EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS176-23885 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH 
Coordinate
chr20:30307230-30309410 
Number of super-enhancer constituents: 70             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30306461-30312254Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30306371-30311908Aorta
SE_02627chr20:30307051-30311961Astrocytes
SE_03109chr20:30308258-30309433Bladder
SE_03156chr20:30306497-30311444Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30297618-30312523Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30291888-30312530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30291812-30312465Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30297611-30312332Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30292115-30312408Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08789chr20:30307109-30310334Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_13448chr20:30306439-30312272CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30302978-30312324CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30302871-30312578CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30302979-30312159CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20764chr20:30302878-30312381CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30303825-30312264CD8_primiary
SE_23622chr20:30306472-30311911Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30302953-30312495DND41
SE_25933chr20:30303441-30311921Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30306378-30312004Esophagus
SE_27731chr20:30306378-30312126Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30306317-30312080Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30306355-30312106Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30306417-30312032Gastric
SE_33407chr20:30306334-30312298H2171
SE_34309chr20:30306323-30312556HCT-116
SE_34643chr20:30298140-30312397HeLa
SE_35852chr20:30306311-30312155HMEC
SE_36989chr20:30297525-30312332HSMMtube
SE_38141chr20:30306459-30312236HUVEC
SE_39144chr20:30307380-30311380IMR90
SE_39443chr20:30308115-30311313Jurkat
SE_39853chr20:30306390-30312315K562
SE_40644chr20:30297536-30312142Left_Ventricle
SE_41648chr20:30306474-30310131LNCaP
SE_42121chr20:30306366-30312046Lung
SE_43515chr20:30291879-30312193MM1S
SE_44365chr20:30306380-30312027NHDF-Ad
SE_44995chr20:30307052-30312090NHLF
SE_45708chr20:30306812-30312173Osteoblasts
SE_47264chr20:30306465-30312746Panc1
SE_47861chr20:30307071-30308101Pancreas
SE_47861chr20:30308207-30309183Pancreas
SE_48182chr20:30306387-30312048Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30306370-30312050Right_Atrium
SE_49684chr20:30307804-30310082Right_Ventricle
SE_49886chr20:30307003-30312251RPMI-8402
SE_50155chr20:30306356-30312043Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30303939-30312172Skeletal_Muscle
SE_51884chr20:30307061-30311605Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30306397-30311994Small_Intestine
SE_53471chr20:30306475-30312120Spleen
SE_55108chr20:30307049-30311900Thymus
SE_55770chr20:30306834-30312280u87
SE_56767chr20:30306433-30312207VACO_400
SE_57375chr20:30306412-30311876VACO_503
SE_57919chr20:30306425-30311882VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30306862-30311641HSMM
SE_64478chr20:30306344-30311737NHEK
SE_65412chr20:30308226-30312394Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30308115-30311313Jurkat
SE_67146chr20:30291879-30312193MM1S
SE_67821chr20:30306834-30312280u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr203030772030308274
Enhancer Sequence
AATACCTGAG AGGAAGGGGG CGGGTACCTT CTACCCAGGC TCAAAGGATC CTGAGTCAAA 60
TGTTCTTTAC TCCCTGGCCT TAGGGAGAGA ATGTGTGCTC AGAAATGGTT CTGATATAAC 120
TGGCTCTTCC ACACACATCC CCTCTGTTCA CCAAGAGGAA GTGACATGTG GTATGTTGTC 180
CAACAGGCTC TGATGATTCT TAAGCAAAGA GATGGAAGAT GGAATTTCAA CCCCATGGAG 240
ATCTAATAAA CTTACCCAGA GTTGCTGTGT CTAAGACCTC TTTCATATGC ACCACTGGGC 300
AGCTGGCAAT TCTCTGGTAG GGGTAGCCTT CTGCAGAGGC TGGCTAGCAG ACCAGGCACC 360
TCTCCCAGAC TGCCTTTTGT TTATAGCTGG CAACAACCCA CCTGGTATTA GGACCACTGG 420
CCAAAGACAA TAGTCAGGCA AAGTGGGCAA GCAGCCTCAA TCCCTACTTG GAGATGCCTC 480
AGAGGGTGTG TCTGCAGTAC TGGAATCCTG TCCCTCCTGT AATCAGCTGA ACAAATATTT 540
GCCCCAAAAG AGAATCAAAG CAGGAGGGAA CAGGAGAGGT CACTGCACAA ACCAACAGGA 600
ACTATTTAAT CATTTATCCC CCTAGAGAGT TCATTTACAG AATGGCTTTC AAGTCTAGTC 660
AGCTAGCTCA AGAGAACCCA CCACCTTTAC CTCCCCTGAC CCCACCCCAG TTATCTGACC 720
TCTATTGACT TGACCCCCTT GCCTTTTACA AGAGCTGGCA CAGACGAGTT GAAATTGCAA 780
AGAAATGCAA AATGAGAGAG GGGGTGGGGT TCCAGGGCAA ACTCAGGAGG TCTCTTGCTC 840
AGTGGTAAAG TGAAGTGCCT GCCACACCCT AGGCCCAGCC TATAGACAGT TGCATTCTTG 900
ACATTCCTGA GTCCATGGTG CATGTCCCCT TCCACCTCAG CTCCTTCAAT GGATGACTTA 960
TTTTCCACAG CTTGATGCTT TTCTGCATAC TCTGAGGGGA TAGAACATCT CTCATAAAAC 1020
CTGCACCTCC GCTAGGTAGG GAGATAAGCA AGAAAACAGG ACTGAATTCA CTGAAGAGCA 1080
AAACTTGCCT ACAGTGACCA CTGGTAAAGA AGCTTTCACC ACCATCTCAT CCTGGCTCAG 1140
TGATGGGCAG GAGAACTCTC CCTCCCTGGA AAGGGAATTT GCTGGTGTCA GTCACTGTGC 1200
TCACATTATC GCCAAGATTT ACAATACACT GTAAGGCAAG GAGAGCTTGC CACATTTTTT 1260
AGTGAAAGAA ACTAAGCCTC AAGAAAGTAA CCCAGCCTGT CCAAGGTCAC ACAGCTAGTT 1320
ACATGACAGA ACTGGAACTT ATACCTGCAT GTGAAGTCTG TTACTAAATC TCAATGTCCC 1380
ACAGAGCCCC AAAGACTAGG TTCTTGCTTT GCCAGCAAAC AGTGCTTGAA GAGGCCCCTG 1440
GGCTCTGGCC GGAAAGTAAC AGGCAGAGCA GCTGGAGCTC CCCAACCGAC CCCAGGCAAT 1500
GAGGTGCAAA GTCCCCTGGC TTAATGTGTG ACACAGCAAG TGCTCCACAA ACAAGGCAAC 1560
CATGCAGAAA GTCGCACACT TTGGGGGAAA TGAACTTAGG GGGCGCAGTG CAAACACAAT 1620
CTGCACAGCC TACACTGCCC CAAAATCTGA CAATTCTCAG CCATTCAACC CAGTGGGAAC 1680
TCCTGCCTAT GGCCATGCCC TAGTCTGAGA GGAGAGTGCC ATACACGCAA ACTTTGAAAT 1740
AAAGGGAACT TGATTTGGGG GAGAGAAGCC CAGGATAGGA CTGAGACCCC TTGGGGGGAA 1800
CAGATGGAGA GGTCTGTGGG TCATTGATGC TCATCATCTT CTCCAGGCAT TATACTCATC 1860
ACCCCTTTGT GTGTGAACCA TTGTATAAGG TAAGGGAAAC ACCGAACTAA CTTCCTACCC 1920
TCACAGGTTT GGGACTTAAT GAACACATAG GCTACAGTTT TCTTTGCTGA GAAACTGGAA 1980
CACAAGTATG GAATAGTGGA GTCATGGGGG TGACCAGGGT GAAAGATGCC TGATCTCTGA 2040
AGCACAGGGT CATTTGTATT TCCAAGGAGT TAACCTCTTG TGGTGAAATG AGGCCAGTCA 2100
GGTTTCCTCA ACTATCAACG TCTCCAACAA TCACCCAACA CAACAGAAAG AGATACAGAA 2160
GAAGGGCTGT TGGGGATCTC 2180