EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS176-35101 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH 
Coordinate
chr6:106576620-106578470 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs4134466chr6106577368hg19
rs9373834chr6106577694hg19
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
JUN(var.2)MA0489.1chr6:106577257-106577271AAAAAGTGACTCAT+6.86
Lhx3MA0135.1chr6:106576727-106576740TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr6:106576724-106576737AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr6:106576728-106576741AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr6:106576723-106576736AAATTAATTAATT+6.92
POU6F1MA0628.1chr6:106576725-106576735ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:106576729-106576739ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:106576725-106576735ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr6:106576729-106576739ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
SE_27341chr6:106576767-106577701Esophagus
SE_56020chr6:106576583-106578933u87
SE_58834chr6:106530700-106671989Ly3
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr6106578000106578373
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH06I106128chr6106576795106578425
Enhancer Sequence
GGCAGGAGAA TCGCTTGAAC CTGAGAGGCA GAGGTTACAG TGAGCAAAGA TTGTGCCACT 60
ACACTGCAGC CTGGACAACA AAGCGAGACT CCATCTCAAA AATAAATTAA TTAATTAATT 120
AAAAAAAGAA CACTGGCCTC TGATCCACCA GAAAGAATTT CATAAGATTC AGTGATAAAG 180
CTCAGCTCGT GGCTTTTTAG GTGAGCCCCT CATTCAGACT CTTTTAGACT CTATTTACTC 240
CGACTTCATG CACAAATCTA AAAGGGTAGG GGATCTGCTT TCCAGTCCAC AGAAGACTAG 300
AAAGACAAAT GAAAAGGCAG AGCCAGGGGG ACAGTGCTGG AAACCAGCAC CCTGAGAGAG 360
GGTAGTGGAG GGAACTGATA TCCAAGCAGC TGGAAGAGGA GCTTTGCAGA CGCCCAAATG 420
TCAGACCGAT TCATGTCAGA GATGACAGCC CCATCCACAG CTCCCTGACA TCGAGAAAGA 480
CAGTAGCCGT GCTCATCAGC ACGTCCTGAA GCCACCAAGA CAGGGACAGA CCACGATCAA 540
CTGCAGCATG ATGAAGAGGT TCATAACTTT TTTAAGGAAT CTCTATATGT AATGGTTCAA 600
GTTTTATTTC CTGAAGGATA TCAGTAACAT CAAGAGCAAA AAGTGACTCA TTCCCTAAGA 660
TTTCAGGATA GCCTAGTTTT GCTTTGTGTA TTTGCATGCA AGTTATCCTA GAGATAAGGC 720
ACACTGTCAT CTATTAAACT AGTCTCCAAT GACCATAATT TTAGATCATC AAGTGACAGG 780
TTTCTTAGAT TATGAAACAA TAATTAGCCT TAGCTTCATG AGTCTGTAAA GCATGTATGA 840
CTATCTCAGC GGACCCTGCA TGTCTGCTAG TGCAGGTTTC ACCACCAATT CTGGCAAGAG 900
CTGGAGTCAG CCTGGGACTG TGGTTATTTT GCATACACGA AAAGCTTGGT AATCTCTTTG 960
AAGGGCCTGG ACTGTGTACA AAGATCCCTC CCTTTTTGCA TAATGGTACT TTACTTCCTG 1020
GATTATAAAG ATATTATTTT ACTAGAGAGA AAGGAACTGG ATTTGTGGCG CATATTTGTC 1080
CAATGATTTA AGTTAATTCC TCATGTTCAA AATGAAACTG TCAGTTATAA GCTGACCAAA 1140
TGAAGCAATA TATTTCAAAC TCAACAGAAT CTTTTTATTC ACTCTACCAA TCTACGTACA 1200
TCCCAAATTC CAACATAATT ACCACCCCAG GTGTTGGTTA AAGAGCACTT TTTAACTTCC 1260
TATGGTGGAC ATTTCTAAGC ATCCACAAAA GTAGACAATA GCATAATGAA CTTCCAGGTA 1320
CCCAACCTTC AGCTTCAGCT GTTATCAATA TTTTGTCAGT CTTAAACAGT ATGCCTTAGT 1380
GTGCCTAAAT GAAATTCCCT GTATTTTAAT TATCCAGAAG GCTGGAAATA TTTGGGCAGC 1440
CAGGCCTCCA ACCATGAGGT ATGATTAGAA AGATTTCAAA GGCTCTTCAC CCCACAGATG 1500
ATGCGTGCCA CGAGGAGTGA TATATTCTTG GTTCTCTCTC TCTGTTTCTC ATACTCTCTC 1560
TGAAAACACA AATGCTCCTG CTGAGGGGGC ATTACTGAAA TTCCTAAAAC CTTGTTAAGA 1620
GTTGGTTTTT ATCAAATGAT TTTGTTCTAG AACAGGAGAC TTTGGAGGGA CAGCCTAGCA 1680
TCCTTGTATC CTGGGGATGA ACAGGGCCCT GGAGGGAGAA AGGGAACAGT GTGATGTGAG 1740
ATAGGAAAGC CAAATACACA GTGTTGTTTT GGCTTAGCCC TGGTAGTAAT TCCTGTAAGA 1800
GACTGTCTGA GAAAAAAATT ACATTTGGAA CATTTTTATT TCAGTAATCA 1850