EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS183-02824 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
T47D-MTVL 
Coordinate
chr20:30304260-30309450 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6087771chr2030306724hg19
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RUNX1MA0002.2chr20:30305443-30305454AAACCACAGAA-6.32
Number of super-enhancer constituents: 104             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30297989-30306428Adipose_Nuclei
SE_00546chr20:30306461-30312254Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30304224-30306272Aorta
SE_01656chr20:30306371-30311908Aorta
SE_02627chr20:30307051-30311961Astrocytes
SE_03109chr20:30308258-30309433Bladder
SE_03156chr20:30304345-30306204Brain_Angular_Gyrus
SE_03156chr20:30306497-30311444Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30297618-30312523Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30291888-30312530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30291812-30312465Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30297611-30312332Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30292115-30312408Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08789chr20:30307109-30310334Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_13448chr20:30303541-30306370CD34_Primary_RO01536
SE_13448chr20:30306439-30312272CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30302978-30312324CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30302871-30312578CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30302979-30312159CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20764chr20:30302878-30312381CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30303825-30312264CD8_primiary
SE_23622chr20:30304312-30305160Colon_Crypt_1
SE_23622chr20:30306472-30311911Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30302953-30312495DND41
SE_25933chr20:30303441-30311921Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30303882-30305348Esophagus
SE_26879chr20:30305408-30306284Esophagus
SE_26879chr20:30306378-30312004Esophagus
SE_27731chr20:30306378-30312126Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30306317-30312080Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30303024-30306306Fetal_Thymus
SE_30903chr20:30306355-30312106Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30304321-30306278Gastric
SE_31430chr20:30306417-30312032Gastric
SE_33407chr20:30302870-30306305H2171
SE_33407chr20:30306334-30312298H2171
SE_34309chr20:30291576-30306320HCT-116
SE_34309chr20:30306323-30312556HCT-116
SE_34643chr20:30298140-30312397HeLa
SE_35852chr20:30303427-30306293HMEC
SE_35852chr20:30306311-30312155HMEC
SE_36989chr20:30297525-30312332HSMMtube
SE_38141chr20:30303934-30306179HUVEC
SE_38141chr20:30306459-30312236HUVEC
SE_39144chr20:30307380-30311380IMR90
SE_39443chr20:30308115-30311313Jurkat
SE_39853chr20:30303646-30306330K562
SE_39853chr20:30306390-30312315K562
SE_40644chr20:30297536-30312142Left_Ventricle
SE_41648chr20:30305472-30306266LNCaP
SE_41648chr20:30306474-30310131LNCaP
SE_42121chr20:30295482-30306315Lung
SE_42121chr20:30306366-30312046Lung
SE_43515chr20:30291879-30312193MM1S
SE_44365chr20:30304163-30305187NHDF-Ad
SE_44365chr20:30306380-30312027NHDF-Ad
SE_44995chr20:30304354-30304900NHLF
SE_44995chr20:30307052-30312090NHLF
SE_45708chr20:30304068-30306118Osteoblasts
SE_45708chr20:30306812-30312173Osteoblasts
SE_47264chr20:30303610-30306362Panc1
SE_47264chr20:30306465-30312746Panc1
SE_47861chr20:30307071-30308101Pancreas
SE_47861chr20:30308207-30309183Pancreas
SE_48182chr20:30304554-30305954Psoas_Muscle
SE_48182chr20:30306387-30312048Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30304407-30306299Right_Atrium
SE_48890chr20:30306370-30312050Right_Atrium
SE_49684chr20:30307804-30310082Right_Ventricle
SE_49886chr20:30307003-30312251RPMI-8402
SE_50155chr20:30304194-30306264Sigmoid_Colon
SE_50155chr20:30306356-30312043Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30303939-30312172Skeletal_Muscle
SE_51884chr20:30307061-30311605Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30303600-30306295Small_Intestine
SE_52373chr20:30306397-30311994Small_Intestine
SE_53471chr20:30304367-30306295Spleen
SE_53471chr20:30306475-30312120Spleen
SE_55108chr20:30305375-30306100Thymus
SE_55108chr20:30307049-30311900Thymus
SE_55770chr20:30302950-30306293u87
SE_55770chr20:30306834-30312280u87
SE_56767chr20:30303028-30306253VACO_400
SE_56767chr20:30306433-30312207VACO_400
SE_57375chr20:30304250-30306250VACO_503
SE_57375chr20:30306412-30311876VACO_503
SE_57919chr20:30304662-30305261VACO_9m
SE_57919chr20:30305360-30306242VACO_9m
SE_57919chr20:30306425-30311882VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30304565-30305188HSMM
SE_63683chr20:30306862-30311641HSMM
SE_64478chr20:30304021-30306145NHEK
SE_64478chr20:30306344-30311737NHEK
SE_65412chr20:30308226-30312394Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30308115-30311313Jurkat
SE_67146chr20:30291879-30312193MM1S
SE_67821chr20:30302950-30306293u87
SE_67821chr20:30306834-30312280u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr203030514130305549
chr203030430430305303
chr203030660230306752
chr203030594030305996
chr203030772030308274
Enhancer Sequence
TTTGTTTACT GCCATACTCC CAGTATGGTA CACAGTAGGA GCTCAATAAA CATTGTTTGA 60
CTCAACGAAT GAATTATTAG GTAAATAGCC ACTCCCATTA TTGTTATTCT GGCTTGACAA 120
GGGTCTGTTT CTTCAGAAAT TTAGTGGGTT TCTCTTCAAT TAGGTATCTG CTATGCCCAA 180
GGCCTCTGCT CAGTGCTGAG GAAACAAGCA TGGACAAGAT GTGGCCTCCA CCCTGAGGAG 240
CTCCTAAATC TAGGACAGAG TAAATCTGTT AGAAATGTCT TCTCTGCACA TAATTTAAGC 300
TCTACCAACT GTTAACTTCT TTTCATTTAT CCAAGTTTTG CCAGGTACCA CACCAATAAA 360
AAAAGACTCA GTCCCTCTTC CTTCAGATAT CTGAAGCTGG TGATATTCTC CTGGGTCTTC 420
TCTTCCCCAG GCTAAACAAA AAGACCCAGT GGGATTGCCT GACTCAGGTC TGCCAACTGG 480
GAACAAGGAA GACAGACTGT CGGATAGAGG GGCAGAAGAG AAGAGGATCC AGGAGTAGAG 540
TGACTCCTTC AAAGAAAAAA GAGGGAGTCC TTAGGGAGGA CTCTGTGGAA TTAGGTTGGA 600
GGTTGGGTGG GGACAGGGCC TCTGCTTAAT TAAGGCAGTA GGAGATTATA CTTCCGTAGA 660
AAAGCAGTAC ACTGGGAATT ACCCCTATGT CTATCCACAT TAAACTCAGG CAAAACCACA 720
GTTGCTTCAA GAAAGCCCCA TGATGGAAGG CTGAGGGCAC TGGCAAAACC AGGGAGACTG 780
GACACAGAGG AGGACGCTCA AGCCCACTGG CCTCAGGACA GATATCTGCT GGGGGAAGGG 840
ACAGAGATAA CAACTGCTGT TTCATGCAGC CCAAACAAAT CTGGGGACAC CCATACAAAA 900
GTCAAGAAAA CCCTCCAGGT TCCATTGGAG CCCCCTGAAA AAATACCCGG GTAATTTTCG 960
ACAGAAGCTA AAGGGCTCTG TGGGGCTACT GGGGAAATTA TTCCTAGGAA GTCTGGAAAA 1020
CCCTGTGATG GTAACAGAAT TTTAAGAGCA ACCTCAAATG TACACTCAGA AGAAGTAGGT 1080
GTTTCAAGGG GGAGCCCCTG AGACACTTCT ACTTAATTTT GGGACCCGAA TGAGATTACT 1140
AAAAATTTCC ACATTTGGGG TTTCTAATGG GGTTTCCCTA AGAAAACCAC AGAACTGCCA 1200
CTATCTGCAA AGGGAGCTGA GGTGCTTCAA CTAAGCATAC ATCCATCTGA AGAAGCCACA 1260
TTAGGCAATA AGAGATCTAC AGAAACTCAG ACCACTGAGC CATACAGCTT AAGAAAGGCC 1320
AAGTTATGTT TTCTCCCCCA ACACAGTTCA TTGCTCCCAA CAATTACGTT TCTATCAGGC 1380
TAAGGGATTT CTTCAGGGAC AGCAATCCCA AAGTGGCAAG GCCCACCTGG GTCCCTTCCC 1440
ACATTCCCAT TGGAAAGCAC CAGAAACACT TGTGTCCCTT CGGGGAAGGT CATGTATACA 1500
ACATTCCAGG AAAGTATCAC AGGGACTTTG TTTCTCAAGG AGAAACTCTA GGGGGAAGAG 1560
TCAGTTCTCT GAGGGAAGCT GCCCATTCAT TAAAGGGTTT CCACCCTACA ATTATGGCAG 1620
GAGAAGGGCT TTTGTGCTAG ATCCTTTACT CGAGTCAAGC TATGGCAGCT GGCTATCATT 1680
ATTCCATTTT ACAGGCGGGA GAGACAGATG GACAAGACAG CCGAACAGGT TCAGCATTTC 1740
ATCAGGTGAC TCCAGGCAGG CAGTAATCTG GCTAAGGGTC TACACTTTCA GTCCTTGAAG 1800
CATCACTCCA CCACTAAGTA GAGATACCTG GGGCAGGCCA CCTTCTCCCC ACACGCACAC 1860
CACTGTCATC TATTGGCAGG GCCTGAGAGG GTTTTAACAA TGAAAAAATT GGCCGGGGCC 1920
AGGCACGGTG GTTCATGCCT GTAATCCCAG CATTTTGGGA GGCTGAGGCA GGCGGATCAC 1980
CTGAGGTTGG GAGTTTGAAA CCAGCTTGAC CAACATGGAG AAACCCCATC TCTACTAAAA 2040
ATACAAAATT AGCCAGGTGT GGTGGCGCAT GCCTGTAATC CCAGCTACTT GGGAGGCTGA 2100
GGCAGGAGAA TCACTTGAAC CCGGGAGGCA GAGGCTGCAG TGAGCTGAGA TCGCGCCACT 2160
GCACTCCAGC CTAGGCAACA AGAGCGAGAC TCCGTCTCAA AAAAAAAAAA AAAAAGAAAA 2220
AATTAATAAG CAGCTCACTC TGGGCAAAAC CCTGATGCCC ACTTGAAACC TGCCATGTCT 2280
GAGTTTTACC AGTGCCAGAA TCTGAGGCTA CCAACACGCC TCTGGGAACC TGCTACTGCC 2340
AACTATCCTT CCCATAGCTA CCTGAACAAA GCCAGTTATC AGTCCAGAGT GAGCACCTTC 2400
ACAGGCATGG TTTGCTTGGC CCAACAGCAT CTCTGGCTTT CTGGGCCAGC ATGTCTAGGT 2460
CACTTTATTA CTCCCTGGAC AACTTGATAG GATGAAAAGT GTTGGCTTTA GAATTATGCC 2520
AACCTTGGTG TAAATTCTCA TTCAGACACT TAACTGGCTG AGGGACACCT GGGGTCAGTC 2580
ACTTAGGCAC AAAGACCTTC ATGTGTAAAC TGGGAATAAA CTCACCTTCC TTGGAAGGTT 2640
ACTGTAGAAT ATATGAAACA GCATGCCGTT TCCATGAAGG AAGGTACCAT GCGTGGCTTA 2700
TGGCCAGCAC CTAGTACACT GCTAGCTTCA CAGTAGATGC TCAAGAAACA CTGGTTGCAT 2760
AAGTAGAGGA CCTAACACAG TGCCTAGTAC TTAACAGGTA CTCAATAAAG ACTAATTTCC 2820
TTCCCCTTTC CTGTAGGGAT GCTAAATTTA GAACATAGCC CTGAGTAGAA TAGCCCATAA 2880
CTCCTACCCT TAAGGATCTC CCAGCCGCAG TCTCCAGGAT AATTACCCGA TGCCACCACA 2940
GTAGCCAGTC GGTGCAGCTT GGAACAGGAT AATACCTGAG AGGAAGGGGG CGGGTACCTT 3000
CTACCCAGGC TCAAAGGATC CTGAGTCAAA TGTTCTTTAC TCCCTGGCCT TAGGGAGAGA 3060
ATGTGTGCTC AGAAATGGTT CTGATATAAC TGGCTCTTCC ACACACATCC CCTCTGTTCA 3120
CCAAGAGGAA GTGACATGTG GTATGTTGTC CAACAGGCTC TGATGATTCT TAAGCAAAGA 3180
GATGGAAGAT GGAATTTCAA CCCCATGGAG ATCTAATAAA CTTACCCAGA GTTGCTGTGT 3240
CTAAGACCTC TTTCATATGC ACCACTGGGC AGCTGGCAAT TCTCTGGTAG GGGTAGCCTT 3300
CTGCAGAGGC TGGCTAGCAG ACCAGGCACC TCTCCCAGAC TGCCTTTTGT TTATAGCTGG 3360
CAACAACCCA CCTGGTATTA GGACCACTGG CCAAAGACAA TAGTCAGGCA AAGTGGGCAA 3420
GCAGCCTCAA TCCCTACTTG GAGATGCCTC AGAGGGTGTG TCTGCAGTAC TGGAATCCTG 3480
TCCCTCCTGT AATCAGCTGA ACAAATATTT GCCCCAAAAG AGAATCAAAG CAGGAGGGAA 3540
CAGGAGAGGT CACTGCACAA ACCAACAGGA ACTATTTAAT CATTTATCCC CCTAGAGAGT 3600
TCATTTACAG AATGGCTTTC AAGTCTAGTC AGCTAGCTCA AGAGAACCCA CCACCTTTAC 3660
CTCCCCTGAC CCCACCCCAG TTATCTGACC TCTATTGACT TGACCCCCTT GCCTTTTACA 3720
AGAGCTGGCA CAGACGAGTT GAAATTGCAA AGAAATGCAA AATGAGAGAG GGGGTGGGGT 3780
TCCAGGGCAA ACTCAGGAGG TCTCTTGCTC AGTGGTAAAG TGAAGTGCCT GCCACACCCT 3840
AGGCCCAGCC TATAGACAGT TGCATTCTTG ACATTCCTGA GTCCATGGTG CATGTCCCCT 3900
TCCACCTCAG CTCCTTCAAT GGATGACTTA TTTTCCACAG CTTGATGCTT TTCTGCATAC 3960
TCTGAGGGGA TAGAACATCT CTCATAAAAC CTGCACCTCC GCTAGGTAGG GAGATAAGCA 4020
AGAAAACAGG ACTGAATTCA CTGAAGAGCA AAACTTGCCT ACAGTGACCA CTGGTAAAGA 4080
AGCTTTCACC ACCATCTCAT CCTGGCTCAG TGATGGGCAG GAGAACTCTC CCTCCCTGGA 4140
AAGGGAATTT GCTGGTGTCA GTCACTGTGC TCACATTATC GCCAAGATTT ACAATACACT 4200
GTAAGGCAAG GAGAGCTTGC CACATTTTTT AGTGAAAGAA ACTAAGCCTC AAGAAAGTAA 4260
CCCAGCCTGT CCAAGGTCAC ACAGCTAGTT ACATGACAGA ACTGGAACTT ATACCTGCAT 4320
GTGAAGTCTG TTACTAAATC TCAATGTCCC ACAGAGCCCC AAAGACTAGG TTCTTGCTTT 4380
GCCAGCAAAC AGTGCTTGAA GAGGCCCCTG GGCTCTGGCC GGAAAGTAAC AGGCAGAGCA 4440
GCTGGAGCTC CCCAACCGAC CCCAGGCAAT GAGGTGCAAA GTCCCCTGGC TTAATGTGTG 4500
ACACAGCAAG TGCTCCACAA ACAAGGCAAC CATGCAGAAA GTCGCACACT TTGGGGGAAA 4560
TGAACTTAGG GGGCGCAGTG CAAACACAAT CTGCACAGCC TACACTGCCC CAAAATCTGA 4620
CAATTCTCAG CCATTCAACC CAGTGGGAAC TCCTGCCTAT GGCCATGCCC TAGTCTGAGA 4680
GGAGAGTGCC ATACACGCAA ACTTTGAAAT AAAGGGAACT TGATTTGGGG GAGAGAAGCC 4740
CAGGATAGGA CTGAGACCCC TTGGGGGGAA CAGATGGAGA GGTCTGTGGG TCATTGATGC 4800
TCATCATCTT CTCCAGGCAT TATACTCATC ACCCCTTTGT GTGTGAACCA TTGTATAAGG 4860
TAAGGGAAAC ACCGAACTAA CTTCCTACCC TCACAGGTTT GGGACTTAAT GAACACATAG 4920
GCTACAGTTT TCTTTGCTGA GAAACTGGAA CACAAGTATG GAATAGTGGA GTCATGGGGG 4980
TGACCAGGGT GAAAGATGCC TGATCTCTGA AGCACAGGGT CATTTGTATT TCCAAGGAGT 5040
TAACCTCTTG TGGTGAAATG AGGCCAGTCA GGTTTCCTCA ACTATCAACG TCTCCAACAA 5100
TCACCCAACA CAACAGAAAG AGATACAGAA GAAGGGCTGT TGGGGATCTC TGACCAGAGG 5160
CCAAAGAAAA GGGACACACA AGGGGCTTGG 5190