312159CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20764chr20:30302878-30312381CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30303825-30312264CD8_primiary
SE_23622chr20:30306472-30311911Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30302953-30312495DND41
SE_25933chr20:30303441-30311921Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30305408-30306284Esophagus
SE_26879chr20:30306378-30312004Esophagus
SE_27731chr20:30306378-30312126Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30306317-30312080Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30303024-30306306Fetal_Thymus
SE_30903chr20:30306355-30312106Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30304321-30306278Gastric
SE_31430chr20:30306417-30312032Gastric
SE_33407chr20:30302870-30306305H2171
SE_33407chr20:30306334-30312298H2171
SE_34309chr20:30291576-30306320HCT-116
SE_34309chr20:30306323-30312556HCT-116
SE_34643chr20:30298140-30312397HeLa
SE_35852chr20:30303427-30306293HMEC
SE_35852chr20:30306311-30312155HMEC
SE_36989chr20:30297525-30312332HSMMtube
SE_38141chr20:30303934-30306179HUVEC
SE_38141chr20:30306459-30312236HUVEC
SE_39144chr20:30307380-30311380IMR90
SE_39443chr20:30308115-30311313Jurkat
SE_39853chr20:30303646-30306330K562
SE_39853chr20:30306390-30312315K562
SE_40644chr20:30297536-30312142Left_Ventricle
SE_41648chr20:30305472-30306266LNCaP
SE_41648chr20:30306474-30310131LNCaP
SE_42121chr20:30295482-30306315Lung
SE_42121chr20:30306366-30312046Lung
SE_43515chr20:30291879-30312193MM1S
SE_44365chr20:30306380-30312027NHDF-Ad
SE_44995chr20:30307052-30312090NHLF
SE_45708chr20:30304068-30306118Osteoblasts
SE_45708chr20:30306812-30312173Osteoblasts
SE_47264chr20:30303610-30306362Panc1
SE_47264chr20:30306465-30312746Panc1
SE_47861chr20:30307071-30308101Pancreas
SE_47861chr20:30308207-30309183Pancreas
SE_48182chr20:30304554-30305954Psoas_Muscle
SE_48182chr20:30306387-30312048Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30304407-30306299Right_Atrium
SE_48890chr20:30306370-30312050Right_Atrium
SE_49684chr20:30307804-30310082Right_Ventricle
SE_49886chr20:30307003-30312251RPMI-8402
SE_50155chr20:30304194-30306264Sigmoid_Colon
SE_50155chr20:30306356-30312043Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30303939-30312172Skeletal_Muscle
SE_51884chr20:30307061-30311605Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30303600-30306295Small_Intestine
SE_52373chr20:30306397-30311994Small_Intestine
SE_53471chr20:30304367-30306295Spleen
SE_53471chr20:30306475-30312120Spleen
SE_55108chr20:30305375-30306100Thymus
SE_55108chr20:30307049-30311900Thymus
SE_55770chr20:30302950-30306293u87
SE_55770chr20:30306834-30312280u87
SE_56767chr20:30303028-30306253VACO_400
SE_56767chr20:30306433-30312207VACO_400
SE_57375chr20:30304250-30306250VACO_503
SE_57375chr20:30306412-30311876VACO_503
SE_57919chr20:30305360-30306242VACO_9m
SE_57919chr20:30306425-30311882VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30306862-30311641HSMM
SE_64478chr20:30304021-30306145NHEK
SE_64478chr20:30306344-30311737NHEK
SE_65412chr20:30308226-30312394Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30308115-30311313Jurkat
SE_67146chr20:30291879-30312193MM1S
SE_67821chr20:30302950-30306293u87
SE_67821chr20:30306834-30312280u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr203030660230306752
chr203030594030305996
chr203030772030308274
Enhancer Sequence
TACACTCAGA AGAAGTAGGT GTTTCAAGGG GGAGCCCCTG AGACACTTCT ACTTAATTTT 60
GGGACCCGAA TGAGATTACT AAAAATTTCC ACATTTGGGG TTTCTAATGG GGTTTCCCTA 120
AGAAAACCAC AGAACTGCCA CTATCTGCAA AGGGAGCTGA GGTGCTTCAA CTAAGCATAC 180
ATCCATCTGA AGAAGCCACA TTAGGCAATA AGAGATCTAC AGAAACTCAG ACCACTGAGC 240
CATACAGCTT AAGAAAGGCC AAGTTATGTT TTCTCCCCCA ACACAGTTCA TTGCTCCCAA 300
CAATTACGTT TCTATCAGGC TAAGGGATTT CTTCAGGGAC AGCAATCCCA AAGTGGCAAG 360
GCCCACCTGG GTCCCTTCCC ACATTCCCAT TGGAAAGCAC CAGAAACACT TGTGTCCCTT 420
CGGGGAAGGT CATGTATACA ACATTCCAGG AAAGTATCAC AGGGACTTTG TTTCTCAAGG 480
AGAAACTCTA GGGGGAAGAG TCAGTTCTCT GAGGGAAGCT GCCCATTCAT TAAAGGGTTT 540
CCACCCTACA ATTATGGCAG GAGAAGGGCT TTTGTGCTAG ATCCTTTACT CGAGTCAAGC 600
TATGGCAGCT GGCTATCATT ATTCCATTTT ACAGGCGGGA GAGACAGATG GACAAGACAG 660
CCGAACAGGT TCAGCATTTC ATCAGGTGAC TCCAGGCAGG CAGTAATCTG GCTAAGGGTC 720
TACACTTTCA GTCCTTGAAG CATCACTCCA CCACTAAGTA GAGATACCTG GGGCAGGCCA 780
CCTTCTCCCC ACACGCACAC CACTGTCATC TATTGGCAGG GCCTGAGAGG GTTTTAACAA 840
TGAAAAAATT GGCCGGGGCC AGGCACGGTG GTTCATGCCT GTAATCCCAG CATTTTGGGA 900
GGCTGAGGCA GGCGGATCAC CTGAGGTTGG GAGTTTGAAA CCAGCTTGAC CAACATGGAG 960
AAACCCCATC TCTACTAAAA ATACAAAATT AGCCAGGTGT GGTGGCGCAT GCCTGTAATC 1020
CCAGCTACTT GGGAGGCTGA GGCAGGAGAA TCACTTGAAC CCGGGAGGCA GAGGCTGCAG 1080
TGAGCTGAGA TCGCGCCACT GCACTCCAGC CTAGGCAACA AGAGCGAGAC TCCGTCTCAA 1140
AAAAAAAAAA AAAAAGAAAA AATTAATAAG CAGCTCACTC TGGGCAAAAC CCTGATGCCC 1200
ACTTGAAACC TGCCATGTCT GAGTTTTACC AGTGCCAGAA TCTGAGGCTA CCAACACGCC 1260
TCTGGGAACC TGCTACTGCC AACTATCCTT CCCATAGCTA CCTGAACAAA GCCAGTTATC 1320
AGTCCAGAGT GAGCACCTTC ACAGGCATGG TTTGCTTGGC CCAACAGCAT CTCTGGCTTT 1380
CTGGGCCAGC ATGTCTAGGT CACTTTATTA CTCCCTGGAC AACTTGATAG GATGAAAAGT 1440
GTTGGCTTTA GAATTATGCC AACCTTGGTG TAAATTCTCA TTCAGACACT TAACTGGCTG 1500
AGGGACACCT GGGGTCAGTC ACTTAGGCAC AAAGACCTTC ATGTGTAAAC TGGGAATAAA 1560
CTCACCTTCC TTGGAAGGTT ACTGTAGAAT ATATGAAACA GCATGCCGTT TCCATGAAGG 1620
AAGGTACCAT GCGTGGCTTA TGGCCAGCAC CTAGTACACT GCTAGCTTCA CAGTAGATGC 1680
TCAAGAAACA CTGGTTGCAT AAGTAGAGGA CCTAACACAG TGCCTAGTAC TTAACAGGTA 1740
CTCAATAAAG ACTAATTTCC TTCCCCTTTC CTGTAGGGAT GCTAAATTTA GAACATAGCC 1800
CTGAGTAGAA TAGCCCATAA CTCCTACCCT TAAGGATCTC CCAGCCGCAG TCTCCAGGAT 1860
AATTACCCGA TGCCACCACA GTAGCCAGTC GGTGCAGCTT GGAACAGGAT AATACCTGAG 1920
AGGAAGGGGG CGGGTACCTT CTACCCAGGC TCAAAGGATC CTGAGTCAAA TGTTCTTTAC 1980
TCCCTGGCCT TAGGGAGAGA ATGTGTGCTC AGAAATGGTT CTGATATAAC TGGCTCTTCC 2040
ACACACATCC CCTCTGTTCA CCAAGAGGAA GTGACATGTG GTATGTTGTC CAACAGGCTC 2100
TGATGATTCT TAAGCAAAGA GATGGAAGAT GGAATTTCAA CCCCATGGAG ATCTAATAAA 2160
CTTACCCAGA GTTGCTGTGT CTAAGACCTC TTTCATATGC ACCACTGGGC AGCTGGCAAT 2220
TCTCTGGTAG GGGTAGCCTT CTGCAGAGGC TGGCTAGCAG ACCAGGCACC TCTCCCAGAC 2280
TGCCTTTTGT TTATAGCTGG CAACAACCCA CCTGGTATTA GGACCACTGG CCAAAGACAA 2340
TAGTCAGGCA AAGTGGGCAA GCAGCCTCAA TCCCTACTTG GAGATGCCTC AGAGGGTGTG 2400
TCTGCAGTAC TGGAATCCTG TCCCTCCTGT AATCAGCTGA ACAAATATTT GCCCCAAAAG 2460
AGAATCAAAG CAGGAGGGAA CAGGAGAGGT CACTGCACAA ACCAACAGGA ACTATTTAAT 2520
CATTTATCCC CCTAGAGAGT TCATTTACAG AATGGCTTTC AAGTCTAGTC AGCTAGCTCA 2580
AGAGAACCCA CCACCTTTAC CTCCCCTGAC CCCACCCCAG TTATCTGACC TCTATTGACT 2640
TGACCCCCTT GCCTTTTACA AGAGCTGGCA CAGACGAGTT GAAATTGCAA AGAAATGCAA 2700
AATGAGAGAG GGGGTGGGGT TCCAGGGCAA ACTCAGGAGG TCTCTTGCTC AGTGGTAAAG 2760
TGAAGTGCCT GCCACACCCT AGGCCCAGCC TATAGACAGT TGCATTCTTG ACATTCCTGA 2820
GTCCATGGTG CATGTCCCCT TCCACCTCAG CTCCTTCAAT GGATGACTTA TTTTCCACAG 2880
CTTGATGCTT TTCTGCATAC TCTGAGGGGA TAGAACATCT CTCATAAAAC CTGCACCTCC 2940
GCTAGGTAGG GAGATAAGCA AGAAAACAGG ACTGAATTCA CTGAAGAGCA AAACTTGCCT 3000
ACAGTGACCA CTGGTAAAGA AGCTTTCACC ACCATCTCAT CCTGGCTCAG TGATGGGCAG 3060
GAGAACTCTC CCTCCCTGGA AAGGGAATTT GCTGGTGTCA GTCACTGTGC TCACATTATC 3120
GCCAAGATTT ACAATACACT GTAAGGCAAG GAGAGCTTGC CACATTTTTT AGTGAAAGAA 3180
ACTAAGCCTC AAGAAAGTAA CCCAGCCTGT CCAAGGTCAC ACAGCTAGTT ACATGACAGA 3240
ACTGGAACTT ATACCTGCAT GTGAAGTCTG TTACTAAATC TCAATGTCCC ACAGAGCCCC 3300
AAAGACTAGG TTCTTGCTTT GCCAGCAAAC AGTGCTTGAA GAGGCCCCTG GGCTCTGGCC 3360
GGAAAGTAAC AGGCAGAGCA GCTGGAGCTC CCCAACCGAC CCCAGGCAAT GAGGTGCAAA 3420
GTCCCCTGGC TTAATGTGTG ACACAGCAAG TGCTCCACAA ACAAGGCAAC CATGCAGAAA 3480
GTCGCACACT TTGGGGGAAA TGAACTTAGG GGGCGCAGTG CAAACACAAT CTGCACAGCC 3540
TACACTGCCC CAAAATCTGA CAATTCTCAG CCATTCAACC CAGTGGGAAC TCCTGCCTAT 3600
GGCCATGCCC TAGTCTGAGA GGAGAGTGCC ATACACGCAA ACTTTGAAAT AAAGGGAACT 3660
TGATTTGGGG GAGAGAAGCC CAGGATAGGA CTGAGACCCC TTGGGGGGAA CAGATGGAGA 3720
GGTCTGTGGG TCATTGATGC TCATCATCTT CTCCAGGCAT TATACTCATC ACCCCTTTGT 3780
GTGTGAACCA TTGTATAAGG TAAGGGAAAC ACCGAACTAA CTTCCTACCC TCACAGGTTT 3840
GGGACTTAAT GAACACATAG GCTACAGTTT TCTTTGCTGA GAAACTGGAA CACAAGTATG 3900
GAATAGTGGA GTCATGGGGG TGACCAGGGT GAAAGATGCC TGATCTCTGA AGCACAGGGT 3960
CATTTGTATT TCCAAGGAGT TAACCTCTTG TGGTGAAATG AGGCCAGTCA GGTTTCCTCA 4020
ACTATCAACG TCTCCAACAA TCACCCAACA CAACAGAAAG AGATACAGAA GAAGGGCTGT 4080
TGGGGATCTC TGACCAGAGG CCAAAGAAAA GGGACACACA AGGGGCTTGG 4130