EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS177-16617 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH_RA 
Coordinate
chr4:54187120-54188590 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr4:54187853-54187863TCTAATTAAA+6.02
KLF4MA0039.3chr4:54188101-54188112CCACACCCTGC+6.62
PHOX2AMA0713.1chr4:54187855-54187866TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr4:54187855-54187866TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr4:54187855-54187866TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr4:54187855-54187866TAATTAAATTA-6.62
RARA(var.2)MA0730.1chr4:54188445-54188462TGACCTCTGGTTGTCCT-6.62
SRFMA0083.3chr4:54188560-54188576TTACCCTATATGGTCT+6.07
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH04I053319chr45418568454188583
Enhancer Sequence
AATATACAAC ATGAAAGTAG AATATTTATT CTATGAAATA TAAGTAGTTT CTATATTGTC 60
AGTAACTATT TAAAATGCCA ATACATACTA ATTGTCATTT TTTGATAAAT TATTCTGAAT 120
TCTTAAAAAT CAAACTGTTT TTACAAATTG TCATGTTTGA AGAAGACCAA TGACATACAC 180
ATAATAATAA CCTGCTACAA ATAGCTCTTT AAGGTCTTTC AAGAAACTTC TGTACATGAA 240
AATATGGTCA TTTCAGTTCA TTCCTGGCTC TTTATTCACC AGAATTACTC AACTCTGAAT 300
GAAATCTTAG AAGCTGCCTT GGGTTGGCAT GTATGAAATG TCAAATGCAG TCTGCTAGAA 360
ACTAACAGGA AATATTCATC ACCAAATAAA ATAGAAAGAA GACAGCAAAA TTTTTAAAAG 420
GTGGCTGAAT GTTGAATCAT GGTGATACTT CAATCAAGTA GAAGGCATGC AATTAAGAGA 480
TGAGGGTGAA ATGTGAACGC GTACCATTAT CTTGTGACTA AACTTAGTTT CTTCGTGGCA 540
TGCACAGGAA GTTAAGCTTA ATCACAGGAT ATGCAATAAT AGTCACAGTA TTCCAACAGA 600
AATCCAATGA CAACAAAAAA CCCAAACAAT TTCAACTAAT TTTAAACAGA AGGCAAGCTG 660
AGTCATAGTT TTTCACAGCA GGGAATAATG GCTTCCATGA GGGGTGAGCT TAATGAGCTC 720
TGAAGGTAGG TTTTCTAATT AAATTATTCA CAGAGGCTTC AATAGTCATC TTTCCTCTTG 780
ACTACCTTTT AAAACAATTA CATCTTTAAC AAATGTACCA ATTAATCTTC ATCTCAATAG 840
AAGCAAAAGC AGCTAAGTGC AAGATATGTG ACAGAGTCCC TTGGTACTGG AAAGCAGCCC 900
TTTGTTCATT CTTTCTTTCA AAATATAAGC ACTTTCTGTG AGCTGGGCAT GGATGCTGGA 960
AACATGGCTG TGAGCATCCT CCCACACCCT GCCTGCATGG AGCTAGCCAT CTAGCAGGGA 1020
AGGTGAAACT GAGCACACTC CAGCAGGGTG ATAAAAACAG AGATTGAGAA CTTTGGGAAA 1080
GTGCAACACC TAACCTGGGC TTGTCAGAGG CGTTTGAACC AGAGCAACTC CATCTTGAAT 1140
AAGGACTGGG TAAAATAAGG CTAAGACCTG CTGGACTGCA TTCCCAAATG GCTTGGGATT 1200
CTAAGTCACA GGATGAGATA GGAGGTTAGC ACAAGGTACA GATCATGAAG ACCTTACTGC 1260
AAGCTGTTTT AGCTTGCAGT AAAGAAGCCG ACCAAAACCC ACCAAAACCA AGATGGCAAT 1320
GAAAGTGACC TCTGGTTGTC CTCACTGCTC ATTATACACG AATTATAATG CATTAGCATG 1380
CTAAAAGACA CTCCCACCAG CACCATGACA GTTTACAAAT GGCATGGCAA CATCAGAAAG 1440
TTACCCTATA TGGTCTACAA AGGAGAGGCA 1470