EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS187-13019 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Th1 
Coordinate
chr2:28628860-28631620 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr2:28629427-28629442TGACCTTTGGCCCTG-6.24
Nr2f6MA0677.1chr2:28629427-28629441TGACCTTTGGCCCT-6.56
RARAMA0729.1chr2:28630208-28630226AAATGGCCTCATGACCTC-6.21
RxraMA0512.2chr2:28629427-28629441TGACCTTTGGCCCT-6.18
ZNF263MA0528.1chr2:28629779-28629800TGAGGAGGTGGGGAGGGGAGG+6.56
ZNF263MA0528.1chr2:28631496-28631517TCCTCTTGCCCTTCCTTCTCC-7.32
Number of super-enhancer constituents: 40             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00532chr2:28629101-28630654Adipose_Nuclei
SE_00936chr2:28629184-28632689Adrenal_Gland
SE_01852chr2:28629267-28632704Aorta
SE_02435chr2:28629255-28632743Astrocytes
SE_02920chr2:28629297-28630420Bladder
SE_09457chr2:28612393-28639628CD14
SE_16603chr2:28628975-28630568CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16603chr2:28631035-28634797CD4_Naive_Primary_8pool
SE_18763chr2:28628985-28635955CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19338chr2:28629101-28634999CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20015chr2:28628855-28637205CD56
SE_21406chr2:28628991-28630860CD8_Memory_7pool
SE_22508chr2:28628988-28635261CD8_primiary
SE_23078chr2:28629286-28630800Colon_Crypt_1
SE_23736chr2:28629559-28630196Colon_Crypt_2
SE_24706chr2:28629455-28630072Colon_Crypt_3
SE_25842chr2:28629221-28630926Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26550chr2:28611854-28633926Esophagus
SE_31386chr2:28629008-28632746Gastric
SE_34659chr2:28629036-28633683HeLa
SE_36417chr2:28630967-28632500HMEC
SE_37130chr2:28626786-28632931HSMMtube
SE_38066chr2:28627427-28634298HUVEC
SE_42329chr2:28629209-28631251Lung
SE_45875chr2:28629087-28633041Osteoblasts
SE_46832chr2:28629542-28630137Ovary
SE_48773chr2:28629275-28630717Right_Atrium
SE_50076chr2:28629205-28632736Sigmoid_Colon
SE_51112chr2:28629001-28630827Skeletal_Muscle
SE_52035chr2:28631051-28632622Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52349chr2:28629259-28632737Small_Intestine
SE_53354chr2:28628992-28634013Spleen
SE_54732chr2:28629288-28630742Stomach_Smooth_Muscle
SE_56154chr2:28629101-28630614u87
SE_56154chr2:28630876-28632440u87
SE_62927chr2:28581266-28660518Tonsil
SE_63825chr2:28629203-28630715HSMM
SE_63825chr2:28631022-28632622HSMM
SE_67698chr2:28629101-28630614u87
SE_67698chr2:28630876-28632440u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr22862964528630316
chr22862920028630600
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I028404chr22862776428634922
Enhancer Sequence
GGGCTAGCAG GACCACAAAG CCTGAGGATG TGCTGAATGC TCTCCATTCC CTTTTTTTTT 60
TTTTTTTTTT TTTTCTTTTT GAGATGGAGT CCTGCTCTAT CACTCAGGCT AGAATGCAGT 120
GGCACGATCT CGGCTCACTA CAACCTCCTC CACCTCCGCG GTTCAAGCAA TTCTCCTGCC 180
TCAGCCTCCT GAGTAGCTGG GATTACAGGC ATGCACCACC ATGCCTGGCT AATTTTTTTT 240
GTACTTTTAG TAGAGATGGA ATTTTGCCAT GTTGGCTAGG CTGGTCTCGA ACTCCTGACC 300
TCAGGTGATC CACCCGCCTC AGCTTCTCAA AGTGTTGGGA TTACAGGCGT GAGCCACCGC 360
GCCCGGCCAC GCTCTCCATT CTCTTCTGGG CCTACCTCAC ACCAAATTTA GAAATTTGTA 420
TCCAGAGGGA CTTTGGAGAC CATCTTTTCT CATTTTCCCT TTATACCCAT TTTACAGACA 480
AGGAAACGGA GACCCAGAAA GGTGAAGGGC CCTGTTAGAG TCTCACAGTG AATTAGTAGC 540
AGAGCCAGCA CTGGAACCCA CTTCTCCTGA CCTTTGGCCC TGTGGTTTTC CCACCACACC 600
ACCTAGGCGT GCCTCATACA ATCTGTCTGG AGAGTTTCCT TCCTTTTTTG AGAGGGAGGG 660
AGAGAACAAG GAGCATTGTA TCCCACATCA GTTGGGAATT CACACATCTC CCAGCAGCTT 720
TAAGGAAGCC TGGGCAGTGG CAGCCTAGAA CTTTGGCTGT TCAGGTTGCC AGCCCTCAGG 780
GCTTTGCTCT GAAGCTTACT CCGGCCGTCC CCAGCCTCCC CCAGCCTCCC TGCTAGGGAG 840
GAGCCTGCCT CCGGAGCCGG CCTGGTGCCT CATAGGCCTC CTCTTGGGAG GTTCCCTCTG 900
TGCCCTGTGG CGGCGACTCT GAGGAGGTGG GGAGGGGAGG GTGTGTGTGG CTTGTGGGTG 960
GGTACATGGT GCTGCTGACA CACTCAAGCT GGAACCATGT TGATCTCACC GCCCCTGAAC 1020
ACTTCCTATG TTGACAGCTC CCACAAGTTG CCCCACACCT CACCAGTCAG GGGAGAGACT 1080
TCTAGGTCAG TCAGGAGGCC AAAAGTTGTC CAGAAGCAGC CAAGGGGGAA GGAGGGCTTG 1140
AACTGGGTCA AGGCCAGCCT CCTTCTTTTC TGCCTCTCAT TAGCGAGGGA TCTAGGGGGC 1200
TTCCTGGGCC TTAAGGGGAG CCCTGGTGGC CCTTTCAGTG GTGAGCCCTA AACCCAGGCC 1260
TGCAGCAGGG CCATAAGGCT TTCTTGGCAA TTCTGCTGGG CTCAAGACAA GACAGGTTTA 1320
GGAGCAGGAA GTATTCAGGG CCTTGGCCAA ATGGCCTCAT GACCTCAGCC GGGCTGTGGA 1380
CTTCCCTCTG TGTGACAGGC ATGGGATTGT CCTCTCTGGT GCTGTGATGA TTGTCCTCTC 1440
TTTGCTGTTC AAAACATCAC AGCAACAGAC CTCCAGGGCT AAAGGGAGCA TTGTGGGACT 1500
CTGACTTGGA CCCAACCAGG ACAGTGGCTC TTTCCTTCAT GGGGTGACCT GAAGTCCAGG 1560
CAGTATCCCT CCTTGGGGTA GCTTCTCCCT GCTCCTCCAA AAGTAGCTTT GATTTTGCCC 1620
CCAGGTGTCC CGTGAGAGCT GACCCAGGTC TTATTCCCCT TGAGATCTTC TAAGCTCCTA 1680
GTGTAGCACC GGGCAGTTAG TAGGTGTGCA GTCAACGTCT GATAACTGAA TGGGTGGGCT 1740
TTCCCTTTGT GTTGCTTTCT GCTTTGGCCC ACAGCCGTCT CCTTGTGTCA CCTCTGCCTG 1800
AGAGAGGCAT TGGGGTCACA GCTCTGCAGG GCTCTGTAGA ACCAGAGCAT TTGCCCTGCT 1860
CAGTAGAGCA GAGTTCATGC TTTCCGGTAT GAGTGACAGA TTCCTAACTG TCTCACTGGA 1920
AGAAGCTAGA TCCTAAGCTC TTTGCAGGGG AATCTTCCTT TGTTTGGTTC GCAGATAAAT 1980
CCCAAGCCCG TAGAACTTCA TCTTGCACAT GGAACCAGGT GCTCACTTGT TGAGTGGACA 2040
GATATGGTGG GCAGCAGGAT TTTACCTGCT GGGGGCTCCT CTTCCTTTTG CATGTCCTGT 2100
CCAACTTAGC ACTGTACCAG GCATGTGGGG GAGTACCTGG GGTTGAACCG TGAGCAGCTG 2160
GCACCCTGGG ATTGGCAGAG GAAATCGGGA GTGGAGTGGC ACTCTTGGCC CTCCCATCAG 2220
CAACATAACA TTCCCCCCTG GGTGGTTCTT AACCTGTGTG GGGACTCCAG GCCCAGCTAC 2280
TTAACAAAAT GGGGATAATG AGGCTTGCAG AGCAGGCAGA GTGATGGGAG GAGAAATTAG 2340
CCAGGGTTTG GAAGAAGCTG CTTAAGTGGG TGGGGCCACG CCTGGCTGGC AGGAGGGGAC 2400
TCTTGGAGAA GCATCCCCAG CTCCTTCTCT CTGGCCTGAG CACTGAATCA GGGCTGATGT 2460
GATAGGTGCT GCCATCATGC CTGGGCCAGT GAATCTCTGA CCCATTGCTG TCCTGTTTAA 2520
ACATGGACTT TAAACTTGGA CATCACCTTC CGGGGCAGAT TCAGCTCAAA AGAGCCCTCC 2580
CAGGCAGCCA GACATCAGGG ATCCACATGT TCTGGGGCCT CTGAGTCCAG CCATGCTCCT 2640
CTTGCCCTTC CTTCTCCTTT CTCCATTTCC AGAAGGGCTT CTTGCCTTAC TTAAAATACA 2700
GTTTTTAAAA AATACTGTGA ACCATTGTCT CTGTTCTAAC CATGATCCTT GGCTTTGGCC 2760