EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS178-24135 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Skeletal_muscle 
Coordinate
chr9:140559730-140562180 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr9:140561342-140561353GTTTTAATTAA+6.14
Lhx3MA0135.1chr9:140561346-140561359TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr9:140561350-140561363TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr9:140561347-140561360AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr9:140561348-140561358ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:140561352-140561362ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:140561348-140561358ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr9:140561352-140561362ATTAATTAAT-6.02
RARA(var.2)MA0730.1chr9:140561844-140561861AGGCCATGTGGAGGTCA+6.38
ZNF263MA0528.1chr9:140561887-140561908TACTCCTCCTCCTCCTCCCCG-6.21
ZNF263MA0528.1chr9:140561881-140561902TCACTCTACTCCTCCTCCTCC-6.55
ZNF263MA0528.1chr9:140561878-140561899GCCTCACTCTACTCCTCCTCC-6.56
ZNF263MA0528.1chr9:140561884-140561905CTCTACTCCTCCTCCTCCTCC-8.31
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
SE_11232chr9:140561146-140563373CD20
SE_32833chr9:140558964-140562778H1
SE_41929chr9:140559711-140561304LNCaP
SE_58494chr9:140551343-140601094Ly1
SE_62965chr9:140561512-140658488Tonsil
SE_68889chr9:140558888-140562343H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr9140559752140562041
chr9140561000140562084
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH09I137664chr9140558495140562715
Enhancer Sequence
GGTGTATAAG GGCCTCTCCC TGTAAGAAAT TTGGAGCTGG GGTGGGCATA GGAGGTGATG 60
TTTAGGAGCA GCCTGAGTGT GGGGAGACTG CTGTGCTCGA ACCTGCGTCG TGCAGGTGCG 120
TCCTGGAGCT ACTCCTTGTG GCAGAAGCAT TGCCCTGAGA CCCAGCCCTG GTATGCTTGG 180
CACTGGGACA GGAGCTCCGG TGGGAGGTGC GCATTGCGAG CTGGTGTTTT CTGTTTGCTT 240
TCCTACCCAC TGTCATGTTG TGGGCTCTTG GCCCCAGAGG TAAAATGTCT CTGTGAGTTG 300
AGTTCCTTGT GAGAGGGCTG GTCCCCAGAT TCCATGTCTA GGTTTTTGTT AGTATTTTTT 360
CAACAGAGCT AATCCTGAGA GGCCCTACGA GCAGTGATTG CTTTGTGGGA TGAGCTGTGT 420
TGATGGTTTC TGTGGAGGGA CCCTTCACGT TTTAGGGTGA AAACAATAAA TGTCTCGTTA 480
AATGGTTTCC ATCTGAGAAC ACTGATTGTT TTAAAATGGT TGTGAATGCG AGGGTTTAAG 540
CAGCTTCCGA GGAGGCCTGG AGGTGCCTGG GCGGCCGCGT GCAGCTCTGG AATCCTGCCG 600
CTGGGGCAGC CTCCATTTCG TGAGATGGCT CTGGAGCATG CCCAGTGCGT GGAGCTTTCA 660
GAGGGAGCCG CCGAGCTGGG CTACTGTGAT TTCTCTGCAG TTGGCCGCAG TCAACAATTG 720
CACTAAGACA GGAGGAAAAA AGTGATGGGG TACAAGCAAG AAACGTGGTA TTTGGTACTT 780
TTTTTCTTTT GCTTAATCCC TCTTTCTTTT ACATTGGTGC TTCTAGGCTG GGGCCAGGGC 840
CTGCAGAGCA GGGACGCTTG CTGTGATGGT GGGGACACCT CCTTGTCCTC CATGCCGCTT 900
GCCTGCCAAA ATAACCCTGT TTTGCTCTCT GGTCACCCAC CATGTGCACT TTCTTGGGAG 960
TGGGATGGGA GGTCCCCTCC AACTGAGGGT ACTGAGAACA GCTCAGGCCC GTTCCACATT 1020
TGCTGGTAGC AGGAGGAACT CTGACCTTTT TCAGTTATGC TGATGATAAA CCAGGACTTT 1080
TTCCCTTGTT TGAACATTTA TAAAGAGCGT GCTTGAACTT TTTTGCTGAC TAGCAGTGTT 1140
TTCCTGTTTT ATTCTCCTAC CTGCCCCCAT GGCAGCCTCA GTGGTGGAGG GAGTGAGGCT 1200
GGGAAGGGAT GACACTGCCA GGTGAGCAGG AACCAGGGAC CCTGGGACCA GAGGCCAGGC 1260
TGTGCAGGGC AAGGGCTGGC CGTGCCACGG TGCAGCTGGC TCTTTGCCAT GCAGGCTGCA 1320
GAAAAGGAAA TCTGTCCGCC TTGGCTGTGA GGATGGCATT GACCACTCAT CAGGAGAGCT 1380
GGGAACAGAG CCTCCCCCTC GGAGCCTGTG TAGTCCCCGT CCACACGTGT GGGTTGTGTG 1440
ATGATCCTGT CTGCGTGTTC ATTGGGAGAC TCCATTTTCC GTGGAATGGT GAGGAGGGTA 1500
GAGAGGCAGC AGAGTCTCCA CTTGGATTTT CTAAGCAATT CCACAGAAAA TAAGACGTTG 1560
CTCAAGCAAG TGCTGGGCAC ATCTTAGGGA GAGACCTAGT GAGGAGGGCT GTGTTTTAAT 1620
TAATTAATTA ATTGTAAATA ACAGGATTAG AGCAGATTGG TTCATAGCTG CCTGTTCTAG 1680
AACCGTATTC TTCGAACAAA AGGGTGGGGG ATGGTAGGCT TCTCTCCTAG CTCTGAGGAA 1740
ACTCCAGCTC AGCGCACAGC ATGAGGAGGA CGAGGGAACA ATAGGGCGTT CCTTTGTGCC 1800
TGCCCTTGAA ACGCGGTGGA GGCCACTCAG TGAGCCCGGG CAGTGCCATC GCTCACGTGT 1860
CCCCAGCAGC AGTGGCGTCT GTGGGGATGC TGTGCACTGG AAATTGGCAC TGTTTTGGGT 1920
AGTGGTTCTG AGAGGAACTG TTTAACCAGG TATGCAAATG TGCTGATGCA GGAATGTTTT 1980
TGAACACCTG TGATGTAAAT TTTAACGGTG GTTAATGTTA GCAGCTCCAC CTGGGTTAGC 2040
TCAACCCTTA GAGATTATTT GTTCTCATCT CTTTGGAGTT GAAAATGTTG TACTTTTCTA 2100
GGAGCCATTT CCCCAGGCCA TGTGGAGGTC AGGTATCTGC TGGTTCTGGC CTCACTCTAC 2160
TCCTCCTCCT CCTCCCCGCT CTGTGGAGAG GGTGGCTTGA AGGAGACGGG CAGCAGGTGT 2220
GTGACTGCAG TCCTGGGGCA CGGGCAGAGG CTGGCATGTG GGGAAAGCAG GACCCGGGAG 2280
GCTGTAGCTT AAGTAGACAT TTGTTTTTTA TTTGAAGAGA ATTTTAGAGA TGGGGTGGTG 2340
GTGGATTTTA GCATTAGAGA TTTCTGGCTT CTGCTTGAAG CACTGTGAAT AGGGGACAAA 2400
AAAATAACCA AGAGGAAAAG TTCATGTAAA GTAGAAGTTT TGGTGTGTTT 2450