EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS179-03256 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SkMC 
Coordinate
chr1:218670270-218673690 
SNPs
Number: 4             
IDChromosomePositionGenome Version
rs622912chr1218670357hg19
rs72738842chr1218672807hg19
rs11118112chr1218673257hg19
rs12046780chr1218673593hg19
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXH1MA0479.1chr1:218673425-218673436TGTGGATTGGA-6.62
Foxd3MA0041.1chr1:218670944-218670956AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:218670948-218670960AAACAAACAAAC-6.32
IRF1MA0050.2chr1:218672251-218672272AAGTGCTTTCTCTTTCTTTCT+6.35
NFAT5MA0606.1chr1:218672400-218672410AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr1:218672400-218672410AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr1:218672400-218672410AATGGAAAAT-6.02
NFICMA0161.2chr1:218670753-218670764TGTGCCAAGTA-6.32
STAT1MA0137.3chr1:218671728-218671739TTTCCTAGAAA-6.14
TCF7L2MA0523.1chr1:218672834-218672848TTCCTTTGAAGTTG-6.16
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02323chr1:218668940-218673595Astrocytes
SE_34115chr1:218670708-218673590HCC1954
SE_36549chr1:218669094-218673670HMEC
SE_37059chr1:218667317-218675140HSMMtube
SE_38564chr1:218669211-218673648HUVEC
SE_45788chr1:218669012-218673879Osteoblasts
SE_51738chr1:218669025-218673706Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_56115chr1:218667886-218673684u87
SE_63527chr1:218668917-218674335HSMM
SE_68133chr1:218622758-218673720TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1218671355218673056
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I218493chr1218667158218673741
Enhancer Sequence
CCTGGAGTGT TGCAGTATAG GAAGCTGTTG ATTATCAAAT GATTTTTCCC TCTTGGAACC 60
TTAAGAAGAA AACACTAGTG TGTGTCTTCA GTAAGTCCTC TGATTTATAG GGCGCTGATA 120
ATTGATTCAA GAAAAAGAAA GTATAGATTT ATATATACAC ACACATATAA TACCTATGCA 180
TGTATATCAT ATGTATATGC ATGTTTATGT ATGCTTTGTG TATGTGTAAA CATCTTTTGG 240
TAAAACTTAT TAATGAAATA TGAAGTTGAT GTAAATATCT TTGGGCTGAA AACAGTTCAT 300
ATATATATAA CAATTAATAA GGGCATAATT TTTCACTTTG CAAAACATTT TTTTCCTTCA 360
CAAAATGATT CCTCACAAGA TTATAAATGA ATGAACTAAT AAACTTCCAC ATGTCTCTTA 420
AAATAGGATT TGCTATATTA GTATTTATTA TAATAATAAT AAAATTAACA TTTTTAAACC 480
TTTTGTGCCA AGTACTGAGC TGAGGGCTTT ATGTGAACTA CCTCATTTCT GTCTCCCAGT 540
CACGCTAGGA TGTAAGGTAA CATCATTATC CTCTGCATTT GAAAACTTGA GGTTTACACC 600
TGTTCCCAAA AATCTATTGA AATAAAATAA AAATTAAAAA AATTTTAAAA AGATATTCAG 660
CCTAGTTGAA AAGCAAACAA ACAAACAAAC CCTTGAGGTT TAGAAAATTT CATAACTCTC 720
CCAGAGTCAC ACCTTAATAA GAGATGTAGC TGGGATTCTG ACCCCATAGC CTGTACCTCC 780
CTCTTCTCAA CAGTATTTCT ATATTTTGGG ATACCATGAC TCTTATGCAA AGCAACTCAT 840
CTGTACAAAT AGCTTGGGCC AAAGCAATCA ATCATGTAAC AAAGGTGTAA ATAGAAATAA 900
AAATATTAAC CCTTGGCTTG GATCCAAATG TCATTCATTT TAGCCAATGT TTTCCTTTCC 960
ATCATTAAGA ATTCTGCTTT TTTTTTTTTT AAGTTTGGGA AAATCTGATA TCAAATAAAT 1020
TCATTGCATT CTTTCTGCAT AACCATGTGG TAAATGCTAG TCCCGGGCAT GGAAAGACAG 1080
GCACAGTAAG CAAAGACAGA ATGAGGAAAA ACTGTGAATC TAGATTTTTT CCTCTGTGTA 1140
AGAAAGTATA GTTCCCTTGG TAGAGAATGC AGAGACTAAA GCCTTTGACT ATTGGACAAG 1200
AAACTGTTGA CATTGCTGTA GTGAATCATC CGTCATACAC AGCTCTTAAT GGGGATGGGA 1260
CAAATTACAG CATTTCATGA TGCTGCCCAA AGATAATTCA GTCTAGCACC TGGATTGTTT 1320
GGAAATCCAC TGGATCCCTC CTTGACTCTC ACATGCTCAT CCTGCATATA CACTCCTTGT 1380
ATAGCAACAA GCATGAGATT GAGCGATAGA GTTGGACAAA TGACCAATAT TTATTCAGTT 1440
AATAAAATAC AGAGTTGTTT TCCTAGAAAC ACCAGCAAGG CAAAGGGAAA CAGAGAGAGG 1500
AATCCTGCTC CTACCAGAGA GATGAATGGG TGTGAGAAAA TGTGAGGGAG ACTCATTGCA 1560
TAAACATAAC TGAGGCTAAA GATCGCTGCA GCCCCAGCCA GGCTAAAACA TGGAGAAGAT 1620
GACCATGCGA GGCTGGGCAA GTGGGGTGCT ATCTACCGAG GAGTGGGTAG GACAAGGGGT 1680
CCAGGCCCCA TGCTTATCTA TTAGGTGAAG TTTTGATCTC AAGGCTGGGA AAGACATGGC 1740
CAGAAATAAA TGTTTAGGAC ATAACATTCT TTCCATGTTA GGACACCACA TTCTTGCTAT 1800
TTGGTGACAA ATGACTGAAC CGGGAGCTTG GTCCCATTTA TGATCTAATT CTATAAAAAT 1860
GAAATCCCGG GCATCTGGTT CAGAGCATTC CAGGAAAGAG TTAAAGCCCA ATATTGCTGC 1920
CTCACTCTGT TCTTCCTTTT TGGTGAATGA TAGGCTAGGA CGTGAACTTG CTGCCTTCTG 1980
GAAGTGCTTT CTCTTTCTTT CTGTGGATTT TATTTTCTGC CTTCTATGGG AGAGAACAGC 2040
TCTCTTGCCT TTCCACTTCC CCTGGGCTTG AAAACACTCA TAGTAGAACA TATACCTTCT 2100
ATCTGAAGAC AACATATAGA AGGTAAAAGA AATGGAAAAT CATCTGCATA AAGAAGAAAA 2160
ACAGAGAGTG AGTGAGCATA TGGGCGTGTC TGAGTGTGCG TGTTCAGTGT AGGAAGTGTC 2220
TGAAGAGAAG TCCAGCTACA AGAACTTGCT GCAATAATTC TCTAACAGCA TGAACAAAGA 2280
CTCCAATAAT AAATGGTGAC ATTTACACAA ATATTTGTGG TTGTGCTTTC CATTTCTTCT 2340
TATAGGAAAC AAGTAAGATT TTTAAATGCT TTAGTGATGT GATCAGTAGA CAGTAGTGGG 2400
AAAGAATTTC CCTGAAACCT GACTTGCAAT CAAAATAAGG AAGGAAGATC TGAGAGAATT 2460
GAGAATATTT CAGCTAATCA GGATATGGCA CTTTCCGGCA TCTGGGTGTC CAAACAAGTG 2520
TTTTGAATTC AATACTGTTA ACATGTGTCA CTTTAATGAA TATTTTCCTT TGAAGTTGAT 2580
TGGATGGTTA CATTTTTGGC AATAATCTTG TGGTCTGTTG CTTACATTAC CTGACCCACA 2640
GTCCATTTTC CTTGTGTTGG CTGTGGGAAA GAAAAAGAGT GAAAAATATC TCAGAACCTG 2700
GGAAACAGCA CTGAGAATGC GACTCATCTT TTAGTTAAAC CACTTCAGAT AGAAGCTCTC 2760
TAAGGATTGC CTCCTCACTG TCTGTGATAT GTGTAACCAA AAAAAAGAAA TAAGTTCCCC 2820
CGGTGTCAAA AAGATAAGGG GAAAAATCCA CAAAATGAGA TGAGGCTATT TTTCTTTTTT 2880
AAGCCTGAAA TAGGAGGTCA GTCCTTTGCA CTCTTCCTTT TGACTTCTAA CAAAACCAAT 2940
CACAGTCAAG CTATTCTCTT GAGTTAAAAA GTGTTTTCAG GAAGTCCATA ACATGTTCTA 3000
ATTGATTATT TAAAAATCCC CACACAGGAA CATCCCCTCA TGGTCTGAAT GTCTTTTTAG 3060
CCCTCTGCTA TTTGCAGAAC CTTAAACAAA TTGTAAGAGA GAGTCCTTGG CTAACTCCAA 3120
GGACCTTTAT GAGGAGTGGG AGAGAAAGGG GAGGATGTGG ATTGGATGCA GCAAAGTGCT 3180
CTCTCAAATC AGCATGAGGC CGGGCATGGT GGCTCACGCC TGTAATTCCA GCACTTTGGG 3240
AGGCCGAGGG GGGCGGATCA CCTGAGGTAA GGAGTTCCAG ACCTGCCTGG TCAACGTGGT 3300
GAAACCCCGT CTCTACTAAA AAAACAAAAA TTAGCTAGGA GTGGTGGTGG GCGCCTGTAA 3360
TCCCAGCTAC TCAGAAGGCT GAGGCCGGAG AATCCCTTGA ACCAGGGAAG TGGAAGTTAC 3420