EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS178-11007 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Skeletal_muscle 
Coordinate
chr17:74246540-74250640 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs8071545chr1774250006hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr17:74247150-74247161AAATCACAGCT+6.14
Hnf4aMA0114.3chr17:74247841-74247857AGGTTCAAAGTCCTAC+6.19
IRF1MA0050.2chr17:74248745-74248766ATTTTCTCTCTCTTTCACTTT+6.21
IRF1MA0050.2chr17:74248751-74248772TCTCTCTTTCACTTTTTTTTT+7.63
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr17:74247509-74247524TGAACTCCTGACCTC-6.22
Sox6MA0515.1chr17:74246683-74246693CCATTGTTTT+6.02
ZNF263MA0528.1chr17:74248049-74248070CTTTCTTCCTTTTCCTCCTCA-7.04
Number of super-enhancer constituents: 25             
IDCoordinateTissue/cell
SE_11415chr17:74247580-74249549CD20
SE_15056chr17:74247576-74249126CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15056chr17:74249138-74250044CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18937chr17:74247402-74249906CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19565chr17:74247575-74249815CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_21340chr17:74248712-74249921CD8_Memory_7pool
SE_23599chr17:74247703-74248615Colon_Crypt_1
SE_24131chr17:74248072-74248530Colon_Crypt_2
SE_27367chr17:74247623-74248919Esophagus
SE_28090chr17:74247720-74249008Fetal_Intestine
SE_29152chr17:74247624-74248997Fetal_Intestine_Large
SE_31864chr17:74247673-74248817Gastric
SE_31864chr17:74249094-74249622Gastric
SE_32663chr17:74247575-74249525GM12878
SE_43246chr17:74247582-74249663Lung
SE_44029chr17:74246139-74247154MM1S
SE_47749chr17:74247791-74248535Pancreas
SE_48284chr17:74246270-74250806Psoas_Muscle
SE_50371chr17:74247468-74249790Sigmoid_Colon
SE_52552chr17:74247474-74249789Small_Intestine
SE_53757chr17:74247335-74249794Spleen
SE_55588chr17:74247785-74248788Thymus
SE_60322chr17:74239092-74270751Ly4
SE_60510chr17:74247565-74275632DHL6
SE_62440chr17:74241844-74272934Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr177424907974249712
chr177424696474247178
chr177424719074247386
chr177424756774249035
chr177424997174250216
chr177424822274248574
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH17I076250chr177424672674249804
Enhancer Sequence
AGTACTGCCA ACAAGTCACT GCACTAGAAG AAAGCAAGGC CCCTAATCGG CCCTCTTGCC 60
CCTGCTGTCT GGATTAGCCA TCTGTGGACG TGTGTGGTGT GTGTATTTGC GGATGTGTGT 120
ATTTGTGGGT CAGAGTTTGT CTGCCATTGT TTTGGGGGGT TTGCTTTTTG TTTTGAGATA 180
CGGTCACCAG GCTGGAATAC AGTGGCATGA ACGTGGCCCA CAGCAGCCTC GACCTCCTGT 240
GCTCAGGCGA TCCTCCCACC TCAGCCTCCT GAGGAGCTGG GACTAAAGTG CGCCACCACA 300
CCCGGCTATT TTTTTTAAGA GATAGGGTCT CACTATGTTG CCCAGGTTGG TCTCGAACTC 360
CTGGGCTCAG GTGATCCTCC CGCCTCAGCC TCCCAAAGTG CTGGAATTAT AGGCGTGAGC 420
CACCGTGCAC GGCCTTCTGC CATTGTTAAC TTCTCACTTA AGTGCCATTT GCTAACTAGA 480
AAGAATGTTC AAGTTCACTG AGTTGGGGCC AGCTCTCCAG GGCTCATAGT TCAGGAATTT 540
TGCCAGCCAG TTGTTAAATT GTTGGTAGCG TAATGGGAGT ATTTACAACA CAGAAACCAT 600
CAAATGCTGC AAATCACAGC TTCCTCCCAT TCTCCAGAGC CAGTTTACCA GCATACCCCT 660
GGTCTTAGGT TTCTTCTAAT CCCCCAGAAG GGCTGGGTAC ATTGCTTCCC ATATAGAAAG 720
TGCTCACTAA ATGAATGACT ATTTAGTTGT TGTTGTTGTT GTTGTTTTGA GACGGAGTCT 780
CCCTCTGTAG CCCAGGCTGA TGTGCAATGG CGCAATCTTG ACTCACTGCA ACCTCTGCCT 840
CCCAGGTTCA AGTGATTCTC CTGCCTCAGC CTCCCGAATA GCTGGGATTA CAGGTGAATG 900
CCACCATGCC CAGCTAATTT TTGTATTTTT AGTAGAGATA GGGTTTCACC ATGCTGGTAA 960
GGCTGGTCTT GAACTCCTGA CCTCAGGTGA TCCACCTGCC TTGGCCTCCC AAAGTGCTGG 1020
GATTATAGGC GTGAACCACC GAGCCCAGCC AAGAATAGTC ATTTTTGAGC AATGACTCTG 1080
TCCAAGCACT TTGGAATGCG TTGTCACCCG AGCTGGAGTG CAGTGGTGTG ATCACAGTTC 1140
ACTGCAGTCT CAACCTCCTG GGCTCAAGCG ATCCTCCCAC CTGAGCCTCA TTTAATCTTC 1200
AAAACAACCC TAAGAGATAA GTATTATTGT TCCCACTTCC CAGATGAGGA AACTGGAACT 1260
CAAGTAGGCA CAGGGAGCAG GAACTGGCCC CAGGTTCTTC CAGGTTCAAA GTCCTACATT 1320
TTACCCATGG ATCATCATCT CACCAGCCTC TGTGGGGAAA GCCTGCCTGG GTGCCAGCCC 1380
TACTGCCCAC CAAGCTAGCG GAGTGATTCT CCCAGGGTGG TGCCAGTGAC AAAGGGCAAT 1440
GCATGGGGAC GTCTCCATCA TTGTCACACC ACCACCTCCA CCTTCACTGT GCCTCTCTCT 1500
AGGTTTAATC TTTCTTCCTT TTCCTCCTCA CTTCCCTCTG TATTATCAAT CTCCTTCCTG 1560
TATCGGGACT ATTTCCTCAA CAGGCCCGGG GAAGCTCTTG TCTATGGAAG TCCTCTTTGG 1620
CCTTAAGCTT CCCTCTAAGA GCTCCAGCAG ATGAGTAACC TGTCCTCCTG CAAACACTGC 1680
CATGAAGTGC GTAGGCAGCT GCCTGCCTTC AGGGCTGGAT GGACACCCTG TTTCCTTGCT 1740
CAATCCCTTC TGATGACTGG ACTCTGTACA CAGTGTGGTC AGTGGGTCAG CTCTGATCTG 1800
GAAGCTCCCA AAGGCAGGAC ACAAGATTTT CTCTGACTGT TCCCAGGCCC CAGGGCGTGT 1860
TGGGCACGGG AGCGTGTGGC ACGGATGTTG TTCGTGATGA GGCATATTCT AGTGGTTTCC 1920
CAATTCGGTT GTGTACAACC CAGTGCTCTA GTGTTCAGTA AATACTTCCT TCCTCTTTAG 1980
GCAGAACACT GGCTCTGTGT TTTATTAACA GCACCTCATG CCTGGCCCAA AGAATGATTT 2040
GTGTGGCTTG GGCTGTTGGG GTCAGAAATG GCATTCATTC ATCATTCACT CTGGAGGTGC 2100
TGTGTTTCTG AAGGAGAAGG GGACCTATCC TGGCAAACAA ATCAGGGGCT TTATGGTAAA 2160
CAAACTCCTC TCTTCCCAGC ACTTGTTTCT TGCTCTCTGT TTTTGATTTT CTCTCTCTTT 2220
CACTTTTTTT TTTTTTTCAC TATACCCGGG CTTCCTGAGT TCCTGACAAT TTCTAAAGCC 2280
TCAAGCATGA TCTCATCAGA AACTCTGGCT TCTTTTAACA TTTCTTTCCC TTCTGCTGAG 2340
TCCTAGTCCA TTTAAATTTC CTCTGTGACT CTGGGAATTT TTTTTCCTTG AGACACAGTC 2400
TCGCTCTTGT TGCCCAGGCT GGAAGTGCAA TGGGCTGATC TCAGCTCACT GCAATCTCTG 2460
CCTCCCAAGT TAAAGCGATT CTCCTGCCTC AGTCTCCCAA GTAGCTGGGA CTACAGGCAT 2520
GCACCACCAT GCCCGGCTGA TTTTGTATTT TTAACAGAGA CGGGGTTTCA CCATATTGGT 2580
CAGACTGACC TCAAACTCCT GACCTCAAAT GATCCGCCCA CCTCGGCCTC CCAAAGTGCT 2640
GAGATTACAG GCGTGAGCCA CCGCGCCCAG CCGGACTCTG GGATTTAAAG ATAACCAAGT 2700
GAAAATAGGT TCATCCTCTT TGACTCACAG CCTGGCTGCC TGTGGAGGCA ATGAGGAGCT 2760
GACATTCACC TGACCCCCGT CCTCTACTTT CGGGTATGCA GAGGCTCTCT TTTGCTGCCC 2820
GCGTCAAGTT AGAAGAGGCC ACATGATTCT TCGGGACAGT GAACCATGAA CAAAGGTGTA 2880
CTGCAGTCAT GTGTTGCTTA AAGACCCGTA TACGCTCCGA GAAATGCGTC ATTAGGCGAT 2940
TCTGTCGTCG TGTGAACATT CTAGAGTGTA CTCACACACA CCTAAATGGG CTAGCCTACC 3000
ACACACCTAG GCCATGTGGC ATAGCCATTG CTCCCAGGCT ACAAACCTAT CCAGCATGTT 3060
ACTATACTAA ATACTGTAGG GAATTGTAGC ACAGTGGTGA AGTATTTGTC CATCTAAACA 3120
TAGAAAAGCA CTTTGGGAGG CCAAGGCGGG CAGATGACTT GAGGTCAGGA ATTTGAGACC 3180
AGCCTGGCTA ACATGGTGAA ACCCTATCTC TACTAAAAAT ACAAAAATTA GCCAGGCATG 3240
GTGGCAGGTG CCTGTAATCC CAGCTACTCA AGAGGCTGAG GCAGGAGAAT CGCTTGAACC 3300
CGGGAGGCGG AGGTTGCAGT GAGCCGAGAT CAGGCCATTG CACTCTAGCC TGAGGGACAG 3360
AATAAGACTC CGTCTCAAAA AAAATAAAAA ATAAATAAAT AAACATAGAA AAGATACAGT 3420
AGAAATACAG CATTCTAATT GAGTGGGCCC ACCTTCACAG ACGCAACCCA TCATTGACAG 3480
AAAGGTCGTT ATGCAGCGTG TGCTGTGCTC CCAGGCTAAG CGTTTCATTG CCGATGCTCA 3540
GCTCTTCAGT CCTCTCATTG TCTGCTGGCA TGTTCCATAT GGTGCAAAGT GCCAGAGAGG 3600
ACATCGTTAT GGCTTATGGC TTGTATATTG CAGCTACTCA AATAAAAAAA ATTATTAATT 3660
TGGGAGATAA ACTGGGAGAT CAAGGTTCCA AAGGAGGAGA GGTTCGCCCC AGGGTCACAT 3720
ACAAGGGGAG CAGTGGAGAA ACTGCATGGG CTGTGAAGGG GGCTGTATTG AGGATTTCAC 3780
CAGTGGCTGG GAAACGGTGA GCTAGGAGAC GTCGACGTCT TCAGAGGAGG ATCAGGACTT 3840
GGGGGAATTT GTGGGTTCCC TGGCAGCCTC ACAGTGGTTG TCAGACCCTT CCCTCTTTGG 3900
AATGTGCCAT CACAAGGCAT TACATGCAAT AGGTGTAATG ACGGTGCACT AGCAGGCACA 3960
CAGTAGGGAG ACTGACCTAA TGCACAGTAG GTAGACATTA GTGCATTAAC ACACACACAT 4020
AGTAGGACTG ACTGTCAGCA TACTAGCAGG CACACACAAT AGCTGGCAGG CCTTGACCAC 4080
GGACAGAGTA TTTTTCTCTA 4100