EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS178-05938 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Skeletal_muscle 
Coordinate
chr12:89738380-89741550 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr12:89740527-89740548AAAAAGAAAGAGAAAAGAAAT-6.07
IRF1MA0050.2chr12:89740521-89740542AGAAAGAAAAAGAAAGAGAAA-6.27
RFX5MA0510.2chr12:89739671-89739687GGTTGCCCTAGTAACC+6.25
SPICMA0687.1chr12:89740280-89740294TACTTCCCCTTTGT-6.47
SPICMA0687.1chr12:89741405-89741419TACTTCCTCTTTGG-6.51
Number of super-enhancer constituents: 23             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00690chr12:89736686-89749897Adipose_Nuclei
SE_25495chr12:89737202-89749426DND41
SE_26301chr12:89738766-89749678Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27644chr12:89739368-89741580Fetal_Intestine
SE_28566chr12:89739453-89741345Fetal_Intestine_Large
SE_30143chr12:89738982-89742175Fetal_Muscle
SE_31980chr12:89739391-89740790Gastric
SE_34489chr12:89739228-89741819HCT-116
SE_35929chr12:89740392-89750597HMEC
SE_38477chr12:89738992-89749161HUVEC
SE_41177chr12:89739166-89741735Left_Ventricle
SE_42423chr12:89739274-89741688Lung
SE_43823chr12:89737701-89749582MM1S
SE_45220chr12:89740269-89741084NHLF
SE_48925chr12:89739317-89741128Right_Atrium
SE_50215chr12:89739271-89741701Sigmoid_Colon
SE_52692chr12:89739104-89741673Small_Intestine
SE_53425chr12:89738103-89741838Spleen
SE_57109chr12:89739987-89741122VACO_400
SE_57109chr12:89741142-89741558VACO_400
SE_67349chr12:89737701-89749582MM1S
SE_67873chr12:89740020-89749518u87
SE_68915chr12:89739205-89740987H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr128973919489741546
chr128974008489740418
chr128974042789740813
Enhancer Sequence
GCTGGTCAGT TTACCTCTCT TCTTCTGTAG ACCTGCACCA TATATATGTC TTCTGCCTCT 60
CCTCCTTGCT TCTTCACACC CTTCCCCTTT CCCCTGACCC ACCTCCCTCT CCCAGTTTGC 120
CTCTAGGAGG GATAAGAGTG AGGAAGTGAA CTTCTTTGGG GCCAGTTTAG TTGTGTCATC 180
CTGAAAGGGG AGTATGGGCA AGGGTCAGGG TCAGGCCCTA TGCTAGCTGG TAGCCATTTT 240
AGAGATACTT AGGAAAAGTA GTTTTATAAT TTAAGTGCCA ATGGGACCAA GGAAGAGCAA 300
CTTCTCTGCG GAGAAGGAGG ATGGAAGTTT ACCCCCGGTG GACACCTCTC TGACAGCACA 360
CCAGCTGGGG CCTCCCATGT GGCTGTGGAA TTCACATGGA ATTTGGCTAG TCATTTAACC 420
TCTGCTTCCT CCACTTCCTC AGCTGTATAA TGGGGACAGC ATTTCCTAGC CGACATCATG 480
AGACTTTATA AAGGGGAGCA AATACTGATG ACAAGCAGTT TCCAACAGGA AGAGCCAAAG 540
GCTCAAGGTT CAGTTCTGCA GTAACAAGCA CTGGATATGC AAACCTTCTC TAACATTATG 600
TGTCAGGTGT CCCATAAAGG TGGCTTTAGG CTTTATTGGC CTTTCTCTGC CTCAGTTTCC 660
TCTTTGCAAA ATAAAGATAA TAATAGGACC TATCTCACAG AGCTGTTTTG AAGATTAAAT 720
GAGATACAAA GTATAGTATC TGGTACTCAT GATAAATGTT AGTTATTTGT TTCACCTGCT 780
CCGCACCTCA TTTTATCATG TAATAAGTGT CACCAATCCA TGAACAGAAG CTGGAATTAT 840
GAGAGAATCC TAGAATGGGA GGTAAAAACT CCCTCATTTT TACAGACAAG AAAAAAGAAA 900
TGCGGTAAGA TTGGGTGCCC TGCCCAGGGC TACCTGATTC ATTAGCAAGA AAGCAGCAGC 960
TACAGTTCAG GTCTCCTAAT TGTCAAGGTT GGTGCAAGTC TCAGTTTTCA TTCCTTTGAA 1020
GACTGTGTTG GTATTTTTAT CCCCAGATAA CCCTTTTTCA TTCCTATTTT AACGCTAAGA 1080
CCAGTTCATA CTATTAACCA CTGCAATCTC TGTCTCCTGC AGCTCCCAGG AAACCTGCTG 1140
ATAACCTCCC CTTCCCAAAA GCCATACCCC ACCCTACCCC CCTGCCCCTG CAAAAGGCCA 1200
GGAAAGGTAG CGCTTTCTCA GAGACCTGAG GAAGCTACTA ATGGGGACAG CAGGTGAGGA 1260
AGGAGGCGGT GGAACTGCAG CTGCTGGCAA AGGTTGCCCT AGTAACCGTG CGGGCTCCAT 1320
TCAGGAAGCC AGCCCAACTC CAAGATGCAA AATGATCGCC TTCACGCGGC TACTGCAAGC 1380
ACAAAGGAAC CAGAGGAGCC CTGATATAGC TGGAAGAAAG GGAGGCACAG AGAGAGGTGG 1440
GGGCCCATGC TGTCAGTTAC AACCTTCCAC CTTCCACAGA AGAAAAAGAA GGAAAGAGAA 1500
TAGCTCTTTG AATCTTCTGG CCTATGTGAA CCGTAAAAAC CACCCATTTA ACATGAGTCC 1560
TTTGGTGAGA ATAGAGGGAA ACAGGCACCC CTCTGTTCAC CAGCCTTCTG AAACAATATG 1620
TCAGGAGAAG GGGGAGAAAC CTCAAACATT GCAACTTTAT GGAGGCTCTA AGCTCTTCAT 1680
ACTCTCTCTC TCCTTTATTC AGACTGGTGA CAAAGACCAT TTGCTCCCAA TTTATTGGAA 1740
ACTTTTTTTT TTTTCACAGC TTGAGCTGCT TAGATGCAGC GAGCTCCCTC TCCCCAAATT 1800
GCAGTCAGAC ACTTGCTGAA TGGGCCAGGC TCAATTATGC TCCCTCCACA GGTTCAGCTC 1860
ACACTGTGAC CCTGCATGGC TTCCTGCTAT TCATATGTGT TACTTCCCCT TTGTGGTAAT 1920
GGCTTGTGGC ACTTAGCCAG AAAACATTAT TAATTTCAGA AGTGGACTGA CAAACAACAA 1980
ACCCACAGTA AAACGAGAGG AAGTGCTGGG GAGGCCAGCT GTCGGCTTGA GCCAAGCAGT 2040
AGGAACTCAA TGTATGCAGG TTCTAGGAGG AAAGAGATAA TAATCCACAA AGAGGAAATG 2100
CACTAAAATT ATCCACAGCC CATATTTTTT TAAAAAACGA AAGAAAGAAA AAGAAAGAGA 2160
AAAGAAATCA GAGAAAAGAA AGGGGGGAAA AGCACCCAGC TACTTGAGCT GCAGCTGGAC 2220
AGGAAATTGC TAACGCTGCT TGCAAATCCT TACTTTGAAC AGGCAGTTTA GGGAATGCCA 2280
GGAGCGGAAA CCGTTCAGAA CTGGATTAAC ACGAGCCAAG TTGAACTGCA ATCCACTTCT 2340
CCTTTCTGTG CTCTTGCTGA CTTGGGACAC CCAAATAGGA CAGACTGACT TGGTATATAT 2400
ATATATTTGC ACTATTTCTG TTTGCTTTTT ATACTTAGTT GCTTAAAAAT CACCATGGAC 2460
AGTTTTATAT GATTGCCATC GAATGAAGGC CACTTGCCTC CTAAGTTAGT GTAGACGACC 2520
AAGCAGTCAA CTCATGTGCC ATGTAGGTGA AAAGCTCATT CTTCTCCCCA CTTCACATGA 2580
AGGGACTGAG CTCATGCAAA AAGAGCCCCA AATATAAGTA CGTTCTAGTT CTTTTGATTC 2640
CATACACCTG CCTTTTATTT TGGTTTGTGT ATTTTTACAT TTGAGGTAAG GAGAGGGTAG 2700
GTCCCAAGAA AAATGGCAAG ATATAAAGTC TTTAGCTTGA AAAGAAACTA AAATAATCCC 2760
CACAAGTTTC AATAAGGGTT TCTGACCCAC ATCCCAAGCC AGTTAAACAA AAAAGCACAT 2820
TACAACAGGG ATGACAAAGT TGCCTCCTAA GTGCCAATGT AAAATTCTAA AGCCATATCC 2880
TGACACGGTG AGGAAGCTTA GATATGCCTT GCCATGCGCA TGCTAGGGGA AAAAGTGGAG 2940
ACATCATTCT GGATTCAGCA TTCTCACACT AGGATATCTG CAGGTAGAAT TGCCCATGAC 3000
AACAGACTGG AAAAAGAATT ATCCCTACTT CCTCTTTGGC ATTATCTCAG CATTATAAAG 3060
CAGAAGATCC TGACAGTGAA GGATAGGGAG GAGGTTAACA TGTGGCTGTC ATCTTGGTAT 3120
TCTGCTACAC CTCTCTGTGG TTAATATCCA AATTGTATTC CTCAGCAAGC 3170