EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS180-01472 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Small_intestine 
Coordinate
chr1:44005400-44010700 
SNPs
Number: 4             
IDChromosomePositionGenome Version
rs2782639chr144006339hg19
rs2842189chr144007648hg19
rs58859557chr144010456hg19
rs6695915chr144010571hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:44006894-44006905CTAATTAATAT-6.02
RARAMA0729.1chr1:44010534-44010552GGGGTCAGAAGGTCTAGG+6.42
Number of super-enhancer constituents: 22             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00616chr1:44005080-44009253Adipose_Nuclei
SE_00616chr1:44009256-44025211Adipose_Nuclei
SE_03403chr1:44004983-44011531Brain_Angular_Gyrus
SE_04240chr1:44003988-44015177Brain_Anterior_Caudate
SE_05040chr1:44001099-44015486Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05962chr1:44000439-44020958Brain_Hippocampus_Middle
SE_07193chr1:44003475-44015024Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08033chr1:44003431-44015175Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_23218chr1:44005985-44017477Colon_Crypt_1
SE_23829chr1:44006114-44007202Colon_Crypt_2
SE_23829chr1:44007449-44009116Colon_Crypt_2
SE_23829chr1:44009144-44011544Colon_Crypt_2
SE_24870chr1:44006024-44012830Colon_Crypt_3
SE_26649chr1:44004605-44010559Esophagus
SE_27645chr1:43995619-44017587Fetal_Intestine
SE_28595chr1:44005404-44017604Fetal_Intestine_Large
SE_31538chr1:44004919-44019003Gastric
SE_41575chr1:44001646-44015303LNCaP
SE_47657chr1:44007821-44008484Pancreas
SE_50363chr1:44005822-44020588Sigmoid_Colon
SE_52524chr1:44004832-44019377Small_Intestine
SE_65452chr1:44004903-44018198Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr14400606544007112
chr14400750644008104
chr14400625444006791
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I043539chr14400545944020850
Enhancer Sequence
CCTAACTCGA AGTCCAGTCT TGCCAGAATA GGTACCTGAA GGTGGAGCCC TCTGTCCTCT 60
CGGGAGGCCA CTAGCTGATG GCATGTCTGG TGGGGTGCAG ATGGGGTGTG CTATAGGACC 120
TGACTTCTGG AGGCTGGGTA GGGCTGATGT GGGGGTACAG GGGAAGATAC TCTGAGATCC 180
TGAGGCCAGG CGCCAGCAAA TACAGGAGTT AAGCCAGGTT GGAGCTTCCT TGGGTACAAG 240
GCCCAGGGTG CCCACAGGGG ATTGGGTTCT GGGGCAGGGG CCAGGTCAGG CTCTAGGCTC 300
AATTGGCAAA GGATCTTGTT GTCTGTGTTG GGGTTTCTCA GCCTCAGCAC CATTGACATT 360
TTGGATCAGA TAACCCTTAT TGTGGGGGCA GGGCTTGTTA TTGTAGGGTG TCTAGCAGCA 420
TCCCTGGTTT CTTCCCCCTA GATGCCAGTA GCATCTCCCC GCTTTCCCCA GTCTCGACAA 480
TCAAAAATGT CTCCAGTCGT TGCGTAATGT CCCATGGGGG CAAAATTACC CTGAATTGAG 540
AACCTCTGGT CTACAGCCTC TTGCTGCTTT CACTATACTG TACAAACCTG GAAAATTGGG 600
GAGGGTCAGT GGGGAAGATG GATAGTGATG GGCCACTTGA GCAGAGTTCT GAGGGGTGAG 660
TGAGTGCTGG GGCAGGAGAA GGACATTTTT TTCCAATAGA CAGAACGGCA GGTACAGAGG 720
CTTGGAGGCA CAAAGTTGGG AAACAGTAAT CCAAGGGGGA CCCCAGCCCC AGAGGAAGGG 780
GCCTGGAGGC TTAGGGGTTA CAGCCGCAGG AAGATACCTC TGCTGGTCCC CTTTGGTCAT 840
TTGCCTCCAG AGTTAGTCTC CTGCTGACCC TTTGCCGCCT CCAAGTCTCT GCGACACTCC 900
TCCTAATCTC CCCCTCCACT CCTCAGTGAG ATGGAGAAAC TGAGAGCTGC AACAGGGTGG 960
GACTCAGTCC AGCTGGTGGG AGCCCCGATA CCAGCCGTGG GAGGGAGGGC TGTTCCTGGC 1020
TCTGCTCACG GATTCTGGCC AACTGGCTGG AGGAGGGAAG GCGGCCTCAC CCTCTTCCCC 1080
ACAGGCCCCT CCTTCCCTGG GTCAGGGGTC CTGGCTGAGA CTATAATTTA TTCCCGTCAT 1140
AATCCAGTGG TTGGTTTGGT GAGAGCTGGA AACATGTTGG TTTTCCCTTC CCAAGTATAA 1200
CAAGGCCTGT TTCCGCCTCC GCGGCCGCTG CTGCAGTGCC ACGCGGTGAA CTGTCCAGGA 1260
CATGACAAAA GGGCTCGGTT AGCTGCCCGC TGGTTAGAAG ATGAACGGCT CAGAGCTCTC 1320
CCTGCCGACA GGCTCTTCCC TTCCTGTTGC CCAAGTGCTG GCCTTTCCTC TTGGCCGTCT 1380
GCTCTGTAGG GCCCTGGATA CCCCTCCTTC TGCTCATGTC CATTTCTGGG CCCCAGGGTC 1440
CTGGCCTGGG GAGGTGAGAT GGGGGAGGCT ACAGAAACAG GTGGTATTTG GAGACTAATT 1500
AATATTTGTG AATAATAATG CATGCCCAAG GAAAACAAAT CAATCTGTGT TTGCGTATTT 1560
ATGATGAGGA CTCAGGAATG ATCCCAGCTG TTCTCCAGCC AGGGAAGCCC CCATCACATG 1620
GTCCCTTGGG CCCCCACAGA GGCTGGCAGG GTGGTTAGGG TGGGCTGCAT GGAGGTGACA 1680
TGGCTTCTGT GTTTTGCAAC GTGAATCTTC TGTGACGTTC ATATGCGAAT GCTGTGGCTT 1740
GGTCTAGTGC CTGCTTCTTC CTTTTCCCTC AAAGCAGTGA TTCCCAGGCT CTTTGGTTTC 1800
ACGAACCAAT ACAATTTCCA AAAGTACTCA AGAGCCAGAC ATGGGGTTGG CAATTTTTTA 1860
TTTTGCCAAG TAAAGGCATT ATAAAAAAAC AACTGCTATC TGCTGTCCCC ATCATTTCAT 1920
ACAGGAAAGA ACATTTTAAC ACCAAGGACA ATATTTGAGA ATAAAGGACA GTTCTTCCCA 1980
AGAAAGGGCA GTTGGCAGCT TTACACTGAC GTAGCAAAGG AAAAGGATAT ATTAAAACCA 2040
TTCTGAATGT GGAAAAATTG TGTCCAATTA TATTCTATAA TATCATACCG TATGTAATTG 2100
TGTTCCTGCC CAAGTATGTC AGCTTGGCAG AACGGATGGT CCACAGTGCA ATTCAGAGAC 2160
GAGCTTGAGT GCCCCAGTGC TCCGGCCTTG TTTTTATCTC GGTTGTTGAA AGCCCAGGCT 2220
CACCCAGCCA TGCTGGTGAA GTGGGTGTTC TGCTGTGAAC ACCGTTGCAT GGATTCACAA 2280
GATGCTCAAC CTCGCAACCG CAGTCAGGCT AGCAGCAGCC CTGCCCCTTG TTCCTCTCCC 2340
ACCTTCTCCC CACAGGTGAC CCTGGGACCC TGGGACTCTG GGGGCCAAGG TCTACTCTTG 2400
AGGCCAGGCC TGGGGATCCA GGGCTGCTCT GCTCTGATGA GGGAGGCCCT GGAGCTGGGA 2460
GTGGCCTGAA CCGCCTGACA CCAGGGCAGG CTCTGTGCCC GGAGTCTCAG GGCGGGAGGC 2520
AGCTTGCTCT CGCCAGGAGC TGGTGAGGGA GAGGCCCTGG CTCGTACAGC TGTGTGGCTG 2580
CCAGAGTAGT TGCCTGAGAA TGTGTTTGTG TGTGTCCCTT GTGTTTCCCC ATCTCCCTGG 2640
GCATCTGTGT CCTTGTGTCC ATCATGGACC ACTGGAAGAA GCTCTCTGTT CTACTTTCTG 2700
GATCTGAACA AAGTGTCCTG AGCACCCCAA CCCAGATACA CAGGGGGTTT CTGGAGGCCC 2760
CACGTTGGGG GTAGGGTTAC CTGAGGCCCA AGTTCTCCAA CACCCATGGC CAGACTCTCA 2820
TCCAGGCTTG TACCACATGG GTGTCTATTC TGGGAGTTTT ACCCCCATGA TGGCTCTCCT 2880
GGGAGCTCTG CCCCCACCAT GAAGTCTGTA ACAGCACGTT ACACCTCTGC TAATGTATGG 2940
GGAGTTGCAC CCCTGTAATG TCCTTATCAG GCAGCTGCAC TCCATGATGT CTGTACCCTC 3000
TGTGTCCGCC CACGTGATGT CTAGACCACA CCATTACACC TCCATGATGT CTGCACCTGG 3060
GCGTTATACT GCTATGATTA CTGCACCAAG GCGGCTACAG GGGATTAAGC CTCTGCTCAT 3120
TGTACTGGGG AGCTATATCC CATGATGACG GTGCTGTGCA TTTTATTTTC ATAGCAGGGA 3180
GATATGCTCA TGCTGGGGGC CTATGTCCCT ATGAAGCCTG CCTGGCAGGG GTTGCATGCT 3240
TGGAATGCTT GTTCCTGGAA GTTAACCTCT GTGACTATTA TATTGTTATA CCCGATGATG 3300
CCGGTACGAG GCCACTGTGC CCTGTCCTTT GGTGCAACAC AGCTGTTGAG TTATAAACTC 3360
ATGTGTCTCA TTCAGGGGCT CCAGGATGGT CCATCAGGGG ACCATACCCC CATGATGACC 3420
TGGCCTGGCA TAGGATACCA GATGTGTCCA CAGGCCCAGG GAGGAAGAGC CACTCATAGT 3480
CCACCACCTG ATGGCCGCTG GGAAGGTGCT CCATCGTTGG CTGCATGTGG CACCATAGCG 3540
CAAGCTCAGG CAGGGCCTTG GTGATGTGTG ACCTCCATCC CACTGTGGCC TTGCAGGCGT 3600
CATTGTGGTC TCAGCCACCT CAGCTCTGGG ATCGTGGAGC AGATCCATCC CCAGCTTGGT 3660
GTAAATGGGG CTGGACACCT ATCAACGTTC TTACTTGAAG AACTGGTGTA AATGAAGGCT 3720
GGACACCCTT CACCGTTCTT ACTTTGTTGT TCAGCTCCTG TCTCAGATTT TTGGTGGGAT 3780
CCTGGGACAG GGGACAACTC TCACCCCTTT TCCTTTGTGT TTGGCCCCAT CCCACTTTGC 3840
ATTCCCACCT GCTTTGTCCA ACACCTTTGC TCAACTGCTG CCTTCTGACC TCATGAACTT 3900
TGATTATCTC AGTTGAGACA AGGGTTCAAA TTTCAGAAAC GACTGGAGCA CCTTTGAGCC 3960
CTGCCCATTC CTGGTCACCT GCCCTGTCAC CTTGCAAATT CTCTTACTAT TGTGGGTCAG 4020
CGGGGACCTG GGTCTGATCA CAACTCCCCT ATCAAAGTCC ATGCGTATCA CTGTGGGGCC 4080
CCAAGGCGTG TTCACCGTCA TGCACTCTGC TCTGTTGCGT CTTCACAGCA TTCATGAGGG 4140
ATCGACCACG TCTCACCCCT CTGCCCAGAG CATGGTGTGA TCAGAGCTTG TGGGCCCTTC 4200
CATACATCCC CTGGTGCCCC CCAGGTGAGG GGTATGGGAG AGAGACCCTG GGGAGCTCAC 4260
CAGTGGGGCC AGGGAGTGAT AGCAGCGTAT CTCCCATGTA TAGTGCGGCC ATGCTAGAGG 4320
CTTCACCCAG GTGCCTGCAG GCACTTCAGG CCAGGAGCCT TGGAAGTAAA GGCCTAGGGG 4380
CATTCAGCCA GTCCCAGACG CTACTCAGTC TTTTTGTGCA TAGCTTCCTG TCTCAAACAT 4440
CAGCCCCTGA GGTTCACACC CCATCATCCC TACACTTGTT TGGCTCCGGG CTTCTGGGGC 4500
AAGGGCAGAA GAGATGTGAG GTTTGAATTC TAGGGTCTAA CACCCCATTC CTGGCCACTG 4560
AGGCCTCCCT GTGGTTTCTC TGTGAAGTAG GAAGGTGCCA TGGGAATGGG TAGGACGAGG 4620
GTGGCCAGGC AGGGCAGCAG CAGCTTGTCA AGAGCACGTC CTGGTGAGCA CTGAGGGGTT 4680
GTGGCTTTGG CTGGAAGCCT CTGATACCTG GAGCCTGTCT TCTGCTAACA AGCCTGTGTT 4740
CAGGGGCCTG TGCTCAGCGT GCTCGTGGAG TCTGGCCTCC CACCTTCTCC CTCCCTGCTG 4800
GGGAGAGGAG GGGCAACAGA ATTCTACCAG GGAGACTCCA GAGTCAGTTG GCTTTGCCCC 4860
TCACTGCTCC TTGTCACTGT CTTGTCTCTC TGTCCTCTGT CCCACGTAAG CGTCTCTCTG 4920
ACCCTGTTTC CCTGTCCTCT TATGGGGGTG AGTTAGAAGC TCAAGGTTTG GACTGGAACA 4980
CACTGTACAT CCTCTGGTCT CACTCACTCC CTGTACCTCC TACTCAGGTT TAGAGAATGG 5040
CCCGAAGGCC TCCTGCGCTC TTTCTCCCTC CACCGTGACT GTTGGGCTGT CCTTGTGGGT 5100
GCTGGGGAAT AAGTGAGGAG CTTGGGTGGT CACTGGGGTC AGAAGGTCTA GGTGGTCATT 5160
GCACAGCCCA AGTGGGGGGC TCTGTTGAAC TAGGCTCTGG ATGGTCAGTG AGGATGACTG 5220
GGGGTCAGAA AGCGTCAGGG GTGGGCATTA GGGACAGCAG TAAATACCAG CTAACTGGCT 5280
CTGCCCTTCT CTCCATTACA 5300