EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS176-28842 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH 
Coordinate
chr4:40256150-40258350 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GFI1MA0038.2chr4:40257066-40257078TAAATCACTGCA+6.92
ZNF263MA0528.1chr4:40257101-40257122TCCTCCCTCTCCCCTTTCTCT-6.14
ZNF263MA0528.1chr4:40257104-40257125TCCCTCTCCCCTTTCTCTTCC-6.33
ZNF263MA0528.1chr4:40257107-40257128CTCTCCCCTTTCTCTTCCTCC-7.35
ZNF263MA0528.1chr4:40257110-40257131TCCCCTTTCTCTTCCTCCTCT-8.28
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
SE_11827chr4:40256526-40257656CD3
SE_14402chr4:40257454-40258314CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17299chr4:40254785-40261199CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18266chr4:40254707-40259452CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19152chr4:40256715-40258101CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_21915chr4:40255985-40257745CD8_Naive_8pool
SE_22292chr4:40254736-40258509CD8_primiary
SE_49838chr4:40256202-40258395RPMI-8402
SE_55399chr4:40256356-40257356Thymus
SE_55399chr4:40257475-40257899Thymus
SE_58296chr4:40151405-40268478Ly1
SE_62215chr4:40173915-40268314Tonsil
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH04I040253chr44025486940258910
Enhancer Sequence
CCGAGATCAT GCAACTGCAC TCCAGCCTGG GCGACAGAAA GAGACTCTGT CTCAAAAAAA 60
AAAAAAAGAA CAATGAACAA TGTAGATGGA TGTTCGGTGC TATTAAGAAA ATAAATTAGG 120
AAAAGGGAGA GAGGATATTT AGCATTTTGG TAGGATAGGG AGGCCTGATA GAGCAGAGGC 180
CCGAATGATG TTGACAGACC ACATCAGTGA TCTGGTTTTA ACACAAACAA CCTCTTTGTA 240
AAAGAAAGCA GGCTTAGGTT TTTCCCTATT GCCCTGCGAG GGACACACAT GCTTTTTACC 300
ATGATGAGTG TTCAATATTG CACAGCACCC TCCAGCAGTG ACTGCCTTCA TTGGGGATTC 360
TAATCCATCT GTCTGCCTGC TGGGAATGAC TGAATTGGGG CAGTTTGAGG GGATGGATTA 420
TCAAATAGAG CAGAACAGAA AATTGGCATG ATTCATAGAA CCAGGGTGGT GCTGGGGGGT 480
TACACAGGCA AGCGGTTTCT AATGGATTCT GCACAAAAGG AAGGAAATGA CTAGAACTCA 540
GGGCCTACAT AGGACTCAGA GTGAAGACCT CGCCTGCAGG GCCCTGAGGA GAGATTCCAA 600
GAATCTGCAG GCTGAGCATG TGTGCTTGTG GCAGCACAGG GTTGAGAAGC AGCGAGGCTG 660
CAGCTTGCTG GAGCCCAACT ATTGATGCAG TTGAACGTCC TTTGTAGCCT TGTTTAAATA 720
GAACATAATA AGGCGGCACA GTCTGTCTGT AGAACTTTTA CACTAATTGA AACAGATATG 780
GGTGCAATTT ACAAGTGAGT CACCAGAGCT AACCCAAGGG CAGTTGTTGC ATCGTAGATC 840
TGTTGTCTTG GGGAATTGAC TTACTGAGGT GTTGGACTGA AGATATTTTT TTAAAAAGTT 900
TTCAGACAGC CCTAGGTAAA TCACTGCACA TGTGTACTTC TCAAATACAT CTCCTCCCTC 960
TCCCCTTTCT CTTCCTCCTC TTCATCGCTT CTGTCTGCAG CCCGGGGGTA CCTCTCTCAC 1020
CCAACTTTGA TTGCTCTAGC ATCAAACAGT GCTGTGCCCA TAGTAATGCT GAACCACATT 1080
TCTTAAGTGA ATCAATCCTC ACAGTCATCA ACTCCACACA TTAATTCATT TAGTACTTTA 1140
AAATTTTCCA AAGTGCTTTT CCTTGTCTTA TTATAACAAT TGCCAGCATT TGGTCAGCAC 1200
TCTAGAGGTT ATAAAGTACT TTGTGTACAC TGTCTCCTAT GACATCACAG CAATGCTGTG 1260
GGTTATTATT ACTTGACTCA TTTTGCAGGC AAGGAAGCTA AGGTTCAGGA ATGCTAAATG 1320
ACTCATCTGT GACCATGTAA CTAATGCTTG GCAGAATCAG GATTTGTACT TAGATCTCTT 1380
GCTCCAAACT CCCTTTTTTC CATTCGATGA TGCTTTCATC TGATGCTCTG GATGACCCTG 1440
TGAGGTGTTA GTGTAAGAGA TGAGGTCCAG GAGGGTGACA TGGCTCATCC AGGCCACACA 1500
CATGCACTCA CTGACCAGAA GTGAGGTCTT CCATCCAAGC CTTGGCTGTC ACTATTTTCA 1560
CCCTTATTGT CAGAGCATAT TTTTTTAACT GAACCCACTT ACTGTGTGGT TGTCTGCTAG 1620
GCATTCATTG AGTAAACAGA TATTGATGCT ATCTCTGTTT AACAAATGGA AAAGTCAGAA 1680
AGAAGGAAAT AATCCATAAA TCCAGGCCTC AAACTGTATT TACCTTACTT CTCTGGATAC 1740
TGCATGCAAA CCCATACAAT TTTTTTTTAA TCTCTTGTTA GTGTAGATCC TTTCATTGAG 1800
CTCAAACCTA AATCAACATG GCAGAACATT TTCCCCGGCT TCTCTGTTAT TTACTGGACT 1860
CCCATTTTTT GGAGTTGAAG GGGACCTCAG GGAGGATTTA GCCCAATCCT ATCATCTTAC 1920
AGATGAAGAA ACTGACTCTC CTCTTTGCCC AAGACACACA GATGGCTTTG GGCAAGTCGG 1980
GACTTGAGGG CCAGGCTTTG GCTCCCAAGG GCTCTCACTT GTTCCTGCAG GCCTCAGAAC 2040
TTCCAGCCTC TAACATGGAG CTTTGGACTC TGCCTATTCG TTTCAGGTTT CTGTGATGGA 2100
AGTTTAAAGG CTGCTGGGTG TGGTGGCTCA TGCCTGTAAT CCCAGCGTTT TGGGAGGCTG 2160
AAGCGAGCAG ATCACCTGAG GTCAGGATTT CCAGACCAGC 2200