EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS178-01578 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Skeletal_muscle 
Coordinate
chr1:150582650-150587110 
SNPs
Number: 3             
IDChromosomePositionGenome Version
rs148193595chr1150582906hg19
rs4970966chr1150584103hg19
rs12045807chr1150584834hg19
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOSL2MA0478.1chr1:150586157-150586168GGATGACTCAG+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:150583437-150583449GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:150585737-150585749AAACAAACAAAC-6.32
HLTFMA0109.1chr1:150583115-150583125ATATAAGGTT-6.02
HLTFMA0109.1chr1:150583421-150583431ATATAAGGTT-6.02
HNF1AMA0046.2chr1:150584460-150584475AGTTAATTTTTAATT-6.49
JUNBMA0490.1chr1:150586157-150586168GGATGACTCAG+6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:150583674-150583689TGAACTCCTGACCTC-6.22
Rhox11MA0629.1chr1:150585292-150585309AAGATGCTGTTAAACAT+6.59
SRFMA0083.3chr1:150583416-150583432AGCCCATATAAGGTTT+6.05
ZfxMA0146.2chr1:150585135-150585149CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_10034chr1:150581598-150589095CD14
SE_13034chr1:150582882-150587632CD34_Primary_RO01480
SE_13478chr1:150581835-150589003CD34_Primary_RO01536
SE_14186chr1:150582566-150587408CD34_Primary_RO01549
SE_14726chr1:150581631-150589008CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18894chr1:150581637-150590010CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19754chr1:150581754-150587333CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_26372chr1:150581394-150588445Duodenum_Smooth_Muscle
SE_34907chr1:150581681-150588976HeLa
SE_36278chr1:150581656-150587296HMEC
SE_38345chr1:150581689-150588426HUVEC
SE_40500chr1:150583737-150584877K562
SE_40500chr1:150585014-150587099K562
SE_45206chr1:150582750-150587242NHLF
SE_56524chr1:150582934-150583594u87
SE_56524chr1:150583609-150588921u87
SE_64527chr1:150582922-150587080NHEK
SE_67845chr1:150582934-150583594u87
SE_67845chr1:150583609-150588921u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1150585611150586454
chr1150585815150586394
chr1150583722150584851
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I150609chr1150581478150588958
Enhancer Sequence
TTGAACTCCT GGTCTCAACA AATCCTCCTG CCTCAGCCTC TGAGTAGCTG GGATTATAGG 60
CACTCGCCTC CACACCTGGC TCTAGGATTT TATTTTAGCA TAAAACCAAA TTCCACTTTG 120
CTAGCCATGA TACAAGTTTC TTTTTGAGAC GGAGTCTCAT TCTGTCGCCC AGGCTGGAGT 180
GCAGTGGCAT GATCTCGGCT CACTGCAACC TCTGCCTCCC GGGATCGAGC AATTCTCCTG 240
CCTCAGCCTC CCGAATAGCT GGGATTACAG GCGCCCACCA CCACGCTAGA CTGATTTTTG 300
TATATTTTAG TATAGACAGG GTTTCACCAT GTTGGTCAGG CTGGTCTCGA ACTCCTGACC 360
TCAAGTAATT CACCTGCCTC AGCCTCCCAA AGTGCTGGGA TTACAGGCGT GAGCCACCCT 420
GCCCGGCCCC TCTTTTTGTA TATCTAATTT AATTCTAACA AAAACATATA AGGTTTTTAG 480
TTTAGTTTTT GAGACAGGCT GTTGCCCAGG CTGGAGTGCA GTGGTGTAGA TATGGCTCAC 540
TGCAGCCTTG ACCTCCTGGG CTCAAGGGAT CCTCCTGCTT CAGCCTCTGG TACAGCTGGG 600
ACCACAGTGC GTGCCACCAC ACCTGGCTAA TTTTTAAGGT TTTTTTGTAG AGATGGGGCC 660
TTACTCTGTA GCCTAGGCTG GTCTCAAACT TCTGGGCTCA AGTGATCCTC CCATCTTGGC 720
CTCCCAAAAT GCTGGGATTG TGGGCATAAG GCACCACGCC CAGCCCAGCC CATATAAGGT 780
TTTTTTTGTT TGTTTGTTTG GTTTTTTTGT TTTTTTTTTT TTAAAGACAG AGTTTTGCTC 840
TGTTGCCCAA GCTGGGGTGC AGTGGCACGA TCTCAGCTCA CTACAACCTC TGCCTCCTGG 900
GTTCAAGCGA TTCTCCTGCC TCAGCGTCTC GAGTAGCTGA GATTACAGGT GTGCACCACC 960
ACGCCCAGCT AATTTTTGTA TTTTTAGTAG AGACAGGTTT TCACCACATT GGCCAGGCTG 1020
GTCCTGAACT CCTGACCTCA AGTGATCCAC CTGTCTTGGC CTCCCAAAGT GCTGGGATTA 1080
CATGCTTGAG CCACTGCACC TGGCCCCATA TAGAGTTTTT ATTGTCATTA TTCCCATATT 1140
ACAGATGAAG GGACTAAGGC TCAAAGGGTA AATAAGTCTG TTCTTAAATA GTGACTTCCT 1200
GAGACACAGG AGATGTTTAA GAACAGTACT GGTAGGTGGG AAGTGGCATT TTGGAGCAGG 1260
AGTGAGAAGC ATGAAAATGT AGCAAGAATA GAAAAGGGTG GGAAAACAGC AAATTAAGAG 1320
GAAGAAAAAT GCAGGTCCTA GCAAGAATTG CTACTCACCA CTGCCAGAGT CTGGGCCATG 1380
TTCTAGGTGT GTATTTAAAC AAATCTCCAT AGCAACCATC TGGTTTCTGT TTTTCTATGA 1440
CAACACGGGC TTGCATTTCT AAATACAAGC ACTGGTGAGG ACAAGTGTGG GCTGGGGAAG 1500
GGAAGTGGGA CCGCTGAGTC AAGGGGAAAT TGCGCAAAAA AGGCAAAGGT TCTCTTGGTA 1560
TGCCCTCATC TATCCCCTCC CAGCACACCC TCAAGGAAGG GGTCTTTCCT TGACTCACAG 1620
CAGTCATTGT TAAGAGCTGA GCCTTGTATG CACTTTGTCT TTTGTTTTGG AGACAGAGTC 1680
TGGCTCTGTC ACCCAGGCTG GAGTGCGGTG GTGTAATCTT TGCTTACTTA AACCTCTTCC 1740
TCCGAAGTTC AAGCAATTCT CTTGCCTCAG CCTCCCGAGT AGCTGGGACT ACAGGCGCCT 1800
GCCACCACTC AGTTAATTTT TAATTTTTTT GTAGAGACAA GGTCTCACTA CATCGCCCAG 1860
CCTGGTCTCA AACTCCTGGG CTGAAGAATT CCTCGTGCCT CGGCCTCTCA AAATGCTGGC 1920
ATTACAGGTG TGAGCCACTG TGGCCAGCCC ATGATATCTT ATTTTTACCA ATTATGTAAA 1980
TTCCTATCTA ATTAGGGTAT ACCCTTGGTG CAAGAGGGGG AAGGGTAGAT GCTTTTGCTT 2040
CTCATTTTCA ACCCAGGTGG CACTTTTGGA GATACTGAGG GTAGAGAGAG GTTGGAGGAT 2100
CTCATCTGAT AAAGGTGTGG TAGCCCCAGA AAGAAAGGTG AGAAAAAGGC AGCTAGGCAT 2160
GGAGATGCAG GAATAAGAAT AGATACTGCC ATGAGGACTA AGTGGGCCCA GACCTGAGTT 2220
AAAACAGCCC CCCATCCCCG CTTTTTTTTT TTTTTTTTTT GAAATGGAGC CTCTCTCTGT 2280
CACGCAGGCT GGAGTGCAGT GGCGCGATCT CGGCTCACTG CAAGCTCCAC CTCCCGGGGT 2340
TCATGCCATT CTCCTGCCTC AGCCTCCCGA GTAGCTGGGA CTACAGACGC ATGCCACCAT 2400
GCCCAGCTAA TTTTTGTATT TTTAGTAGAG ATGGGGTTTC ACTGTGTTAA CCAGGATGGT 2460
CTCGATCTCC TGACCTCGTG ATCCTCCCGC CTCGGCCTCC CAAAGTGCTG GGATTACAAC 2520
AAGAGCCCCT TTCTTAAGCA TAGTGATTCT CAACCAGGCA ACCAGGCAAC TCCAGGGGGC 2580
ATTTGGCAAT GTCTGGGGAC TTTTCTGATT ATTCTGACTA AGCAACTAAT GGGTAGAGGA 2640
CAAAGATGCT GTTAAACATC CTGAAATGCA CAGGACAGTC CCTGCAACAA AGAATTACTT 2700
GGCCCAAAAT GTCAGCAGTT CCAAGATTGA AAAACCTGAG TAAAGAGATG CTGGTCCTAC 2760
AGGAAACGTC TCCTTTGTCC ATTGCAGGAG CACCAGTGTG ACAGATAAAA CCATTTGAGG 2820
GGGGCCGGGC ATGGTGGCTC ACGCCTGTAA TCCCAACACT TTGGGAGGCC AAGGTGGGTG 2880
GATCACCTGA GATCAGGAGT TCGAGACCAG CCTGGCCAAC ATGATGAAAC CCCATCTCTA 2940
CTAAAAATAC AAAAAATTAG CTGGGTGTGA TGGCTACCTG GGAGGCTGCG GCAGGAGAAT 3000
CGCTTGAATC TAGGAGGTGG AGGTTGCAGT GAGCCGAGAT TGCGCCATTG CTCTCCAGCC 3060
TGGGAAACAA GAGCAACACT CTGTCTAAAA CAAACAAACA AAAAACTATT TGAGGGGGAT 3120
ATACCAGAGA TGCCTGCTTG TTCCCCTGGG CCCTGAGTCC CTCTCAGACT TTCAGACCAA 3180
GTATTTTTAG TTTACTTCTG ACAAAAATAA ATTCAAGCCA GAATCCAAAT TTGCTGTGAA 3240
ATCAGCTGGT TCTAGAGAAT AGGGTATTTT CCTATACCCT TCTTGGTATA GGCAAAACTG 3300
CCCCACAGAG GCTGTGCAAT CAGGCAAAGG CATGCTCCTC TTGGCCTTAG TTTCACCATT 3360
TGTAAAACGA GTACACTGAA CTCAATGATC TCGAATGTCC CTTTAGTTCC AAAACTCTGT 3420
ACTTTTGGAC ATTTAAGAAA TATCCTGGGC TGTACAGTTT GGGTCTGTAA AAAAGGAAAT 3480
GACTCAAATG CAATAGAGGA AGCCTAAGGA TGACTCAGAC TTCCCTAATC ATAAACGACA 3540
CTTCAGACAT GGACCTTAAC GTCAAACCAG GATTCATGAT CACTAAATGA CTTTCCTTTT 3600
GTACGTGTGA GCAGGTGGCG TTCACCAGGG GTGAGACTTT ATTGACAGTA AGTTGCCTCT 3660
GCCAAAAAAC GCCCTCATAT GTCTGCTGAT GTTTGAATTT CTCCTATGCA GAGTTTTGTC 3720
TCCAGTTAAA AATGTAAATA CTGTTGTTTC TTGTTGGAGC TCAGAGGAAA AAAAGATAAC 3780
TACTCTAGGA TATGTATCAA TTTGATGCTA CTTTATTTTA TTTATTGAGA CAGGGTCTTG 3840
CTCTGTTGCC CAGGCTGGAG TGCAGCAGTG CAATCACAGC TCACTGCAGC CTCAACCTCC 3900
TGTGCCCAAT CGATGCTCCC ACCTCAGCCT GCCATTGCTG GAACTACAGG CACATGACAA 3960
CACGCCTGGC TATTTTTTTT TAATTTTTCA GACAGGGTCT CCTTACATTG CCCAGGCTGG 4020
TCTCAAACTC CTGTACTCAA GTGATCCTCC CCCTTCAGCC TCCCAAAGTG ATGGCATTAC 4080
AGATGTGAGC CACCTCACCC CAGCAAGTTG ATTTTTAACA AAAGATAACA GCAAAACCCC 4140
AGATAAATTA GCAAACTACC TTCACAGCTC GATGTGAGAA CTCTCTTAGT TTTATTTATT 4200
TATACACAGA GTCTCATTCT GTTGCCCAGG CTGGAGTGCA GTGGTGCAAA CACAGCTCAC 4260
TGCAGCCTTC ACCTTCTGGA CTCAGGCTAT CCTCCAGCCT CAGCCTCCCA CGTAGCTGGG 4320
GCCACAGGTG CATGCCATCA TGCATGGCTA ATTTTTTAAT TTTTTTGTAG AGATGGGGGT 4380
CTCATTTTGT TGCCCAGGGT GGTCTCGAAC TCCTGGGCAC AAGCCATCTT CCCCTCCCAA 4440
AGTGCTGGGA TTACAGGCAT 4460