EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS177-01289 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH_RA 
Coordinate
chr1:145023140-145025870 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr1:145023976-145023990CTAATATTTATAAA+6.24
Lhx3MA0135.1chr1:145023901-145023914AATTAATTAATTT-6.92
POU6F1MA0628.1chr1:145023902-145023912ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:145023902-145023912ATTAATTAAT-6.02
PRDM1MA0508.2chr1:145023945-145023955TCACTTTCAC+6.02
ZNF263MA0528.1chr1:145023310-145023331TGCCTCTTTCCCTTCTCCTCC-6.07
ZNF263MA0528.1chr1:145023313-145023334CTCTTTCCCTTCTCCTCCTTA-6.12
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00153chr1:145021681-145025798Adipose_Nuclei
SE_03895chr1:145020279-145026000Brain_Anterior_Caudate
SE_29575chr1:145023219-145025412Fetal_Muscle
SE_36911chr1:145020986-145026466HSMMtube
SE_40587chr1:145022793-145024868Left_Ventricle
SE_45547chr1:145022981-145026888Osteoblasts
SE_48047chr1:145021953-145026881Psoas_Muscle
SE_51073chr1:145020774-145035772Skeletal_Muscle
SE_55884chr1:145023861-145026599u87
SE_68443chr1:144988869-145040149TC71
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1145023690145024549
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I148860chr1145023122145024569
GH01I149269chr1145023551145023750
GH01I148859chr1145024640145024869
Enhancer Sequence
GTGGTTTTTT CTTCCCTGCC TCAGGGCTGG ATCTTGGCAG AAATCTTCAC TTTGTTAAGT 60
CCCAGATGGA CATGAAAATA CCAGACAGGG CACATCGGGC TACACATGCC ACCTGACAAT 120
TATTTCGTAT CCAAAAGTAG ATCACCAGCT TGTGATTCTT CCAGGCCCCC TGCCTCTTTC 180
CCTTCTCCTC CTTAAAAGCT TTCCCTGAGA GTAAACAATG CCAAAGAGGA ATGTACTACG 240
TATGCACTCC CCTCTGTGGA GGTAAAATAG GAGAAGGATG TCAAAACCAT CAACCAGAAC 300
AATGTCTTAA AAAAATCTGT GGGGAAAAAA TTTATACTTA GCTGCTGCTA TTCACTGAGC 360
ATTTCTGCCT AGTCCACAGA CAAAGGTGGC TGCATCTGCT GTCAGGAGCA AGGTCAACCC 420
TCAGGCCAAA TTCAGCCCAT CCGACATGTT TTATTTAGCC CACACAAGTT TGACCCACTT 480
CTAACTGCTC TTGGGAAATG AGTGGGTCTG CCAACACTGG GCCTGCCTTC CCACACAGCG 540
GGAGAACTTG CCCCCTTTAC ACAGGACAGG GATGTGTTTT CCAGTTTGCC ACAGTCCCTG 600
CCACTCCCTG TCCTTGTCGT CCCTCATTCA CTTAATTATG ATACTTGCCT GGCATCTTGC 660
AGGTTTCTGA TGCTGTTACC CCAGTATAGA CCAAGTGCAG ACAGAATTTC ATTTCTGCTT 720
TATTAAGGCA CAGTCTTGAG AAACCCATTG GCTTCACACA CAATTAATTA ATTTGTGGCA 780
ACAAGCTACT ATATTGGCTT GCATGTCACT TTCACCTCTC TGGGCATTAG TTTTCTCTAA 840
TATTTATAAA AGAAGGACAT GACTTTCTAA GGTTCCTTGC AGTAATTATG CAGTTCTATT 900
CTAATAGATG CTTAAGCATA AAACCCATTT TAATACTGTC CAAGGATCCA GGATACCTTC 960
CAGACATGAT CTCACTCAAT CTTCTCTGCT CTGCAGATTG CACATTATAG GTCAAGAGCA 1020
AGCTACAACA CAGCAATACA TATCAGCCCT ACCAGACACC TCACCCTTCC CGCATCACCC 1080
ACACCCACTC TGAGCACACT GCCTGCCTGA TATGAATCAA TAACTGGAAG GATAGAGAGG 1140
TCACTTTAGA TGGGTACTGA GTTAATAAGC ATACTCGCAG TGTCTCAGGA GATTTTTAAG 1200
AAATCACTTT AGCTCTATTA ACAGCTCAAG TTCCCTCTCT TATTGCCAGA GAAAGGGGCT 1260
CACTCAGCTG CTCCACAAGT TACAAAGGAA TCTGACGCTC CCCAAGGGAA GGGGCTCAGA 1320
CTGAAGAAAC ACAGAGTATA AGTCTAAGGG GTTGCAATTT GTGACAACAT TTGATAAACC 1380
AAAGTGCAAG GAGAATTGGG GTATGGTAGA GACAGACTCC AAGCATGGAC ACACACACAC 1440
ACACACACAT ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACAAAGTGGT AATATATGTT 1500
GGTACATTCT TTCGTATTAC CCAAGTTCAG AAAAAAATTT TATATCCTTG TCCTAGTTTC 1560
TCAAATTCAA GTGTCTCTAG TTTTTTAAAA TATCAATTCA TGAATGACTC ATGCTCAGCT 1620
AATATGTGGT TCACCAGGCC ACTTTTAGCT CTCCTGCATT TCCATATATA ATCTTTCTCC 1680
CATGATGCTT TCACTTAAAA TTTTGCTTTT TCTGTATAAA TGAACTATAT TTTTCCTCAA 1740
TGTCTTACCT TGTCTTTCTC CCTACGTCAT CAATCTGCTA ATGACAATAC CAATTCCACT 1800
AAAACCACAT ATATTAATAT TCTCACCAGG ACATTATTTT GCTTTCGGAA GTACCAAGCA 1860
TTTTCCAAGT ACAACCTACT CACAAGCTGT TCACCTGCTT GATTTCTGCA TGGTATATCA 1920
CTCATATTTT CTTGAGTTGC TGATAAGTAG CTATTAAGAT ATTAGACTCA AATAACACAT 1980
CAACATTCAA TATCCCATAT TACTTGGTTT TTCTATGGCT TTCCAGGGTG ATTAAGTTGA 2040
GAATGATCAG GAAATAATTG CTTCTCTGAA GGCCATCTGC CACCCCCTGA TATTCTGACA 2100
TTCTCAAACT GTCCTGTGAT GATTTCTTCC AGTAATTTTC TAAGAATGGT AGTTTCATTT 2160
ATGGCCAGGG TTATCCAAAA CACTCAGTTT TGCTTTACTT GAAACTGGCC ACTGATATAG 2220
CTCCTTTCAA GATTCAAGCA TCTCATTGGT CCCACTAGTC TAGTTTCTCA TAACATTGTG 2280
GGGAGGGGTA GACACTTGGG TTTCTTCTTG CTTAGGAGCC TGCAGAGAGA GATATTTTCT 2340
ATAAGGCAGG TATAGACCTT CCTCCGTAAA CTGTTATTTC TGGTATTATT TTCTTGTATT 2400
TTAGTCTGTC TAATTTGTGG ACTGAGAGGA ACAACAGATC ATATGAATGA ATCATCTCAT 2460
TCAAAAGCAA TGACAAGATG GTAATCATCA TTACAAAGCA GGTTCTATGA GTCTTTGAAC 2520
AGTATGAGAT ATTTGTATTC TAGGACCAAA ATCACCACTA AAACTATTTC TAAGGTACTG 2580
ATGCCTGTCT AGGCTCCATA CTTTCTTCTC TCCAGTCTCA CCTACTAAAA TAATTAACCT 2640
AAGGTTATTT ATTCCCATAT GAGTGTCTAA ACTCCCAAAG GAATGGTGAT TTTCAGGCCC 2700
TCTCTTCAGG CCAATCACAG GTATTTAGTT 2730