EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS178-00129 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Skeletal_muscle 
Coordinate
chr1:8454540-8459140 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr1:8457948-8457959TAATTCAATCA+6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:8455317-8455332AAGGTCAGGAGTTCA+6.04
POU2F2MA0507.1chr1:8459035-8459048TTAATTTGCATTT+6.25
SNAI2MA0745.2chr1:8458908-8458918AACAGGTGCA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 42             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00045chr1:8452127-8460150Adipose_Nuclei
SE_02022chr1:8455562-8457961Aorta
SE_02685chr1:8453900-8455407Astrocytes
SE_02685chr1:8455412-8458882Astrocytes
SE_03407chr1:8456775-8457350Brain_Angular_Gyrus
SE_03947chr1:8455648-8458563Brain_Anterior_Caudate
SE_04978chr1:8455327-8458485Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06073chr1:8455339-8458577Brain_Hippocampus_Middle
SE_07042chr1:8455426-8457730Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07921chr1:8455522-8459037Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_11329chr1:8446106-8460302CD20
SE_18764chr1:8453940-8459116CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_23717chr1:8455522-8456365Colon_Crypt_1
SE_25808chr1:8455157-8458849Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27457chr1:8455422-8456672Esophagus
SE_27457chr1:8456762-8458594Esophagus
SE_29887chr1:8455420-8458317Fetal_Muscle
SE_31622chr1:8455468-8456548Gastric
SE_31622chr1:8456995-8457584Gastric
SE_31622chr1:8458108-8458675Gastric
SE_37218chr1:8454074-8459264HSMMtube
SE_39132chr1:8455453-8458614IMR90
SE_40658chr1:8455117-8459203Left_Ventricle
SE_42166chr1:8455452-8459030Lung
SE_44612chr1:8455413-8459062NHDF-Ad
SE_45170chr1:8454207-8458904NHLF
SE_45677chr1:8452328-8460198Osteoblasts
SE_47251chr1:8453660-8459514Panc1
SE_48103chr1:8455418-8458882Psoas_Muscle
SE_48600chr1:8455433-8459084Right_Atrium
SE_50481chr1:8455471-8458823Sigmoid_Colon
SE_51176chr1:8455007-8458926Skeletal_Muscle
SE_52016chr1:8454055-8455308Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52016chr1:8455374-8458830Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52725chr1:8455454-8458751Small_Intestine
SE_53408chr1:8455166-8459067Spleen
SE_54752chr1:8455534-8458192Stomach_Smooth_Muscle
SE_58576chr1:8455425-8501956Ly1
SE_60758chr1:8454848-8500160DHL6
SE_62661chr1:8450826-8509851Tonsil
SE_63725chr1:8453894-8455322HSMM
SE_63725chr1:8455410-8458900HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr184555358455974
chr184560118457893
chr184546558455368
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008393chr184539948459064
Enhancer Sequence
AGAAAACTAA AGCACAGAGA GATGAAATAA TTTGTCCAAG GACAGCGGGA GTGGAAAAGG 60
AATTCACACA CATTTCCGTT TTCCAGTAAT TTAACTTAAG AAAGGAGCTA CTGCAGAGAA 120
CAAACTTATC AGTCATGGAA TCCCACATCA CTCAGTGCTG GAGAGGGGGA ATGAGCAACA 180
AAAAAGTGAC AAATCATAAG GTCTGAGTCC CAACTCTCAG CCAGAGTCAC CCAATTGCTT 240
CAGAAGACTG TTACCCCAAG GAAATAAGAA AAAAATACGT TAACTTGCTC TGTAAACCAT 300
AAAATCCACT ACTAGTATAT ATATATATTA TATCTCCATG AAGCACTTAC CACAGTTACA 360
CTTGGTTTTT GTTTGCATTT CTTAGCAGGT GATTAATACT TTAAGGGGAG AGAAACTGTA 420
TTACTCATTT TTATATCCTC AGCATCTATC TAAAATGTCT TTCCCATAGA AACTCAAACG 480
TCTGTTGAGT GGTTGAGTGA GTAAATAAAT GTAAATAAAA TAAAAAAGAA AACATATTTT 540
AAGGGCCAAA CAGCCCAAAG GCATTCCATG AGGGAAGTTT GTTACTAAAC TTTCAGATAA 600
GGTGTCTAGT ATTTCCTGTA ATAAGATATT GTATATTCCC CTTCTCCTGC CCACAGAATA 660
AATCAAGTAC AAAGAAACTA AAAATAATAA TACCAAAGAA TGAGCAATTT CCGGGTCGGG 720
TGCAGTGGCT CATGCTTGTA ATCTGAGCAC TTTGGGAAGC CGAGGCGGGT GGATCACAAG 780
GTCAGGAGTT CAAGACCGGC CTCGCCAATA TGGTGAAACC CCATCTCTAC TAAAAATATA 840
AAAAATTAGC CGGGCGTGGT GGCACACGCC TGTAGTCCCA GCTACTCGGG AGGCTGAGGC 900
AGGAGAATAG CTTGAACCCG GGAGGCAGAG GTTGCAGTGA GCTGAGATCA CGCCACTACA 960
CTCCAGCCTG AGCAACAGAG TGAGGCTCTG TCTCAAAAAA AAAAAAAAAA GAATGAACAA 1020
TTTCCTCTTT GGTCTTGTCT GCATAAAAAA GGAACCTCTC CTGCTCAGCT ATGCAGGCAC 1080
CTGGAGACAT TTGAAGCTGG AGGTAGGAAA AAAAAAAGGT GAAGGTGAGC TTGACCTAGA 1140
AGGGCAACTG TGAACAAGGT GCTTTGAGGA AGCAATGTCA AACCTGTGTG GACCTTTTTG 1200
TAAACAGGTT AATTTCCTAA ATTCTTTTGT GGGAATATAA GACATCCGTG TTTCTAAAAC 1260
GGGAGAGGAG AGGAAACAAA AACCAAAACC AAAACCACCA CCATGCACTG AAGGCCTGCA 1320
GTGGGGGCAC AGGAGGAAGT ATGAGAGGTT CCATGCCTGA GTTGTGATGT TTGCAGAGAA 1380
TTAGCCAGTG AGAGTGCCCA AGGAACACGG GAGCACAAAT CTGAGAAGGA ACACTCGAAC 1440
GAGGACCAAT TCTATTATTA TTATTCTGCT CTGTAAGGCA TAGGTGACAC CACCCCTCTC 1500
TCTGTGCTTA AAGGACAGCC ATTCCATTAA CTACCCACCT TGAATGGATT CCAGAGAAAG 1560
ACTTTGTTCC CCAAGAAATA TTAGCAAAAG CCTTCAAGCC AGGGCTAAGA GCCTTAGTGA 1620
CAAGTGAGAA GGCACAGAAC AACTGAGCAG AGATCATCTC TTGAAAACCT ATGCTAATTA 1680
TCCTGTTTCT ACCATCAGGA AAGTGGGAGG GGGGAAGGGC TGCTGTGCTA TCACTTGGGG 1740
TCCATTCTGG GGTCAAATTT GAATCCCAGC TTCTAGAGCT GAATTCAATG TGGAGTTTGT 1800
TGTCCATGCC AAAATTCAAA GGCTGATCAA GTTGAAGAAC GTGACATGGA CATAATGTGA 1860
AGTACATGAA AACTCACATA CAAAGTACCT GCCCTCCTGG AACCAGTCCC CAGTTATCAC 1920
AGAGCCGAGA GGAAACCAGT CCCCTATTAT CAAATCCTCT TACTCTTGAC TAGAGTGATG 1980
GAATTTGGGA AGAATGCAGC AGACTTCTAA AGACTGCTCA GCTACAAGCA GGATCTTCAT 2040
CTCCTTTTCA GCTGTGGATA ACAACGGAAG CAGTCAGCCG TCTAATAAAT CAAGTTTAAT 2100
TTTAACAGCA TGAAGTATTG CCCGCTTTGT AATTATACTT CCAAAGGTAA AACCCAACTC 2160
GAATTAACTT AAAAAAATTG TTATTGAGGT AAAATTCACA TAACATAAAA TTAATCATTT 2220
TAAAGTTTAC AATTCAGAGG CAGTTAATAC ATCTACAATG CGTGCAGCCC TCAGATCTAA 2280
TTCCAAAACG CTTTCATCAT CCCCCAAAGG AGACCCCTCC CCCTCATTAA GCAGTCAAAG 2340
TGAACTTTTT CCACAATGGC ATTCTTTGTG ATATATCATG CTTTCTCCAC AGTATCAGTT 2400
TATTCACTTT CAACAGCATC TTTGCATTTT AAAGGTAAGG GAAAACTCAA AGGACCATGA 2460
GAACTAACAC TCACAAATGT GCTTTCCAGT CTACCACGTG ACTGTATACA CATCTGGTGA 2520
GACAGTTATC TCAGGCAAAA TGTACTGTGT GTCTTCCCTG GGAGGAGAAA CAGGAGCTGA 2580
TTCTAATGGA ATGTTTACTA TGTGACAGAT ACTGAGTCAG AAACAGCACA GCAGCTAAGA 2640
CTGGGTGCTC TGCAACCACA CTGCCCAAGT TCCAGTTCCA ATTCAGTGTG AACTCTGTGT 2700
TCTTTGGGCA AGTCATCATA ATCTCTCTGC CTCCTTTCTC TTCACACGTA TTGTGATGGC 2760
AACACCACCA CTTGCCTCAT GGAGATGCTA TGAAGGTTAA GTAAGTTCAA GTGCTTAGAA 2820
CAGTGCCTAG TGCATAATAA GAGCTCAATC ACTGCTGCCT TATTCGACTT TCACTACGAC 2880
TCTGAGGGAG GTTCTATTTG TGCCCCCATT TCATTACTGA GGAACTTAAA TTTTACAGCA 2940
TCTAAGAGAC TTACCCCAAA CCCCCAGAGA ATAAGTGGGA TAGCTGGGAT TTGAACTCAA 3000
TTCTGAGTTC TGTTGGCTTA GCAACCATTC TGTAAAATGT ACCAAGGAAC AAAACCTTTC 3060
TGATCCCAGT TACCAAACTC ATGTTGAGCA AAATCACACT CACACAGGAA AAAAAAAAAA 3120
AAACACATGA AACTGTCACC AAAATGGCAA TAACCCAACT GTGCTACAGT TTTATTTCCT 3180
GCTGGCTTCT CAGTTCTCTA AGCCTTGAGG ATCCACGCGC CTTAGACCAT TATTACCTCC 3240
TCCCCCATAT GCAGTAAGTT CCTGACTCTT CTGATCTTTC CTGTTCTTAC TGGGCACCAT 3300
CCCCCAAGAC CTTCTGCTAT TTGTACTTTC TGATTTCAGG CTCTTTATTC TCTGATACAC 3360
ACTGTTGCCA GAATAATCTT CAAAAAGATT GACTGCAACT TTCAACTTTA ATTCAATCAT 3420
ACAAATATTT CTTGAGCATC TAGGTGCAAG GCACCATGAT GAAGATAATG TGAGTAAGAC 3480
AGTCCTTGCC TTCAGGAGCT CAATCCAAAA AGGGAGGTGT AAGATAGAAT TTCATAAGAC 3540
AATGCAGAGC CAGAGAAAGG CCCTAAGAGA GGCATGATGT TCTACAGGGG TATTCAAAGG 3600
ACAGAGTTAT ATCCTCCTCA GATTAGAGAA AGATTAATGA AGGAAATTAA GTTTAAAAAT 3660
GTAGAGCATT TCCACATGGA GTAACAGAAG GGCAGGCATT CTGGGCAGAA CACTGCAGGA 3720
AGAAATGGCA GACAGGAAGC CTGAGTGTTT GGCAAGGGCC AGAGGTGCAG AAAGAAAAGC 3780
AGTAGGGAAG GGGCTTGGAG AAGCTGATTT GGACCACAGT ATAAAAGGTC TTGACTCTCA 3840
GGCAAGGGGG TTAGTACTGA GTGTGGCTGA TGAAATCTCC ATAGCTTTGC TCTCCTGTGT 3900
GCTTTGCTCA GGGTTGGTTC TCACCATCTC CCCATCACTC AAGGCCTAGT TCAAGTCTCA 3960
GCTTCTTCCT GACGTGTGTC TTGACCGCCC CAGTGTAAAA TAAGATCCTC TTCTATTAAC 4020
AACGACCATC TCTACAATTT ATTTGGCAAT TAATCACGTA GTGCTTCTAA CATCTGTTAT 4080
CAGTCTTAAA TGATTTTTCC TTTTTCTTAT TATTTATCAT GCGTATTTAT GTTTTGACTC 4140
CCCAGTGAAG TATTCACTGA ACTCTAGTGT GGGGGAGGAG TCTTCCCCAA CTCTGGAAGA 4200
TCACCAGAAA ATACGCAGCC TAAAAACAGA TTTTGTCAGG TGACTCTGAT GACCAGTTGG 4260
GTATGCAATC CACTACACCC ATGGAATCTG GCACAGGGCC TTGCTATACA TCGAAAAATT 4320
TGCTATTTTT ACAGGTATCT GTGATTTTCA CTTCATATCT CAACAACAAA CAGGTGCATC 4380
AATGTGCGCG GCCACTAGGA GTACATGAGA GTACCTGCTT TTCAACAACC TCACTTCTAC 4440
TTAGAACTGA TAAACTTTTT TGTAAATATA ACGGGTGTGA AGTAATATGT GTATTTTAAT 4500
TTGCATTTCC CTGTTAGTGA GGCTGCAAAA CTTTGCAGAC TTTTCAGATT TTCTCAGCTA 4560
AAACTACCTG TTCTCATCTT TCACCCATTT TTCTATTGAA 4600