EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS179-03252 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SkMC 
Coordinate
chr1:218646270-218650780 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs623356chr1218647386hg19
rs1764705chr1218648556hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr1:218650648-218650659TAATCCAATCA+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr1:218648583-218648596GTTAAGTGGTTAA-6.62
ZNF263MA0528.1chr1:218650537-218650558AGAGCAGGAGAGAGAGAGAGA+6.23
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02323chr1:218646382-218647251Astrocytes
SE_02323chr1:218648227-218650769Astrocytes
SE_34115chr1:218648222-218649452HCC1954
SE_34115chr1:218649745-218650759HCC1954
SE_36549chr1:218648751-218650832HMEC
SE_37059chr1:218646289-218657164HSMMtube
SE_38564chr1:218645950-218648182HUVEC
SE_38564chr1:218649404-218650756HUVEC
SE_45788chr1:218648084-218650762Osteoblasts
SE_51738chr1:218648090-218650886Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_56115chr1:218648409-218650897u87
SE_63527chr1:218648003-218655213HSMM
SE_68133chr1:218622758-218673720TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1218646870218647214
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I218472chr1218646309218656788
Enhancer Sequence
AATCTGAAGA AAAAAATTAA ATTAAATTAA AACATAAACA GAATCCGAAG AACTAAACAC 60
AGAGTAGAGA TGTTGGCCTG CCCCATGCTC TGAAAGACCA TCTGAGGGCT TCTGAGCCTG 120
GTACACCCTG GGGAGTTCTC AGAGAGAGAG AGGGATGTTT AGATCATGCA CCAGAGGGCC 180
TCATGCAAGC AGGTACAACT ACAGGAGGTC CCTCACCCAT CTCTGATGGT AGTTATGGCA 240
GTAATAACAC CCTGATGGGT AGTACAATCT TAAGCATGAG ACAAAATTAG TTTTGTATGA 300
AAATGGTTTC AAATGTGGGT GTCTTTATTA GAAATCCAAA ATATCAAAGT AATCTTCAGA 360
GGCCACGGTT TCTCTTGTGT CATTTCATGA TACATGCTGA TGTCTTCACA TAGGAAAAGA 420
AAAAAGAAGA ATAGGGATCA AAAAAGAGGG AAGGTACAAG GAAAGGAATA AGAGATTTTC 480
AAATGTATGC CACCTGCTTT GAATGTTGTT CAGATATGTG TCTTACAGTA TGCCTGGTGT 540
GCCTTTGTTA GAGATTAATT GGACAAATTT GATTTTATAG ATGATATGAG CCAGAATTGC 600
AAAGGTGGTG TTTCTCCTCT TATGTGAAGA GGAAGTCAGG GGGAGATGAA AGGGAGAATA 660
ACCTTTACCT CATAATTTCC TTTCCCCTCC TCTCTGTGTA AGCCACATTA GTCTCTCAGC 720
AAAGGTACTT GGAGAAACTT GCTAAAATTT TCCCTCATGC TTGAAATTTA CTTACCCTGG 780
GTAACAGGAA ATGTGGAGTC TTGTGATGTA GATTGTTATA CCAGATGGTA ATCTTAGCAC 840
ATGCTATTTA TGTAGATCAG CCATGTGTGT GAGTCATCCA TGTGAGGCTG ACCTCAGCCA 900
CTGTGAAATC GGGTTCCATA CCGCCATTAT TAATAAATAA TAATAATGGT ACTGATTAGG 960
CATCATTTTG ATGCACATCT AATGAGGCCA TTACCTTTAT ATGATATTAA ATCTGGAATT 1020
GTTTTCTTTT TCTAAATAAT ACTTTATTAA CAACTGGCCA TGTTGTTAGA TTGCTATTTT 1080
TTACTGGCAA GGGCAGGCAC ACAATTTAAC TCAGCTAAGA TTAGGTAATT AAGGTATCTG 1140
CCACTTGCAT TGCGCTATTC ATTGAATGCC CTAACTACTT TGTTCTTTCT TTGAAGCAAA 1200
TGCCTGTCCT TATTTAAGTC ATCCTCTTCT AGGTCCTGTG GTTTGAGTTA TTATTTTACT 1260
GATGATAAAT TTGAGTGGGT AATCCACACT CTTTCATCTT GTCTCCCTTT TAACCACTAG 1320
CTAATTTAGC GATGGAGAAT AGTTTCGCTT TTATTACAGC TTTGATTATC TGGTGGTTGC 1380
AAATAAGTCA GATAGGGAAG CCTGCGCAAA GATAAATGCT TTAAAAGCAG GAAGTGTGTT 1440
TTATTTCCTT TCAACTAGCC ATCTGTTCAG GATTCTTGCC TTTAATCCTT CCCTATTTTC 1500
TTTCCGCCTT CTTTTCTTGC ACTTTCCCTT CATAGTGGCT AGAACTGTGC TCTGCACAAA 1560
ACAGGCAATA TCTTTTTGGC TTTGTAACAA CCGCAGAGAT TTTCTAATAT GACCCACTTT 1620
TCCAGAATGT TTCCTGCTTG TCTCTTTGAG AGACATGCCG TCACTTTTTT TTTTCTGTTT 1680
CTCTTACCCA AAGATAACAT TTCTTACCCA ACATCATTAG TGTAAAGATT CTAAGGTTTT 1740
AATGGTAATG CATTACATAC ATTTGTTTTC TCTTGGCTCG TGATTGTGGC TGGAGTCCTT 1800
CATTTTGTGA CTGAATTCAG ATCAGAATAC AAAGATAGCA AGTTCATTAG GGTTTTAATT 1860
TGCACACAGT TCCATTGGAG CAGCAAAATG ATTAAGGGTA CAAAAGAGAC GGGTTTCAAT 1920
GAGAAATAAG AGGCATTGAT TTACCTCTTG CTAGTGGGAG TTAGGGAGTG AATTGTTACA 1980
GAAATTGTGC TGCCAATAAT ACTTAACCCG AATTTTAGGT AATTTTTTTT CTTAGTTGCT 2040
GTCCTGAGTG AGGCGTACAG CTATGAGATG TACGGAATTC TTTAGAGCAA GGTCCTGTAT 2100
CATCAAAAAC TTGCTAGGCA TAGATTTCCC TGAGGGCCTA CAGTGGAACC CAGGAGCACA 2160
TCCAGCTCTG TCTTGGCAGT TCACCCTCTC TCTCTCCTGC TTTATAGAAG GAAAAAGTGA 2220
AAAGCACCCA TTTTTCCTTC AGAGGAAACA ACTCTTACAA GTTTATCCAG ATCTAAGCAG 2280
GGACTCATCT GAGACAGTCT CATCTCAGCA CTGGTTAAGT GGTTAAGAGA TGAGGCTTTG 2340
AAATCAGATC AATGTGGGAC TGAGTTCCAG CCCCAGTGAC TGTAACCTTT GACAAGTGGC 2400
AAAACCTCTC CTTGCCTTGG ATTCCTCATG TCTTACATAG GAATAATATA GCACCCATCT 2460
CATAAATTGG CTGTGAGTAT TCAATGAGAG AATCATGAAA AGTACCTGGC ACCAGCAGAT 2520
GGCAGCTATT TTTATCTATG ATCCACTAGG TAGAACATTT CTGTGCTTTC CCCAGTCTGA 2580
AATGGAGATG CCTTTACATC ATCCTTCATG GCTATTCTTA ATTACTCATG TCATTTGACT 2640
TTTAAGTGCC CATCATTAGC TTTCTATCAA GCCAAATGCC TATGAAACAA TAGGGATAAT 2700
AATTATATAG GCAGTCTTTG CGGAGCTTTG GAATACTGAC ATTTTGTCAG AATTTCTGGA 2760
TCCCTGATCA AGATAAGCAA AAAGCAGAAC ATTTCTGGTT GAGGATTATT ATCAATATTA 2820
ACCACTTCTT CTGCTCCTGA CCCTCTCCCC TGTCCCATAA AATACTAAAC TCCTATAATT 2880
ACACAAGATG CCTAGGTAGT AACAAACGCA AGTGGAACTT AAGAGATCAA GACTGGAGTC 2940
AGGAGAGTTT CAGAGCTGGC TCATTCAGCC CTAACATCCC ATGATATGTG ACTGTGAACT 3000
TTTTAGCTAG ATTATAAACT CCTTGAAGGG CTTGTTGATT TCTGGAGGGA GGAAGGTGGG 3060
GTTAGAATTT GCAGTGATCT GAACTAGGAT AACTTCCTAT ATGTCTTCCA GGGCTTATCT 3120
GAAAATTCCA CTTGTCTCTG AAAATGAACT TCTTATTCCC AAATACTTAA CTTTATTATA 3180
ATCTCTATAC ATAGCAAGCA TCTATCTGGT GCCTAACAGA TCTCTTATTG TACAAAGCTC 3240
ACACTTCATA TATGAGGAAC TTACACACTA AGTTGAAGGT GATTATAATA ACCTGGTTAA 3300
GGAGATAAAC AATTCAGTCT TGAAATGTGA AGAACACCCA TTAAAAAGAT TTTAGGAACA 3360
TAGACTGTAC TTGCCTTCTC AATTTTCCTT AACACATAGA ATAAATATTT GATATTGAGT 3420
TATTTTGGTA TTTTCAGCAA CTTTTAAAAT TATTTATTAA ACTCCTAAAT ATCATCTTTA 3480
TAAGATACTG TAGGAAACAA AAATTAGAAA ATTCTTGAAT ACGATTATTA TTGGTGTCTA 3540
TTTTAAAGGC TAGTCATTTG TTAGTTTGAG ATTCTGTGTC AACAGATATC AACGTGACGG 3600
CTGATCAACA TGATGATCCT GTTAGAAAAT ACCATGAGTC CAGAGACACT TTTGTAATGA 3660
GTCATTGCTA TTTAGCTTCT TCCACAAATG GTCTTAACTT GAGCAGGACT CTTAAACCAA 3720
CAAATGTTAG TTGCTAGAAA GGCATTTGGA TTTAACAAAG AAGATATTAA TTGTTTTGCA 3780
GCTTCTATTA GCAGTTCTTT AACCTACAGC ATAAAATTTG AAATCTGAAG GGGACTTAGA 3840
GACTGAGACA AGTCCTTATC CAGCATGTAA CTCCCATCCC AAACTATCTA GAATTGTCTA 3900
GCCTCTTTTA CTAACTGTTC ACTAGAGATA GAATGTGAGC CAAAAAAGCA AACCACATAT 3960
GTAATTTTAA ATTTTCTAGT AGTCATGTTA AATAAGTAAT CAGACATAGG TGAAATTGAT 4020
TTTAATACTA TATTTACCTC AATATGTTCA AACGATTACT ACTTCAGCAT GTGATCATTA 4080
TAAGAATTAA TGAGTGTATT ATTTTGTTCT CACGTTGCTA TAAAGAACTA CCTGAGACTG 4140
GGTAATTTTA TGAAGAAAAG AGGTTTAATT GACTGGCATT TCTGCAGGCC TAATAGGAAG 4200
CATGGTTGGA AGGCCTCGGG AAACATAATC ATAGCAGAAG GGGAAGCAAA CAGTTCTTTA 4260
CTATGGCAGA GCAGGAGAGA GAGAGAGATA AGGGGGAGCC ACTGCATACT TTTAAACCAT 4320
CAGATCTCCT GAGAACGAAC TCACTGTCAC AAGAACAGCA TGGGGGAAAC TGCCCCCATA 4380
ATCCAATCAC CTCCCACCAG GTCTCGCCCC TGACACATGG GGATTACAAT TCCAGATGAG 4440
ATTTGGTTGG GGACATAGAG CCAAACCATA TCAGCAAAGA CACTTTTTTT TTTTTTTTTT 4500
TTTTTTTTTT 4510