EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS180-00686 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Small_intestine 
Coordinate
chr1:20802290-20805220 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:20803829-20803840GATTTAATTAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr1:20803837-20803850TAATTAATTAGTT+6.22
Lhx3MA0135.1chr1:20803833-20803846TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:20803834-20803847AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:20803830-20803843ATTTAATTAATTA-6
POU6F1MA0628.1chr1:20803835-20803845ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:20803835-20803845ATTAATTAAT-6.02
RFX2MA0600.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC+6.02
RFX2MA0600.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC-6.29
RFX5MA0510.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC+6.07
RFX5MA0510.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC-6
mix-aMA0621.1chr1:20803838-20803849AATTAATTAGT+6.62
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03446chr1:20803030-20803671Brain_Angular_Gyrus
SE_03446chr1:20803754-20804585Brain_Angular_Gyrus
SE_05163chr1:20802127-20814849Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06168chr1:20800960-20809454Brain_Hippocampus_Middle
SE_06941chr1:20801073-20814394Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08044chr1:20802020-20815753Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_23263chr1:20802154-20804475Colon_Crypt_1
SE_24162chr1:20802438-20803173Colon_Crypt_2
SE_24162chr1:20803198-20804404Colon_Crypt_2
SE_24976chr1:20802327-20803850Colon_Crypt_3
SE_24976chr1:20803865-20804568Colon_Crypt_3
SE_27987chr1:20800622-20814579Fetal_Intestine
SE_28809chr1:20799528-20814863Fetal_Intestine_Large
SE_41848chr1:20802447-20804302LNCaP
SE_41848chr1:20804758-20805193LNCaP
SE_65794chr1:20802035-20804918Pancreatic_islets
Enhancer Sequence
TGAAATGGGC ATGATATATA GTTGTAACTG GCACACACCA TAAACATGAT TCCTAGGGCT 60
GCTGTGAGAA TTAAATAAGA AAATGTACAC GGAACACTTA GCACTGTGGC ACATGACAAG 120
AAGGCTATTA AGAAAATTTA AATAATGGAA AAAAAATAGA ATACCGATAG TGATAACTGC 180
GCACTCATAC AATGCCTTGG TTGCAGAGGT CATTCCCCCA CATTACCTTG TGGGGTTTGA 240
TCAGCAGTTC TGGAAGCACC TAGGGCAGGA ATCACCACCC CAGGGTCACA GATGAGACTG 300
CTGAGGTTCC CAGAGGACCC AAGCAGGGCT GCAGGTGCCC TGGCTCCCAA CTCAGTCAGT 360
GCTCTCTGGT TCCGGAAAAG AATTCTGGGT GAAAGCGGGA GGGGGTGGGA AGCTCCTTCC 420
CCCCAGGTAC CCCTGAGGTC TAACTCTGGA ACTCCTTGGA TAATGAGAAA AGGGGGGCTT 480
CGGAACCCAG GACGTGGGTT CCACATCCTG CGGGGGCAGG GAGGCCGCGC GGGAGGCCGC 540
CAGACGCAGT AAATAATTCA CACAGATGAA CTGGAGATAA GGGCGGCTTC GTGGAGGATC 600
GAGTTCAGGT CGGAGGAGGC TCAGACGGCT GGGGGGACTT GTGGTCTCCC CGGTCTGAGA 660
GGGGAAAATT CCTGGGACTC TGGCTGCCAG GAAAACACAG TCCCCAGGTG CCGGCTTGGT 720
GCCACTCCCT GCCATTGGCG GGAGGGAGCT CCCCGGAACT GCCCCGCGGG GCAACAGGCC 780
TGGCCAGCCG CCTCCGCCCA GCCGTCCCCA TGGCAACCGG CTGGCCTGGT CCAGGGTTCA 840
CGGACAACCG GATCCTCTGT CTCCCCTCCC CCACGGGAGG CTGGGCGTCT TAGACTCCCA 900
ACTGTGTTCT CTGGGAGCTT CCAGCTGCAG GAACCTACAG AATCATCCTG TCTGACCCCC 960
TCGTTTTATG GGAGTAGTTG AGACCACGGA CTCTGGGGAC CTGCCCGTCC TGGTTGCAAG 1020
CCCCGCTCCA CCATTTCCTG CTGTAGGATC CTAGGCAGGG GACTTGGCCA CCCTGTGCCT 1080
CGGTGTTCAT TATCTGTAAA ATGGGGATGA TAATAAGTGA CTGTCTTATA GGGTTGTGAA 1140
AATTGAATGG ACTAAATGCA AAGAGGGCAG AGTGGTTACT GGTCTGTAGC CAGCACTGAG 1200
GAAGCATTAT TTTCCATGTT GGGAAGGTGA CGGTCACACA GCATGCTATT AGCAGATTTG 1260
GGATTGGAAT GCAGTTGCCA ATTCTTCCTA AAACACCCAG GGTGGCCACA TTGGGATTCT 1320
CCAAGGGTTA CCTGTGCTTC CTGCGGGCCC ACCCAACCCC CCTCTCTAAC CTCTTGACAG 1380
TCACAGTCAT TGAATTGTCT TTGACCAGGC AGTAAAATCC CTGAACCAGA AAAGGTCTTG 1440
CTCTAGCCAG CCCGGTCTCC CCAGTGCCAA GCACAAACCC GTTTCCTGCA CCTCCACTTT 1500
CCACCCCATG CCTGGTAGAG GAGTTGTTGA ATGAATATAG ATTTAATTAA TTAATTAGTT 1560
CATCTCCTCT ACCCAAACAC CCTCCCAGAG CAAGCTCCTG AAGCCCCTGG CCACCCAGCT 1620
CTCTCTCTTA CAGGACACCC CTTACGCTGA CCACTTCCTG CCATCAGCCC CCACCCCACC 1680
CCACTGCCAT CACCATGCTG TTCACAGTTC CCATGGCACA TTGCCTGGGT CCTCCTCCTC 1740
CCTTCAGCCT GCCCTCCCTC ACTTCCCTCC CCGGTTAGTG ACCCTTTGTC CTCAAAATGG 1800
CTGTTTTGGG GTCAAGGACC CTCCTCCAGG TCCAGAGGTG TACATTTCCC CTGGGTTAAG 1860
GAAAAACCCT CCAATGTGAG AGGCAACAAA GTAAACCGTC CTCATCCCCC ATCCTGGGGG 1920
AGACAAATGG GGGCCTGGTA CTGCCACGAT GGGTGTAGGG GTAATCCAGC GGCTTTCTGG 1980
GACTCTCCAT CCCACTAGGG AGGTGGCAGG GGCTTTTGGA CGCAGAATCT CTGCCCTTAG 2040
GGGCCACCCC ACAAGCTCCA GCCCAGCTGC CAGGTTTCCT CGGATACGGC CCAGTCGCCT 2100
CTGATTTATT TTTGCATGTG GTTTGGGAGA ATCTCTGTTG CTGGAATAAC GACAACCTTT 2160
TTTTTTCTCT CTCTCTTTTC CTTCCCTCCA ATAGGCAGAC TTTATAAACC AGAGCAGCTG 2220
CCTGAAGGTT TCCAAGAAAA AAATTCTGCA CAGTTTCTAA CCAGGGTGAC AGTTCCCCTC 2280
CACAGGAAGT TACTTTTATT AATTTTTTTA TCTCTTCTTT TGTAAGACTA TATACTGGTC 2340
ATCAGGCAGC ACCTGTGGGC ATTTTCTTAT TTCCCCCCAC TGCTCCCATT TGCCTGGAAT 2400
TCATTATTAA ATCTAACTCA TAGTGGCCTT GCCCAACACA GGGGCGAAGT TCAAACTACT 2460
GAAAAATGGG TCACTCAAAT CGCCTGTGCA GAAGAATCCC AAATAATTTA TGGAGATACT 2520
CCTCCCTCAA GGCGGTGAAA CATAAATCCC TGTCCCTGAA GTGTGGGCTG TGCATAATGA 2580
TTTCCTTCTA TGGAGTATAG TATGGAAAGC AGGGGGAAAG AGTAATCTTG CAGGAGAGAA 2640
ACCTGACAAG CACTAGCTCA GCCAGATGGC CAAGGTCAAC ATCAGCAGCG ATCAGTCGTG 2700
TCTATAGCAT GGACACTTGA TATGATGTGA TGGAAACAGC ACATCACCCC CAAACCCATA 2760
ACCACAGTTG AACCATGAGA AAAACAGCAG ACAGACCCCA CCTGAGGGAC AGTCTACAAA 2820
TTACCTGACC AACAGTCCAT CAAAAGCAAG GAAAGTCTGA GAAACTACCA CAGCCAAGAG 2880
CAGCCTAGGG AAATAAGATG GCTGCATACA ATGTGAGAGA CCCTGTGGAA 2930