EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS178-00278 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Skeletal_muscle 
Coordinate
chr1:12231280-12236060 
TF binding sites/motifs
Number: 46             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CREB3MA0638.1chr1:12235443-12235457CTGCCACGTCACCC+6.73
FOXP1MA0481.2chr1:12233024-12233036TTCTGTTTACTT-7.22
FOXP2MA0593.1chr1:12233025-12233036TCTGTTTACTT-6.32
GATA2MA0036.3chr1:12232427-12232438TTCTTATCTGT+6.14
Gata1MA0035.3chr1:12232427-12232438TTCTTATCTGT+6.62
Nr5a2MA0505.1chr1:12231941-12231956TCTGACCTTGACCTT-6.94
RESTMA0138.2chr1:12235219-12235240TTCAGGAGCAAGGCCAGAGGC+6.06
RORAMA0071.1chr1:12231949-12231959TGACCTTGAT-6.02
SP1MA0079.4chr1:12235246-12235261AGTGGGCGGGGCCTG-6.76
SP2MA0516.2chr1:12235245-12235262GAGTGGGCGGGGCCTGG-6.64
SP4MA0685.1chr1:12235244-12235261GGAGTGGGCGGGGCCTG-7.2
Stat4MA0518.1chr1:12233725-12233739CGTTTTCCTGGAAG-6.23
ZNF263MA0528.1chr1:12231491-12231512TCTCCTTCCCTCGCTTCCTTC-6.08
ZNF263MA0528.1chr1:12234302-12234323TTCTCCTTCTCCTTCTTCTTC-6.47
ZNF263MA0528.1chr1:12234206-12234227TTCTTCTTCTTCTTCTCCTTC-6.52
ZNF263MA0528.1chr1:12234209-12234230TTCTTCTTCTTCTCCTTCTCC-6.7
ZNF263MA0528.1chr1:12234212-12234233TTCTTCTTCTCCTTCTCCTTC-7.12
ZNF263MA0528.1chr1:12234215-12234236TTCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.13
ZNF263MA0528.1chr1:12234299-12234320TCCTTCTCCTTCTCCTTCTTC-7.15
ZNF263MA0528.1chr1:12234221-12234242TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234227-12234248TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234233-12234254TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234239-12234260TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234245-12234266TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234251-12234272TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234257-12234278TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234263-12234284TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234269-12234290TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234275-12234296TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234281-12234302TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234287-12234308TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234293-12234314TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234218-12234239TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234224-12234245TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234230-12234251TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234236-12234257TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234242-12234263TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234248-12234269TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234254-12234275TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234260-12234281TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234266-12234287TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234272-12234293TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234278-12234299TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234284-12234305TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234290-12234311TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234296-12234317TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
Number of super-enhancer constituents: 43             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00369chr1:12226565-12247198Adipose_Nuclei
SE_01471chr1:12232095-12234188Adrenal_Gland
SE_01471chr1:12234592-12236046Adrenal_Gland
SE_04546chr1:12232368-12233932Brain_Anterior_Caudate
SE_04546chr1:12234570-12236102Brain_Anterior_Caudate
SE_06521chr1:12231395-12234253Brain_Hippocampus_Middle
SE_06521chr1:12234379-12243644Brain_Hippocampus_Middle
SE_09154chr1:12224797-12249846CD14
SE_10696chr1:12231624-12233979CD19_Primary
SE_11902chr1:12231048-12236114CD3
SE_14553chr1:12231008-12236205CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15480chr1:12231304-12235464CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16369chr1:12231214-12235920CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16946chr1:12231228-12235850CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17650chr1:12231292-12241643CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17827chr1:12231021-12246713CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18389chr1:12226183-12250288CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19117chr1:12225970-12243644CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20048chr1:12231058-12236137CD56
SE_20873chr1:12231198-12236438CD8_Memory_7pool
SE_22347chr1:12226250-12242299CD8_primiary
SE_26251chr1:12232165-12234254Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26251chr1:12234361-12236001Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27503chr1:12231615-12234368Esophagus
SE_27503chr1:12234497-12236079Esophagus
SE_30788chr1:12232018-12234343Fetal_Muscle
SE_30788chr1:12234469-12236114Fetal_Muscle
SE_32030chr1:12231844-12234207Gastric
SE_32030chr1:12234507-12236040Gastric
SE_38661chr1:12234401-12236100HUVEC
SE_41498chr1:12232230-12236136Left_Ventricle
SE_42336chr1:12231389-12236106Lung
SE_48967chr1:12232188-12234263Right_Atrium
SE_48967chr1:12234520-12236102Right_Atrium
SE_50250chr1:12231283-12234299Sigmoid_Colon
SE_50250chr1:12234498-12236097Sigmoid_Colon
SE_52522chr1:12231293-12236092Small_Intestine
SE_53313chr1:12231250-12236109Spleen
SE_55394chr1:12232096-12233341Thymus
SE_55394chr1:12233345-12234247Thymus
SE_55394chr1:12234547-12235437Thymus
SE_55394chr1:12235467-12236045Thymus
SE_61096chr1:12184746-12245090HBL1
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 8             
ChromosomeStartEnd
chr11223209612232448
chr11223360012234159
chr11223460012236012
chr11223507012235463
chr11223169312231881
chr11223353112233800
chr11223380012234000
chr11223400012234197
Enhancer Sequence
GGCTGGTCTC GAACTCCTGA ACTCAAGTGA TCCACCTGCC TCGGCCTCCC GAAGTGCTGG 60
GATTATAGGC GTGAGCCACC CCACCCAGCC CCATTCTCAC TTTTAAGCCA TGCTTTTCTG 120
TCCTCAGATG TGCTGCACAC ACACCTGCTC CAGGGCCTTT GCACTTGCTT TCCCCATCAC 180
CTCCAATACT CCTCCTGCTG ACGTCTCTTG GTCTCCTTCC CTCGCTTCCT TCTGCTGAAG 240
TAGACAATCC TGCCTGTAGG TGCTCCCTGC CAGGCACTCT CACTCCCTGA CCTGCTTTGT 300
ATTCCTGTAT AATGCTCTTG ACCTATTCTA TTTATTTCAC TTTTATTATG TCTTCCCACA 360
AGATTGTAAG TACCGTGAGG ACAGGGACTC ATTCACCACT GTAGACTCTA GCCTAGAAGA 420
GGGTTTTTCA GTCAGTGCCT CTGACTTTAA TTCTTTGTTG TGGGGCTGTC CCGTGAGCTG 480
TAGGATGTTT AGCGACATCC CTGGCCTCTA CTTATTGGAT GGCAGTAGCG CCACCCTCCC 540
TCGTGACAAA AATATCTCCA GATATTGCTA AGTGTCCTTT GGGGTTGGGG GATTGCCCCT 600
GATTGAGAAC CACTGGCCTA GGACAGTGCC TGGCACATAG TAAGTGTTCA AAAAATATTC 660
ATCTGACCTT GACCTTGATA ATGGCCCTGT TTTACAGATG AGACGGGGGT TTGAAAAGTC 720
AGTGGTGGCA GGGTGGGGTT CTGTTTGCCT CCATCTCTTG GGGTATTTTT CTGGGCTCCT 780
CTTCCCATTG AGTGGTGTCT GCTGAGGTTA GGGGTCCTCT CCCCAAATTG CTCACCCCCT 840
CGACATCCCT CGTGTAGTGA GGGATGGGGC CACTCACTGA CGGTGACTCA GGGCCCCAGA 900
ATGCATGTGA TTTACCCAGA AGCGGGCAAG GAGGGAAGCT GGGGTTTGGG GTGCCGGGGA 960
TGAACAGGAA CAAAGGAGAG GCGCTGTGGC TCCCCGTTCT GGACCCTCGT CTGGCCACAG 1020
GGAAGCAGCA CTGATGACTC TGGGGAAAGG CCCCGGCCTC TGAATCAGAT AAACCTCAAG 1080
TCGCTGCTCT GCTGTTTTAC TGGCTGTGTG ACCTGGGCAA GTCTTTCTAT CCCTCGGAGC 1140
CTCTGTGTTC TTATCTGTAA AATGGGAGTA ATCCTAGCCT CACGGGCTGG CTGTCAGGAT 1200
TAAAAGTGCT TTCTAATCCT GGCATTGGCA GCTATTTGAG CCATTGGTGG CTTTGCAGGT 1260
CTGACCCGAC TCTCTGGGCC ATGGGGTGGT GCTCGGGCCT AGGTGGGGAC CCCTGTGGAG 1320
TCAGACTGTC TGCTCTGAGC CCCAGGGCCC TGAAGCTTGG GTGGCAGCCC TGCAGTTGCC 1380
CAGAGTTCCT GTCTAAGTGG CTTTGTTGCC CATCATCTCA GAAAGCAACT TCTTTCCTCC 1440
CTGCCTTTTC CTGTCTGTGC TTCTGCCCCA GTGCCCCCTG GCTGGGCTCT CAAACCCACT 1500
GCTTGACAGC CTGGTCTTAG GACACTGTAT TGTGGCAAAG GCTGTGGGGT CAGGATATCC 1560
CCTCCCCTCC CTTTGCCACC CCTTTTAGTG AGTAACAGGT GCTGTGTGTT TTGGGGATGA 1620
GTGAAGGGTA CATTTGGTGA AGCACAGAGA GAGTGCACAA GGCTTCAGTT TGCAAGATGG 1680
GCACGGGAAG ATTCCAGGCC ATCTCCAAAA CCTCTTCCAT CTCCAACCTC TGTGCTGCTG 1740
AAGGTTCTGT TTACTTGTGA CCCTGAGAAG GGGATGCCCT ATGGGGGCTC TTCTGAGATC 1800
ATGCTGTCCA TTTTCCTGCC TCCAAGTGAC TTCTAAGACA GCATGGCTCT GAGGAAGGAG 1860
CACTGACTTG GGTGTTGGGA GATCACAGTT CCCATCTGAG CACCGTCACT GGCTTGCTGT 1920
GCTACCTTGC TTGGGTTACT TAACCTCTCT GGGCCTAAGC ATCCCTATCT ATGAAACCTA 1980
ACAACCCTGG TTCCAATGCT TTCCTAGAAT ATTGGGGAAG TGTCGGCTTT GAGTATACTT 2040
GACAAAGGCC ACAGATTGGG GGTGGGGTAT ATAAAAGTCT ACAGGAAGGA GAGCCCAGGA 2100
CTCCCCACTG TCAATATCTT GGTTCCCCAG CTTCTCTTCT TCTTGCTGAC CTCAATCTCA 2160
CTTGCTTTGG GTGGATTGAT TTCCTGACTC AGGCTCCAGG GCCATCAAGA ATTCACGGCT 2220
GCCTTTCAGC CTTCATGAAG GACATGGTGG AGCTCCTTAG GCAGAACTGG GGTTTGTGGA 2280
TGTCCTGCCT CTCTGCCCCT TGGTACCTAG GTGGCACCTT TTCAAGTTCG GGAGCTAGAT 2340
CCTTTCCCCT TCCCCACACT GTAGGAAAGT CCTTACTGTA GGCAGGCGCT GCAGAGCCTG 2400
CTGTCTGGGA ACCCACAGGT TCAAGGAAGC CTTGAGCAGG AAGGGCGTTT TCCTGGAAGA 2460
AGCCCTTTGT CGCTGGTAAT GGGTGCAGGC TGCTCTGACC CGGTTCTGAG TCCTGCCCCC 2520
TTCCAGGCCT AGGGCTTTGG GCCTTGATCA CCTCTGCTGA GTAGCTGACT GCGGGGCTGG 2580
GGCTCTGATG CTCAGGACCC ACCTCTCTGG GACCCACAGT CTTTTTCCAC TGTGGCGTGT 2640
AGTGATGTCA CAGGTGGCAG TGATGTCACT GTGGTTTGAG GTACTTGGCT GTGAGCCCCG 2700
GAGGAGGAAG TGTCTGTTCG CTGATGGGGG GTTGGAAGAG ATCATTGACT TCTGCCCCAA 2760
GCGTGAGCCC CAAGTGTGCA GGGGGGAGTG CGGGGGGAGG GCTGTTGGCG GCGCATCCCA 2820
GGGCTCTGGC TCTGCCCTTG CATCTAGCCT GTCTTTCCTG TGGGCTGTGA CAAGCCACTC 2880
TGCATCTCTG AGACTCCATT TCTTCTTCTT CTTCTTCTTC TTCTTCTTCT TCTTCTTCTT 2940
CTCCTTCTCC TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT CTCCTTCTCC TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT 3000
CTCCTTCTCC TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT CTCCTTCTTC TTCTGATGGA GTCTGACTCC 3060
GTTGCCCAGG CTGGAGTGCA GTGGCGTGAT CTTGGCTCAC TGCAACCTCT GCCTCCCAGG 3120
TTCAAGCTAT TCTCCAGCCT CAACCTTCCA AGTAACTGGG ATTACAGGCA TGCACCACCA 3180
CACCCGGCTA GTTTTTGTAT TTTTAGTAGA GATGGGGTTT CACCATGTTG GCCAGGCTGG 3240
TCTCGAACTC CTGACCTCAA GTGATCTGCC CGCCTTGGCC TCCCAAAGTG CTGGAATTAC 3300
AGGCGTGAGC CACTGCGCCC AGCTTCCATT TCTTCTTTGA AAAGTAGGAG GGGTTGGAAT 3360
TGTCACCCTG GAGGTTCATG GTTGCTAGAT TATTGATTCT GTTGCTGGAT TCAGGAGACC 3420
TGTTAGCTGG CTAGTTCACA GCAAGTATTG GGTGTTTGGA GGGGGGCTGC AGAGCCCCTT 3480
CTCAGGCCCC AGGAGGGCCA GCTGCCCTCC CTACCCCCTC TTTTGGACAC TAGTGGGCAT 3540
GTTCTGCTGG GAAAACAGAC AGTGTAACCT GACTTCGAGG GCTGCAGGCT GAATCTCTTT 3600
CAGATGTACT GGCTCCTTGA GAGGCCTAGC AGATCTCTAC TCTGTGGGTC CCTTTCGGAG 3660
CTGGGGCTCA GGTTTGACCC AGCCACTCTG ACCGGAGACA GCGCAGAAAT CACCAGGAGC 3720
ATTTGTTTGT TTTCCTTTGC TGTCCAGACA GTGGCCCACC GTCTGCTTCA GTCTGAGCGT 3780
GGCCCTGCAC TAGTGAGACT GATGTGGCCA CAGGTTCAGA GAATCAGTGC GCCTGAGTGG 3840
GAGAGCAGAG CGGGAGGGGA TTTGGAGGCA GGCGGGCTGT GGACAGGGAG GGGGGAGGAC 3900
ATCTTCCGAG CTGTCAGCGG GAGGCCTTCT TGAAGGTCTT TCAGGAGCAA GGCCAGAGGC 3960
CGTGGGAGTG GGCGGGGCCT GGGGCTGGGA GTCAGGGGTC TGAGGCCTCA TCTTGGCCCG 4020
GCCTCTGCTT CCGGGAGAAC TTGGCCAATT CCCTTCTCCT TTCTGAACCT TGGTGGCCCC 4080
AGCTGTCACT TGAGATTAGC AAGGACCTCC CTGGTCCCAG CAGGAGTGAG TGGCTTTGGG 4140
CAGGGGGTGG AGTGCAGATT GCACTGCCAC GTCACCCAGC TCAGAAGGCC CAGGTGTGGT 4200
CCAGCTGTGG ACTTGATTGT GAACTCCTGG GGAAGGGCTC TGGTCCTTTG CCTCAGTTAG 4260
CGGGACCCCC ACCAGTGCCC TGGGTGCCCC TGCTGGCCCC TCCTCTCGCT GACCCCAGCC 4320
CCAGTTTCTG GCTGCAACTC ACAGAGGCCC CAGGCTCCTG TGGCCCCATC ACCAGCAGCT 4380
CCTGCTGTCA TTTCCTGAGC CTCGCAAGCC CCTAATCCTG CTCCTTCCTG TCCTGGCCCC 4440
CAGCTCCCTC AAGCCCCACT CCTGCATCCC ATTCTCCCTG GACATCACCC CTCCCACCCC 4500
TTGGCTCAAT TTCCTTCCTG TCGTGGCTTG GTCCTTTGGT CATTGCCCTG GTCTTTTCTT 4560
GTCCCCTTCC TGATTCTGCC CTTCTCCAGG CCCACACGGG GAACCTCCTA ACCGCTGAGC 4620
CCTGAAAGGT AGGCGGGTTT AGGATGAGTG GCTACAGGGA GGAGAATGGT GTGGGGAGAG 4680
AGATATGGAG GAAAGAATAT TAGGGGACAG GCCGGGCACG GTGGCTCACG CCTGTAATCC 4740
CAGCACTTTG GGAGGCCAAG GCGGGCGGAT CACTTGAGGT 4780