EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS180-03250 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Small_intestine 
Coordinate
chr1:156466120-156470270 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10908505chr1156468243hg19
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:156468381-156468399CCTCCCTTCCCCCCTCCC-6.04
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:156468377-156468395CCTTCCTCCCTTCCCCCC-7.1
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:156468373-156468391CCTCCCTTCCTCCCTTCC-8.06
MYCMA0147.3chr1:156466230-156466242GGGCACGTGGGG-6.07
ZNF263MA0528.1chr1:156468377-156468398CCTTCCTCCCTTCCCCCCTCC-6.09
ZNF263MA0528.1chr1:156468373-156468394CCTCCCTTCCTCCCTTCCCCC-6.65
ZNF263MA0528.1chr1:156468372-156468393TCCTCCCTTCCTCCCTTCCCC-6.67
ZNF263MA0528.1chr1:156468388-156468409TCCCCCCTCCCCCCCTTCCCC-7.07
ZNF263MA0528.1chr1:156469853-156469874AGAGGAGGGAGAGGGAGGGAG+7.53
ZNF263MA0528.1chr1:156468389-156468410CCCCCCTCCCCCCCTTCCCCC-8.08
ZNF263MA0528.1chr1:156468380-156468401TCCTCCCTTCCCCCCTCCCCC-8.36
Number of super-enhancer constituents: 101             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156465189-156476309Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156465123-156476044Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156465207-156468384Aorta
SE_01624chr1:156468387-156476109Aorta
SE_02565chr1:156469795-156476049Astrocytes
SE_02937chr1:156468807-156469775Bladder
SE_02937chr1:156469801-156475479Bladder
SE_03183chr1:156465551-156470721Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156467954-156468407Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156468701-156469223Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156468612-156471986CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156468582-156469168CD3
SE_12168chr1:156469839-156476292CD3
SE_13036chr1:156466540-156467469CD34_Primary_RO01480
SE_13036chr1:156468049-156468754CD34_Primary_RO01480
SE_13036chr1:156468793-156472076CD34_Primary_RO01480
SE_13485chr1:156465196-156476191CD34_Primary_RO01536
SE_14170chr1:156465715-156466589CD34_Primary_RO01549
SE_14170chr1:156467146-156468304CD34_Primary_RO01549
SE_14170chr1:156468402-156476146CD34_Primary_RO01549
SE_15064chr1:156468335-156476467CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156468699-156473244CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156468726-156472622CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156468445-156472542CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156466294-156476695CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156466624-156476417CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156467906-156476154CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156466814-156476634CD56
SE_21124chr1:156468394-156476159CD8_Memory_7pool
SE_21730chr1:156468468-156476440CD8_Naive_7pool
SE_22205chr1:156468381-156476957CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_23670chr1:156465636-156467896Colon_Crypt_1
SE_23670chr1:156467923-156468409Colon_Crypt_1
SE_23670chr1:156468420-156470673Colon_Crypt_1
SE_24009chr1:156468521-156470659Colon_Crypt_2
SE_25163chr1:156468482-156469101Colon_Crypt_3
SE_25163chr1:156469338-156475883Colon_Crypt_3
SE_25856chr1:156465342-156477016Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26648chr1:156465154-156476164Esophagus
SE_28187chr1:156466638-156468184Fetal_Intestine
SE_28187chr1:156468391-156476221Fetal_Intestine
SE_29274chr1:156466454-156468169Fetal_Intestine_Large
SE_29274chr1:156468218-156476064Fetal_Intestine_Large
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156468651-156480271Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156465385-156476063Gastric
SE_32703chr1:156465262-156472841GM12878
SE_33523chr1:156465372-156473390H2171
SE_34669chr1:156467034-156476478HeLa
SE_37054chr1:156464710-156476367HSMMtube
SE_38176chr1:156467537-156476177HUVEC
SE_39310chr1:156468423-156470654IMR90
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156465586-156466685LNCaP
SE_41764chr1:156467948-156468364LNCaP
SE_41764chr1:156468497-156471403LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_44813chr1:156468511-156476032NHLF
SE_45962chr1:156465453-156476220Osteoblasts
SE_46671chr1:156466803-156467897Ovary
SE_46671chr1:156468431-156470688Ovary
SE_47855chr1:156468651-156470639Pancreas
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_48580chr1:156467911-156476055Right_Atrium
SE_49466chr1:156465535-156467898Right_Ventricle
SE_49466chr1:156468478-156470678Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_51995chr1:156465545-156467660Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51995chr1:156468480-156469739Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51995chr1:156469832-156470695Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52473chr1:156465351-156469748Small_Intestine
SE_52473chr1:156469779-156476230Small_Intestine
SE_53429chr1:156465373-156476196Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156468465-156468974Thymus
SE_55197chr1:156469022-156469677Thymus
SE_55197chr1:156469792-156476120Thymus
SE_57194chr1:156468590-156471295VACO_400
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_63769chr1:156465531-156467660HSMM
SE_63769chr1:156468416-156469749HSMM
SE_63769chr1:156469818-156476118HSMM
SE_65297chr1:156461973-156472274Pancreatic_islets
SE_68350chr1:156458923-156476306TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1156466392156467540
chr1156468556156468776
chr1156468000156468081
Enhancer Sequence
CCGAAAGGCG AAACTCTGTA CATCTGGAAA GCTGGGGCCC AAGAGGAGGG ACCCGGGGAC 60
ACACGGTCAG TGTGAGGGGC AGAGGCAGGC TGTGCCAGGA ACACAGAGAG GGGCACGTGG 120
GGGAGGGGTA AGGGGCAGGG ATGGAAGTCA GCCAAGGCTC CTTGACTCAC AAGCCATGCT 180
CTTTATTTTG CAGACAGGGC TCTGCCTGCC CATCTGTGGT CTAACCTTAA TCCCTCCTGC 240
TCCAGTCAGC CCTTCTCTCT TCAAAGTTCT TGCTATGCCC TTCGCCTTCT TGCCTCCGGT 300
CCCCTCAACC CCATCCCAAC TCTCCAATCC TTTAATCATC TTTGCCATTC ACTACCCCCC 360
ACCTCCCGCA GTGCAGCAGC TGCTCTGTGG GTGTCTACAT ACCAGTGTGT ATGTGTTGCA 420
CACTTTCCTG CATGTGTACC ACTAAATGCT GTGGACTGCA TTGGGCATGC CTGTCTACAT 480
GAGACCCTTA TCTAGCTCCC ACTACTGGGG GAAAGGGGCC TAATGGCTAT TTCTCCCACA 540
GCTCCAGGAC AAACGCCTCA GAATACTTTC AGCCATAAGC AGGGAGAGGA AAAAGAAGAT 600
AAATATTCCG AGATCCAAAT AGCACCGACC CCACCAAGCC AAAGGTCAAG GCCTTTCCTT 660
TCGGGAGAGC CACTGGAAAA GAAAGTGCTT TGAGTTCCCC TCCTTTCCTA TGCAAAATTA 720
GAGCCATCTC TCTCCCCCCC AGCTTCCCCA CTGGGAAGTT CTTCCTGAAG TCTAAGCTCC 780
ATCCTACCTG CTGTGATCAT GGATAGACAG AGTGACATCG ACCACAATAC AGTCAGACGT 840
CCAGCTTCTA GAACACAGCT TCTAGTACCT AACCGCCCCT CCCTCCATGA GTAAGTCACC 900
AAACTGGGAC AGAAGGACAG ACAGTTGGCC GGACTCCGGC CCCATGACTG GCTCATAAAA 960
GCCACCAGCA ATTACAGTGA TGCTGAGGTT GTGCCGGCCT GCCACCATTT CCTCCTTCTC 1020
TATAAAAAAG AGATAGTTGC CTCAAACCAG CTGGCCTGAG AGAGCCTCGA GAGTCCCAGC 1080
CATGGTCCCG TGGGATGGGG AGAATCCCAG CACCACAGTG CCATGAGACT CAGAACCTGA 1140
CCCTTGATGA TGGGTTCCAG GCTCACATCG GATCCTCATA CCCACTTATA GAACCTGATG 1200
AACACCAACG ATGACCTGTG TCCAAGAGGT CAAGGCCTGT ATTAAGTCAA GGCCCTCAAC 1260
TCCTCTTTTC CAGTAAGGCC ACCACTCTCT CGACTAGAGG GGCAAAGAAG CAGGGGGCCT 1320
GACTCAAATA GAACTAGGGA AATGTTGGGC CCACCCACTT GCTCCTGGAC TTCCCTTGTC 1380
CCCATAAAGG TACTCAGGTG TGTGGCAAAG TGTCCAACCA AGGGCCCACA CCAGGCCAGC 1440
GTAAGTCCTG AGATTCTGGA TCCAGTGCCA ACCAGGGAGA GCAGGGGGCC CAGCTGGTCA 1500
GGAAGAGAAA GTTGACAAAA TGGGGAGAGG TCCAGGCCTC TCTGGGGGTA TAAGAGCCAG 1560
GGACGACCAC AGCAGAGGGA CCCTCTGAGG GCACGGTAGA GGAGAAGGGT CTGAGGGGCT 1620
GGGCCATAAT CAATGAGGGC CTATCCCCAA GGCCTCCTCG GGGGCCAAGG CACCTCCCAC 1680
TCCAAGCTTC CTTACTACTG CTCCTTTAGC TCCCCCCAAC CTGAAGAGTC TCCCTCTGGC 1740
TTCTCTTCCC TATCACATCT CCCAGGAAAG ATTAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAC 1800
CCTGCTACAG AGAGATTATA TAACAGCAGC CAGAAAGACT ATCATATCTC CCAGCCTATG 1860
AGAAGAACCA GGAGCCAAGG GGGCAGAGCC AGGATGCCCA GGCCCTCCAG CCCAGGGGCA 1920
CCAAGCACAG AGTGGGGTGG ACACGGACAG CACCTGCCAC CCCTCCAAGT CCTCCACCAA 1980
TCTTTCAGGC ATTGAGTACA GCAGACAGAA GCTCTAGCCA ATTCCCCATG CCCATCCCCC 2040
AACACAAGGA TCATGAGGCT CTCTGGGTCC TGCTTCTTCC CTTGGACTGG GGCTTCCATG 2100
AACACGGACT GTATGTCTCC CTTCCCAGAA TCCCTCCCTA CTATGAAGTT GTGCCTAAAA 2160
GAGTGGAAAG ACGAAAGCTC TGACACAGAT TTGCTGTGTG ATCTCAGGTA AAAAACTCAA 2220
CCTTTTGGGT CCCTACAGGG GTGAGTAAAA GCTCCTCCCT TCCTCCCTTC CCCCCTCCCC 2280
CCCTTCCCCC CAGAGAGACC AGAGACCTCT CCCTTTACAA ATGTACATGC ACACACATAC 2340
ATATACACAC ATATGCAAAC ATACAGGGTG TGTTGGCGGG GGCAGGGGAG TTACAACAAA 2400
GAGAATATAA TCACTGAGAC CCAAAGGTCC AAATGCCTAT GCTGGGGCAA GTGGGGAAGG 2460
AGCTCCATAT AAGCTCCAGT GTCCCCCAAT CACCCCGTAT AAAGAGGTCC TCAGCCACTC 2520
CCACAATAGT CCTACCCCAC CCCCATCTCC TGCCCAACAC ACTGGGAAAC CACAGGAAGG 2580
AAATTCATTC CCAGGCAGGG CCGTGGGAGC TGGGACAGCC AGACTAAGTC CTGGGGCGGG 2640
TGTGACCCCG TGGCCACAAG CGGGTGGACA TCTGTGAACA CTGACATGTG CCTTTTCAAT 2700
GCTCTCCTCA GCTACTGAGA CCTTCCTGTT GGGGTTGGGA GAGGAGTGGG AGGTGGACAG 2760
CTCCCAAACG CCAAAACACC CAATCTCAGG CTGACCTGCG CTCCCCTCCT ATCTCCAGGC 2820
CAGAGCAGCC CAAGGTCACC GCCCCAGACG GCAAACTTCC CATAGTCTAG GCTGGACCCT 2880
GAATTGCTGC GGAGACCCAC TGAAGGGATA GGAGGAGGAG TGGATAAGGG CCACCTCCAC 2940
CCCAAAGCAA AGAAACCAGG ACTCTGAGGA AAACTCAAAT GGGGGTTGGG CACAGCAAAG 3000
AGGGACACAG GATCCCCCCC AACCCGCTAT ACCCTCCCCC AACCCATCAA CAATGCACCA 3060
AGCAATGGGA GGCAGAGGGA GGCTCCCATT CAGAAGGGCA AACCTGGGAT AACCCGGTCG 3120
GTGGCTTCTA GAGTGCCTTC CTTTCAGGAG GAGTCCTCGG AAGGCTGCTG AGAGGACAGC 3180
GTGATTCACT AGGGGGAGGG GGCCCCTTTC CCCATCCCCC TAAGACCCGA ACCTGGTAGG 3240
AGAGAAGCTG GCATTGGAGT GGGGGACTAA AAGCATTTTG GTCTCCTTGG CCCATCCTCC 3300
CAAAAGCCCC CCCAAACTCC CTAAACCCCC GCTCGCAGCC CAGCTCCGCC TGCCATAGGT 3360
GGAAAGGACT AGAGAACTCT TGCCCAGATG TTGAACAGCT GCAAACTTCT GGCCAGGGAG 3420
TTCTCCAGTT GGGGTTACTG ACAAACCACA TCAGGGGTCT CGGAAGCGGG GCTAGGAGGT 3480
CTCAAGGAAG GGTCCTGCGT GCCCACCTCG TGGCGACTCC GCGTCCCAAC TCCACAGGCA 3540
CCCGGCAAAC ACGGGCCCCG GAGACACACA CACTCACACA CCCCAACCCA CTACCCCGGT 3600
GTCATCTGAA CAACATCCCC CCTCCCTCCC CCGCTTCCCA AACAGCTGCG GCTCCCCCCG 3660
CCTCCACCCT CCCGCCGCCC TCCCAGGCCC CCTTCTGCAC CATTTCGGGC CAAGGAGGAG 3720
GGAACAGGCG GCGAGAGGAG GGAGAGGGAG GGAGGGCCGG CTGTTAAAAT GTCAGTCGCT 3780
CCCGACTGTC ACCGGAGACC CCCTCGGAGG ATGGCGCCCC GTCCCAGACC GCTCGGAGGC 3840
CGTCGTAAAC CCCCTACACG AACAGGCGGG CGCGCCCCCA ATCCGCCCGT CCCCACCCCG 3900
TACTCCCAAC ACCCAAGGGA ATTGCAGCCC ACTCCACTTG TCCCCCACGA CAGACTCCCT 3960
GACACAAACA GTCCCCTAGG TAATCCCCGC CAACGCCACA CGAAAACACG GCCCGCTTCG 4020
CGAGTTCCTC CCGGCCCGGG GGCTGCCCCA TCCCACCCCT CAGGGGGACG GTCTAGACCA 4080
CCCTCCACCC CAACCCCTGG ACCGGGTGGG GGAGGGGGCC TCTTAAAGTG GCAGGCGCAT 4140
TATTTTTCTC 4150