EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS176-26490 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH 
Coordinate
chr3:71544990-71547260 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs11720523chr371545170hg19
rs6798507chr371547039hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF9MA0653.1chr3:71545613-71545628AGTTTCGTTTTCATT-6.41
JUND(var.2)MA0492.1chr3:71545331-71545346ATGGATGAGGTCATG+6.02
MEF2AMA0052.3chr3:71546072-71546084TCTAAAAATAAA+6.07
ZfxMA0146.2chr3:71545732-71545746GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02329chr3:71544583-71548169Astrocytes
SE_09191chr3:71541698-71547451CD14
SE_10856chr3:71540154-71553996CD20
SE_12176chr3:71540131-71545864CD3
SE_16818chr3:71544701-71546060CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17460chr3:71525976-71548622CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18589chr3:71531889-71546927CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_21547chr3:71535178-71547083CD8_Naive_7pool
SE_21991chr3:71531907-71547304CD8_Naive_8pool
SE_45920chr3:71543874-71548507Osteoblasts
SE_58320chr3:71535686-71635865Ly1
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I071492chr37154163471548550
Enhancer Sequence
TGCTGGTACT AACAATCATG GGCCACATTT TGTAACAGGC AGGTAATGCA AATGAGCGAG 60
GAAGGCCAGG TGTAAGGTAA CAGGGAGAGG GAAGGAATGT GGCAAGCTGA GAAATCCTCA 120
CTTTATCAGC TTCAAGGGGG AAGCCATTGT ACTTCCCCCT CCAATTACTG CCACATGGGC 180
ACATACCCTC AAGAACCTCA AGAGCTTTCA ATTCTACAAA TAAAGGCAGT AATCTAGATT 240
TCTATTTAGT AAAATTCCAG AATTTTTCAA AGATGGCAGC TAACTTTTTA AATAAGTTAT 300
ATTTAAACAA AACAAACATG TTGCAATCCC TGTAGCAAAG GATGGATGAG GTCATGCACT 360
GTCTCCAGTT TTATGATTCC AGAGTGATTC AGAAGCACAG AGAAGCAGTA CGGGTGACAC 420
AGAAAAGCAC AGTAGGTGTC TGGGCAGATA AGAGCTTTCT AGAAGAATTC ATTATCTTGA 480
GGTTTTGGGA GGAATTGGAA GATTGGGTGG AAAACGCATT TCACAGGTCA GAATATCATA 540
CTCGAAGGCT TGGGGGTGAG GAGTAGGCAA GTCAACAGCA AAGATCAGCC ATGAGGAGAG 600
GGCTGGTGGA GGTTTCCTGT GGGAGTTTCG TTTTCATTCG GACTGGAGTG AGTAGCAGCT 660
TTCTAGCTAA GACATAAATC GGTTAAACAA TACTCTATGT GGCCGGCCAC AGTGGCTCAC 720
GCCTGTAATC CCAGCACTTT GGGAGGCCGA GGCGGGCGGA TCACGAGGTC AGGAGATCAA 780
GACCACACTG GCCAACATGG TGAAAATCCC TCTCTACTAA AAATACAAAA ATTAGCTGGG 840
TATGGTGACG CCAGCTACTA GGGAGGCTGA GGCAGAAGAA TCGCTTGATC CAGGGAGTCG 900
GAAGTTGCAG TGAGCTGAGA TTGCGCCAAT GCACTCCAGC CTGGCGACAG AGCAAGACTC 960
TGTCTAAAAA AACAAAAGAA ACAAACAACA ACAACAAAAA GACAAAAAAA AACAATGCTC 1020
TATGTGTATG GTCATTAGTG CTGTCTTATT TGACTTCTAA TATTTTAAAG TAACCAGGCA 1080
TATCTAAAAA TAAAGGGTGA ATCACCACTG TGGTGTGTGG AAGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1140
GTGTGTTGTT AAGAATTCAA CAGTCACAGG ACTGAATTCC ATCTTCATGG AACCCCATAG 1200
CTAACTAAAA TACTTAACTG TTCTGAACTC TAGACATAAA AAAATACAGC AACTGAAATT 1260
TTTAAAAATA CCAGAAGATA GATACCCAAA TAAATTATCC TTTCCACAGT ACAGAGGCAA 1320
AAACAAAAAA GAAAAGAAAA AAATGACAGA AACCCCCACC CGCCTACGTA GAATTGTATA 1380
ACTAGAAAAA CTATCTCTTA AAGCTGAGGG TGAAATAGAA GCTTTTTCAA ACAAACAGAA 1440
GTTTATCACC TCTCTATAAG GACATTCTAA AAGACTTACT TCAGACCAAA AAGAAACAAT 1500
TTCCAGGAGA AAGTTTTTTG ATTTAAGAAG GTAGGGAACA GCCAACTTGT GAAGTAGAGT 1560
AAGTGAAAAG TAAATGCACT AACAAACAAT GTGCAAGTCT CAAACATTTT TTTAAAATGT 1620
AGCAGTACCC CCACTTGCTT TCTACCCCAG CTCACGGTAT TTACACTGTA GCAATATCAA 1680
TCACCAAGGC CATGGACTGC AAATGTGAGT GTGCAGGGAG GCACCAGCTT GAAGCCCAAG 1740
TTCCCACCCT CCATAGTCCA GAGATTCTTA AACAAGTTCC AGGAATCTGC TGTTCTACCC 1800
AACAGATACC CCAGGTAACT CTGATAAAGA TCTGAAGAAC ACTGCATTGC TCTCTGACTA 1860
CTTTAGGGGA AGGAATTATT CAGTGAACCC CCAGGGGCTC ATCCCTGGGA GGCTCCAGCT 1920
GAGAACACTA TCAAACCTTT GTTCTTTTCC ACTTCACTAC AGCCCCAGAA GTACCTTGGC 1980
CCAGGAGGTC AGCAGTAACC CTGCCTCAAC CCTGCTAATC AAGAGCTGCA ATAAATTAAA 2040
AGCCCATTGA AATATTTTAG AGAAAAGCCG AGAAGTGCTG AAACATTAAT TGTGCCATAT 2100
TCAATCTGTT TTCCTAGAGA TTTGAAAAGC CAGATTACCA TCTTGGGGGT CATTAGAAAG 2160
AATGAAGCTT TCTCCCTTTT CAATTTACAT ATTTAAAAAT GCATGCGTTC TGGCAGTGGC 2220
TACTAAGTCC TTTCCAACGC TTTCCAAGTC CTGTGGCTAC TCCAAATGCC 2270