EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS187-00399 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Th1 
Coordinate
chr1:25874080-25880050 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs75446219chr125877492hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ETV6MA0645.1chr1:25877427-25877437AGCGGAAGTG+6.02
KLF4MA0039.3chr1:25876312-25876323GGAGGGTGTGG-6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:25875058-25875073TGAACTCCTGACCTC-6.22
ZNF263MA0528.1chr1:25879156-25879177TCTTTCTTCATGTCCTCCTTC-6.14
Number of super-enhancer constituents: 20             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02010chr1:25874005-25874912Aorta
SE_02010chr1:25875060-25879910Aorta
SE_04384chr1:25875509-25878227Brain_Anterior_Caudate
SE_05146chr1:25875255-25899602Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05991chr1:25873945-25899913Brain_Hippocampus_Middle
SE_06990chr1:25875392-25877046Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_06990chr1:25879194-25881343Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08141chr1:25875552-25880283Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_15269chr1:25874020-25879614CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16249chr1:25875203-25877364CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16249chr1:25877736-25879339CD4_Naive_Primary_7pool
SE_17633chr1:25869448-25897028CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_19031chr1:25874010-25893424CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_24457chr1:25875584-25877457Colon_Crypt_2
SE_53664chr1:25874022-25874772Spleen
SE_53664chr1:25874991-25896829Spleen
SE_55600chr1:25876051-25876946Thymus
SE_65397chr1:25873633-25875032Pancreatic_islets
SE_65397chr1:25875239-25877712Pancreatic_islets
SE_65397chr1:25877870-25884606Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr12587522725877800
chr12587456825874711
chr12587572825875887
chr12587591325876642
chr12587955225879601
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I025547chr12587436025877970
Enhancer Sequence
TAGAACGTGC TCTTCAGAGC CGTTCCACTG GAGGGGCAGT TCCCGGAAGC CCGGTGGAGA 60
GGACTCCTGG GGTCGGGAGA TCTTCATTCC CCAGTCTGCG CCAGCCTCAG CATCTCCAGC 120
AGGCAGAGTG GCAGGTACTG GCAGTCAGCA CAACATGGAA ATGGTGTGCA GGGAGGATAA 180
GGGCGGCCAC TGACAGCACC AGGGAAGGTC CCTCTGAGAA GGTGACTCGG TACACACCGG 240
TGAATCCCAG GAGGGAGGAG TCTGGGAACA GTGTTCCAGC TAGAGGGAAC AGCAAGTGCA 300
GGGAATGTTG AACTGGAGGC TAGGACTCTG CTTCTCCCGG GTCTGGGGGC TGTGTGAGGG 360
GCATGTGGCT TGAAGGAGTC AGAGGTCACC CACTGCCCAC TGAGGGTCAG ATACTCTTTT 420
TGAGCAGCCC TGCAGGGCTC TGCCTGACCC CAGCAAGGGG CTTGGGCTGC AGGAGGCAGG 480
TATGGACTGA AGTCCCAGTG CTGTCAATTA TGAGCCATGG TCAAACTCCT CTGAGCTTCT 540
TTATCTGTGA AATGGGAACA CTGATCTATC CTGGACTCTT CTCTCAATAT GAGAATGGTC 600
ATGGACACGT TAAATCTCTT TGCATTTGAC CACTGTAATG ACAGTAGCTC ACACTTGTGA 660
TACTTGGTAT GTACCAGACA AGCTTCTAAG CTCACCTCGG GTGTGAACTC AGTTCATCCT 720
CAAGACAACC CCATGGATGG ATACTCTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTAAGA 780
GGGAGTCTCC TTCTGTTGCC CAGGCTGGAG TGCAGCAGTG GGATCTTGGC TCAGTGCAAC 840
CTCCACCTCC TTGGTTTAAG TGATTCTCCT GCCTCAGCCT CCCAAGTAGC TGGGATTACA 900
GGCGCCTGCC ACCACACACA GCTAATTTTT TTGTATTTTT AGTAGAGACA GTGTTTCACC 960
ATGTTGGCCA GGCTGTTCTG AACTCCTGAC CTCAAGTGAT CCACCTGCTT TGGCCACCCA 1020
GAGTGCTGGG ATTACAGACA TGAGCTACCA CGCCTGGCTG AGGTGGATAC TCCTATTGTC 1080
CCTGTTATTT ATTTATTTAT TTGAGACAAG GTCTCACTCT ATTGCCCAGG CTGGAATGCA 1140
GTGATATGAT CATAGCTTAC TGCAGCCTCG ACCTCCTGGG CTCAAGGGAT CCTCCTGGGT 1200
AGCTAGAACT ACAGGTGCAC ACTGCCACGC CCAGCTAATT ATTTTTTGTA GAGACGAGGT 1260
CTTACCATGT TGTCCAGGCT GGTCTTGAAC TCCTGGCCTC AAGCAATCCT TCCTTCTCAG 1320
CCTCCTAGCA CACTGGAATT ACAGGCATGA GCCACTGTGC CTGTCTTGTC CCTGTTTTAA 1380
AGTTAGGACA CTGAGATCCA GGGAGGTTCA GTGACTATGA ACTCCACAGC CCATAGCATA 1440
TTTTTCTCTT ACTGTGTAAG TAGGTACTTA GGAAATGGTA GCTGCTGCAA TTTGTCATTT 1500
TAAAAATTAT TTTCTTTTGA TAACAATCTC AACAGCTTTG ACTTCTGAAA TTTTCCTAGT 1560
ACTTTTCACG TCCAGAAACT TCTGGTGACG CTCCTGAGGG GATGAACCCA TTTGTCAGAT 1620
AGAATTACAG CCCAGAGAAG CAGCTACACT CCAGGTCAGG GCAGAGCTTG AGCCCTCTTC 1680
TGAGATGTTG TCACTCTGGC CTCTGAGGCC ATCTCCCCAC CAGGCTGGGG GAGGCTGGAG 1740
GCCAGAGCCC CGGTTGGAGG CTCCCCTGGC CCCTGGGTTT GGCTGCAGCT CTGATGTTGC 1800
AGACACACCA GCCAGGCAGG GTCTCTGGGA GCAGCAGAAC GGGCACAAGG GCATTCAGCC 1860
CAGCTCTGAC TCCCGGGTGG TTGGGGGACC TTAACAAGGA AAGAACACGT GTTCACAGCT 1920
GTAATTTAGA CCTTAGACCA GGCATATGGT CTGTCCCCAG CTAACTCCAG CAGCAGGTCA 1980
TCTGTAAAAT TGCAACGTTA AAATAGCGCA GTCATTACCC ACTACAGGGC CAAAAATAAC 2040
TAGGACCGGA ACAGGGCTGT GCACTCAGGC CTGTATTTGC CCAGGGGCCT CTGGGAGCAC 2100
CTCCTGAAGC CGTGGGCTCC TCCCGGCAAT AAGGCCTCCG GCTGTGGCTG GCGAGTAGGG 2160
CGGGTGGCGG GTGTGGCCCT GAGCCCTACC AATGGGCCTT CACTGAGAGC TCCCAGGTGC 2220
TGGTTTCTGT GGGGAGGGTG TGGGCATGAG GGGCCTTACG CTCTAGTGAA GACATGAGTC 2280
ATGTGCACAG ACCACAGGAG GGAAGCAGCT TCCTAGAGAG AAAGGAGCAT CTCAGTGGGG 2340
CCTGGGAACA TGGGGTACAA GGGAGAAACA GGACCAGACT GGACGGCCAC ATTGGGCAGG 2400
CGCACGCTTC CATGCCAGGT CCTGGGGAAG CAGACATGAA TGGCAGGTAC TTTAAAGGGA 2460
AGAGACGTGT AGGCAGTGCT TGGCAGTGGG TGGTGTGGCT GCAGGAGGAA GAAGAGATTT 2520
ACAGTCAAGA AAGGCACCAA CAGCCCGCCC ACAGGAGGGA TGAGGCCCCA CTGGAAGGTG 2580
TACTGAGCAA CTGCGATGGG CCTGCCTCTC TGCTAAATTC TATAAACTTA TCCAAGGGTC 2640
ACAACAGCCC CCAGGAGTCA GAGCTGTTGT TTCCCCCATT TTAAAGATGA AAAACTGAGG 2700
TTCAGGGAGG GTAATGAGCT CACTCAAGAT GACTCAGACA TGAAGCATTG GAGCTGATAT 2760
CTTAGGATTA AGGCCTTGCT GTTAACCACG AGGCTATATT GCCTCAAAGG AGGCTTCCTG 2820
GAAGAGGTTG GATGTGTGGG GTTTGATCAA GTGAAGAAAG GGCATTTAGG ATAGAGGGAA 2880
CTACTTGAGC AAAGGCAAAG AAGTTAGACA GTAAATATTA CATTATTAGG AAGAAGCTCT 2940
GCATGGTTGG AGCTTCTTGG GGTAGGGGGT ATGTAGGGAT ATTGTGGGAG AAGAGACGGG 3000
GAAACTTAAA ATTCCCTCAC AGTCACTGGT CATTGTGGGG ATTGTCTATA GTGGACTGGG 3060
TGGGGTGAGG AGAGTCCCTC TGACTTGCCA TGTTACCTTG CACAGGTCCC ATCCCTGTCT 3120
GGGCTTCAGT TGTATCATCA AGTGAGGGGC TTGAGCTGAG GGCCTAAGGC TGATGAGTGG 3180
CAACCAGTCT GTAAGGACGT GGTTAGAGGA GGGGAAGGGT CAGGCCAGGG AAGGAGGAAT 3240
GCAGAAAAAT GCTGAACATT TCAGGGGTCA GGGAGGACTA GGGAATGTTT TGACAGCAGA 3300
GAGATCACCA GTGACCTTGG CAGGCTTTGG TTCTTTGGAA TGGAGGGAGC GGAAGTGACT 3360
TTGGAAAGGG GCCAGGAAAG GGCTGAACCA GAGGAAATGG GAGAATGGGG ACATGAAAAT 3420
GGGGGCTGGA GAGGGAGAGT GGAGAATGTT TGCCAGGGGT AGGGATGGAT AATGAGATGT 3480
TCAAACCTTG ATCAATTAGT ATTGCTTGCC TGGGGCCTTG TGCTGAGAAA GGATCAGAGG 3540
GAAGTAGAGC TGCAATTGAT TATCAATGTC TGCCAAGGGT GCGGGTCATA GGCACAGTAG 3600
CACTTCTTTC CATTGCTGTC CTTGCTTAGA TGGGTCTCAG GTTGAAATTG GTGGCCTGGG 3660
TATCCTAGCC TGCAGAGGGG AAGCCTTAGG TATTAGGAAT ACCTAATTCC AGGTGAGAAG 3720
AAATGCCTCC GCCTCCAAAA ACCTGATCTT TTGCTAGAAT TAAGGTAGTT TGCTGCATGA 3780
TAAAGTAGTA TGGTCTCATG GTCAGGAGCT TGGGCTTTAG AGTCAGTCCT TTGAGTCTCA 3840
GTTTCCTCTC TGTAAAATGG GAATGAGAGA ATGCCTGCTT GCAAGGTGGC TGTGAGTGTT 3900
AGAGGTGATG GTAATAGCTA TGGCTTTATT ATTGTTGCAT CTTTGTTATA TGAAAGCGCT 3960
GTTTTTCCCT GATGATGGTG CTGTTATTCT GAACTTGAGA GCAGGGTCTG TGTCTGAGTT 4020
GCTCCAGGGC CCCATCACTC AACCCAGGAC TGGGGACATC TCAGGGACTT TCACATTCTT 4080
TTGGAGGATC AAATGGAATA GGCTTGTGGT TGATGGGACA GAGGATAAGG TCATGTTGGG 4140
CTTTGGGGTC ATCTCAGTGG AGACCTGGCC TCATGTTGGG GTGGAGGCCC AGGGATGAGA 4200
TCTAGGGCTG GAGGGTCACT GGGCCTGGGG CCAGGGCTGG GGATGGGATG GGGTTGTCCT 4260
CGTCATTTCT TCCTTGAGCG AGTATTGAGC GCTACCTGCA TGCCAGGTTC TAGATGACAG 4320
TCAGTAAGTC CCTGCTCACC TGATCTCAAG ACATGAGGGG AACTGGGTAC ATCTGTAAGT 4380
TCCTGTATAA CCCTCCCCAG CCCTGACACC CGCACCCTCT TTCAGATGAA GAAATGGCCT 4440
CAGAGAGGGA CAGTGGCTTG CTCAAGGCAA ATCCAGAGAA ATGTGGGTGT ACAAGGCTCC 4500
TTCTGGCTGT GGAGAGGGGG ACCAGAGCCC CTGGAGGCCC AGGGCTCTAG GATAGGAGCT 4560
GAGAGGGGCA GCAGGGATCC AGACTGGGTA GGGGACCTGG TGATGCCACC TGGACCCAGA 4620
CTTCTGCTCT TGACAGAGCC GGAACTCCAG AACCAAGCTG AGCCTTGTAG TAGGGGCCCA 4680
CATCCCTGCC AGAGCCTCAG CTGCCCTGGA ACTAGCAATA CCCAAACTTT CTTCCTGTGG 4740
CTTTTCAATC AGAGCCAGTG AGGAAGGCCT CAGGAGGAGG TAGGGAGGGC CCAGGACATC 4800
TCCCAGCCCC TCCCTGGGGG ATGGTCTAGG GAAGCTGGCC CTGGCTACCT CTCGTGGCCC 4860
CTGGAAGCTG ATTCCTGGCT GGATCCTGCT CTGTCCTCAA CAAGATTGTG TGTGAGGCTG 4920
AAGAGCAGTT TTCTTTCTCA TCTGTAAAAT GGTGCAGTCA TAACAAACAC CTCCTACAAG 4980
CACAGCATCT GTGAGGGTTT CCTCTCTGTA AAATGGGACA GAGAGGTAGG GGACAGGAAG 5040
GGGCTCTGGC AGGTGGAAGT GTGAGGTGTT CATTCATCTT TCTTCATGTC CTCCTTCCGA 5100
GGAGCCGGGG ATGGTCAGAA ACTGTCAGTG CAGCCTGCTT TTGCCCTCAT GCCCATTTGC 5160
CTCCACGGGG CCCTCACCTA CGTGGTGGGG CGCTCTTTCC ACGTGTCCCT CCTGGTCCAT 5220
TTGCCCACCC AGTGAGGCAG GCTCATCCCC TTATTTCCTG ACATTTGTGT GGTTGGTGCT 5280
TTTAGAGAAC TCTCCTTGTG GACTCTGTTC TGCACCATTG TCACAGCCCA GAGAGGGGGG 5340
AATGTTAGTC CCAAAGAGGA GAGGGGACTT CCCTAGGACC ATCCAGGGGG TGGGAAGCAG 5400
AGTGGGTCTC GAACCTTCTC CGATTTGGGA AATCGCCTTC TCCTCTCCCC ACCCACCCTT 5460
ACCCTTCCCT GCTCTCCCTG GGCTACTGTC TCCTGCCCAG CCTCCCACAT GCCCCTGTTG 5520
GTCTCTACGG ATGCGCACAG GGAGGAAAGC AGTGCAGGCT GGGGCCATGG GAACCGCTCA 5580
GGGTTGAAGT CCGACTCATT GTATGTGGCC TTCATCTCAT GACTTTGCCT CCCTGAGCCT 5640
CAGTCTCCTA ATCTGTAGAA TCATTGTCTC ACAGGATTGC ACTAAGGATT CAGTAAGAAA 5700
TGGTATGATT TGCCCTCAGC AAGTGGTAGC ATTGAAGTAA AGAGGGCTCA GGGCTTGAAA 5760
ATAGGGCTCG AAACTTGGCT CTTGCACTTC CTGGCTCTCT GGACTTGGTT ATGTGATTGA 5820
GCCTCCATGG CCTCCGTGTC TTTGTCTGTC AATGGGTTTG ATTAAAGCGT TGACCTCATA 5880
GGTTCTTAGG AGGATTAATG AGAACATTTT ATGTAAAGCT GCTTACATGG AGCCTTGGTA 5940
TGTGCCGGAA AGCTTTAGCC CTTTATTAAA 5970