EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS187-00211 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Th1 
Coordinate
chr1:12493250-12496700 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:12494625-12494641GTTTGTTTATTTAGCC-6.18
RARA(var.2)MA0730.1chr1:12493624-12493641GGGTCATTCCAAGTTCA+6.12
RUNX1MA0002.2chr1:12494493-12494504CTCTGTGGTTT+6.14
Sox3MA0514.1chr1:12496562-12496572CCTTTGTTTT+6.02
ZNF263MA0528.1chr1:12494025-12494046GGAGGAGGAGGAGGAGGAAAG+10.19
ZNF263MA0528.1chr1:12493951-12493972AGAGGAGGAGGTAGGGGGTGG+6.36
ZNF263MA0528.1chr1:12493954-12493975GGAGGAGGTAGGGGGTGGGGA+7.37
ZNF263MA0528.1chr1:12494028-12494049GGAGGAGGAGGAGGAAAGAAG+8.13
ZNF263MA0528.1chr1:12494022-12494043TGTGGAGGAGGAGGAGGAGGA+8.15
Number of super-enhancer constituents: 32             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00009chr1:12492605-12496972Adipose_Nuclei
SE_01743chr1:12492493-12494609Aorta
SE_01743chr1:12495152-12496825Aorta
SE_03005chr1:12493307-12494046Bladder
SE_03005chr1:12494394-12494761Bladder
SE_03005chr1:12495997-12496699Bladder
SE_15065chr1:12492619-12497585CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20910chr1:12492967-12497444CD8_Memory_7pool
SE_26086chr1:12493139-12494968Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26086chr1:12495130-12496765Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26716chr1:12492824-12494882Esophagus
SE_26716chr1:12495112-12496779Esophagus
SE_29231chr1:12492824-12495344Fetal_Intestine_Large
SE_29231chr1:12495587-12496554Fetal_Intestine_Large
SE_29871chr1:12492943-12496653Fetal_Muscle
SE_33776chr1:12492745-12496835HCC1954
SE_37319chr1:12492732-12495649HSMMtube
SE_39882chr1:12492813-12499393K562
SE_41209chr1:12492560-12495038Left_Ventricle
SE_41209chr1:12495188-12496727Left_Ventricle
SE_42647chr1:12492609-12494807Lung
SE_42647chr1:12495092-12496753Lung
SE_45864chr1:12493103-12496844Osteoblasts
SE_49026chr1:12492458-12494788Right_Atrium
SE_49026chr1:12495807-12496754Right_Atrium
SE_50544chr1:12492877-12494722Sigmoid_Colon
SE_50544chr1:12495565-12496682Sigmoid_Colon
SE_51539chr1:12492828-12494951Skeletal_Muscle
SE_51539chr1:12495449-12496864Skeletal_Muscle
SE_52815chr1:12492745-12494814Small_Intestine
SE_52815chr1:12495340-12496737Small_Intestine
SE_54847chr1:12492782-12495035Stomach_Smooth_Muscle
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I012432chr11249284412500570
Enhancer Sequence
CCCTGGAGTA GGTGCTCGAA ACCTTTGCTT TTTGCCTTTT CGCTTTAATC TGGAACGCTT 60
GGGGAAAAAA AAAAAACAAA AAAACAAAAA AACAACAACA AAACAGTAGA CCAAATGGTG 120
ACTGAGTCCC AACCCTTCTT CAGGCCAGAT GAAATCATGG TCCCTGCTGG CGCCATTCCT 180
CCATCTCAGA GCCCTCACTT GGGTTCAGAC CCTCAGTCAC ACAGGGAGCC CCGCCACAGC 240
TGAAGTGTTT TGTCAGAGCA AGATTGCAAA GAGTTAACAC TTTTGCTTTT TCGGAAAGTT 300
ATCTGTGAAG AGTATTAGTT GTTTAATAAA GCGTGCCTGC CCTCCCGATG AACCCGCCAG 360
TGACTCTGCA GCTGGGGTCA TTCCAAGTTC ACGCAGTGGA CTTTTGACTG CCTTCTGTGT 420
CTGTGAAAAC AGTCGGCAGC TCCTGCGGGG ATCATTCATT CAGGCCTGTA ACACAAAACT 480
ATTGCCAATG GGCACCTGCT GGGGCAGCTT CCCGGGAGGG CTGGGAGGAA GATACCAAAC 540
TCATCAGGCA TCTGTGGAGA TAAGAGCGGC AGGGGATCCA CTGGGATCCC GCTAATCAGG 600
CCTGCACTTA GACCCCACTG CCTGGCCAAC AGGCTGGTGT CAGAATGTAT TAGGCAGCCC 660
TGGCCAGGAT AGGATGTGAG CTAATTAAAG GCCTTTTACA AAGAGGAGGA GGTAGGGGGT 720
GGGGAGAGAG AGAGAGTGAG AGAGAGAGAG AGAGAGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGGAGG 780
AGGAGGAGGA GGAAAGAAGT TTGAAGTGCA TTCCCCAAAT TTCCAGCACA TTCTTTATTC 840
CTCTGTTTTA TCCCTCAAAA CAGAAGAAAA CAAATTAGAG GCTGAGCATT TGGTTATTTC 900
TAACCTGAAA TTGTCATTCA TTGTGCCTGA TGCCGTATTG GTTTTAACTG CTATTTTTGT 960
GGAATTACAT ATACTGTGAA AGACATCTTT TGCCGCAGTC TCCCTGGGAA CATCCTGTTG 1020
TTGAAATGCC GTTGGTCAGC TGCTTGAATT TTGCCCTTTT CTCTGACTTT GACACATCAA 1080
GGCAAAAATA GGTACCTATT TGTGGTGTGT TCTAGGTTTC TCCCTTTTGC TTGGAAAATC 1140
CACTTGCCAG CTGTGAAGGG TGCTGCTGGG AGGATGAAAT GAGTCAGTGC ACAGCGTGTG 1200
CTCTTAAAGT TTGGTGGTTG AGGTGGCGGT GGTAGCAGCT TGGCTCTGTG GTTTAAAATG 1260
CCACAGCATG CACTATCTTG AAAATACTCA GTAGTCCTAG CATACAACTG GGTTTTAGTT 1320
ACACCTACTT AAGGAAGAAA GCTCATTTGA AAGTGTTTGA TTTTCCTGTA CTTTCGTTTG 1380
TTTATTTAGC CTGTGTATTC CCCCCACCCC CAGTAAGCAG CAAACTAACT TATTTATAGG 1440
CCTCAGGTAT GTTTAAATCT GTGGTATTTT CTTAATCAGC CTGATAATGA TACATTTTTG 1500
AAAGCAGTTT TGTTCACACA TAAACCTAAG CCTTTATTAT ATTATTCTGA TACATTCCAC 1560
ATAAGCTTGT CTGTGCACAA AGAAACATTT AGATTAATCT TGTACTACAT GGTAACAATC 1620
CTAGGAAATT CCAATCAAAA GCCAACAACC TGTTTCCTTC ATTCTGGACT GTTGGTGGGT 1680
TTGTTTTTGT CTGTGGTCTG ATAAGGAGTA ACAACAATGT TAATTTTGTA TTTCCTTGGC 1740
ATTTGTCTCA CATAATCTTT TGTCAAAGTT GACCAGTAGG CTTGTCAGGC TTGCCATGCA 1800
GTTTATGAAA TAAATAGTTA CAATGGAGTA GTTAACTTAG CCCTGCGGAA TATGTTAGTG 1860
TATCCTTACC GTAAGTGTTT AAAATGTTAA TTACATTTAT CTTTATTTCT CAGCATTGCT 1920
ATACAGAAAA CATGGGATAG ACACTGATAC TGATTGCCCA GTTGAAATAA GTTTTGAATT 1980
TAGTAACTGA ATGGATAGCT TTAAAAATGG TACTAATATT TTGGGAGACT GAGGTGAGCA 2040
GATTGCTTGA ACTCAGGAGT TCGAGACCAG CCTGGGCAAC ATGACCAAAA AAAAAAAAAG 2100
TCTAAAAAAT ACAAAAATTA GCTGGGCGTG GTGGCACCCG CCTGTAGTCA CACCTACATG 2160
GGAGGCTGAG GTGGGAGGAT CATCCGAGCC TAGGAAGTTG AGGCTGCAGT GAGCTGTGTT 2220
TGCACCATCA CATTCCAGCC TGGGTGACAG AGCAGGACCC TGTCTGAACA ACAACAACAA 2280
AAAGATACTC ATATTTATTG ACTGCTTCAC TATGTGCCAG GTACTGTTCT GAGTCTTCAT 2340
ACAAATTGAT TTGTTTAATC CTCATAACGA CCCTGTGGAA TGCTAGTTTG TAAATGAGGA 2400
TACTGACGTT CAGAGAAATT AACTAATTTG CCCAAGGTTA CAAGGAGAGC CAGGCTAAGA 2460
ACCGAGATTC TCTGATTCAG AGCCCGTCCT CTTAATACCA GTGCAAAAGC AGCACTCTAT 2520
CTAGTAGGCT TCATTCTCGA ACCTCTCTGC GATATATTTG CAGGGATTAA CCATGTAAGG 2580
CTGTATTATC AAGGGGATAC AGAGAATTTG AGTCACAGTT TAAAGTCATT TCCTGTGCTA 2640
CCCTGTGTTG TATAATTAGC TCTTTTGTAG ATGCTGTACC ATCCAGGCCA AAGTGTGTGG 2700
CCGAAACCAG GAAATTGTTC TAACCCTGTC TGAGACACTT AGTGAAGGAG TTTTGACTTT 2760
GCTCTAACTC TACACATCGA GCTGACTATA GATTTATGTG CAAAAAGCAT AACCTCATGT 2820
TAACAGGTCT ATTTATTGTG TCTCTAGAGC AAGTTCACAA CTATGTATGG ACAACTAGAA 2880
ATGCCAGGCT CTGTGCTAGG CACAGGGGAC ACAGACATAA ACAAAACAAA GCCCTCTCCC 2940
CTTGGGGTCA CCATCCAGCA GGGGAGGAGG ACTTGCAGTC ACACACATGT GGGAAAGTGT 3000
TCCAGGTTTG AGTTTGGTGT CTGTGGGGGT TCCTGTAGGG GGATCTCAGG AAGGGGTGGA 3060
CTCTTCTACC CAGGACAAGG AAGGTCTGTA CAGGGGAAGG CACGCCGGTG CCCAATCCTG 3120
AAGTCCAAGG AGATGCTTGC CATGTGGACA AGAGACAGGT GGGGACAAGA AGAGGCACAC 3180
AGGGAGCAGT CCCAGCAGGA GGGAGCCTGG GGTGTGCAGC AGCAGGACTA GGGAGGGGTC 3240
AGTGGAGCTT AGCAGGTGGG CCTCTGGAAT GAGGAGCTGG CCTAGTGGGG AAAGACTGGC 3300
TCATTGTACA TCCCTTTGTT TTCCCTTGTT TCGCCCCCAC CCACCACGTG AATTTAAAGG 3360
GGAAGAGACT TAACTGAATG TTTCACTTTT TGAGCCTAGT ATTGTTATTT GTCATGATTT 3420
GACCATAATC TGCATATATA CAATGTTAAC 3450