EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS177-16531 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH_RA 
Coordinate
chr4:40256270-40258160 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GFI1MA0038.2chr4:40257066-40257078TAAATCACTGCA+6.92
ZNF263MA0528.1chr4:40257101-40257122TCCTCCCTCTCCCCTTTCTCT-6.14
ZNF263MA0528.1chr4:40257104-40257125TCCCTCTCCCCTTTCTCTTCC-6.33
ZNF263MA0528.1chr4:40257107-40257128CTCTCCCCTTTCTCTTCCTCC-7.35
ZNF263MA0528.1chr4:40257110-40257131TCCCCTTTCTCTTCCTCCTCT-8.28
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
SE_11827chr4:40256526-40257656CD3
SE_14402chr4:40257454-40258314CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17299chr4:40254785-40261199CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18266chr4:40254707-40259452CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19152chr4:40256715-40258101CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_21915chr4:40255985-40257745CD8_Naive_8pool
SE_22292chr4:40254736-40258509CD8_primiary
SE_49838chr4:40256202-40258395RPMI-8402
SE_55399chr4:40256356-40257356Thymus
SE_55399chr4:40257475-40257899Thymus
SE_58296chr4:40151405-40268478Ly1
SE_62215chr4:40173915-40268314Tonsil
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH04I040253chr44025486940258910
Enhancer Sequence
AAAAGGGAGA GAGGATATTT AGCATTTTGG TAGGATAGGG AGGCCTGATA GAGCAGAGGC 60
CCGAATGATG TTGACAGACC ACATCAGTGA TCTGGTTTTA ACACAAACAA CCTCTTTGTA 120
AAAGAAAGCA GGCTTAGGTT TTTCCCTATT GCCCTGCGAG GGACACACAT GCTTTTTACC 180
ATGATGAGTG TTCAATATTG CACAGCACCC TCCAGCAGTG ACTGCCTTCA TTGGGGATTC 240
TAATCCATCT GTCTGCCTGC TGGGAATGAC TGAATTGGGG CAGTTTGAGG GGATGGATTA 300
TCAAATAGAG CAGAACAGAA AATTGGCATG ATTCATAGAA CCAGGGTGGT GCTGGGGGGT 360
TACACAGGCA AGCGGTTTCT AATGGATTCT GCACAAAAGG AAGGAAATGA CTAGAACTCA 420
GGGCCTACAT AGGACTCAGA GTGAAGACCT CGCCTGCAGG GCCCTGAGGA GAGATTCCAA 480
GAATCTGCAG GCTGAGCATG TGTGCTTGTG GCAGCACAGG GTTGAGAAGC AGCGAGGCTG 540
CAGCTTGCTG GAGCCCAACT ATTGATGCAG TTGAACGTCC TTTGTAGCCT TGTTTAAATA 600
GAACATAATA AGGCGGCACA GTCTGTCTGT AGAACTTTTA CACTAATTGA AACAGATATG 660
GGTGCAATTT ACAAGTGAGT CACCAGAGCT AACCCAAGGG CAGTTGTTGC ATCGTAGATC 720
TGTTGTCTTG GGGAATTGAC TTACTGAGGT GTTGGACTGA AGATATTTTT TTAAAAAGTT 780
TTCAGACAGC CCTAGGTAAA TCACTGCACA TGTGTACTTC TCAAATACAT CTCCTCCCTC 840
TCCCCTTTCT CTTCCTCCTC TTCATCGCTT CTGTCTGCAG CCCGGGGGTA CCTCTCTCAC 900
CCAACTTTGA TTGCTCTAGC ATCAAACAGT GCTGTGCCCA TAGTAATGCT GAACCACATT 960
TCTTAAGTGA ATCAATCCTC ACAGTCATCA ACTCCACACA TTAATTCATT TAGTACTTTA 1020
AAATTTTCCA AAGTGCTTTT CCTTGTCTTA TTATAACAAT TGCCAGCATT TGGTCAGCAC 1080
TCTAGAGGTT ATAAAGTACT TTGTGTACAC TGTCTCCTAT GACATCACAG CAATGCTGTG 1140
GGTTATTATT ACTTGACTCA TTTTGCAGGC AAGGAAGCTA AGGTTCAGGA ATGCTAAATG 1200
ACTCATCTGT GACCATGTAA CTAATGCTTG GCAGAATCAG GATTTGTACT TAGATCTCTT 1260
GCTCCAAACT CCCTTTTTTC CATTCGATGA TGCTTTCATC TGATGCTCTG GATGACCCTG 1320
TGAGGTGTTA GTGTAAGAGA TGAGGTCCAG GAGGGTGACA TGGCTCATCC AGGCCACACA 1380
CATGCACTCA CTGACCAGAA GTGAGGTCTT CCATCCAAGC CTTGGCTGTC ACTATTTTCA 1440
CCCTTATTGT CAGAGCATAT TTTTTTAACT GAACCCACTT ACTGTGTGGT TGTCTGCTAG 1500
GCATTCATTG AGTAAACAGA TATTGATGCT ATCTCTGTTT AACAAATGGA AAAGTCAGAA 1560
AGAAGGAAAT AATCCATAAA TCCAGGCCTC AAACTGTATT TACCTTACTT CTCTGGATAC 1620
TGCATGCAAA CCCATACAAT TTTTTTTTAA TCTCTTGTTA GTGTAGATCC TTTCATTGAG 1680
CTCAAACCTA AATCAACATG GCAGAACATT TTCCCCGGCT TCTCTGTTAT TTACTGGACT 1740
CCCATTTTTT GGAGTTGAAG GGGACCTCAG GGAGGATTTA GCCCAATCCT ATCATCTTAC 1800
AGATGAAGAA ACTGACTCTC CTCTTTGCCC AAGACACACA GATGGCTTTG GGCAAGTCGG 1860
GACTTGAGGG CCAGGCTTTG GCTCCCAAGG 1890