EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS178-00028 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Skeletal_muscle 
Coordinate
chr1:2168050-2172870 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESR2MA0258.2chr1:2168620-2168635AGGACTGGCTGACCT-6.32
HNF4GMA0484.1chr1:2170044-2170059TGGACTCTGACCCCT-6.04
Hnf4aMA0114.3chr1:2170042-2170058TCTGGACTCTGACCCC-6.58
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:2168072-2168087TGACCTCTTGATCTG-6.43
POU2F2MA0507.1chr1:2170560-2170573ATATGCAAATGTA-7.12
RREB1MA0073.1chr1:2171930-2171950TGGGTGGTGGCGGGTGGTGG-6.01
TCF7L2MA0523.1chr1:2168823-2168837TTCCTTTGATGTCA-6.42
Number of super-enhancer constituents: 15             
IDCoordinateTissue/cell
SE_05718chr1:2168186-2170889Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07454chr1:2168407-2170347Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08491chr1:2168106-2170220Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_17322chr1:2160103-2173005CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17845chr1:2160096-2171778CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18345chr1:2167890-2170116CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18345chr1:2170979-2172713CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19191chr1:2168049-2169741CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19191chr1:2171164-2172797CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_41586chr1:2168255-2170572LNCaP
SE_41586chr1:2170716-2172069LNCaP
SE_46124chr1:2168347-2170095Osteoblasts
SE_46124chr1:2171012-2172606Osteoblasts
SE_62490chr1:2120386-2191742Tonsil
SE_68979chr1:2168150-2170665H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr121718242171946
chr121721422172385
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I002237chr121686402169494
GH01I002239chr121711252172449
Enhancer Sequence
GGCCAGGATG GTCTCCATCT CCTGACCTCT TGATCTGCCC ACCTCGGCCT CCCAAAGTGT 60
TGGGATTACA GGCATGAGCC ATTGCGCCTG GCCATTGTTC CACCTTTGGA AGAAATTGGT 120
TCACCGTCTT CTGACCTGGG GGGCGCTTCT ACCCTGGTTC CATATTGAGG GCTGGGAAGT 180
TGCTGGAATA TTATTACCCT TGGCTGGTGA GGCTGAGTGC TGATGCTCCT CCCAGCTCTC 240
AGCCCTGCCT GGACCAACTG CGGCTTCTGC TGGAACGTCG GCGGCTGACT TAGAAAGAAA 300
CAGCTCCTGT TCTAGGCTTC CTGCAGGTCC CACGGTGCTG CTTGTTTCAG AGAAACGCAG 360
CTCAGGCTGG CGGCCTCAGG TGGGCATGGG TGGCAGGGGA TGCCATCACC CAAATCAGGG 420
ATCTTTCTCT GTCCTGAGGG TTCCACCCCA GGACCCAGGG CACTAACTGG GTTCTTGTGT 480
GGCCCTTCCC GACCAGACCT GACCCCTGAG CTGCGTGTGT GAGGTGATGG TGACTCCACG 540
ACAGCTTGTG TGCCGTTATG GGGGCACCTG AGGACTGGCT GACCTCACCG GGAAGTGCGT 600
CAGGAGTGGG TGAGGGGTGG TGGGAGGGCA GGGAGCGCCC AGCAGGTGTC CAGCGGTGCT 660
GGCGCTGCCT CTGTCTCTCT GTCCACGCCC TGTGTGTATC TGGAGTGGCT TAGGTGCTCC 720
CTGCGGTGCT CCTGGCTGCT GTGGTTCCTG AAGGCTGCGG CTGTGCCGGT GGTTTCCTTT 780
GATGTCAGTC TTCTTCTACA GGGGAAACCA TGTTGCCAGG AGAGCCAGGT GTCCGCTAAT 840
TACGTTGTGT TGTTCTGCCC AGGAGTGAAC CTGTAAGTGA TGAGAATAAG AAGCGGCTGT 900
CAGCCTGCAG ACCCGCCCTC ACCCTGTCCT GGTTGGGGTG CTGCCTGCTG GGAACCCCTG 960
GTCCAGCTGT TGAGAGGAGG CTGACTGGGG GCACAGTTGT TGCAGAGTCT GATGCAGGCT 1020
TTCTCTGCCG GGAAAGTAAC ATGGAAACAT TGTTGCTTTT ACTATGGAGC AGATGTATCT 1080
TTGCCCAGAA ACAGAAATGC TCTTGGTTTC TTTTTTTGGA AATAAGGCCC ATAGGCTGGG 1140
TCCTTCTTGC CCTGTTGAGG GAACGTGTCT GTCCTTAGCG TGGAGGCCAG TCTGGCCGGG 1200
TGCTGAGCTC GTCCTGCAGA ACACGCGTGA ACGCCTCATC CCTGAGGGCC CCGGGAGGCT 1260
GGCGCCCTCT GTGGGAGGTC TGAGGTTGGC CCATTTGACC CTATCCAGGA CGGGTTACTT 1320
AAGGAGTCCA ACGGGCCTTG AGAGGCTGAT CACCCTCGTG TGGCGGGCGT CTCTCCCCGG 1380
TGCCCTCCCG CCTGGTGCTG TCAAGGGCTT CTCTGTGCCA GGCGCTGGGC TGTGGCAGCC 1440
CCAGGTCCCC GCCTGGTGTG GCTGCCCACG GTCCAGGCAG CTCCAGGGTG GGCATCCTTG 1500
GCTCCCTCCC TCACCAGCTG GCCCTGGGAG GTCTGTCTGA GAGGAGTTAG GCCTCATTGT 1560
CCGTGCTCAG AGAACCCGAG CCTTCCTTAG GAAGCAGTTT GTCCCCGTGC CTCCCTTCAG 1620
GATCCTGTGG CCTGAGAAGC CTCTGCGTGG CAGTGGATGG CAGCTCCAGC TGCCCGTGGC 1680
CCTCTTTTTT TATGGTTTCC CAGATGACTG GGCCAAGCTG GGCCTCTGCA TCCTAGGCAT 1740
GCTGTTCCCT GCGCTTCCCT GGAAGGTCGG CGGCCCTGCG TGGACCTACA CGGTACCCAG 1800
GACAGGCCTG CCATGGCACC GGTTGGGCCT CTGGGCACAG GGTGCTCTGC CTCCATGGCC 1860
CTGACAGGCT CTGATGCCTG AGGATGGGGG CCGGGCACTC CCAGCCTTGA GACTTCCCTC 1920
TGCAGAGGTG GCACAAGCCC GGGGCCCCAG AGTGAGGGGA CTCTTGCCTG CCTGGTGAGG 1980
GTGAGCGTGG GGTCTGGACT CTGACCCCTG GTCCAGGCGG GAGAGGAGCA CACTGGACAG 2040
GGCAGCCGAG CCACCCTCTG CGGAGCTGTG GACACTGCGT GTGTGGTGCT GAAGGTGTAC 2100
ACGTCCACTG AGGCCACCTG CGCCGCTGCC TGTGTCCTGT GGGCTGGCAC TCACCGAGTG 2160
AGAGCTGTGT GCAGAACCTC CGCTGTCAGC GGGCCAGGCC ACACTGGGGA GGGAGGTATT 2220
CCGTGTGCTT GCACTGAAGC CTGCCCCAGG CTGCCTTCTG GGTTAGGGAT ACCCAGGACC 2280
TCCATAGCTG GTGTGGCGTC TGTGAGATCT CAGCTGCTGC TTCCCTGGAC GCCCGTGTGG 2340
ACCTGGAGGG GGGTGGGGAC CCGGCCTGGC ATGGTCCCTG GCCACCTGCC TGGTGCTCCG 2400
GGTTGTGCCG TTGGCAGTGC CTTCGCTCTG CCTCACCTGC TGCCTCCGCC TTTCCTGGCT 2460
ACAACCCTGT TGCCCAAACC ATTAAAAAAA TTATACTACC AAGTTGAATG ATATGCAAAT 2520
GTAGTCAATT AAGCGAGGGG ATTTTAATTA GCAGTTTAAG TTCATGTGTG AAGTGCCTTG 2580
CCTTAATTAC TTGACAGTTT TGTTGTAAAT TTGCTAAGTT TTTTTTTGCA GAACTATCAA 2640
AACTGTGATT TTTGTTAACA TTCTTGGATG CGGTGAGTGG CGCCCAGCTT GCCTGACCCT 2700
AGTGGGTTTT GTCTTAATTT ATAAAGCTCT TTAAACTGTG AAAACAAGGT AAACCCCCTG 2760
GGTTGCCTCT GTGTGGCTCT TCGAGTCAAG CCGGGCTCGA TGTCTTCCTT GTCACTGGCT 2820
GGGGTGGGGA CCTGCCTCGT GCGTGGTCTT GAGCTCCCGT TGGGGGAACG GGAGAACCTT 2880
CATCCCATGT GGGTGTAGCC GTTGGCGGCA CCTTTGTACG GGGACACACC CTGGACCTGA 2940
ATGGAGTCAG GAAGGGTTTC AACCTGGATG GCCCGCGTGC CGGGGACCCG CAAGGTGTGC 3000
AGTGGCAAGG GCCGGTCCTG GTGGCGGGCT CCCTGGTGAT GCTGGTGGAT GGTTGTGCGT 3060
GGGCCTTGGG GTTCACAGTT CAGTTTGGGA GAGGCGAGAA CCCCTCACTT TGAAGTCTTT 3120
CCTGGCCAAC GGGAGGCTTC TCAGAGCAGC TTTCACGGCT CCGGGGCTGA GTGAGGCCTG 3180
TGTCTAGGCT CATCCTGCCC TCCGGGGCGT CCCAGTGTGC CTGGGCAGTG GCGCAGCTGG 3240
CTCCTTCCAC TGGGTTTAGG TGTGCTTCTG CTCCCCACTG CTGCTTCAGC TGCGTCCTTT 3300
GCGGGTCCCC GTAACTTCAG TGCCCCCACC CCTGTTCGGT TCCCTGACTG AGCTCGGCGC 3360
CTCTAGTGTA GATGGGTTTT TAATTTTCCC AGCTGAACGT CGTTATTTGG ATTGTGATTT 3420
CTTTGGTGTT TCAATGGACT GTAGATGAAG GAGGACCTGT TTTCTCTCAG GAGTGTCTGT 3480
GGGGTCTCTT GTCCTGGTTT GCTCAGTGAA GTGTGGCCCC AAGGGCTGAG GGAGGTGGCC 3540
AGGACCCCGC AGGGTGGCCC CCACCACAGA GGCTGCTGTC CTCCGGGTTC TTCTCCACTT 3600
TCTGGGACCT TGGCCGAGGA GGCCTCTGGG AGGGTGAAAT GGCCACAGGC CTGGAGAAGC 3660
GACACCGGTG GGAAGCCACC GGCAGAGAAG TCAGGGAGGA GGGAGTCCTG GGCCTGGAGG 3720
AACGTGGGAG GGGCAGGCGC CTCCTAGCAG CCTCAAGAAA TGTGGGCCAG GCAGGTCTGG 3780
CTACGGGCAG GAGTGTGTCT GGGACTCTGA ACTGCCAGAA GCACTTGGCG GCAAGCCACA 3840
TGCTGTCACA ATGTTGCCTG GCCCCCATGA GGAGGTCCCG TGGGTGGTGG CGGGTGGTGG 3900
CTGGTTGTGG GGCAAGGCTG CGGGACTGGG ACCGCTGGCT TCCTGGGGCC ATCGAGGCTC 3960
CCAGAAGAAG AAATCAAGAG GATTTTAAGA AGCAGAGTTC TCTTTAGCCC GAAGTAACCA 4020
TACAGCATTA ACAAGAAAAC TTGGAATTCT TCGAAGTGAA GCTCTCTCTA CTTGTTCGGA 4080
GGATGGAGGA CAGTTCTAGA TCCAGGAGAG CGGTGGCGCA GACACGGACT TCACCCTTGG 4140
TGGGAGGGGA GAAGCACAGC ATCCTGTTGT TCGTGAGTCA GGTGAGAGGC GCGAGAAACC 4200
ACAGCTCTTA GGAAAATCCG TGCTGCCCAG TGTGGGGGCC GTCCACAGCC CTTCGGCACT 4260
GCTGGGGAAG TGGCCCTGCG TCGACCCCAA TCCTCCTCAG CTGTGTTCAG CCCCTGAGAT 4320
GCCCTGGGCT CCCTGGTTGA GCTTTGGTGG GTAACTGCAG GATGCACACA GGAGCTGCAG 4380
GCGAGGGCTT TGTAGGAGCT CTGTGGCCGC CCCACATCCC TGGCCTCTGC CATTTTCTGC 4440
CTAAACGTTG ACACATGGAA GAGGGAGCCC AGGATGCTGT GGGCCCAGAA GGTGGGGCCC 4500
TGCGGGCTCC ATCACTTCAC TCCAGGGCAC AGAGGGCCCA GGGTCCCCTC ACACTTGCCT 4560
GTGGGGACCA GTGGGAACAA TTCTCATTTT ACTGTCATTA TGAACTTGCG GCTTAAATAT 4620
GTCTGTGGAC TTCAAAGTGC CATCCTGTGT GGAAAATTTC CAGCTTTCAC TGAAGTAGAG 4680
AGATTAGCTC AATGCACCCC ATGTATCCCG TTCACCAGTT ATCCACAGCT CACTCATTTT 4740
GTTTCATCCA ACTCCCTCTC CTATTTTGAG GGGGAGGGAT TGTAATTTTT TTTTTCTTTG 4800
AGACTGAGTC CTGCTCTGTC 4820