EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS178-00034 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Skeletal_muscle 
Coordinate
chr1:2201440-2206970 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs4648819chr12204790hg19
rs12045693chr12205581hg19
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GLI2MA0734.2chr1:2205823-2205838CGACCACCCATGACG+6.66
Klf1MA0493.1chr1:2206850-2206861TGGGTGTGGCC-6.62
MYBMA0100.3chr1:2206125-2206135GACAGTTGGT-6.02
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:2203545-2203560CGGGTCAAAAGGTCA+7.44
RARAMA0729.1chr1:2202086-2202104AAGGTGAAAAGTTCAGGC+6.61
RARAMA0729.1chr1:2203545-2203563CGGGTCAAAAGGTCACTG+6.66
RREB1MA0073.1chr1:2205304-2205324CTTGGGTGGTTGTGGTGGGG-6.16
TFAP2CMA0524.2chr1:2202307-2202319TGCCCCAGGGCA-6.44
TFAP2CMA0524.2chr1:2202307-2202319TGCCCCAGGGCA+7.22
ZEB1MA0103.3chr1:2201651-2201662GGGCAGGTGGG-6.14
ZNF263MA0528.1chr1:2202164-2202185CCCTCCCGCTTCCCTTCCTCT-6.28
ZNF263MA0528.1chr1:2204648-2204669TCTCCCGGCCCCTCCTCCTTC-7.27
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_11303chr1:2205480-2208750CD20
SE_17322chr1:2201358-2202641CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17322chr1:2202905-2205200CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17322chr1:2205669-2208727CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18345chr1:2201742-2202650CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19191chr1:2201651-2202804CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19191chr1:2205658-2207017CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_31962chr1:2201550-2203069Gastric
SE_31962chr1:2205985-2208669Gastric
SE_41586chr1:2201365-2203621LNCaP
SE_41586chr1:2204609-2205679LNCaP
SE_41586chr1:2205875-2206796LNCaP
SE_46124chr1:2201321-2202610Osteoblasts
SE_46124chr1:2205845-2207065Osteoblasts
SE_68719chr1:2201457-2203804H9
SE_68719chr1:2204755-2208710H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr122025372203842
chr122015842202424
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I002270chr122014392203406
GH01I002272chr122034392204040
GH01I002273chr122042972211950
Enhancer Sequence
CTGTGGCTGG CGTGGGTCTG GCGGGTCTGG CATGTTTGGT GGTGCCTGCC ATCAGGCTGC 60
CGATGGATGA GCCTGCCTGT CCCCCACGGA TTGGAGTTTT GCCCAGGGGT GCTGTGCCCT 120
GGTCATTGTC CCCTACAGCC AGGCAGTAAA GTGTGGCCAG CACCTTGCTG CAAGAGAGGG 180
ACAGAGGTCA TCTGTCTACG AGCTAGAGCA AGGGCAGGTG GGCCCACTGG CTGGCGCTGC 240
GTCTGGGTTC GGTCCTGGAC CTGCTGCGTG TTATCCTCCC TGCGGGCCTG GCATGGGAGT 300
AGGGGCTGAG AGATGCTGGT GACACCACTC TGACGCCACG GCCTGAGGCA GCCGTTGGAC 360
AGTGCCCATC TTGAATGCAG CCCTGGTGAC CTGAAGCCCC TGCGTTGGTC CCTCACAGGC 420
CAGGGGGTGT GGCCACAGGG CCTGGGCTTT GTCCCGTTTA CGAGAGGTCA GGCGGTCACA 480
GGGTAATGGG AGGCCTGTGG TTCCTGGGCT GCCATCTGGC GATTGTAAAA CGGGCAGTGT 540
GCAGTGTTGA GGGGGCGCTG GGGAAACAAG CTGCCGGCTG AGGAGGCCGC ACTCCCCGTG 600
CCTCCCGGGC AGACACCTCA CGGCCTTTCT CTGGGTGTCT GAACCCAAGG TGAAAAGTTC 660
AGGCTGTCCC TGCTCTCCAG AGGGGCTGGA GGTGGGGCGG GAGCAGAGAC TGGACCTGGC 720
CAGCCCCTCC CGCTTCCCTT CCTCTGGGCC CCTGGACTCT GGGGGCGAGG GCAGGGCTGT 780
TTGGCTGTTG GACATCCTTG CTGTCCCTTT GCTGGACTCT CCAGAGGACC AGCATGGAGG 840
TGCACAAGTT CACATTTGTC CCTCTCCTGC CCCAGGGCAC CTGGCCCTGT CCCGGGCCAC 900
CCCAGGCTGG ACCAGCTGCC CATGTCACCA GGCCAGGCGC TTTCCCTGTG AATGAGCCGA 960
TGGCCGCAAG TGCCTGGCCT CAGGCCTGGG CTGTGGGGAT GACTGAGGCC CAGTGAGGAG 1020
TGGGCTGGGG CCTGGTGTGA CCTGCACGGT CTGTGGGGGT TGGAGGGATG CGCGACTTGG 1080
GCCCACCCCA GAACTTGGGG TTTCCTGATG GGTGTTGGGG TGCACACAAG CCTGGGCTCC 1140
TTTGTGATTG GCGACCCCAG GGTCCCGGGA CAGTCCCTGA GAAGCACAGA GGCCTGGACA 1200
CTCCCACCTC CCAGTCAGGC CCTGCCACAT CCTCCCTGAT GGCTCCAGGG GCTTTTGTTC 1260
ACTGAAGAAC ACTTGCTGTC CTCCCCTCAG AAGAGTCTGC TCGGTGGGGG AGCCGCAGGG 1320
GGCTGCTCCC TGTCCAGGCC AGAGAAACCA GGCAGCCTCT CCCGCCGGGA GAGGTCCCCC 1380
ACAGGAGCCT GTTATGGAGC CGCGTGGCGC CTGGGCTGGT GTCACCCCTG GGAGCCCCCT 1440
TTTAAAGAAG ACTCATTCAA TGTCCCTCTC TCAGACGGCC TCCAGCGTGG CGATTAAGCG 1500
CTCAGATGCT GGCAGGTTCC GCGGAGTGCC CGGCTGCCCT CGGCAGGGGC TTTGTGTTGG 1560
CTGCCCTGCC CCGGGCTGAC CCCAGACGCT CGCCTTTTGT GCTACGCTGC TCTCGCCCCT 1620
CGGGAACCTT TGTCCCATTG AGCCCCGCCA TTGCCTGGGG CCCCTTGCCT GTCCCTGCGG 1680
GCCCGCCCCA GGGCGGGGAT TGTGGCCCTG GTCCCCTGGG GGGGGGTAGG GGGCTTTTGG 1740
TGGCCTAAGG GGACCCTCTG AGCACTCATG CAGGCCTCCC CCCAACCTCA CGTCCAGGTC 1800
TGTTGCCGAG GGGCCAGGAG ATTCTGACAT TGTGCGATGG CCCCAGAGGT TGACATCCTG 1860
GGGAGGATTG GCTGGTGATG CTTCCAGAAA GTGGTTTTTG AAGATGCATC TGGTCCTGGC 1920
CCGTGGATGG CTGGCGGGAC TGGGAGAGAC ACTCCGGGCC ACTGGCTGCT TTCTCGCAGC 1980
TGTTCTCCTC TGGGAGGACT TGCCCCTGTG GGCAGGTGCA GGGGCACTGA GCGGAGGGGC 2040
TTGGGGGCCC CTGCCCGCCC CAGGCCACCT TGCTCTCTCT CCAGGCCTGC GTCCTGCAAA 2100
GAGGCCGGGT CAAAAGGTCA CTGCCCCGAT TTTTATTGCT GTCTCTTACG TTCTCACGAC 2160
CTCTTGCCCT CTGCACAGAT GGGCGGGGCT GGAGCTTCCA CGAGGGCCGG CCTTTCCGGG 2220
GATTAAAAAC CCACTGAAAG GTCTGAGCCT AGCTACCAAG CTTAAATGTC TTAGTAGCTT 2280
AAAAATGGTG TTAAAAATTA AGCAAAACAC ACATAGACTT CCAGGTTTAG CATAAATAGA 2340
AACCAGAGGT GTTGAGACCG TGCTGCCCCC TCAAACCAGC GCAGTGGAAA GAGGGGCAGA 2400
GCCCTCCACA GGAGCCCTCC GCTGGGGGGT TGGGGAGACG GCCCTGGCCC AGCGTCTGCA 2460
GCTCCCAGCG GCACTGAATG GCAGTGGCCG TCCCTGTGGT CTGGGGGCCT CCTTCCCCCA 2520
CAGGCTACAC AAGCCCTGGT CCTGCCAAGG CTCGGGGAAG CCCTTTGTGA CTTTAGAAAA 2580
ATAATAATGG AGGGTGAACT GGTTCCTATT TTTGCATTGT AATTGATTGC CAAGAACCCC 2640
TGAAATTAAA TACAACCATG TATTTTAAAT GGTGTCCTTA ATGTAGAATG TTTTTATCAA 2700
AACCAAAACT CCCTGTTGAG GCCTTAGTGT TCTGTCAATA GCGTGTTGGA GTCTGGTTCC 2760
CGTCTCCCCT GCCCCGGCCT ATGTGTGCTG ACCCTGGGAC CGGTGAGGCA GTTCTCACCA 2820
CGCCCCGAGC CTCCCCCTCC CACGCCCCGA GCCTCGCCCT CCCACGCCCC TCCTGCCCCC 2880
GAGGCTCGCT GGCGTCTGTG CTTCTTCCAG GCGGAGGGGG AGGTGGTAGG CACCTTGGGT 2940
CTTAAATCAG AGAAACTGTC CCAGCAGTAG TAAAAGTCAT CAGCTGGCCC CAAAGAGCCC 3000
CTGGAAACAC AGGCTGTACC CCGCCTCCAT GGAGACATTT GGTGCCACCT GCGTTCAGTG 3060
CAGATGCCAC ACGGCTCTTC CTGAGATGGC TTCCGAGGCC ATTTGGCCCT TCATCTCGGG 3120
AACAGACCAA GGGGGTGTTT TCGGCCGTCT GAGACCCACC TGGGGGTGTC TGGGCCTTGG 3180
CCATGCTGCC TTCTCCAAGC CCCATGCTTC TCCCGGCCCC TCCTCCTTCC CACTGGCGCC 3240
GGAGACCTTT GGTAGTGGGT GTGGAAAGAC AGCAGCTGTG GGGTCCCTGT CCTGGCCGGC 3300
CACTCCTCCT TCCCGCCAGT GCCGGAGACC CTCGGAAGTG TATGTGGAAG GACAGCAGCT 3360
GTGGGGTCCC TATCCTGGTC AGAGGGTGGC ATTCCTCCCA CAGTCCTGGG AGCCACAGGG 3420
CTGAGATGGG ACTTCTCAGC TTGGCATGGG GAGGGCAGGA CGGGGTGGCT GCCATGCCTC 3480
ATTCTGTCTG TGATGGAAAC GGGAGGGCCT GGCCCTGCCT CTGTTACTGA GCTTGAGCCA 3540
GGGACACCCG TGACCCTGCC TGGGGCGGTC CTCCCCAGCC TTGTGAGCCA GGGCAGAGGT 3600
GCAGGTTGGG TGGCTGACCT GGTGGGGGGT AAGAACATCC ACGGAGAAGT GTGACGAGTG 3660
TGCGACCAGA GTGTGGACCC AGCCAGGAGG CCTGACCGTG ACTGCAGCCT CCCCCAGCAT 3720
TGCACCAAAG TGTGCTCGTG CAGGACCTCG AAGATGCCCC GTGGGCAGCG TTCGGGCTGA 3780
GGCTGCAGGG GGCCTTGGGA GCACGGTGGC CCTCCTGTCT GTTCTGTGGA CCGGGTGCGG 3840
ATGGGCCGTG CAGGCAGACG TGCTCTTGGG TGGTTGTGGT GGGGATGCCT CTCCGCCCAC 3900
CACCCTCTCA CTCACTGCCC TGGCTGGAAG GTGACGGCAT CTCCCTGACC GGCAGCGCCA 3960
GGATGGCAGC CCCACAACAG TGTCCTGGTC GCCCCAGAGG CATGCTGAGC GCCCATGCGT 4020
GTGCGCAGGT CCTACGGGCC GTGTCCAGAC CCAGCCCCGG GGTCAGGTGA CACCTGTAGT 4080
TGGGTGAGCG CTCACACAGG CACCTCCAGG TAAGGGGGAT TGAGGAAGGT AGCGCTTTGT 4140
CAATGGCACT GGTTTTGCTC CGAGGCTGGA CTCCTTTTCC CTTTGAGGAG CTCTGCTCAT 4200
GTGCTTTGCC TGCTTTCCCA TGGCAGGCTT TTTATTGGTT AAATAAAGAC ACAAACTTTT 4260
CATCAGTCTT TGCAAATACT TGGTTCCGGC AAGTTCTTGG CCCTTCCCAG GCTTGGGGCT 4320
GCCGGCTCAC GGTTCTTCTC TCTGCATTTC AGCCAGGCCC CCATATGCTG GGTTTGCAGG 4380
TCACGACCAC CCATGACGGC TGTGCTGCGT GGGGTGCAGT TCCCCGTGGG CGCCGAGGGT 4440
GGTGTGGGGC TGCCTCTCGC TCGCTCCACC AGCCACCCGA GGGCCCGTGT CCTGGTCGTG 4500
GCCGCGTGTG CTCTGCTGTG TGGGTGGTCA GTCCTCCCCA GGGGCCACCT GGATGGTGTC 4560
CACTCCTGCC CCATGGCAGG AAGTCCCAGC GGCACCTGGC CACGTCCCTC TAACATGTTT 4620
CTGGAAGTGG GATTCTAGGC TGGAGCCTCA TAGCGGGCAG ATACTGCCCC CTGGCCATGA 4680
GCCATGACAG TTGGTTGATG GGACTTGAAG GGGCCTCTGG ACAGTGTGGC TGCAGCCCTG 4740
GACCCTAGGA GAATAGCAGC CGTGATGGGG GGCAGGGACC CCACTTTCTG GGTGGGAGTG 4800
AGGAGGGCCG GCTGCTGCCC CTTGCTGCAG TCATCTTCAG TCACTTTCCC GGCCGCCACG 4860
GCCCCCTCCT GGCTTCTTGC TCTCAGCAGA GGGGACAAGA CCCTTGTGAG GGTGGGCACA 4920
GGCACTCCAA TTGTTTGGGG CCTTCGCTGT CCCTTGCTGT CTGTGCTGGT CTTTCCAGGC 4980
ATCCCCAGGC CGTGTGTGTC AGCAGGTGGA GGCTGGGCAC CTCTCACCCA CCCAAGCTGA 5040
AGCGGCCTCA CAGGGGGTGG CACCAGGTGT TTCTCCAGCT GAACAAGCTC GCCCTGGAAC 5100
CCCCACCCTG AAAGGGCTAC TGCCCCCATG AGAGGAGCTT CTAGAGATGG TGGCCAGCCT 5160
TGGGGGCCCG GTGGAGATGT GTTCGCGGGG TCCTGGTCTG ATTCTGTCTT GGAAGGAACA 5220
TCGGGCCCCT GAGAGGTCAG AGCAGTGGCC GGCCCACGGC TCCGCTCAGG CGCCACGGCG 5280
GCTCCTTTCT GTTTCTTGTA GTCACTGAGT TCGAGGTTCC CACAGGGAGG AGGCTTCCTG 5340
TGGCTCCGCC GTCAGGGAGC AGTGGGGCTG CCCCAGCCTC TGGGGGCTTT TTAGGTGCTC 5400
TGAGGCGATC TGGGTGTGGC CTGGCCGGTG TGGGCAGCTT TGCCCTTCGT CTGAGACCCC 5460
GAGCCCTGGG GCAGGATGAG GGGTGTGGGG AGAGTTTGCT TTTTCCAGAG ACGTTTATCT 5520
GTTTTTTTTT 5530