EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS187-05349 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Th1 
Coordinate
chr12:9909850-9913350 
SNPs
Number: 3             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10844706chr129910132hg19
rs4763879chr129910164hg19
rs3176789chr129912730hg19
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr12:9913004-9913014TCTAATTAAA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 25             
IDCoordinateTissue/cell
SE_11947chr12:9909793-9915454CD3
SE_12982chr12:9910529-9914808CD34_Primary_RO01480
SE_13515chr12:9909847-9916361CD34_Primary_RO01536
SE_14239chr12:9910419-9915730CD34_Primary_RO01549
SE_14472chr12:9909223-9918932CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15534chr12:9909803-9915406CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15865chr12:9909659-9915194CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16365chr12:9909621-9915158CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16954chr12:9909706-9915470CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17533chr12:9903016-9918776CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18029chr12:9906982-9918942CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18288chr12:9902672-9921855CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19721chr12:9908638-9916320CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20404chr12:9909686-9916180CD56
SE_20817chr12:9909651-9915750CD8_Memory_7pool
SE_21536chr12:9909633-9915376CD8_Naive_7pool
SE_22065chr12:9909699-9915727CD8_Naive_8pool
SE_22559chr12:9909681-9919204CD8_primiary
SE_58851chr12:9854191-9918815Ly3
SE_61106chr12:9854379-9922621HBL1
SE_61448chr12:9853799-9923196Toledo
SE_62228chr12:9851402-9927511Tonsil
SE_66708chr12:9909640-9911562Jurkat
SE_66708chr12:9911694-9912068Jurkat
SE_66708chr12:9912175-9915071Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1299109599911930
Enhancer Sequence
GACAGTATTT TTTGGTGAAG TTGCTGCAGA TGTGGAGCAA CTGGAATTTT CAGATATTAT 60
TGGTGGGAGA GTAAATTGGA AAAACACTTT GGAAACTGTT TCTTATAAAA TTAAATATAT 120
GCCTTTTCTA TGGCCCAACA AACCTACTCC TATGTATATC CTCAAGAAAA ATGAAAATAT 180
GTTCTCAAAA TGCCTTGTGC AAGAATGCTC CTAGCAGCTT TATTCTTAAG AGCCAAATTC 240
CAGAAATAAT CCAAATATCC ACCAACAGGA AAATAAGTGA ACAAATTATG GTATATCCAT 300
ACAAGGGAAT TCCGCTCAGC AATTCAAAAT AAGACAACTG ATACATGCAA CAAAATGAAG 360
GAATCTCCAA AAAAAATGTT GAGTGAAAAA AAATCCAGCC ACAGAAGATT GTATACTACA 420
TATTTGCATT TACATGACTT TAAATAATAG TTGGTCTAAG CTCTGGTGTC AAAAATCAGA 480
ACAGTAGTTG CCTTTGTGTG TGTAGGAAAG GTAATTTAAC TGGAATGGGA CACAGGGCAA 540
ACTGTCTAGG GTGATGGAAA GATTCAAATG TTGCTGGTCT TGTGGTTATA CCACTGTCAT 600
AAGTCGTTAA ACTGTATACC TACGAGCTGT GCATTCATCG TATGTGAACT AAACCTCAAT 660
TTAAAATGAT ATGTGAATGA ACAGTAAAAA TTTGAATTTT TCAAAAGATG TTAAAATAAT 720
AGAGGAAATG TAACAGTATT ATAGACCAAA TATTCAGCGA AAGTTATTTC ATTTACCCTC 780
TGTACAATGG TGAAACAAAG TAAAAGCCTT TTTTTTTCCC AACAAGCAGT GTTTCTATGG 840
AAGGATTTAG AATAAAAATA TGATGTTAAC GATAACTGAT AGTTACAAAA AACTCTAAGA 900
GGATGTCTGT TCTACACTCT AAGTAAATAA CTGAGGAAGG AGAAAAGAGA ATTTTGCGAC 960
TTAGATTTTG GATTTTAATT TTGCAGGATG AGCTGTCAGG AGTCTTAAAA TGCGGCCCCA 1020
CAAGGAGTAT ACAGGTCCCT ATTATGTTCT CAAAAACCAA AATGTAAAAT GGCTGCTTAA 1080
GTAACTGACA ATGCAAAACA GTTTCAAAAT AGAAAACATT CTATTTTTCA ATATGGATGA 1140
TTTTCATAAC TTAAAAAAGT TTACATAAGA CATATCTTGA AATACACATA TTTTTACCCT 1200
TAAAACATTT ATCTAAAGGT AAACTGGACC AAGAGAAGTT GCCTTTTTTT CACAGTAATT 1260
TACTGGGTAC TGGTGTCCAC ATCAACTTTT GCTTTATCTG GAAGTTATTT TTCCCATCAC 1320
AGATCGGCAC TCAGATTTTG CAAGAGAAGC CTTTACTTCA CTGCCGTCTA GCTCGATTTT 1380
CTCAGCTTCT CAAAGCAAAT TTTTCTTTGT TCACCGGTAT AGAATCATCA TTGGAAGCCG 1440
CCTTTGCTAC CCAAGGTACC AAGTTCGGAG CTCTGTCTGG TTTCACTTCA CATTATGTGA 1500
GTCAGTCGTG CTGCTTGAAC TCAGTATTGC AACAGCTCTG TCTCCTCAGT GAGCACTAAC 1560
ACACCCCAGT GACCCGTGGG TTCCAGAGTC TCAGTCAGCC CATCGGCTCA ACGAGGGAGT 1620
AAGCTTTGGG ATGACTCTCA GATGATACTT TATTCCCATT AATGAGGGCT ACTGTTTTAT 1680
TTATTTATTT TTTGAGACGG AGTCTCGCTC TGTCGTCCAG GCTGGAGTGC AGTTGCGTGA 1740
TCTCGGCTCA CTGCAAGCTC CGCCTCCCGG GTTCACGCCA TTCTCCTGCC TCAGCCTCCT 1800
AAGTAGCTGG GACTACAGGC GCCCGCCCCC ACGCCCGGCT AACTTTTTGT ATTTTTAGTA 1860
CAGACGGGGT TTCATCGTGT TAGCCAGGAT GGTCTCCATC TCCTGACCTC GTGATCCGCC 1920
CACCTCGGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AATTGAGGGC TATTGTTACC CACAGCTTGA 1980
CTTATCTCCT AGGTGACAAA ACATTTCCCT CAACAGCACA CTTTTGCTTT GATTTCAGGT 2040
CCTGCACATT AATGGAGAAG TTGAAAATCA ACTCAATTTG CTACTAATTG AATCACCCAA 2100
GGATAACGTC CAAGGATGAC TAGGGCAGCC TAAATCAGAC ATTCAAAAGA AAGTTGAAAC 2160
AGTATCAGGA AAAGTTAAAA ATTTCTGTAT TAGGTCCTTC TTTCACCTAT GCTCTCTATT 2220
TATTGAGTAG TTATTATTAT TATTATTATT ATTATTTCTT TTTGGCGGCA CACCTGTGCC 2280
GTAAGTAATG GCTCGCCTGA TTACCTGAAA ATTTGCATGC TTTGCATTTG TAATCCACAC 2340
TATATTTTAT GTTCTTAAAC ACAGGATGGA TTTATGAGAA GTAACTGATG TTTTTCGGAA 2400
GTAAACTAAT ATAGTAGACA CACGCTTAGA AAATAATCCC TTTCCACAAG ATTGTTTTAG 2460
TTCTCCTGTT TCTTACATAT CCCTTTGTTA ATAGATCGCT CTTGCTGACA AGTAGACTAA 2520
TTCCTAAGTG CTAGTGCTTT AGGGTACCTC ATTAACTAAG GAGAAAGAGG GATAAATAGA 2580
AAAACTCAAC AAATTTTACA GAAGTAAGGT ATAGAAAAAC AATAGGCAAA ATCCCAGTAA 2640
CAGGAAATAA GCTAGATATG TGGATAGAAT AGACAAATAG AAGAGAGGAA AATTTCTAAG 2700
ATGATTATAT TTTGCTGAGA GACAAAGGAA AGGAAGAACA AATTCTAAGT TACATAGTCT 2760
TTGAAGCCAG AGATTGGAAA GGTTAAATAG AAGGATGAAA TAGAGGAAAA GAGTCCTATA 2820
AAGAATACCA AAGCAGGAGA TTGCATTTTC GGGAATTCTT TTGTGACTTT TTTTTTTAGC 2880
AAATTACAAA TGGACACTGT AAATTTTCAT CTGCTGATAT AGCTATTCTC TCAAAGATGG 2940
CAAACTTGCC CATTTCCAGC AACTAGAGGA TGCTGTCATG AGAACACAGG ATAAGGTACA 3000
CTGAAAGCAG ACACTGAATG CAAAGGAAGG CAAACAATGT AATTGCTTAT GTGGAAAACA 3060
GAATTTTTCA TAAAGAGAGA CAACACTTCC TGGAGAATGT ACAGATGGAT ATGAAAAAAA 3120
TGATGGAGAA TAACTGGGCT AGAGCAGAAA GTTTTCTAAT TAAATCTAAA CACTGAGATG 3180
ATATAAACTA AAGCAAAGAG AAAGATCTTT AAAGATCTTC TGAAATTCAT TTTTGCGGCT 3240
TTCTCTCATC TCAGGTATTC TATCTTCTTA TAGATAAAAA GGGGTTTACC TCTTCCCTGA 3300
AGAAGAACCT GTCTTCTCTA AAAGACAAAG CCTCACTTCC TTCCCTAACA ACCATTAGAT 3360
ATCACATACA TAGAGATTAG CAGTATATTT CTCTAAGATT ATATATCATA TATAGAGAGA 3420
TTACCAGTAT ATCTTGTATA ACTACTATTA ATGTCATATA TAGAGATACC AGAGAGTAAA 3480
TAGGCAATCA GATCTGACTT 3500