EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS176-25168 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH 
Coordinate
chr22:36756810-36758900 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs136211chr2236758547hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr22:36757898-36757913GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr22:36758739-36758754TGAACTCCTGACCTC-6.22
PRDM1MA0508.2chr22:36757483-36757493TCACTTTCAC+6.02
ZNF263MA0528.1chr22:36757210-36757231CCCCCTTCCCTTTCCACCTCA-6.09
Number of super-enhancer constituents: 63             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00116chr22:36744550-36773501Adipose_Nuclei
SE_00874chr22:36756697-36757690Adrenal_Gland
SE_01541chr22:36756672-36757952Aorta
SE_01541chr22:36758001-36762083Aorta
SE_02243chr22:36756652-36757859Astrocytes
SE_02896chr22:36756802-36757908Bladder
SE_05865chr22:36756326-36761563Brain_Hippocampus_Middle
SE_09195chr22:36744556-36774047CD14
SE_10697chr22:36756800-36757861CD19_Primary
SE_11020chr22:36744527-36785336CD20
SE_11868chr22:36756699-36757969CD3
SE_11868chr22:36758007-36758669CD3
SE_13866chr22:36756805-36758676CD34_Primary_RO01536
SE_14476chr22:36756786-36757863CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16932chr22:36756964-36757891CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_16932chr22:36757992-36758699CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17339chr22:36756664-36780212CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17788chr22:36746596-36785463CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18286chr22:36744506-36778586CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19119chr22:36756666-36778387CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20220chr22:36756688-36757984CD56
SE_20220chr22:36758098-36763991CD56
SE_20975chr22:36758609-36763480CD8_Memory_7pool
SE_21957chr22:36756540-36757850CD8_Naive_8pool
SE_22328chr22:36756666-36770326CD8_primiary
SE_23071chr22:36756789-36757919Colon_Crypt_1
SE_23071chr22:36758133-36758683Colon_Crypt_1
SE_23740chr22:36756795-36757549Colon_Crypt_2
SE_25782chr22:36756588-36771936Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26521chr22:36756697-36758025Esophagus
SE_26521chr22:36758036-36775377Esophagus
SE_27650chr22:36756641-36761849Fetal_Intestine
SE_28644chr22:36756100-36761903Fetal_Intestine_Large
SE_30956chr22:36756775-36757644Fetal_Thymus
SE_31378chr22:36756746-36757946Gastric
SE_31378chr22:36758108-36762068Gastric
SE_35832chr22:36756767-36768386HMEC
SE_36959chr22:36758623-36770080HSMMtube
SE_37948chr22:36745836-36771974HUVEC
SE_40597chr22:36756652-36770124Left_Ventricle
SE_41574chr22:36756793-36757576LNCaP
SE_41574chr22:36758071-36758664LNCaP
SE_42094chr22:36756687-36757946Lung
SE_42094chr22:36757994-36770152Lung
SE_44762chr22:36756662-36757927NHLF
SE_44762chr22:36757965-36758680NHLF
SE_45604chr22:36756644-36768407Osteoblasts
SE_47169chr22:36744668-36771991Panc1
SE_47463chr22:36756741-36757565Pancreas
SE_48566chr22:36756719-36761708Right_Atrium
SE_50050chr22:36756680-36761699Sigmoid_Colon
SE_51217chr22:36756632-36757724Skeletal_Muscle
SE_51217chr22:36758477-36761577Skeletal_Muscle
SE_52340chr22:36756669-36762077Small_Intestine
SE_53283chr22:36756728-36758683Spleen
SE_54489chr22:36744394-36771971Stomach_Smooth_Muscle
SE_55761chr22:36758025-36763029u87
SE_58448chr22:36724049-36832686Ly1
SE_62244chr22:36719186-36785326Tonsil
SE_65307chr22:36756313-36764221Pancreatic_islets
SE_67526chr22:36758025-36763029u87
SE_68689chr22:36755117-36757853H9
SE_68689chr22:36758619-36761630H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr223675821236758558
Enhancer Sequence
AGGAATATCC TGCAGGAAAA ACCTCTCTCC ATGCTGGTCT GGGAAATGCT GGTCTGGTGA 60
GATGGGCACA AAGCCTGTGG CAGAAGAGCT GGATTTGAGT CCAGCGAGGT GCTGACCAGC 120
TGTGCAATCC TGCAGGCACC ACCCAGGCCT CGGCTTTCCC ACCTGCAAAA TGTCCTATCT 180
GCTCACAGGT ATGCACAAGG CCACTCTCTG CAATACACAC CAGGGCTGTC AGAGCAGTTA 240
TCTACAGGGT GGGTCAATAA AGTGGCTCCT CTGTCACCCA GGGCTAATAA CCTACAGCAG 300
CCTCGACCTA GGCCCTCACT CTCCCCAGGC TAACAAGGAG TGGGGGGCTC CTCCCAGCTG 360
CCAGTGCCCA GGAGGTAGGA GCTGAAGACT GCGGGTGGGC CCCCCTTCCC TTTCCACCTC 420
AGGAATGTTG TTTGCTTACA GAAGAAGCTG GAACTTGTTT CCATTAGCAG TATTCCAACC 480
CAAGCCTGTG TTGATGCTTA GCAGATAAGA AAACCAGAGA GGAACTTAGT GCCCGGGCCC 540
CAGAGCCTGC CCCATCTGCA GGTTCTGCCT TTGCCTCCTT GAAGCGGGCA TGGAGGGGGG 600
CTCAGGTGAC TGCTGAAAGT CCAGGAAACA ATGAAAGATG ATGGCATTTG CCTGTCCAAG 660
GGAGGGCCTG TGGTCACTTT CACTTTGCCT GGCACCGAAG GAAACTCAGG CTATCAAAAA 720
CAACACCAGT ACGTATTTCA AATCATGTTG TACACAATGG ATATAAACAA TTTTTGTCAA 780
CTTAAAAATT AAATGAACAA TTTCTTTTAA AAAAAAAATG ACACCAGAAA CCAGAATGTG 840
GTACATAGAG TCCCTCCTCC TGCATGGGAA GGGGTGGGGG CAATAGCTTG GGACAGGCTG 900
GAGGAGATAA ACTGGGGCAG CTAACCCAGG ATCTTATCAG CCATTTAGGA ATGTGGACTT 960
TATTCTAGGG ATAATTGGGG AGGAGCAGAG GTGACATCAG ATTTGTATTT TAAAGTAATT 1020
GGCTGGGGGT GTACGGTGGC TCACGCCTGT AATCCCAACA CTTTGGGAGG ACAAGGCAGG 1080
TAGATCACGA GGTCAGGAGT TCAAGACCAG CCTGGCCAAC ATGGTGAAAC CCCATCTCTA 1140
CTAAAAATAC AAAAATTAGC CAGGCGTGAT GGTGTGCGCC TGTAATCCCA GCTACCCGGG 1200
AGGCTGAGGC CAAGAATTGC TTGAACCCAG GAGGCAGAGG TTGCAGTGAG CCGAAATTGC 1260
GCCACTGTAC TCCAGCCTGG GGGACAGAGC GAGACTCTGC CTCAAAAATA AAAAAAACAG 1320
AAATCATCCT CCCTTACCTG CATGGAGGGG GCAATGAGAA GTCAGTGGTT GGAAAATACT 1380
GGGGACTTGC AAGGAGGGAG CTTCCAATCT AAGAGAAGAA AAGACAGTTC CCTGACCAGG 1440
CTAGGTGGAG AGTGATTAAA TGACACGAGA GGGACAAGTG CAGCCATAGA CTTTACCCTC 1500
TGATCTCCTA CTCCATAGAG CCTGGCTCGA GGAGAGTCCT GGAATCACCG TCCTACGACA 1560
GTGAGAAGTG ACCAAGCAAT CCCAGGAGCT CCAGGGCCAG TGTTTCCAGA GCATCTTAGG 1620
CACAGATCTC ATGTGGCATG TGTCACACAG ACTACACAAT AAAGTGTCCA ATGGGGTGTC 1680
CTCCACTAAG ATACCAACTT CAGGACCACA GAGACATGGC TTTAGATCCT CAGCACAGAA 1740
ACCATTTCTG AGTCGCTCTG TTGCCCGGGC TGGAGTGCAG TGGCACAATC TTGGCTCACT 1800
GCAACCTCTG CCTCCTGGAT TCAAGTGATT ATCCCGCCTC AGCTGGGACT ACAGGTGCAT 1860
GCCAGCACGC TCGGCTAATT TTTGTATTTT AGTAGAGATG GGGTTTCACC ATGTTGGCCA 1920
GGATCGTCTT GAACTCCTGA CCTCAAGTGA TCCACCTGCC TCAGCCTTCC AAAGCGCTGG 1980
GATTACAGGC ATGAGCCACT ACACCCGGCC TGAAACCATT TCTTAATGAA TAAATCAAAC 2040
AACCAATGAG CCAGGGCAGA AAGCAGCAAA AGTTTGAGGC CAGCCCTGCC 2090