EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS180-00409 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Small_intestine 
Coordinate
chr1:12231790-12234440 
TF binding sites/motifs
Number: 40             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr1:12233024-12233036TTCTGTTTACTT-7.22
FOXP2MA0593.1chr1:12233025-12233036TCTGTTTACTT-6.32
GATA2MA0036.3chr1:12232427-12232438TTCTTATCTGT+6.14
Gata1MA0035.3chr1:12232427-12232438TTCTTATCTGT+6.62
Nr5a2MA0505.1chr1:12231941-12231956TCTGACCTTGACCTT-6.94
RORAMA0071.1chr1:12231949-12231959TGACCTTGAT-6.02
Stat4MA0518.1chr1:12233725-12233739CGTTTTCCTGGAAG-6.23
ZNF263MA0528.1chr1:12234302-12234323TTCTCCTTCTCCTTCTTCTTC-6.47
ZNF263MA0528.1chr1:12234206-12234227TTCTTCTTCTTCTTCTCCTTC-6.52
ZNF263MA0528.1chr1:12234209-12234230TTCTTCTTCTTCTCCTTCTCC-6.7
ZNF263MA0528.1chr1:12234212-12234233TTCTTCTTCTCCTTCTCCTTC-7.12
ZNF263MA0528.1chr1:12234215-12234236TTCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.13
ZNF263MA0528.1chr1:12234299-12234320TCCTTCTCCTTCTCCTTCTTC-7.15
ZNF263MA0528.1chr1:12234221-12234242TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234227-12234248TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234233-12234254TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234239-12234260TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234245-12234266TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234251-12234272TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234257-12234278TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234263-12234284TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234269-12234290TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234275-12234296TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234281-12234302TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234287-12234308TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234293-12234314TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234218-12234239TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234224-12234245TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234230-12234251TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234236-12234257TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234242-12234263TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234248-12234269TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234254-12234275TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234260-12234281TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234266-12234287TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234272-12234293TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234278-12234299TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234284-12234305TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234290-12234311TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234296-12234317TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
Number of super-enhancer constituents: 31             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00369chr1:12226565-12247198Adipose_Nuclei
SE_01471chr1:12232095-12234188Adrenal_Gland
SE_04546chr1:12232368-12233932Brain_Anterior_Caudate
SE_06521chr1:12231395-12234253Brain_Hippocampus_Middle
SE_09154chr1:12224797-12249846CD14
SE_10696chr1:12231624-12233979CD19_Primary
SE_11902chr1:12231048-12236114CD3
SE_14553chr1:12231008-12236205CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15480chr1:12231304-12235464CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16369chr1:12231214-12235920CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16946chr1:12231228-12235850CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17650chr1:12231292-12241643CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17827chr1:12231021-12246713CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18389chr1:12226183-12250288CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19117chr1:12225970-12243644CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20048chr1:12231058-12236137CD56
SE_20873chr1:12231198-12236438CD8_Memory_7pool
SE_22347chr1:12226250-12242299CD8_primiary
SE_26251chr1:12232165-12234254Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27503chr1:12231615-12234368Esophagus
SE_30788chr1:12232018-12234343Fetal_Muscle
SE_32030chr1:12231844-12234207Gastric
SE_41498chr1:12232230-12236136Left_Ventricle
SE_42336chr1:12231389-12236106Lung
SE_48967chr1:12232188-12234263Right_Atrium
SE_50250chr1:12231283-12234299Sigmoid_Colon
SE_52522chr1:12231293-12236092Small_Intestine
SE_53313chr1:12231250-12236109Spleen
SE_55394chr1:12232096-12233341Thymus
SE_55394chr1:12233345-12234247Thymus
SE_61096chr1:12184746-12245090HBL1
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr11223209612232448
chr11223360012234159
chr11223353112233800
chr11223380012234000
chr11223400012234197
Enhancer Sequence
CTTATTGGAT GGCAGTAGCG CCACCCTCCC TCGTGACAAA AATATCTCCA GATATTGCTA 60
AGTGTCCTTT GGGGTTGGGG GATTGCCCCT GATTGAGAAC CACTGGCCTA GGACAGTGCC 120
TGGCACATAG TAAGTGTTCA AAAAATATTC ATCTGACCTT GACCTTGATA ATGGCCCTGT 180
TTTACAGATG AGACGGGGGT TTGAAAAGTC AGTGGTGGCA GGGTGGGGTT CTGTTTGCCT 240
CCATCTCTTG GGGTATTTTT CTGGGCTCCT CTTCCCATTG AGTGGTGTCT GCTGAGGTTA 300
GGGGTCCTCT CCCCAAATTG CTCACCCCCT CGACATCCCT CGTGTAGTGA GGGATGGGGC 360
CACTCACTGA CGGTGACTCA GGGCCCCAGA ATGCATGTGA TTTACCCAGA AGCGGGCAAG 420
GAGGGAAGCT GGGGTTTGGG GTGCCGGGGA TGAACAGGAA CAAAGGAGAG GCGCTGTGGC 480
TCCCCGTTCT GGACCCTCGT CTGGCCACAG GGAAGCAGCA CTGATGACTC TGGGGAAAGG 540
CCCCGGCCTC TGAATCAGAT AAACCTCAAG TCGCTGCTCT GCTGTTTTAC TGGCTGTGTG 600
ACCTGGGCAA GTCTTTCTAT CCCTCGGAGC CTCTGTGTTC TTATCTGTAA AATGGGAGTA 660
ATCCTAGCCT CACGGGCTGG CTGTCAGGAT TAAAAGTGCT TTCTAATCCT GGCATTGGCA 720
GCTATTTGAG CCATTGGTGG CTTTGCAGGT CTGACCCGAC TCTCTGGGCC ATGGGGTGGT 780
GCTCGGGCCT AGGTGGGGAC CCCTGTGGAG TCAGACTGTC TGCTCTGAGC CCCAGGGCCC 840
TGAAGCTTGG GTGGCAGCCC TGCAGTTGCC CAGAGTTCCT GTCTAAGTGG CTTTGTTGCC 900
CATCATCTCA GAAAGCAACT TCTTTCCTCC CTGCCTTTTC CTGTCTGTGC TTCTGCCCCA 960
GTGCCCCCTG GCTGGGCTCT CAAACCCACT GCTTGACAGC CTGGTCTTAG GACACTGTAT 1020
TGTGGCAAAG GCTGTGGGGT CAGGATATCC CCTCCCCTCC CTTTGCCACC CCTTTTAGTG 1080
AGTAACAGGT GCTGTGTGTT TTGGGGATGA GTGAAGGGTA CATTTGGTGA AGCACAGAGA 1140
GAGTGCACAA GGCTTCAGTT TGCAAGATGG GCACGGGAAG ATTCCAGGCC ATCTCCAAAA 1200
CCTCTTCCAT CTCCAACCTC TGTGCTGCTG AAGGTTCTGT TTACTTGTGA CCCTGAGAAG 1260
GGGATGCCCT ATGGGGGCTC TTCTGAGATC ATGCTGTCCA TTTTCCTGCC TCCAAGTGAC 1320
TTCTAAGACA GCATGGCTCT GAGGAAGGAG CACTGACTTG GGTGTTGGGA GATCACAGTT 1380
CCCATCTGAG CACCGTCACT GGCTTGCTGT GCTACCTTGC TTGGGTTACT TAACCTCTCT 1440
GGGCCTAAGC ATCCCTATCT ATGAAACCTA ACAACCCTGG TTCCAATGCT TTCCTAGAAT 1500
ATTGGGGAAG TGTCGGCTTT GAGTATACTT GACAAAGGCC ACAGATTGGG GGTGGGGTAT 1560
ATAAAAGTCT ACAGGAAGGA GAGCCCAGGA CTCCCCACTG TCAATATCTT GGTTCCCCAG 1620
CTTCTCTTCT TCTTGCTGAC CTCAATCTCA CTTGCTTTGG GTGGATTGAT TTCCTGACTC 1680
AGGCTCCAGG GCCATCAAGA ATTCACGGCT GCCTTTCAGC CTTCATGAAG GACATGGTGG 1740
AGCTCCTTAG GCAGAACTGG GGTTTGTGGA TGTCCTGCCT CTCTGCCCCT TGGTACCTAG 1800
GTGGCACCTT TTCAAGTTCG GGAGCTAGAT CCTTTCCCCT TCCCCACACT GTAGGAAAGT 1860
CCTTACTGTA GGCAGGCGCT GCAGAGCCTG CTGTCTGGGA ACCCACAGGT TCAAGGAAGC 1920
CTTGAGCAGG AAGGGCGTTT TCCTGGAAGA AGCCCTTTGT CGCTGGTAAT GGGTGCAGGC 1980
TGCTCTGACC CGGTTCTGAG TCCTGCCCCC TTCCAGGCCT AGGGCTTTGG GCCTTGATCA 2040
CCTCTGCTGA GTAGCTGACT GCGGGGCTGG GGCTCTGATG CTCAGGACCC ACCTCTCTGG 2100
GACCCACAGT CTTTTTCCAC TGTGGCGTGT AGTGATGTCA CAGGTGGCAG TGATGTCACT 2160
GTGGTTTGAG GTACTTGGCT GTGAGCCCCG GAGGAGGAAG TGTCTGTTCG CTGATGGGGG 2220
GTTGGAAGAG ATCATTGACT TCTGCCCCAA GCGTGAGCCC CAAGTGTGCA GGGGGGAGTG 2280
CGGGGGGAGG GCTGTTGGCG GCGCATCCCA GGGCTCTGGC TCTGCCCTTG CATCTAGCCT 2340
GTCTTTCCTG TGGGCTGTGA CAAGCCACTC TGCATCTCTG AGACTCCATT TCTTCTTCTT 2400
CTTCTTCTTC TTCTTCTTCT TCTTCTTCTT CTCCTTCTCC TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT 2460
CTCCTTCTCC TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT CTCCTTCTCC TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT 2520
CTCCTTCTTC TTCTGATGGA GTCTGACTCC GTTGCCCAGG CTGGAGTGCA GTGGCGTGAT 2580
CTTGGCTCAC TGCAACCTCT GCCTCCCAGG TTCAAGCTAT TCTCCAGCCT CAACCTTCCA 2640
AGTAACTGGG 2650