EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS178-01707 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Skeletal_muscle 
Coordinate
chr1:156455590-156460300 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3790455chr1156456301hg19
rs1171563chr1156456529hg19
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:156459286-156459297ACAGATAAGGA-6.14
IRF1MA0050.2chr1:156455632-156455653TTTGACTTTTTTTTTCTTTTT+6.07
MEF2AMA0052.3chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.44
MEF2BMA0660.1chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.92
MEF2CMA0497.1chr1:156460263-156460278GGCTATTTTTAGCCT-6.68
PLAG1MA0163.1chr1:156459529-156459543GGGGCCCTTGGGGG+6.3
POU2F2MA0507.1chr1:156458371-156458384ACATGCAAATGAG-6.54
ZNF740MA0753.2chr1:156456961-156456974CCGCCCCCCCCAC+7.82
Number of super-enhancer constituents: 76             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156457065-156458145Adipose_Nuclei
SE_00337chr1:156458785-156462158Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156456670-156457855Adrenal_Gland
SE_00902chr1:156457886-156465033Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156458406-156465126Aorta
SE_02937chr1:156459147-156460802Bladder
SE_03183chr1:156456043-156465384Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156457996-156458566Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156459107-156459811Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156456452-156464992CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156456935-156461868CD3
SE_13485chr1:156456265-156458192CD34_Primary_RO01536
SE_13485chr1:156458238-156464737CD34_Primary_RO01536
SE_15064chr1:156456690-156463250CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156457379-156459814CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156457977-156460457CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156457236-156458338CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156458341-156459309CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156459405-156460421CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156455796-156465002CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156455595-156466497CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156456364-156463048CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156455831-156464221CD56
SE_21124chr1:156457099-156461742CD8_Memory_7pool
SE_21730chr1:156458726-156460216CD8_Naive_7pool
SE_22205chr1:156457256-156460201CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_23670chr1:156458712-156461319Colon_Crypt_1
SE_24009chr1:156457788-156458281Colon_Crypt_2
SE_24009chr1:156458815-156460139Colon_Crypt_2
SE_25163chr1:156458742-156460751Colon_Crypt_3
SE_25856chr1:156458944-156461980Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26648chr1:156457546-156463758Esophagus
SE_28187chr1:156458987-156460424Fetal_Intestine
SE_29274chr1:156458941-156460473Fetal_Intestine_Large
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156457385-156464605Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156457284-156462277Gastric
SE_32703chr1:156456813-156464850GM12878
SE_33523chr1:156455889-156465173H2171
SE_37054chr1:156457835-156464275HSMMtube
SE_38176chr1:156459372-156461851HUVEC
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156458508-156459348LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_44813chr1:156459756-156461387NHLF
SE_45962chr1:156459159-156461844Osteoblasts
SE_46671chr1:156458747-156461587Ovary
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_49466chr1:156457509-156462281Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_51995chr1:156459182-156460267Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52473chr1:156456590-156465184Small_Intestine
SE_53429chr1:156457271-156464857Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156458029-156461282Thymus
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_63769chr1:156459121-156461353HSMM
SE_65297chr1:156456555-156461791Pancreatic_islets
SE_68350chr1:156458923-156476306TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr1156459000156459400
chr1156456600156457200
chr1156455896156455956
chr1156456267156456663
chr1156458442156458923
Enhancer Sequence
AGCTGGGACC ATGAGTGTGT ACCACCATGC CAAGCTAATT TTTTTGACTT TTTTTTTCTT 60
TTTTTTTGTG AGACAGAGTC TCACTCTGTC ACCCAGGCTG GAGTGCAGTG GCGTGATCTT 120
GGCTCACCGC AACCTCTGCC TCCCGGGTTC AAGCGATTCT CCTGCCTCGG CCTCCCAAGT 180
AGCTGGGATT ACAGGTGTCT GCCACCACAC CTGGCTAACT TTTGTATTTT CAGTACAGAC 240
AGGATTTCAC CATGTTGGAC AGGTTGGTCT CGAACTCCTG ACCTTGTGAT CCACCCACCT 300
CGACCTCGTG CTCCATGGGC CCTGGGCCTC CTACTGGTAC CCTGGGACAA GAGCAACACC 360
AGCCCAGCCA GCCCTGAGTG GCCCAGCAGA CACCTGAGCC CCAAACCAGC TCCAGACACC 420
CCATTCCTCA CCTGTGACCC CAGTGTCTGC CAAGTTCCCA TTGCAAAGGC TCCAGCCCAG 480
GGATTTCAGC TCCCCTGCTT CCCAGTGCAA TCCAAAGACT GTGCTTTCTA GAGCTACAGT 540
GGTGTGGGCT TTGGCAGGGA AGGTAGGGGA GGGCACACAG AGGGCAAGGG GAGGGGGCTA 600
CAAATAGTTG GCTTTTTAAA TGGGATTCTC TGGCCTAGTC TTGAAAACCC AATCTAGACT 660
GTTAAATGCA GGAACTGCTG AGCTCCTCTG GCTTACAGCA TCTACCCTCC CTCTCTCCCC 720
TTTACTATCT CCCTCTCACC ACCTTTAGTT CATAACCGAA TTCTTGCAGA GATGTAACCT 780
CTGTCAGCTG ATGACCAATA CTGCCTCTTC CTCCAAACTG GAAGAGAAGC CTCTCTTTGT 840
TCTCATGACC CTCAGAAAAG TCATTCTTGC AGTCTTTCTA GCATTTATCA CAATTGTGAA 900
TAACTATGAT TCTGTGCTTC TATTTAACGC CTGGCTCCTC TATGAGACTA AAGTTTCATG 960
AGGGCAGGAA TCACATCTGT CTTTTTCACT ACTCTATCTC CTATAAGAAG GGAGCTGAGA 1020
AAATGTCTGT TGAAAAGAAG AAAATACTAT TTCATTGTTG TGGTGCTGTG AGAAGTCCTT 1080
CTTGCAGTCT AACCTCCAAC AGTCTTGCTG CAGTACCAGT TCCTCTCACT CTATCCTCTA 1140
TGGAGCTAGA ACCCTTGCTC TCCCAACTGC CCCTGAAGAT TTGGACACCA CCTACCCTCC 1200
AACCACCCCT GGTATCCCAG TCCTCAACCC TCCCCACCCT CAGGTTGGTT GGTGCAGAGG 1260
GTGAGACTCT AAAGTCTTCT AAGGAGCAGC CCTGAGCACA TGGAGATGGA GAGGATGGGG 1320
TTGCTTAGGC AACTGTCGCC TGGCAACCAG CTCCCTGGCT GATCTCCTAC ACCGCCCCCC 1380
CCACCCCCGC CTCATGCTGG GGGAGCTGGG ACGAGAGAGG GATCAGGGCT GAGAAGGCAG 1440
GGAAGCAACA GAGATTCACT GAGCATCGTC TGACAGAGAG AAGTCAGGGT TAAAAAGACT 1500
AGGCCCCATC TATCCCCACT CCCTACCAAG GTAGCCCAAA GCACTTTTTA TAATTCCATG 1560
CTTCCCAGGC CCCTTTCCCC ACTGCTGCTC CCACTTCTGT GCCAACACTG CCAGAGGAGG 1620
AGATGCCCCT GTCTTAGGCA GTCCTTCCTC CCATCTAACC ACAAACCCCT CTACAAAGCA 1680
GATGCAGTCT ATACTGACCT TTTTTCCTTC TGCTATCCAT TCCACATTGC TGCAGGGTCT 1740
TTGAAAGCCC TGAGGCAAGA ACATGAACTC AACCCTGATT TTGGAAGAAG GGGTAGCTGG 1800
GGCCTAGGCA GGCACAAAAT ACCCTAACCT GACCCTATCC AAGGTTTGGA GGCCTATCCT 1860
AGCTAAACTT CCCTCCTACC CAATTAGGGA GGTTTTAATG AACACCTGGA CCTCCTTAAT 1920
TAGCCCTCTG CCTAATTACC TAACCAACTG GCAGGAGCCA GAGGCCTGGG CATCTGTTCT 1980
CCAGATGTGA GTCTCTCCTC TCCAGCCTCA CCTGGCCCCA TTCTTCTCCT GTCTGGTCTA 2040
CTCCTCCTCT AGGAAGCCCT CGCAGATGAT CCGGCCCTTG GCTGCTTCTC TTCTAACCAT 2100
CTCTCCTTCA CCCTGCCTAG TATCTGGAGC CCAGGGCTTG GGAGGACTTG GGCTACCAAA 2160
GAGACAGGGG GTTGGCCAGG ATGGCCTTCC TGTTCTGATG GCCCCAGGGC CTGCCCAATC 2220
CTGACCTCAG GCCACAACTA TGACTCCTCG GGCTGACAGT ATCTATGTCA CCAAAAGTTC 2280
CCCTTCAAAG GCTCTCAAGG CTCTGGCTGA TTGACTCTGA TTCACCTGAC TCCGTGGACA 2340
GGACAAGGGT GGGGCGGAGT GAACCTTGTG GGTGGCAGGG GGTTGGGACA GGCAGAGGCA 2400
GGGCCTTCCT GGTGGACATG GGAGAAGCAA AGATGGGCAG GACATTTGGC AATGCCCACC 2460
CATATCTGTT CCCATCCTAG TGGTCCCAAG GCTCAAAGAA ACTACAGGGC ATCTGCTTTC 2520
AAAGCTCCCA TACCAGCACA GGTCAAAAGG GAGCAGATGC CCAGAGAGGG AAACAGGCAC 2580
AAACTCACCA ACTGTGGAGA AGGGTGGCTG AGGAGAAGCC TTCACAAATG GACAGCAGGG 2640
AGGATGCAGG GCAGGAGGCC CCTCTGACAA CACCCTTGAC AAAGAGAGCT GAGGGGACCA 2700
GGGGGAATCA AGAAGGACCC CACTGATAGC CATTTTTCCA ATCCCAGGTA CCGACCCAAT 2760
TAGAACTTGT GGGTTGTGTT TACATGCAAA TGAGCTACAC ATGATGTGCA AAATGTACCG 2820
TAAAGGAGGA CTGGTTTGGA GGGGGCATGG GAGAAGAAAC AGGTCCCTGC CTCCCCCAAT 2880
GCAACACCTC TGGGTACCTG AGCAATATTC AAACCATTCT CGGGTTTCAG AATGATGCTA 2940
TCTCAGTTCC TGTGTGAAGG TGGCCTGGGG CCAGTGGGGA GAGCGGTGAA GGGGAGAGGT 3000
CAGGGTAGCC TCCTTGCAGC TGCAGCAGGG CTGAGCAGGG CTGTCCTTCC CATGGAGCTG 3060
CAGGGGAATT CCTTTCCGAT AGCCAGCCTC TATCCTCTCT TTCTTGCTCT TGGCAGGGGA 3120
GTACCTACCT GTCCTTCTCC CCTACACCCT TCCACCCATA TCTGTTCCCA TCCTAGTGGT 3180
CCCAAGGCTC AAAGAAACTA CAGGGCATCT GCTTCCAGAG CTCCCATACC AGCACAGGTC 3240
AAAAGGGAGC AGATGCCCAG AGAAGCTGAG TGAGCAGCCT CGCATCACAG AGCAGTGGGC 3300
CTCAACCTGC TCTTCCTCAT GGTGAGAAAG GGAGCTCTCA TTAGGCAGGC CCTTCATCTC 3360
TTCCTCCCAG GCTGCTCCGG GCTGCAGGCT GAGGACTGGA GGGGAAGGCA GGAGGCGCTG 3420
GAGACAGCTG TCATCCCTCC TCCCGCCCCT TCCCTGTGGC TGGGCTGCAG GGCATGAAAT 3480
AAGCAGCAGG CGCTGGGGGA GGGGGTGACA ATCCAATCCA CCTGTCACCC CCACAGTCAG 3540
GCAGCCTCAA GCAGCCTGCT CACTAACGAG GGAGGAGGCG TGGGTGAGGC AGACACAGAA 3600
GAGGGTGGCA GAGGGGGGAC AGACACACAG ACACAGGAAA GATGACAGAG AAAAAGAGGC 3660
AGCGAGGCCA GAAGGCATTA TGGGGCAGAG GCAGAGACAG ATAAGGAGAG GGCTAGAGGA 3720
GAGGGAGAGG CAGGAGACCA CAGAGACAAA GATTCAGAGA GAAGCAGGTA GAGAACAAGA 3780
GACAGGTTCA ACAACGGCTT CCAGGACTGA CTCCTGGCCC AGCGCTGGGG GAATAACTCA 3840
ACAGGACACC ATCCCTGCCC TCTGAGAACT TGCAGTGCAG CCAAGAGACA GACAAGGGAG 3900
GGGCAGGTCC CACCCAGGGC AAGGGCAGGG AGAGGCAAGG GGGCCCTTGG GGGCCTGGAC 3960
TGGACCCAGA CACAGCCCCA GAAGGAGCAT CCCAGAGCAG GCAGGCCGGC CCTGAGAGGC 4020
AGCAGAGGTG AGGACCGAGG ACCAAGGACG ACAGCTGCCC AGCTGAATCC CCAGGCCCTG 4080
CCTTATTACC CAGTCTACCC TCAGGTTCAC AACCTTCCTA GTCATTCTCT CTTCCAACTT 4140
CAGCCCTGGG ACCTCCTCCC TAGTACAGAG ACACAGGCTA AGGAGCTCTG GGAGACAGGG 4200
CAGGAAGGTG AAGCCGGTGA TGCCCCCAAA CACCCAGGCA AGATGGTCCA GGATCATTCT 4260
GTGGTTCACA CAGTGAGCTC TTCCTTCACA AAAGAAGTGG GGGGCATTAC CCCTCCGAAG 4320
TCTGAGCCAA GGCAGGAGCC TCACATTGTC CCTCTCCCCA TCCCACACAC AGCCCAATTC 4380
TCACAACCCC TCCTGCGAGG CCTGCTCCCC ACGCCCCTAC TCCTGGGCCC CTCTCGGGTC 4440
TCCTTCTCAT GCTCCGTTCC CTCTGCCCCC TCTCTGTCCC CGCCCCCTCC CACAGCAGCC 4500
TCTTTTCTTC ACCCCAGAAG TGCTTCTAGG GTCTGATCTC AAAGGCAGAG ACCCAGCCCC 4560
AACCCTTCAA AGTTCTGTCT GGCAGGCTCA CTACCCAAAT CCCTGGTTCC CACCGTCTTT 4620
CCCTCCCTCG GGGACTCCCC TCCCCCAGTC CAGCAGCCTC AGGGCTGGGC AGGGGCTATT 4680
TTTAGCCTGG GCACTGAGCT AATTTTAACT 4710