EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS178-02285 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Skeletal_muscle 
Coordinate
chr1:223892450-223895120 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata4MA0482.1chr1:223894355-223894366AGGAGATAAGA-6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:223894565-223894580GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
SP2MA0516.2chr1:223893170-223893187ATGTGGGAGGGACTTAG-6.73
ZNF263MA0528.1chr1:223894171-223894192GAAAGAGGGAGGGGAAGAAAA+6.35
Number of super-enhancer constituents: 38             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00224chr1:223891886-223912166Adipose_Nuclei
SE_01908chr1:223891964-223894610Aorta
SE_02306chr1:223892116-223896302Astrocytes
SE_04026chr1:223892317-223894515Brain_Anterior_Caudate
SE_05972chr1:223891995-223895701Brain_Hippocampus_Middle
SE_07996chr1:223892580-223894588Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_23408chr1:223892519-223892911Colon_Crypt_1
SE_23408chr1:223893759-223896170Colon_Crypt_1
SE_25230chr1:223894802-223895832Colon_Crypt_3
SE_26209chr1:223892263-223896172Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26925chr1:223892455-223896502Esophagus
SE_31491chr1:223892450-223896280Gastric
SE_33950chr1:223892039-223897144HCC1954
SE_34545chr1:223893587-223897272HCT-116
SE_34979chr1:223893945-223896369HeLa
SE_36294chr1:223892209-223896197HMEC
SE_37129chr1:223886879-223896561HSMMtube
SE_38254chr1:223892197-223897487HUVEC
SE_38957chr1:223892076-223894679IMR90
SE_38957chr1:223894705-223896262IMR90
SE_41495chr1:223892178-223896347Left_Ventricle
SE_42269chr1:223892060-223896221Lung
SE_44530chr1:223892152-223896327NHDF-Ad
SE_44904chr1:223892205-223896189NHLF
SE_45872chr1:223889824-223896323Osteoblasts
SE_49408chr1:223892167-223893562Right_Atrium
SE_49408chr1:223893604-223894625Right_Atrium
SE_50365chr1:223893595-223896281Sigmoid_Colon
SE_51879chr1:223892369-223896155Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53249chr1:223893884-223894596Small_Intestine
SE_53249chr1:223894745-223896091Small_Intestine
SE_55958chr1:223886755-223897239u87
SE_63671chr1:223892313-223896169HSMM
SE_64794chr1:223894664-223896174NHEK
SE_65644chr1:223892460-223893201Pancreatic_islets
SE_65644chr1:223893499-223896161Pancreatic_islets
SE_67677chr1:223886755-223897239u87
SE_68376chr1:223892363-223922876TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1223892629223893260
chr1223893295223893662
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I223704chr1223892008223897501
Enhancer Sequence
GTGGTCAAGG ATATCAACAA AAAAATAGTT GCTGATCCCA GGAGAAATAC AACACTGAAT 60
TGAGGGGAAA ACACAGAAAC ACATCTAGAC TGTCATTAAA CAAATGTAAC CGAGGCAGGG 120
GAAATGTGGA GCCCCAACGT GAGTAGGTGA TGGAGTTGGG TGACTGTCAT ATGTCACAGC 180
AGGATGGGTA GTTGGCTGCC CCCAGCCCCC TCCTGCCGCT CCCTGTTCCA GCACCCTGGC 240
CCACCAGCCC CTTCCTGGCA ACTCCCATAC TCCCCCAGTT CATCCACTAA AGGATTAATA 300
GCTCACTCAG GGGAGGCTTC CTGCCCCTCG GCCAACACCA ACTTCCCTTT CAGCAAGCCA 360
GTGTCGGCAC TACAGTGGTT TGGAATACTT TCAATATCAC TCCCTGTTAA CAAGCCTATC 420
CTTGGACTGG CTGAGAAAAG AAATGGAACG GGGCAAAGTA ACAAAACAAA GAGGCAAGAC 480
AGAGCCAAAT GTCTCCTATG GTTACCTAAA TCACAATTTA GACAAGCACT GGTGATTCTT 540
GCACATAGAG AACCACCACT GAACTGTACA GGGGAAACTG GTTTCTGCCC CAGAGATGTG 600
TTGGGGAAAT GACATACTGA CCACCATGAC TACATCCTCG GAAGACTGAG TGGCAGAGTG 660
CTACTTTGGC TTTCTTACCA GGTGAACTTG AGCATATATC TGGGCAGTTC TAGAATTTCG 720
ATGTGGGAGG GACTTAGGGA TGAAAAAAAT AAAATGTGGA TGGTAGATGG CATTTGGGGC 780
AGGGGATTGG AGGCTTGTCT TGTAGCTGTT TCTGCTTAGT AAGCTCCCTG TTCTGGCTTA 840
GAGACATATT TATTGGGGAG CTTGCTGATG GGAATTATGG ACGGGGCCAA CTCCTCTCCC 900
AGCACCCTGT GGTGCTGACA TCTGAGGTGA TCACTTCCCA TGGAGTGGAG AAAAGCATGC 960
TGCTCTATAT TTGTTCCCTA CAACAGGAAG CGTGAAAACA GGATTTGCTG CCACATGTCA 1020
AGTACTCATG TGCCTGTAGA AGAAAGGGGC CATTGCTGCT GATGATAACA ATGATAGCAT 1080
CTAAGGTTTT ATAGTTCCCC AAATAATTTC ACATACACTG TGATTTGATG CTTATAACAA 1140
CCGTGTGAAC TATGCAAAGT AGGTATTATT TCCCCATTTT AAGAGATGGG AGAATGGATA 1200
GTTAGTATTT TGAAAATTGC CAGACCCCAC ACTTATAAGA CTACATGTAT TATTAGTAAA 1260
ATTACTACTA GGGGACCCCA GCTATGAAAA CCTCTCTGGG AGATAGCACT GGTGGGTGAG 1320
GGGCAGCAGC TTCGGCTCTT GCCTCCTGGC AAGGGTGGGA TGTAATACCC TAAGCTCCAA 1380
CAGACTGGGG AAAGAGAAGG GGCTTAGAAA ACTGTCTGGG CTGCTGGATT TCTTTCCGGA 1440
GTTTCCCTCT CTCCTTCTAC TGTCAGCACG TCCCATCTTT TGCAACACCA GGGAGAAGCC 1500
TTTCCATGCC TCTTCAGCTC TTGGAATCCC TCCAGAAGCC CCCTCCCTCC TGAGTGGCAT 1560
CTAACAGGCC TGTCCAATAC TCATGCTACA GCTATGAGGA AAGAATAAAC CCTGCAGCTG 1620
CTTCAGAAGA GAAAGAAATC TCTTTTCAAA TGAAACCGTT TTTTGCAGCC CTGTGGAATT 1680
CATATTCTCT GTGATCTCCT TTGGATTCAA ATCACGGACC TGAAAGAGGG AGGGGAAGAA 1740
AACAGGTTCT TTTCCTCTGC CTGGGCCTGC CGTTCCCTCT GCCCTCCTAC ACTGGGTATG 1800
GACAGACCCC AAGGGACCAT GGTCTAGGTG TTGGCAGCCA GGCTGGCTCT ACAACACAAC 1860
ATGTCAGCTG CTCTGCTGGG CCTCTGTTTA CTCATCCATT AAATGAGGAG ATAAGATCTC 1920
CCTTGACTGG CTGTGAAGAT TAAGTGCACA AATATGTGTA AAGTGCACAA ATATGTCAAA 1980
TAAAAACTGA GACTGACACG TGGAGGTGCA AAATTAAAAA GGAAGCTTTG GTTAGTATCT 2040
CCAGAACCTG GCTAGGCACG GTGGCTCACA TCTGTAATCT CAGCGCTTTG GGAGGCCGAG 2100
ATGGGTGGAT CACCTGAGGT CAGGAGTTCA AGACCAGCCT GGACAACATG GCGAAACCCC 2160
GTCTCTATTA AAAATACAAA AATTAGCTGG GCATGGCAGT GAGCCCCTGT AATCCCAGCT 2220
ACTCAAGAGG CTGAGGCAGG AGAATTGCTT GAACCCGGGA GGCGGAGGTT GCAGTGAGCC 2280
GAGATCACGC CACTGCACTC CAGCCTGGGT GACAGAGTGA GACTCCACCT CAAAAAAAAA 2340
AAAAAAAAAA TCCAGAACCT GCAGATTGTG CCTCTGATGC ATCTCAAACA TCCAGGGCCA 2400
GGGAGAAAAT AATCTAAAGA AAAATACTAC TGAAAAAGAT TCCATTGCCA TGGCCCTCTG 2460
AGACACACAC ATTCTTATTC TCTTATTTTC TCTCTCTCTC TCTCTTCTTC TCTCTCTCTC 2520
TCTTTCTATC TCTCTCTCTC ACTCCCTCTC TCATTTACTC ACAAGGTCAG TGGCCCAGAC 2580
CCAGGCAGTT CTGGATAATC CCAGCTGTTT CTGACTCACC ACCATCCTCA GGGCTGGCTG 2640
ACTCACTCCA GGAAGGTTTT CCACCATGAA 2670