EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS179-00107 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SkMC 
Coordinate
chr1:8476720-8479700 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs115109046chr18477866hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:8477190-8477206AATTGTTTATTTAAGG-6.15
Foxq1MA0040.1chr1:8477190-8477201AATTGTTTATT+6.02
Pou2f3MA0627.1chr1:8477353-8477369GTCTATGCAAATGACA+6.09
Number of super-enhancer constituents: 35             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00045chr1:8465614-8485937Adipose_Nuclei
SE_02022chr1:8477510-8478261Aorta
SE_03407chr1:8479298-8480064Brain_Angular_Gyrus
SE_04978chr1:8478743-8481068Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06073chr1:8479138-8485793Brain_Hippocampus_Middle
SE_07042chr1:8478805-8485534Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07921chr1:8477474-8483841Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_11329chr1:8474464-8493359CD20
SE_18764chr1:8477368-8486022CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_23717chr1:8479176-8479684Colon_Crypt_1
SE_25808chr1:8476636-8485754Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27457chr1:8477725-8478732Esophagus
SE_28078chr1:8478132-8486070Fetal_Intestine
SE_29095chr1:8478033-8485919Fetal_Intestine_Large
SE_31622chr1:8477645-8478284Gastric
SE_31622chr1:8479255-8479634Gastric
SE_40658chr1:8476604-8477230Left_Ventricle
SE_40658chr1:8477420-8481421Left_Ventricle
SE_41679chr1:8477672-8478706LNCaP
SE_42166chr1:8477479-8478781Lung
SE_42166chr1:8478827-8481118Lung
SE_45677chr1:8477327-8485510Osteoblasts
SE_47251chr1:8465934-8485673Panc1
SE_48103chr1:8477498-8481110Psoas_Muscle
SE_48600chr1:8477483-8479198Right_Atrium
SE_48600chr1:8479269-8481116Right_Atrium
SE_50481chr1:8479223-8481104Sigmoid_Colon
SE_51176chr1:8473915-8486131Skeletal_Muscle
SE_52725chr1:8477578-8478762Small_Intestine
SE_52725chr1:8479134-8481145Small_Intestine
SE_53408chr1:8477393-8478777Spleen
SE_54752chr1:8475052-8485774Stomach_Smooth_Muscle
SE_58576chr1:8455425-8501956Ly1
SE_60758chr1:8454848-8500160DHL6
SE_62661chr1:8450826-8509851Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr184776378478703
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008416chr184766058477230
GH01I008417chr184773948478781
Enhancer Sequence
TTTTCTGTTT GAAATATTTT GCAATAATTA GAAAAACAAA ATCAAGCCCT AATAGTGAAA 60
CTTTACAATT TTAACAGAAT AAAGACAGTA TCATTTTAAG AATGATATAC TATGCAGGCT 120
CAGAATTCTG CAAGTCTGCA TTACTGTAAA TAGCGGTGCT TCCTAAACTT TACAGTACTT 180
TGGAATCCTC TGGGGGGTCC GTTAAAATGC AGATTCTGGC TCAAGAGACA AGGACAGGGC 240
CTGAGAATCT TCCATTTTAA CCAGTGATGA GAGTGCTGGC CTGAGGAGCA CACTGTGAGC 300
AGTGAGGATA GACAACGTTT GTAGAAGAGG GACAAGGTTT AAAAACAGAG ATCTTCTAAT 360
GTACTGGTAT GTGGCCGTGA CACATTTGCA CATTCTCAGT AGCATCAACC GACTAAGGAA 420
GTCCATACTT TGTTATGCAA CATTAGATTA AGCATTAATG AGGCTAGGAA AATTGTTTAT 480
TTAAGGTTAT AACCTGAAAT TAAATAAAAC TTCAGGCTGG AAGCTCATAT TGAATACTAG 540
AATCATTTTT AACCTCTTAA TATTAACAGA AACCTGATTA CTCAGTCTTA AAGCCCTTTC 600
TCAATAGCAT TTATTCTCTG CTGCAGGAAT ATGGTCTATG CAAATGACAT TTTGCCTGAA 660
GAAAAAAGTA CAGTTAATGG CCAGTAGTTA CGTACGTATT TAATAGAATT CATTCCCAGA 720
AATGTGGCTA AGAAAGGTGG TTGATTTTCA TGTTATTTAT TAAATTAAAA ATTTAAATCT 780
CTAATACCTT TCATCCCATT ACTTAAAGTT AAAAACGTCA AAACTGGCTG CCCTTTCACT 840
GGGCCCTTGG TGCCAAACAG TGACACATTT CCAATAGAGA AAATGAAGAT AGAAGGCAGG 900
CTTCCCTTCC CATTAACTTT GAACTTTCAA GTCCCTATCT GTCTTCCTAC AAGACTAAAT 960
TATAAGAAGA GCCTCCTCTT TGGTCCCATC CTATACATAC TTCGGTAGCA CAGCCCTCAC 1020
TTCTCTTCTT AAAAGCCTTA AATGGGTCCC ATCCCCACAC TCACCCATAC ACATTCTTTG 1080
GAGGGAATTC AAGGTCCCCC AAAATCTACC CTGCAGCTAT AATTTGGGCC CAAGTTCTAC 1140
TGCATCCGCT TATGCAACCT CCTTTCCAAC CATGCTCATG TACTTGCTGG GCACGTTTTA 1200
CAATTTCCTG TCTCCGTGCC TTTGTTCATA GTATTTCCTA TGGCTGGAAA GTTGCTTTTC 1260
CTCTACCCTC CCAACCTGGG CCTGTCAAAA ATGAATCCTT CCTTCAAAGC CCAGTTCAAA 1320
CACCGCCCCT CCAATTAGCT TTCCAGGAGC CTCTGTGCTC ACTTTGTGGG GCCTGAACCT 1380
CCACCCACCA GGGCCCTCAG CACATTCTAC CAAGTATGGC AGGTATGTAA ATGTCGTGCT 1440
GGCTCCCTGC AGGGCAGGGA TGGCACCTTG CTTCTCTTTA TAGATACCCT ACCCATTGCA 1500
GTGCTCAGTG GGCACCCAGA ACTTTAAAAA ATTGAACTAT ACACAAAATT TAGTTCTGAT 1560
AATGGGAAGT GAATGAAAAT GAGTTTCCAG TGTAGTAAGT GTCAATGCAC CACCAACTGG 1620
GATTACAAAT GACACAAGCT TAATCTTCAC TGGGCTAGGT GCTCAAAAAT AAAAAGAAAG 1680
AGACGAGAAA GACAGCCAAA GCATGTCCCC TTTCACCTTC CATCTCCCTC CAGGGGCTAA 1740
CACTTTGGGA ACACCTCTTG GCTACCAAGC TGGGGTAGAT CACATTGTCT TCTCACCAAT 1800
CTTAGTTGCA CCAGAGACAA GCAACGGCAG GTCACTGAGG AAGCGCTCCT GGACTACGAC 1860
CCAGTGCCAG CTGAATTTGT CTAAGTAATA GGAGACACAG CTATAAACAA AGGCCAGGAT 1920
TCAAGGGACA ATCATCCAGG TGCCAGACAC AAAAAGTCTT TGGTTCAAAT AACTGATATG 1980
TCCTCAGAGA AGAGATATGT CACCACTGCT TGAATAATTA TCTCATGATT TTGAAGAAAA 2040
CTGCAATGTA TAGACAAATC AAACAAAAAA TTATTTTTGG ATCATCCACG ATTTTGTGTT 2100
ATTCCTAACA TGGATTCACC TTTAGGTAAT TAAGATTCTC TATTAGGCCT CCTACTTTTT 2160
CAGGCATTAC CTTAACATCA AAGCTCATGT ACCATCCATC TACCCAACAA TAAGTGGCAG 2220
GGCTCAAAGC AGAATCAAGA GGCCTAGTTC TCCACTGTCC TCCCAAAAGT TCAGACACCG 2280
GGCGCTCTGT GACTTATACA AATATACTAA CACTTAAGAC TCTGATGTGG TTTATGACAA 2340
ACAGTGGCTT GACAGAGAAG AGGTATACAG CCAAGGTGAA TCTAAAATGC TCCACCCGTA 2400
TTCCTGACTA CATTTCACCT ACTAATTATA TACTTTATAA GCATATTGAG GGGAGGTAAA 2460
TGGTTATAGA GAAACAGAGA ATGGGAAAAA GTATAATAAA CTACAGGATA TTTGCACAAC 2520
CATGACACTA AAAGATTTGA CTTGTAGTTA TTCTCTTGGG TACCCTGAGG TTAACACGTA 2580
ATACCCATTC AACTAAGCCT CTATAAACAG TTGGGTTTTC CGCAATCACA GCCACTATTC 2640
CCACTTCAGT GGGCAGCAGT GTTCAGAGAA AAGCCAGATT TAGCTCTTGT GCAATAAACA 2700
CCAGAAACCA AAAGAGCTAG GAAAGCTGTT TACGTCTATG CCCACCAGGA ACCCTTCTCT 2760
GCTATAACCG CATGAATGAA CTGGTAAGAA TGAGGTCTCA ACAAAGCTTC AAGACGGACG 2820
TTGTTAACTA GTTGCTGCCC TCCAAGTTTT TGGCAAGACA GATTAATGAA AAACAGGTAA 2880
CTTATTTTTA TACAGGCTCA GTATATTTAC AAGCAGAAAG GAATTCTGTA CTTTTCAAAG 2940
CATTTAGCTA CCACCTTATG TAGTATTTAA GGTAGACAGG 2980