EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS176-23955 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH 
Coordinate
chr20:33905530-33908960 
SNPs
Number: 3             
IDChromosomePositionGenome Version
rs1406948chr2033905619hg19
rs6060369chr2033907161hg19
rs6088791chr2033907909hg19
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr20:33907056-33907067TTAATTAAATT-6.32
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02275chr20:33905091-33909712Astrocytes
SE_26824chr20:33905238-33907989Esophagus
SE_28226chr20:33904907-33909177Fetal_Intestine
SE_29043chr20:33904883-33909293Fetal_Intestine_Large
SE_36174chr20:33905204-33909057HMEC
SE_39170chr20:33905039-33909136IMR90
SE_44275chr20:33905060-33909528NHDF-Ad
SE_44962chr20:33905127-33909221NHLF
SE_45807chr20:33904873-33909959Osteoblasts
SE_51781chr20:33905671-33909330Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_55706chr20:33904888-33910416u87
SE_63567chr20:33905657-33909435HSMM
SE_64842chr20:33905143-33908040NHEK
SE_67595chr20:33904888-33910416u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr203390573533906821
chr203390628533906606
chr203390757033908807
chr203390700533907177
chr203390691233907531
chr203390774533907913
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I035317chr203390499233910110
Enhancer Sequence
GGCTAAGACA GGCTTGCTGG TAACTGAATT TTTACAAGGG CCTGTGTACT ACGCCATGCA 60
TAGCATGTTC TATCCAACTA GTGTTTTAGG GGATTTTCTT CTTCTTCGCC TTTCTTTCCC 120
CCTGTTGAAT ACCTTCTGTG TTTCTGGAAT TTCAGAAACA TATACTGCCA AACTTCTACT 180
GTCCCATCTT CCAGAAAGGG GTAAAGGGAA GAGTCAAGAA ACAGGCCAGA GCTAGAGTTC 240
ATTCCTTCTG TCATGTGAGG ATGAGACTAC AACTCAGACC TCCTGATACC CATACTTGGA 300
GGATCTCCCT ACTCCCACAT GAGTTGTTCT CCTAATTGTG TTAGGAATAA TCACAGCCAC 360
AAACGGATGA TATCAGAGGT GTCAAACAGT AAGGCAGGAG CATCTCTCAG AGGAAAACAT 420
TCACTGAACC TGCCTAGCAG AGCTAGTTTA TGTCATGTAT CACACCATTA AGCTTTGGAG 480
CAGGAAGGGC CCTCAGAGAT TACCTAGCTC AATACCCTTG AGGAAAGGGT GAACTGAAAC 540
CCAGAAAGAA GAGACTTATT CAAGATCACA CATCAAGTTA GTATAAGAGC CAGGATTAGA 600
ACCTGATTTC TGGGTAAGTG CTTTTCCTAC TTTACCATCT GCAGGGCATT TCCAGAGATC 660
ATCAACACAT TCATCTGCAA ACCTCAGTTC TTGCTTTCCA GCAAGGCCCA CAAACATACA 720
AACACATTTT CTCCTCTTGG GATACACCTG CATTCTGGTT GGCTACTGCC CAGGAAAAAC 780
GGAGTGCAAG AGTAGAGTTC CTTACTAGCA AGGCTCCTTG ACTTCCTGGT CCTATATTCT 840
AACTCCAGTG ACCTGTAAGC TGCCTCTCCC TTCACCTCTA GCTGAGACAA TGGCAAACTG 900
CCACAGCTAG AAATGCTTTT CAGATATCAT CACCCAGGCT GGATTAGATC ATGAAAAGGG 960
GCCTTCCTGG AAGAGGGTGG AAGTGAGATC AGTACAGACA CGTGATCTGC AGGCAACAGG 1020
TGAGGGCAAG TGACAGCACC TTCCTCAACT ACCGGACTCA CTCGGCAGGG CCCTTCTAGC 1080
TAGTCCAGCA GCCAAGGGGA GCAGGATATT CGCTCTGGTG AATCCCTGTT GGATTTTATT 1140
CCCTCATTTA AGTTTTTGGT TGCTGGTGTG CAGGTTCCCC ACCTCTCCAC TGCCAGATCA 1200
TTCTATATGG AGCACTCTGC CCATGACTAC ACAGCTGCAC CCAGCAGAAG AGAAACTCCT 1260
CCCAGATAGT GTTGGGCCGT TCTCTTATTA AACTCATCCT TTCCATAATG CTTTGCTTTT 1320
CATAAAAACC CATACATACA ACACCACAAG GAAAAGGTTC CTTTTATATC AGTTACTCAT 1380
ATTTTCCCAT TTATTTAAGC CATTAAAATT CATGCAGATA TTTTATAAGC CACCAGGATT 1440
CAGTGACTGG TATTACTGAA TGTTTAATAA TAAACTAAAC AGAAGAAATC AGAGGGTTAA 1500
ATGATGACTG CAATTCCTGT AATGACTTAA TTAAATTTTT ATTGAGTACA TAAACTATGA 1560
TGTCACCTCT AGCCAACCAC AGGCCTGCTT TCCCAGCATG TCACAGGGAG GGAGCACTCA 1620
ATAGGAGGCT TGGCTAAATG AGCAGCAGGT CTCAGCTGAA ATGGGGAGGG GAGTGAGGCT 1680
CATGTAACAC ACTCAATAAA TTATCCGTTC ATTTTTAAAC AAAGTCCATG AGTTATAATA 1740
TATTTGCCAT GCACTTTTTA TGACATAATA AAAATGTTAC CTTAAGGATT ACTTAACACA 1800
TACTACAAAT ATTATAGCAG AGGCAGGCAC AAGGGGCAAA GAAAACAAAC ACGAGCAGGC 1860
CAGGGACGGG TCCTGGAGTT TATGTCCCAG GGGAAACAGC ATAGTATATT AAAAAGGGAA 1920
TGCAAAAAAA AGGAAGGGAT GCAAGAGTTC AGGGTTACTA ATCGGCAGAT TAATGAATGA 1980
GACAACCAAC AGAGAACACA AGTAAGGCAA TAATGAATCT TGCAGGGCAC ATGTTTAATT 2040
AAAGTAGCAT TCTCAAGGAG GAATATTAGC TTTAAAGAGA TGCCAGTTCA TTTGAGGCCA 2100
ATTCGCTGCT CTCTTTCCCC TTTTCACTGT TGCTGCCTTA AAGATATTTA TGTGACTGCT 2160
TAACAGAGGA ACCAGACTAT GTGGATACAG GGACTGATGG GAGATCAAGT TTTAACTCCT 2220
CCATGGACTC TACAAGGCTT CTAGTGATCT GCTCTTGGCC ATCTTTTTTG CCTCCCCTCC 2280
TCTTGCCTCC CCATCTTACT TCACCCTGCA GTCAGTAAAG TATGTGCACA GATACATCAT 2340
GCTGTCATCT ATTTCTTAGT CATACTGCTG CCAGGAATTC TTCTCTTCTT TATCCACTGA 2400
TGGAAGGGAT GCTAACTCCT TATCCTCTAA GACTTAGCAC ACATATTTTC TCTACTAAGT 2460
CTGCCCTCTC CCCCATCTAC AGGTGCCCCA AAGTGATTCA AGTCTGGAGA CGGGTCCCAT 2520
CATTCATTAT TTACCAAGTG CCAATAACTG TGCTACAACT TTACACATTA GCCCACTTAA 2580
ACCTTCCCAA GGACTCTAAG AGACAGGAAC TGTTACTGTC TCCACTTTAG AGAAGAGGAA 2640
TCTGATGTTT GGGAAAGTTA AAGCTAGACA GCTAGGAAAT AGTGGGGTCA AGATAAGAAT 2700
ACAGAGCAAT CCAACTCCAT TGCCTACCTG TGTTGGAATA GACACTGGAA GGAATGTAGC 2760
TGCCCCTTCC TGTGCCCCAC AGCTCAGGCT ATCTGCAGAG GCAGAACTAA GAAATGCTAA 2820
TGTGGTCTTG AGTAAACACA ACTCAGAGAT TCCAGTTCCA GTGGCAGCTA GAGACAGCCA 2880
CCAGATGGGT CATCAGTGGC CGGTTACTAA TACATCAGAT ATCCCTAGTA GAGCCAAGCT 2940
CCACTCCTGG GAAAACCTGA GGTTGAGAGT GGGTGTAATT ATGGTGGGGG AATGGGAAAA 3000
CAGAAGAAAG TTGGTATGGA AAACACTGAT GAGCATGAAG GTGAGAATAA GCTTTAAGGT 3060
TACTGGCTTG AAGCAAAGTT GCTAACAGTA GCAGACTAAG AATTTGCTGG AATGAATGAA 3120
TGACAAAGGA CAGCTAGAGT TGCTGGCTGA AGCCTAAGGA CTATATCAAA TTCATCATAA 3180
GGCAACAATG CAACACAAGA TTGTAGGTCA TGTTTTAGTT TGCTGTAGTA GACAGTAATG 3240
CCACCACCAA TGCTTTGCAG TGCCAACGCC ATGTTCTACA GTCATTGTGC GGCAACAGGC 3300
TGATGTGCAC TGAACATCAG CTAGCCTATT TAAAGTTCAG GTTAGAAATT AGCCCACTGT 3360
GGAATATTTT GTGAGATACT TAGAAACAGA GTAAGAGTAG ACAGACAAGA GAGACGGGGG 3420
ACATGGAGAG 3430