EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS187-12309 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Th1 
Coordinate
chr19:39170970-39172620 
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ZNF263MA0528.1chr19:39171401-39171422CCCTCACCTTCCTCCTTCTCT-6.4
Number of super-enhancer constituents: 57             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00865chr19:39170550-39171587Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39171728-39172631Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39164445-39171596Aorta
SE_01543chr19:39171720-39172610Aorta
SE_09404chr19:39164511-39180526CD14
SE_13194chr19:39171638-39172441CD34_Primary_RO01480
SE_13490chr19:39171584-39177811CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39170904-39172653CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39170346-39172578CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39164561-39178319CD56
SE_20865chr19:39170480-39179166CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39169957-39177919CD8_primiary
SE_23062chr19:39168629-39171558Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39171682-39172615Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39170961-39171539Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39171789-39172545Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39170896-39171572Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39171669-39172582Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39164448-39177989Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39168562-39171587Esophagus
SE_26525chr19:39171653-39172624Esophagus
SE_27614chr19:39164407-39180553Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_31384chr19:39170454-39171474Gastric
SE_31384chr19:39171716-39172634Gastric
SE_34299chr19:39171460-39178238HCT-116
SE_34681chr19:39170836-39180506HeLa
SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39168763-39172804HSMMtube
SE_38012chr19:39168814-39172845HUVEC
SE_40018chr19:39171034-39171644K562
SE_40018chr19:39171701-39172619K562
SE_40594chr19:39164568-39178326Left_Ventricle
SE_41601chr19:39171788-39172557LNCaP
SE_42097chr19:39164441-39171613Lung
SE_42097chr19:39171618-39178328Lung
SE_45660chr19:39168564-39172655Osteoblasts
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39170953-39171437Pancreas
SE_47461chr19:39171777-39172438Pancreas
SE_48075chr19:39168529-39178289Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39168554-39171607Right_Atrium
SE_48555chr19:39171750-39172615Right_Atrium
SE_49449chr19:39170918-39171396Right_Ventricle
SE_50056chr19:39164598-39172640Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39170726-39172632Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39170881-39171625Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39168564-39178308Small_Intestine
SE_53291chr19:39169852-39171576Spleen
SE_53291chr19:39171661-39172642Spleen
SE_55638chr19:39170884-39171285Thymus
SE_56725chr19:39168926-39171553VACO_400
SE_56725chr19:39171684-39172570VACO_400
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39169454-39171639HSMM
SE_63494chr19:39171736-39172535HSMM
SE_65266chr19:39168886-39178027Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr193917176739172459
chr193917103039171442
chr193917171739172581
chr193917182839172087
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
CAAGCACGTC TGGGTAATTT TTGTATTTTT AGTAGAGATG GGGTTTCACC ATTTGGCCAG 60
GCTGGTCTCG AAGTCCTGAC TGCAAGTGAT CTGGCCGCCT TTGGCTCCCA GATTGCTGGG 120
ATTACAGACA GGCATGAGCC ACTGCGCCCG GCCTCAGGAA GTAGTTGAAT GAGTGACTGA 180
ATGAATGCCC ACGTGAGCAA ATGACCTGTT TGCTGAACTT TAGACTGACG TTGCCTGATG 240
CCCACTGCTT GTGCAGTACG TACTTCAGTC TCAGCGTGTC TGAGACCAAA CTCATTTTCA 300
AGTCCCACTT CTTGGGCTTG GCATTGCCCA TTTGTCAGCC ATCCGAGTCA GAAACCTTGG 360
AGTCAGCTTT TGACTTCTCA TCCTGTAACA GGCACCAAGT TTGATTTCTT TCCCTTGAAT 420
ATCTCTTAGA ACCCTCACCT TCCTCCTTCT CTTTATTCCT ACCATTGTCC TTACTCAGGA 480
CCATATAGTG AGGGTTTAAA AGTGCAGAGT CTTGGCCGGG TGCGGTGGCT CACACCTGTA 540
ATCCCAGCAC TTTGGGAGGC CAAGGCGGGT AGATCACCTG AGGTCAGGAG TTCGAGACCA 600
GCCTGGCCAA CATGGTGAAA CCCCGTCTCT ACTAAAAATA CAAAACTTAG CTGGATGTGG 660
TGGTATGTGC CTGTAATCCC AGCTACTCAG GAGGCTGAGG CAGGAGAATT ACTTGAACCC 720
GGGAGGTGGA GGTTGCAGTG AGCTGAGATT GCGCCACTGT ACTCTAGCCT GGGTGACAGA 780
GTGAGACTCC AATCTCTAGA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAGCAGATT CTAAACTCAC 840
AGTGCTGCTG CTGGCTGCCT GAGCTTGTGT GGCTTTGGAC AGATGACTTA ACCACTCTGT 900
GAAGATGGTA TCTGATGCAC AGGAAATGCT CCAACGTTGG CTCTTGTCGT CATCTGTGCC 960
CATGTCTCCC TCAGCAGCCT CCTGACTGGC CTTCTCCAGT CTCCTGGTTT GGATTGAGGC 1020
TCCCTAGACC CTACCTTTCT GAGACTGGTA TCTAGTCAGG TTACTCTGGG AGATCTCCAC 1080
CCCCCACTGC CCAGAGAGCA GGTTCTGAGC TCTTCAGTCT CTCCACCTTC TGGCCCCGGC 1140
TGACACCATC CCTGCCACTT CTCCTGGGGT CCCCAAACAT CTGTGGTACT TTTGTCTTTC 1200
TTGCCCTTGG TGTTCCCACT CTGCAGAACA ACCTTCTCTC CAGGTCACCA CTGATCGCAA 1260
TCGCGCTCTC CTTTCAAGGC CCAGATCAGG TGTCACCTGA CCTTTGCTGT CCTCAGATCA 1320
CACCTCCCTG TAGCGACTGG CTCGCCAGTG TCCCTCTCTG ACCGAGCTGT GCACTCCTCC 1380
AGGGCAGCAC TGTCAGGGTC TCCCCCAGAC CCTTGGTTGT GATTCTCTCT CCTTGTCCTG 1440
AATCTCAGTT TTCCTGATAC ATGGGATGCT ACCTGAAGGC AGGTTTCAAC TTTCAATCTT 1500
TTTTTTTGTT TTTTGGGTGA GATGGAGTCT TGCTCTGTTG GTCAGGCTGG AGTGCAGTAG 1560
CGCCATCTCG GCTTACTGCA GCCTCCGCCT CCTGGGTTCA AGGGATTCTC GTGCTTCAGC 1620
CTCCTGAGTA GCTGGGACCA CAGGGGCCTA 1650